700 Entri Tambahan Nama OrangFadilah, supervisor; Dodi Safari, supervisor; Rafika Indah Paramita, examiner; Andi Yasmon, examiner; Ariel Pradipta, examiner
001 Hak Akses (open/membership)membership
336 Content Typetext (rdacontent)
710 Entri Tambahan Badan KorporasiUniversitas Indonesia. Fakultas Kedokteran
264b Nama PenerbitFakultas Kedokteran Universitas Indonesia
504 Catatan Bibliografipages 78-90
852 LokasiPerpustakaan UI
049 No. Barkod15-25-14008747
338 Carrier Typeonline resource (rdacarrier)
590 Cat. Sumber Pengadaan KoleksiDeposit
903 Stock Opname
534 Catatan Versi Asli
Tahun Buka Akses2025
053 No. Induk15-25-14008747
653 Kata Kuncis. pneumoniae; serotipe 3; profil genom; pcv; indonesia
040 Sumber PengataloganLibUI ind rda
245 Judul UtamaKarakterisasi Genomik, Faktor Virulensi, Gen Resistensi Antibiotik, dan Lokus Kapsul Polisakarida Streptococcus pneumoniae Serotipe 3 = Genomic characterization, virulence factor, antibiotic resistance gene, and capsule polysaccharide locus of serotype 3 Streptococcus pneumoniae isolates
650 Subyek TopikStreptococcus pneumoniae; Polysaccharides, Bacterial; Gene mapping
264c Tahun Terbit2025
850 Lembaga PemilikUniversitas Indonesia
904b Pemeriksa Lembar Kerja
520 Ringkasan/Abstrak/IntisariStreptococcus pneumoniae serotipe 3 masih menjadi penyebab utama morbiditas dan mortalitas pada pasien yang terinfeksi pneumokokus. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakteristik genom, faktor virulensi, gen resistensi antibiotik, dan lokus kapsul polisakarida (cps) dari 19 isolat tersimpan S. pneumoniae serotipe 3 pada kelompok usia anak-anak dan dewasa dari berbagai wilayah di Indonesia. Karakterisasi genomik dilakukan dengan teknik whole-genome sequencing menggunakan platform Illumina, kemudian dilanjutkan dengan analisis bioinformatika menggunakan pipeline ASA3P, PathogenWatch, ABRIcate, dan GeneViewer. Pada penelitian ini ditemukan galur ST451-GPSC234 (n=5), ST180-GPSC12 (n=4), ST458-GPSC51 (n=2), ST3805-GPSC12 (n=2), ST4909-GPSC363 (n=2), ST700-GPSC10 (n=1), ST5292-GPSC309 (n=1), ST505-GPSC 12 (n=1), dan ST4233 (n=1). Selain itu, ditemukan isolat resisten terhadap tetracycline (42%) yang dibawa oleh gen determinan tetM4, tetM8, tetM12, dan tet32; chloramphenicol (10%) yang dibawa oleh gen catPC194; dan co-trimoxazole (5%) yang dibawa oleh gen folA dan folP. Penelitian menemukan galur ST700-GPSC10 tidak memiliki gen cpsA, cpsB, cpsC, cpsD, dan tnp pada lokus cps serta tidak memiliki gen penanda faktor modulasi imun meliputi gen cps4A, cps4B, cps4C, cps4D, igA dan zmpC. Penelitian ini menunjukkan isolat S. pneumoniae serotipe 3 memiliki keragaman genetik tinggi dengan karakteristik genom unik yang dapat berkontribusi terhadap patogenesis serotipe 3. ......Streptococcus pneumoniae serotype 3 remains a major cause of morbidity and mortality in pneumococcal infected patients. This study aimed to analyse genomic profiles, virulence factors, antibiotic resistance, and capsular polysaccharide (cps) loci of 19 archived isolates of S. pneumoniae serotype 3 in children and adult groups from various regions in Indonesia. Genomic characterization was performed by whole-genome sequencing technique using Illumina platform, followed by bioinformatics analysis using ASA3P, PathogenWatch, ABRIcate, and GeneViewer pipelines. This study found ST451-GPSC234 (n=5), ST180-GPSC12 (n=4), ST458-GPSC51 (n=2), ST3805-GPSC12 (n=2), ST4909-GPSC363 (n=2), ST700-GPSC10 (n=1), ST5292-GPSC309 (n=1), ST505-GPSC 12 (n=1), dan ST4233 (n=1). The isolates were found to be resistant to tetracycline (42%) carried by tetM4, tetM8, tetM12, and tet32 genes; chloramphenicol (10%) carried by catPC194 gene; and co-trimoxazole (5%) carried by folA and folP genes. This finding revealed that ST 700-GPSC 10 lacks of cpsA, cpsB, cpsC, cpsD, and tnp genes in cps locus and devoid immune modulation factor genes including cps4A, cps4B, cps4C, cps4D, igA, and zmpC. This study suggest that S. pneumoniae serotype 3 isolates have high genetic diversity with unique genomic characteristics that may contribute to pathogenesis of serotype 3
090 No. Panggil SetempatT-pdf
d-Entri Utama Nama Orang
500 Catatan UmumTidak dapat diakses di UIANA, karena: akan ditulis dalam bahasa Inggris untuk dipersiapkan terbit pada Jurnal Internasional yaitu Journal of Microbiology, Immunology, and Infection yang diprediksi akan dipublikasikan pada bulan Maret tahun 2025
337 Media Typecomputer (rdamedia)
d-Entri Tambahan Nama Orang
526 Catatan Informasi Program StudiIlmu Biomedik
100 Entri Utama Nama OrangRatna Fathma Sari, author
264a Kota TerbitJakarta
300 Deskripsi Fisikxvii, 90 pages : illustration + appendix
904a Pengisi Lembar Kerjatanti-Mei2025
Akses Naskah Ringkas
856 Akses dan Lokasi Elektronik
502 Catatan Jenis KaryaTesis
041 Kode Bahasaind