Pengulangan dalam barisan DNA terjadi apabila terdapat sub untaian yang
muncul lebih dari satu kali. Dalam pembentukan barisan DNA, terjadinya pengulangan
dapat menghalangi pembentukan barisan yang unik. Banyaknya kemungkinan
pembentukan barisan DNA bergantung pada pola pengulangan pada barisan DNA
tersebut. Untuk setiap bentuk pengulangan DNA, banyaknya kemungkinan
pembentukan barisan DNA dapat dihitung dengan bantuan digraf tereduksi dari digraf
DNA. Sedangkan pola pengulangan barisan DNA dikarakterisasikan dengan
menggunakan graf pola utama. Untuk barisan DNA dengan n pengulangan, bentuk
pengulangan DNA yang dihasilkan dihitung sehingga akan menghasilkan k-cara
pembentukan. Pada skripsi ini dibahas kemungkinan pembentukan barisan DNA
dengan pengulangan menggunakan k-cara pembentukan, dengan 1 k 8.