Perkembangan ilmu pengetahuan di satu sisi memberikan manfaat yang besar bagi kehidupan manusia. Ilmu pengetahuan melahirkan berbagai teknologi yang membantu manusia, supaya lebih efektif dan efisien dalam bekerja dan menghasilkan berbagai produk. Namun di sisi lain, dampak dari perkembangan teknologi ini menyebabkan pencemaran lingkungan. Pencemaran yang berkelanjutan mengakibatkan kerusakan alam dan juga kehancuran hidup manusia. Dalam tulisan ini penulis ingin menganalisa kerusakan tanah pertanian yang disebabkan oleh pupuk kimia. Kajian filosofis dalam tulisan ini berangkat dari pemahaman akan alam berdasarkan konsep filsafat Plotinus. Plotinus memberikan teori tentang asal usul alam, dan sifat metafisisnya, yaitu keharmonisan dalam seluruh alam semesta. Kemudian, dari sudut pandang sains, Thomas Kuhn mengajak kita untuk merubah paradigma lama yang destruktif dan diganti dengan paradigma baru yang konstruktif. Sintesa dari kedua filsuf ini adalah paradigma metafisis yang menjadi solusi dalam menanggapi kerusakan alam. Penerapan dari paradigma metafisis dapat diwujudkan dalam pertanian organik.