ABSTRAK
Kanker mulut rahim merupakan kanker yang menempati urutan kedua di dunia dan pertama di negara berkembang, termasuk di Indonesia. Insidensi kanker inidiketahui memiliki keterkaitan yang erat dengan infeksi HumanPapillomavirus (HPV). Tipe HPV berdasarkan kemampuannya dalammenginduksi kanker mulut rahim digolongkan menjadi low-risk dan high-riskHPV. Di Indonesia, tipe HPV yang bersifat high risk adalah tipe 16, 18, dan52. Untuk menekan insidensi kanker mulut rahim di Indonesia, perludirancang vaksin chimeric Virus-like Particle (cVLP) yang bersifat polyvalentdengan cara merancang plasmid dan host berbasis protein kapsid L1 melaluiprediksi epitope model algoritma Hidden Markov Model (HMM). Studi in-silicodilakukan untuk menentukan sekuens DNA cVLP HMM1 dan HMM2,kemudian dibuat suatu rancangan DNA rekombinan dengan menggunakanplasmid pUC19 dengan menyisipkan sekuens DNA HMM1 dan HMM2menggunakan enzim restriksi BamH1, EcoR1 dan HindIII, yang dapatmengekspresikan vaksin cVLP tersebut ke dalam host. Prediksi analisismodifikasi pasca translasi dilakukan agar dapat menentukan host yangsesuai untuk ekspresi cVLP HMM1 dan HMM2. Hasil penelitian secara insilicomenunjukkan bahwa hasil modifikasi pasca translasi yang terjadi hanyaN-glikosilasi. Persentase host yang diprediksikan sesuai untuk ekspresiHMM1 dan HMM2 yang direkomendasikan SuggestES adalah sel mamaliasebesar 64,66% dan 66,67%, dan sel E.coli sebesar 35,34%, dan 33,33%.