ABSTRAKTingginya angka infeksi virus dengue (DENV) di Indonesia merupakan masalahkesehatan yang masih belum tertangani. Pengobatan infeksi DENV hingga saat inimasih mengandalkan imunitas penderita. Berbagai jenis antiviral DENV sedangdikembangkan, salah satunya menggunakan rekayasa genetika berbasis sekuensuntranslated region (UTR). Namun data mengenai UTR DENV masih sedikit. Olehkarena itu, penulis melakukan penelitian untuk menganalisa sekuens danfilogenetik UTR DENV-1. Dalam penelitian ini, dua strain Indonesia dibandingkandengan 25 strain dari GenBank menggunakan program Genetyx 5.1. Hasilpenelitian ini menunjukan bahwa terdapat beberapa sekuens yang lestari, sehinggamemenuhi kriteria sebagai target siRNA, yaitu 3’UAR, CS1, CS2, dan RCS2.Sementara sekuens 5’ UTR tidak memenuhi syarat siRNA karena ditemukanperubahan pada beberapa strain, termasuk strain Indonesia. Filogenetikmenggunakan UTR tidak sesuai dengan filogenetik envelope dan tidak dapatdigunakan untuk menjelaskan pola penyebaran DENV-1.

---

ABSTRACTHigh prevalence of dengue virus (DENV) infection still become an unresolved issuein Indonesia. Treatment for DENV infection relies heavily on natural immunity.Various DENV antivirals are on development, one of them is untranslated region(UTR)-sequence-based. However, there is only a few number of data available onUTR DENV. Therefore, this research was done to analyze the sequence andphylogenetic of UTR DENV-1. Two Indonesia strains were compared with 25strains from GenBank using the Genetyx 5.1 program. There are four conservedsequences that fill criteria as siRNA targets, which are 3’UAR, CS1, CS2, andRCS2. 5’UTR sequence does not fill the siRNA criteria because mutations werefound within some strains, including Indonesia strains. Phylogenetic using UTRdoes not fit envelope phylogenetic and can not be used to explain the DENV-1pattern.