Cerita cekel Endralaya terdiri atas 16 pupuh (78 halaman). Diawali dengan pupuh (tembang) Asmarandana yang menceritakan tentang awal kepergian Raden Danajaya (Arjuna) yang menyebabkan kesedihan para Pandhawa, Dewi Sembadra diboyong ke Dwasawati, dan sang prabu di Amarta menyuruh Arya Sena dan Raden Gathotkaca pergi mencari Raden Danajaya. Ternyata Raden Danajaya pergi bertapa, mengubah namanya menjadi Cekel Endralaya. Pada saat itu Negara Dwarawati diserang oleh para raksasa bala Kurawa. Para raksasa dapat dikalahkan oleh seseorang yang mirip Arjuna. Orang tersebut ternyata Bethara Kamajaya. Cekel Endralaya memanah Arjuna tiruan yang segera musnah dan kembali ke Kahyangan Cakra Kembang.