Penelitian mengenai kondisi tutupan karang di perairan Pulau PanjangBesar, Kepulauan Seribu telah dilakukan pada tanggal 9--13 November 2005.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi tutupan karang di PerairanPulau Panjang Besar, Kepulauan Seribu. Penelitian dilakukan denganmenggunakan metode Line Intercept Transect. Hasil penelitian menunjukkankondisi terumbu karang pada kedalaman 3 m berada dalam kondisi rusak(tutupan 10,86--16,10%) kecuali di sisi Barat Laut (43,31%) yang beradadalam kondisi sedang. Terumbu karang pada kedalaman 8 m berada dalamkondisi rusak dengan angka tutupan tertinggi di sisi Barat Daya (14,86%).Bentuk koloni bercabang mendominasi pada kedalaman 3 m dan bentukkoloni masif mendominasi pada kedalaman 8 m. Kondisi tutupan karang disebagian besar perairan Pulau Panjang Besar berada dalam kondisi rusak,sedangkan lokasi yang memiliki kondisi sedang adalah sisi Barat Laut.