UI - Tesis Membership :: Kembali

UI - Tesis Membership :: Kembali

Deteksi mutasi A2058G dan A2059G pada gen 23S rRNA treponema pallidum yang menyebabkan resistensi azitromisin menggunakan uji nested multipleks PCR = Detection of A2058G and A2059G mutations on treponema pallidum 23S RRNA gene involving in azithromycin resistance by nested multiplex PCR / Desy Ariani Gultom

Gultom, Desy Ariani; Andi Yasmon, supervisor; Yeva Rosana, supervisor; Beti Ernawati Dewi, examiner; Wawaimuli Arozal, examiner; Ika Puspa Sari, examiner (Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016)

 Abstrak

ABSTRAK
Sifilis merupakan penyakit multistadium kronik yang disebabkan oleh bakteri
Treponema pallidum dan ditularkan dari lesi aktif pasangan seksual atau dari ibu
hamil yang terinfeksi pada janin yang dikandungnya. Saat ini telah terjadi
peningkatan kasus T. pallidum resisten azitromisin akibat mutasi titik A2058G
dan A2059G pada gen 23S rRNA. Di Indonesia belum ada data terkait resistensi
T. pallidum terhadap azitromisin sehingga penelitian ini bertujuan untuk
mendapatkan metode nested multipleks PCR untuk deteksi kedua mutasi yang
menyebabkan resistensi. Tiga pasang primer digunakan pada reaksi nested PCR.
Untuk mendapatkan kondisi uji yang optimal dilakukan optimasi parameter yang
penting pada proses PCR. Uji nested multipleks PCR dapat mendeteksi 22.000
jumlah copy DNA/ml dan tidak bereaksi silang terhadap mikroorganisme yang
potensial menyebabkan hasil positif palsu. Uji awal 45 sampel klinis darah
ditemukan 13 sampel positif T. pallidum dan tidak ditemukan mutasi baik
A2058G maupun A2059G. Dua sampel positif dikonfirmasi dengan DNA
sekuensing dan menunjukkan tidak ada mutasi titik. Uji nested multipleks PCR
yang telah dikembangkan pada penelitian ini dapat digunakan untuk deteksi
mutasi gen 23S rRNA T. pallidum yang menyebabkan resistensi azitromisin pada sampel klinis darah.

ABSTRACT
Syphilis is a chronic, multi-stage infectious disease caused by Treponema
pallidum that is usually transmitted sexually by contact with an active lesion of a partner or congenitally from an infected pregnant woman to her fetus.
Azithromycin-resistant strains of T. pallidum is associated with a single point
mutation (either A2058G or A2059G) in both copies of the 23S rRNA gene of T.
pallidum. These strains are now prevalent in many countries but there is no data
available about it in Indonesia. Therefore, in this study we developed a nested
multiplex PCR to detect A2058G and A2059G 23S rRNA gene point mutations of
T. pallidum. Three primer sets were designed for nested PCR reactions. To obtain
optimal PCR reaction, all parameters were optimized. The assay could detect at
least 22000 DNA copy number/ml and showed no cross reaction with other
microorganisms that potentially cause false positive result. A total 13 of 45 whole
blood specimens were PCR positive for T. pallidum and no single point mutation
(either A2058G or A2059G) were detected by PCR. Two positive specimens were
confirmed by DNA sequencing and showed no mutation. Thus, nested multiplex
PCR developed in this study is potential to detect azithromycin-resistant T.
pallidum in whole blood samples.

 File Digital: 1

Shelf
 T-Desy Ariani Gultom.pdf :: Unduh

LOGIN required

 Metadata

Jenis Koleksi : UI - Tesis Membership
No. Panggil : T58761
Entri utama-Nama orang :
Entri tambahan-Nama orang :
Entri tambahan-Nama badan :
Program Studi :
Subjek :
Penerbitan : Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016
Bahasa : ind
Sumber Pengatalogan : LibUI ind rda
Tipe Konten : text
Tipe Media : unmediated ; computer
Tipe Carrier : volume ; online resource
Deskripsi Fisik : xv, 108 pages: illustration ; 28 cm + appendix
Naskah Ringkas :
Lembaga Pemilik : Universitas Indonesia
Lokasi : Perpustakaan UI, Lantai 3
  • Ketersediaan
  • Ulasan
  • Sampul
No. Panggil No. Barkod Ketersediaan
T58761 15-19-592683373 TERSEDIA
Ulasan:
Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20433333
Cover