Anggota-anggota marga Citrus, memiliki jumlah kromosom sama yaitu 2n = 18. Untuk membedakan jenis-jenis Citrus dengan data kromosom, digunakan data yang lain, seperti ukuran, bentuk, dan juga indeks kromosom. Penelitian telah berhasil dilakukan pada tiga jenis Citrus yang mewakili dua seksi, yaltu Citrus aurantifolia (seksi Limonellus), C. medica, dan C. limon (seksi Citrophorum). Telah dilakukan analisis kromosom berupa pengukuran panjang, penentuan bentuk, pendeskripsian kariotipe, dan penghitungan indeks kromosom. Kesimpulan yang dapat dirumuskan dari hasil penelitian ini adalah adanya perbedaan panjang, bentuk, dan perumusan kromosom pada tiap jenis Citrus, menunjukkan bahwa ada perbedaan diantara jenis-jenis tersebut. Perbedaan tersebut dapat digunakan sebagai ciri taksonomi. Setain itu juga nilai indeks kromosom yang telah dihitung pada tiap jenis Citrus, menunjukkan perbedaan dan dapat digunakan dalam taksonomi untuk membedakan jenis-jenis Citrus, serta merupakan nilai untuk mengetahui dekat atau tidaknya suatu hubungan kekerabatan.