UI - Tesis Membership :: Kembali

UI - Tesis Membership :: Kembali

Analisis dan prediksi interaksi protein antara protein HIV-1 dengan protein manusia menggunakan algoritma LCM-MBC dikombinasikan dengan association rule mining = Analysis and prediction of protein interactions between HIV-1 Protein and human protein using LCM-MBC Algorithm combined with association rule mining

Olivia Swasti; Alhadi Bustamam, supervisor; Titin Siswantining, supervisor; Sri Mardiyati, examiner; Hendri Murfi, examiner; Dian Lestari, examiner (Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2019)

 Abstrak

Human Immunodeficiency Virus (HIV) merupakan virus yang menyerang sistem kekebalan tubuh manusia. Virus ini terdiri dari 23 protein dalam RNA untai tunggal. Interaksi protein HIV dan protein manusia dapat mengakibatkan penyakit AIDS. Dengan mempelajari interaksi protein dapat digunakan untuk mengembangkan obat antiviral. Untuk menganalisis interaksi protein dilakukan dengan proses biclustering. Algoritma LCM-MBC merupakan suatu algoritma biclustering yang digunakan untuk menganalisis interaksi protein.
Hasil dari biclustering digunakan untuk memprediksi dengan association rule mining. Untuk mengetahui fungsi-fungsi biologis dari protein yang terdapat pada satu bicluster digunakan DAVID Gene Ontology. Terdapat 45 bicluster yang memiliki protein HIV dalam satu bicluster sebanyak lima. Dari bicluster yang diperoleh ini, Terdapat 11 protein HIV-1 yang diprediksi akan berinteraksi dengan 36 protein manusia. Jika protein manusia terhubung dengan protein HIV sesuai dengan tipe jenis interaksinya, artinya protein manusia tersebut berinteraksi dengan proten HIV-1.

Human Immunodeficiency Virus (HIV) is a virus w attacks the human immune system. This virus consists of 23 proteins in a single-stranded RNA. The protein interaction between HIV proteins and human proteins can impact to AIDS The research about HIV-1 proteins and human proteins interactions leads to the insight of drug target prediction. To analyze protein interactions carried out by biclustering process. The LCM-MBC algorithm is a biclustering algorithm that is used to analyze protein interactions.
The results of biclustering are used to predict with association rule mining. To find out the biological functions of proteins found in one cluster used DAVID Gene Ontology. There are 45 bicluster that have five HIV proteins in one bicluster. From the bicluster obtained, there are 11 HIV-1 proteins that are predicted to interact with 36 human proteins. If human protein interacts with HIV-1 protens, it means that human proteins will relate according to the interaction type by HIV proteins.

 File Digital: 1

Shelf
 T54287-Olivia Swasti.pdf :: Unduh

LOGIN required

 Metadata

Jenis Koleksi : UI - Tesis Membership
No. Panggil : T54287
Entri utama-Nama orang :
Entri tambahan-Nama orang :
Program Studi :
Subjek :
Penerbitan : Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2019
Bahasa : ind
Sumber Pengatalogan :
Tipe Konten : text
Tipe Media : unmediated ; computer
Tipe Carrier : volume ; online resource
Deskripsi Fisik : xii, 70 pages : illustration ; 28 cm + appendix
Naskah Ringkas :
Lembaga Pemilik : Universitas Indonesia
Lokasi : Perpustakaan UI, Lantai 3
  • Ketersediaan
  • Ulasan
  • Sampul
No. Panggil No. Barkod Ketersediaan
T54287 15-21-525035317 TERSEDIA
Ulasan:
Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20492859
Cover