Dalam proses hukum acara baik itu di Pengadilan Pajak maupun di pengadilan lainnya, ada salah satu tahap yang sangat penting dan sangat menentukan hasil akhir dari sebuah proses panjang pencarian keadilan, satu bagian penting tersebut adalah pada saat tahap pembuktian. Dimana pada tahap ini para pihak memberikan semua alat bukti, data atau dokumen baik itu data atau dokumen utama maupun data tambahan/pelengkap, serta dalil-dalil. Di mana dengan itu semua, setiap pihak dalam sengketa berharap, semua hal yang mereka ungkapkan dalam persidangan dapat membentuk dan menimbulkan keyakinan Majelis Hakim, bahwa dalil yang mereka ajukanlah yang benar. Akan tetapi dalam Pengadilan Pajak Majelis Hakim memiliki kebebasan untuk menentukan sistem pembuktian yang dipakai, beban pembuktiannya, dan apa saja yang harus dibuktikan, serta penilaian terhadap hasil pembuktian tersebut. Sehingga dengan demikian pada tahap pembuktian, yang dapat dilakukan oleh para pihak adalah bagaimana mereka (para pihak) sedapat mungkin membuat agar Majelis Hakim berpendapat dan berpandangan yang sama, seperti apa yang telah diajukan oleh mereka.