Penelitian mengenai persentase tutupan terumbu karang, komposisi
bentuk koloni, dan keanekaragaman karang batu di lereng terumbu atas
Pulau Panjang Besar telah dilakukan pada tanggal 11--13 November 2005.
Sampel diambil dengan metode Quadrat Sampling Along Transect di lereng
terumbu atas (upper reef slope) pada 4 stasiun, Barat Daya, Tenggara, Timur
Laut, dan Barat Laut. Kondisi terumbu karang Pulau Panjang Besar
dikategorikan buruk dengan persentase tutupan karang batu hidup kurang
dari 25%. Komposisi bentuk koloni karang batu didominasi oleh bentuk
koloni bercabang di Stasiun Barat Laut, Barat Daya, dan Tenggara. Bentuk
koloni masif mendominasi di Stasiun Timur Laut. Karang batu yang
ditemukan sebanyak 20 marga dengan rata-rata indeks keanekaragaman
sebesar 1,01 di Stasiun Tenggara; 0,80 di Stasiun Timur Laut; 0,64 di Stasiun
Barat Daya; dan 0,34 di Stasiun Barat Laut.