Background: HIV infection in HCV-infected patients accelerates disease progression and reduces the success rate of Peg-IFN/RBV treatment. HCV mutation in NS5A-ISDR/PKR-BD region improved the outcome in HCV monoinfection treated with Peg-IFN/RBV. SNP-IL28B polymorphism is predicted to have an effect on HCV quasispecies evolution. However, the role of NS5A mutation and SNP IL-28B in HIV-HCV coinfection is still unclear. The aim of the study is to determine the role of HCV NS5A-ISDR/PKR-BD mutation and SNP IL-28 polymorphism on the successfulness of Peg-IFN/RBV therapy in HCV-HIV coinfection.
Methods: prospective cohort was performed in this study. Plasma sample were obtained from 30 and 8 patients with HCV-HIV coinfection and HCV monoinfection, respectively. PCR nucleotide sequencing was performed after RNA virus extraction and cDNA synthesis. Protein secondary structure and prediction of mutation function were analyzed using PredictProtein (PP) program.
Results: sixteen HCV-HIV coinfected patients and none from eight HCV patients achieved sustained virological response (SVR). ≥1 non-neutral mutation was found in 24/30 HCV-HIV coinfection and more frequent in SVR group (14 patients). ≥1 non-neutral mutation were found statistically significant for overall SVR achievement (p<0.05) in all patients regardless of coinfection or monoinfection status. Of the 27 HCV-HIV coinfected patients with CC-gene, 21 subjects had non-neutral mutation. The structure which was expected as NS5A binding site structure was different from consensus (wild type) in SVR group, while the structure was similar to consensus in non-SVR group.
Conclusion: having ≥1 non-neutral mutation was associated with SVR achievement in Peg-IFN/RBV therapy, regardless of monoinfection and coinfection status.
Latar belakang: infeksi HIV mempercepat progresifitas penyakit pada penderita hepatitis C dan menurunkan angka keberhasilan terapi Peg-IFN/RBV. Mutasi VHC pada regio NS5A-ISDR/PKR-BD meningkatkan hasil luaran yang lebih baik pasien monoinfeksi VHC yang diterapi dengan Peg-IFN/RBV. Polimorfisme SNP IL-28B diprediksi memiliki efek terhadap evolusi quasispecies VHC. Akan tetapi, peran mutasi NS5A dan SNP IL-28B pada koinfeksi VHC-HIV masih belum jelas. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui peran mutasi VHC NS5A-ISDR/PKR-BD dan polimorfisme SNP IL-28B terhadap keberhasilan terapi Peg-IFN/RBV pada koinfeksi VHC-HIV. Metode: studi ini menggunakan desain studi kohort prospektif. Sampel plasma dikumpulkan dari 30 pasien koinfeksi VHC-HIV dan 8 monoinfeksi VHC. Sekuensing nukleotida PCR dilakukan setelah proses ekstraksi RNA dan sintesis cDNA. Analisis struktur sekunder dan prediksi fungsi mutasi menggunakan program PredictProtein(PP). Hasil: sebanyak 16 pasien koinfeksi VHC-HIV mencapai SVR. Tidak ada pasien monoinfeksi yang mencapai SVR. Mutasi nonnetral ≥1 ditemukan pada 24/30 pasien koinfeksi dan lebih sering ditemukan pada kelompok SVR (14 pasien). Mutasi nonnetral ≥1 ditemukan bermakna secara statistik terhadap status SVR (p<0,05), terlepas dari status koinfeksi ataupun monoinfeksi. Dari 27 pasien koinfeksi yang memiliki gen CC, sebanyak 21 pasien memiliki mutasi nonnetral. Struktur yang diduga sebagai binding site didapatkan berbeda dibanding konsensus pada kelompok SVR, sedangkan pada kelompok non-SVR struktur tersebut sama dengan konsensus. Kesimpulan: mutasi nonnetral ≥1 berhubungan dengan tercapainya SVR pada terapi Peg-IFN/RBV, terlepas dari status monoinfeksi atau koinfeksi.