Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Riset pencarian senyawa bioaktif yang memiliki aktivitas penghambatan terhadap enzim elastase dan antioksidan dalam menunda proses penuaan pada kulit terus diupayakan agar dapat dikembangkan menjadi kandidat agen anti-aging yang potensial. Tanaman mabolo (Diospyros blancoi A. DC.) merupakan tanaman asli Indonesia yang belum banyak dieksplorasi pemanfaatannya baik secara tradisional maupun ilmiah sebagai anti-aging. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif dari ekstrak metanol daun (EDM) atau ekstrak metanol kulit batang (EKM) tanaman mabolo yang memiliki aktivitas anti-elastase dan antioksidan teraktif. Ekstraksi daun dan kulit batang dengan pelarut metanol mengggunakan ultrasound assisted-extraction (UAE). Aktivitas anti-elastase dan antioksidan dari tiap ekstrak, fraksi, subfraksi, dan isolat dievaluasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa EKM memiliki aktivitas anti-elastase dan antioksidan lebih kuat dibanding EDM meskipun keduanya memiliki aktivitas yang sangat kuat dibawah 50 µg/mL. EKM sebagai ekstrak teraktif dilanjutkan fraksinasi padat-cair dan menghasilkan fraksi etil asetat kulit batang mabolo (FEKM) yang memiliki aktivitas anti-elastase dan antioksidan paling kuat dibandingkan dengan fraksi metanol kulit batang mabolo (FMKM) maupun fraksi heksan kulit batang mabolo (FHKM). FEKM sebagai fraksi teraktif difraksinasi lebih lanjut dengan kromatografi kolom menghasilkan 16 subfraksi etil asetat kulit batang mabolo (SEKM A-SEKM P). Hasil identifikasi isolat melalui FTIR dan NMR dibandingkan terhadap literatur. Isolat DB1 yang diperoleh dari isolasi SEKM N diduga asam galat, sedangkan isolat DB2 yang diperoleh dari isolasi SEKM L dan SEKM N diduga asam betulinat. Aktivitas anti-elastase isolat DB2 [IC50 = 8,62 µg/mL (18,88 µM)] lebih kuat dibanding DB1 (IC₅₀ = 93,35 µg/mL (548,70 µM)]. Akan tetapi, aktivitas antioksidan isolat DB1 lebih kuat dibanding isolat DB2. Sementara itu, aktvitas antielastase isolat DB2 menunjukkan jenis inhibisi unkompetitif secara in vitro. Hasil interaksi secara in silico diprediksi isolat DB2 menghambat bukan pada sisi aktif enzim elastase (1B0F) dengan energi bebas ikatan sebesar -5,85 kcal/mol.

---

Studies on the discovery of bioactive compounds that have inhibitory activity against elastase enzymes and antioxidants in delaying the skin's aging process are still being explored so that potential anti-aging agents could be developed. The mabolo plant (Diospyros blancoi A. DC.) is a native Indonesian plant that has not been widely explored for its traditional and scientific uses as anti-aging. This study aimed to identify bioactive compounds from leaf methanol extract (EDM) or stem bark methanol extract (EKM) of the mabolo plant that have the most active anti-elastase and antioxidant activities. Extraction of leaves and stem bark with methanol solvent using ultrasound assisted-extraction (UAE). Both the anti-elastase and antioxidant activities of each extract, fraction, subfraction, and isolate were evaluated. The results showed that EKM had stronger anti-elastase and antioxidant activities than EDM although both had very strong activities below 50 µg/mL. EKM as the most active extract was followed by solid-liquid fractionation and resulted in ethyl acetate fraction of mabolo stem bark (FEKM) which had the strongest anti-elastase and antioxidant activities compared to methanol fraction of mabolo stem bark (FMKM) and hexane fraction of mabolo stem bark (FHKM). FEKM as the most active fraction was further fractionated by column chromatography to obtain 16 ethyl acetate subfractions of mabolo stem bark (SEKM A - SEKM P). The results of isolate identification by FTIR and NMR were compared to the literature. Isolate DB1 obtained from SEKM N isolation was considered gallic acid, while isolate DB2 obtained from SEKM L and SEKM N isolation was considered betulinic acid. The anti-elastase activity of isolate DB2 [IC50 = 8.62 µg/mL (18.88 µM)] was stronger than DB1 (IC50 = 93.35 µg/mL (548.70 µM)]. However, the antioxidant activity of isolate DB1 was stronger than isolate DB2. Meanwhile, the anti-elastase activity of isolate DB2 showed an uncompetitive type of inhibition in vitro. In silico interaction results predicted DB2 isolate inhibits not on the active side of the elastase enzyme (1B0F) with a binding free energy of -5.85 kcal/mol."

"Acetogenin Annonaceous adalah senyawa bioaktif hadir dalam daun Annona muricata. Dalam penelitian ini, isolasi senyawa asetogenin dilakukan dengan menggunakan tiga-fase kromatografi kolom terbuka pada ekstrak daun sirsak, fraksi F005. Melalui isolasi kromatografi kolom terbuka, senyawa asetogenin dalam fraksi dapat dipisahkan sehingga dapat digunakan sebagai senyawa standar murni untuk analisis kuantitatif. Kedde reagen ditambahkan, yang bereaksi terhadap kelompok lakton asetogenin, untuk memilih fraksi yang kaya akan senyawa asetogenin. Fraksi yang mengandung asetogenin hasil isolasi kolom terbuka dianalisis secara kualitatif dengan High Performance Liquid Chromatography (HPLC) dan Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR). Pengamatan dengan HPLC menunjukkan bahwa fraksi F005, isolat dari tahap kedua dan ketiga isolasi, yang dipilih oleh reagen Kedde, terbukti mengandung senyawa asetogenin sebagai berikut: bullatacin, squamocin, squamostatin-A, dan squamostatin-D. Hasil analisis kualitatif FTIR memperkuat keberadaan senyawa asetogenin dengan puncak serapan pada bilangan gelombang 1.750 cm-1, yang merupakan puncak serapan untuk kelompok lakton asetogenin. Isolasi dengan kolom HPLC menghasilkan bullatacin yang dapat digunakan sebagai senyawa standar untuk analisis kuantitatif senyawa asetogenin lain yang terkandung dalam fraksi daun sirsak.

---

Annonaceous acetogenin are bioactive compounds present in the leaves of Annona muricata. In this study, the isolation of compounds asetogenin performed using three-phase open column chromatography on soursop leaf extract, fractions F005. Through a simple open-column chromatography isolation, acetogenin compounds in these fractions can be separated so that it can be used as a pure standard compounds for quantitative analysis. Kedde reagent is added to select the content-rich fraction acetogenin compounds, which react to the acetogenin lactone group. Fractions containing isolate of acetogenin were analyzed qualitatively using High Performance Liquid Chromatography (HPLC) and Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR). Observations by HPLC showed that the fraction of F005, the isolates from second and third stages of isolation, which are selected by Kedde, shown to contain asetogenin compounds as follows: bullatacin, squamocin, squamostatin-A, and squamostatin-D. FTIR results reinforce the existence of acetogenin compound with the absorption peak at the wave number 1750 cm-1, which is the absorption peak for the acetogenin lactone group. Isolation with HPLC columns produced bullatacin that can be used as a standard compound for quantitative analysis of other acetogenin compounds contained in the fraction of soursop leaves."

"Ekstraksi senyawa bioaktif menggunakan Deep Eutectic Solvent (DES) semakin masif digunakan karena memiliki toksisitas rendah, biodegradable, mudah disintesis, dapat diatur polaritas serta selektivitasnya sesuai kebutuhan, dan aman bagi lingkungan jika dibandingkan dengan pelarut organik. Sintesis DES dari pencampuran Hidrogen Bond Acceptor (HBA) dan Hidrogen Bond Donor (HBD) akan memberikan jenis yang beragam sehingga sulit untuk menentukan campuran DES yang akan memberikan hasil ekstraksi terbaik. Penelitian ini menggunakan mangostin sebagai representatif dari ribuan senyawa bioaktif dan difokuskan untuk mencari korelasi antara polaritas DES dengan hasil ekstraksi menggunakan Nile Red sebagai parameter kepolaran. Hipotesis dari korelasi tersebut akan diuji pada senyawa bioaktif lainnya yaitu (kuersetin, rutin, polifenol, fenolik), ekstraksi cair-cair (asam palmitat), dan ekstraksi cair-gas (CO2) Penelitian ini menggunakan data sekunder untuk mendapatkan data yang ekstensif terkait hasil ekstraksi senyawa bioaktif alfa-mangostin, kuersetin, rutin, polifenol, fenolik, asam palmitat, dan CO2 menggunakan DES dan data polar parameter Nile Red (Enr). Selanjutnya, akan dilakukan uji polaritas DES jika data polaritas yang tidak tersedia pada literatur. Hasil akhir menunjukkan adanya korelasi kuadratik yang ditunjukkan oleh kurva regresi maupun secara kuantitatif yang ditunjukkan dari nilai regresi kuadratik antara hasil esktraksi dengan polaritas DES.

---

Extraction of bioactive compounds using Deep Eutectic Solvent (DES) has emerged as a highly promising category of green solvents due to the low toxicity, biodegradable, easy to synthesize, and considered safe for the environment compared to organic solvents. The synthesis of DES from mixing Hydrogen Bond Acceptor (HBA) and Hydrogen Bond Donor (HBD) has provided various types, making it difficult to determine the DES mixture that will give the best extraction yield. This study used mangosteen as a representative of thousands of bioactive compounds and focused on finding the correlation between the polarity of DES and the extraction using Nile Red as a polarity parameter. The hypothesis of the correlation will be tested on other bioactive compounds (quercetin, rutin, polyphenols, phenolics), liquid-liquid extraction (palmitic acid), and liquid-gas extraction (CO2). This study uses secondary data to obtain extensive data regarding the extraction results of the bioactive compounds alpha-mangosteen, quercetin, rutin, polyphenols, phenolics, palmitic acid, and CO2 using DES and data on polar parameters Nile red (Enr). Furthermore, the polarity value of DES (Enr) will be carried out through experimental research if the polarity data are not available in the literature. The final result qualitatively shows that there is a quadratic correlation based on the curve as well as quantitatively which is indicated by the value of the quadratic correlation between the extraction yield and the polarity of DES (Enr)

"

"Kuinolin adalah senyawa heterosiklik yang derivatnya memiliki berbagai aktivitas biologis seperti antibakteri dan antioksidan. Struktur kuinolin telah dibentuk dari prekursor isatin dan etil asetoasetat melalui reaksi Pfitzinger pada suasana asam. Dari turunan kuinolin tersebut dibentuk struktur kuinolin benzimidazol melalui reaksi tanpa pelarut dengan o-fenilendiamin. Selain itu, dibentuk senyawa turunan kuinolin hidrazon melalui reaksi dengan hidrazin hidrat diikuti aldehid aromatik. Sebagai variasi digunakan tiga jenis aldehid aromatik yaitu: benzaldehid, 4-hidroksibenzaldehid, dan trans-sinamaldehid. Keempat senyawa yang terbentuk dikarakterisasi menggunakan kromatografi lapis tipis (KLT), uji titik leleh, FTIR, LC-MS, dan spektrofotometri UV-Vis. Uji aktivitas antioksidan dan antimikroba dilakukan untuk mengetahui bioaktivitas senyawa yang telah disintesis. Pengujian aktivitas antioksidan menggunakan metode DPPH sedangkan uji aktivitas antimikroba menggunakan metode difusi cakram. Hasil uji antioksidan menunjukkan aktivitas antioksidan yang lemah pada semua senyawa bila dibandingkan dengan asam askorbat. Senyawa 3, yang disintesis dari 4-hidroksibenzaldehid, memiliki aktivitas antioksidan paling baik dengan nilai IC50 sebesar 843,52 ppm. Nilai IC50 senyawa 1, 2, dan 4 berturut-turut adalah 4784,66; 4343,97; dan 3612,62 ppm. Uji antimikroba terhadap bakteri Escherichia coli dan Staphylococcus aureus menunjukkan bahwa semua senyawa yang disintesis tidak memiliki aktivitas antimikroba pada rentang konsentrasi uji 75–1000 ppm.

---

Quinoline and its derivatives are known to possess various biological activities such as antibacterial and antioxidant activity. In this work, quinoline moiety was formed from isatin and ethyl acetoacetate by Pfitzinger reaction under acidic conditions. Quinoline benzimidazole derivative was synthesized from quinoline derivative and o-phenylenediamine via solvent-less reaction. In addition, quinoline hydrazone derivatives were formed by the reaction of quinoline derivative with hydrazine hydrate and aromatic aldehyde. Benzaldehyde, 4-hydroxybenzaldehyde, and trans-cinnamaldehyde were used separately as aromatic aldehyde in this experiment. The four compounds formed were characterized by thin-layer chromatography (TLC), melting point measurement, FTIR, LC-MS, and UV-Vis spectrophotometry. The synthesized compounds were evaluated for their antimicrobial and antioxidant activity. Antioxidant and Antimicrobial activity were evaluated by DPPH assay and disc diffusion method, respectively. All compounds showed weak antioxidant activity compared to ascorbic acid. Compound 3 showed the best antioxidant activity (IC50 = 843.52 ppm). The IC50 values ​​for compounds 1, 2, and 4 were 4784.66, 4343.97, and 3612.62 ppm, respectively. All synthesized compounds did not have any antimicrobial activity against Escherichia coli and Staphylococcus aureus in a concentration range of 75–1000 ppm."

"Senyawa turunan tiosemikarbazon merupakan senyawa yang mempunyai aktivitas biologis yang baik, yaitu sebagai antioksidan, antitumor, dan antimikroba. Pada penelitian kali ini, telah dilakukan sintesis senyawa turunan tiosemikarbazon dengan menggunakan limonen dan empat senyawa aldehid aromatik yang berbeda yaitu benzaldehid, 4-hidroksibenzaldehid, sinamaldehid, dan vanilin. Produk akhir senyawa turunan tiosemikarbazon yang terbentuk diidentifikasi menggunakan KLT serta dikarakterisasi menggunakan Fourier Transform Infrared spectroscopy (FTIR), Spektrofotometri UV-Vis, dan Gas Chromatography Mass Spectrometry (GC-MS). Produk akhir senyawa turunan tiosemikarbazon diuji aktivitas antioksidannya dengan menggunakan metode 1,1-Difenil-2-pikril-hidrazil (DPPH). Pada penelitian ini diperoleh produk benzaldehid limonen tiosemikarbazon dengan persen rendemen sebesar 58,18%, 4-hidroksibenzaldehid limonen tiosemikarbazon dengan persen rendemen sebesar 49,47%, vanilin limonen tiosemikarbazon dengan persen rendemen sebesar 43,91%, dan sinamaldehid limonen tiosemikarbazon dengan persen rendemen sebesar 73,01%. Kemampuan antioksidan tertinggi diperoleh oleh senyawa vanilin limonen tiosemikarbazon dengan nilai IC50 sebesar 108,8 ppm dan kemampuan antioksidan terendah diperoleh oleh senyawa benzaldehid limonen tiosemikarbazon dengan nilai IC50 sebesar 177,2 ppm.

---

Thiosemicarbazone derivatives are compounds that have good biological activity, such as antioxidant, antitumor, and antimicrobial. In this study, thiosemicarbazones derivative compounds were synthesized using limonene and four different aromatic aldehydes, such as benzaldehyde, 4-hydroxybenzaldehyde, cinnamaldehyde, and vanillin. The final product of the thiosemicarbazone derivatives were identified using TLC and characterized using Fourier Transform Infrared spectroscopy (FTIR), UV-Vis Spectrophotometry, and Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS). The final product of the thiosemicarbazone derivatives were tested for its antioxidant activity using the 1,1-Diphenyl-2-picryl-hydrazyl (DPPH) method. In this study, the products obtained were benzaldehyde limonene thiosemicarbazone with a yield percentage of 58.18%, 4-hydroxybenzaldehyde limonene thiocarbazone with a yield percentage of 49.47%, vanillin limonene thiosemicarbazone with a yield percentage of 43.91%, and cinnamaldehyde limonene thiosemicarbazone with a yield percentage of 73.01%. The highest antioxidant ability was obtained by vanillin limonene thiosemicarbazone with an IC50 value of 108.8 ppm and the lowest antioxidant ability was obtained by benzaldehyde limonene thiosemicarbazone with an IC50 value of 177.2 ppm."

"Resistensi antimikroba adalah salah satu masalah utama yang dihadapi oleh berbagai sektor, dimana masalah ini mengancam efektivitas dari upaya pencegahan dan pengobatan dari penyakit yang disebabkan oleh infeksi mikroba sehingga diperlukan adanya strategi baru untuk mengatasi masalah ini. Salah satu molekul yang secara aktif dipelajari dan dipertimbangkan sebagai strategi alternatif adalah peptida antimikroba yang diproduksi secara alami oleh bakteri yang disebut bakteriosin, terutama yang dihasilkan oleh kelompok Bakteri Asam Laktat (BAL). Penelitian ini bertujuan untuk mengonfirmasi dan mengkarakterisasi bakteriosin dua peptida unik dalam kelas IIb yang diproduksi oleh Streptococcus macedonicus MBF10-2 dengan pendekatan in silico dan konfirmasi sekuens DNA penyandi nonlantibiotiknya. DNA genomik bakteri diesktraksi dari hasil kultur dan gen penyandi nonlantibiotik disekuens dengan metode Sanger. Hasil sekuens dibandingkan dengan sekuens gen penyandi nonlantibiotik hasil Whole Genome Sequencing (WGS) untuk mendeteksi keberadaan mutasi pada sekuens DNA dan asam amino yang dihasilkan. Sekuens asam amino dari kedua peptida kemudian dilakukan pemodelan menggunakan metode de novo, saling ditambatkan, dan divisualisasikan untuk melihat ikatan dan interaksi yang terbentuk. Hasil penambatan Sm1 dengan Sm2 menunjukkan terbentuknya interaksi pada motif A25xxxA29 dan A29xxxG33 dari Sm1, serta S11xxxA15 dan A38xxxA42­ dari Sm2. Penambatan kedua peptida dengan sesamanya menunjukkan terbentuknya interaksi di residu Ala-19, motif G8xxxG12, dan motif A25xxxA29 pada Sm1, serta residu Ala-42, Gly-16, dan motif S11xxxA15 pada Sm2 sehingga diprediksi peptida tunggal sudah memiliki aktivitas inhibisi. Prediksi ini perlu ditelusuri lebih lanjut dengan uji in vitro.

---

Antimicrobial resistance is one of the urgent and growing problems that many sectors are facing which threatens the effectivity of preventive and curative effort on treating diseases caused by microbial infection, thus posing the need to discover a novel strategy in order to tackle the problem. One potential molecule currently being actively studied and considered to be an alternative strategy is an antimicrobial peptide naturally produced by bacteria called bacteriocin, especially those produced by the Lactic Acid Bacteria (LAB) group. This study aims to identify and characterize a unique two-peptide bacteriocin within the class IIb bacteriocin produced by Streptococcus macedonicus MBF10-2 through in silico approach and confirmation of its coding DNA. The bacteria’s genomic DNA was extracted from culture and its bacteriocin-coding DNA was sequenced with Sanger Sequencing method. The sequence result was then compared with the initial Whole Genome Sequencing result to detect any mutation in the DNA and its translated amino acid sequence. The amino acid sequence of the two peptides were then modeled with de novo method, docked with each other, and visualized to see the bonds and interactions formed. The docking result showed interactions within the A25xxxA29 and A­29xxxG33 motifs of Sm1 and the S11xxxA15 and A38xxxA42 motifs of Sm2. Docking of each peptide with its own showed interactions in Ala-19, the G8xxxG12 and A25xxxA29 motifs of Sm1 and Ala-42, Gly-16, and the S11xxxA15 motif of Sm2. These interactions pose the possibility that a single peptide might have an inhibition activity of some degree when working on its own. This possibility should be investigated further through an in vitro test."

"Dalam rangka pencarian aktivitas antimikroba dari aktinomycetes di Papua, sebanyak seratus isolat Actinomycetes yang berasal dari tanah dan serasah dari beberapa ekosistem di Pulau Batanta dan Salawati, Papua Barat telah diuji. Sebanyak 200 ekstrak dari 100 isolat Actinomycetes telah diperoleh melalui dua tahap ekstraksi. Metabolit non polar diekstraksi menggunakan pelarut etil asetat : metanol (4:1), sedangkan metabolit polar diperoleh dari pemekatan medium menggunakan metode kering beku. Berdasarkan hasil pengujian menggunakan metode difusi agar, sebanyak 43 dari 200 ekstrak (21,5%) memiliki aktivitas antimikroba terhadap bakteri dan khamir (Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis NBRC 3134, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Micrococcus luteus NBRC 1367, Candida albicans NBRC 1594, dan Saccharomyces cerevisiae NBRC 10217). Hasil penelitian menunjukkan beberapa ekstrak Actinomycetes memiliki aktivitas anti bakteri gram negatif (1,5%), anti bakteri gram positif (17%), dan anti fungi (17%). Metabolit yang diekstraksi dengan pelarut etil asetat : metanol lebih aktif (35%) dibandingkan dengan pelarut air (17%). Sebanyak lima isolat yang memiliki aktivitas antimikroba tertinggi (BL-13-5, BL-06-5, BL-14-2, BL-22-3, dan Sl-36-1) diidentifikasi berdasarkan data sekuen gen 16S rRNA. Berdasarkan hasil pencarian homologi dengan program BLAST, diperoleh homologi spesies berturut-turut adalah Streptomyces kanamyceticus (92%), Streptomyces verne (92%), Streptomyces narbonensis (92%), Streptomyces malachitofuscus (98%), dan Streptomyces hygroscopicus (96%).

---

In the framework of exploitation of antimicrobial activity of Actinomycetes in Papua, one hundred isolates of Actinomycetes isolated from soil and leaf litter samples from various ecosystems in Batanta and Salawati Island, Raja Ampat, West Papua were screened. We obtained 200 crude extracts from 100 isolates based on two extraction phases. Nonpolar metabolites were extracted by ethyl acetate : methanol (4:1) solvent while the polar metabolites were concentrated using a freeze-drying method. Based on the agar dilution method, a total of 43 from 200(21.5%) crude extracts have antimicrobial activity against bacteria and yeasts (Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis NBRC 3134, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Micrococcus luteus NBRC 1367, Candida albicans NBRC 1594 and Saccharomyces cerevisiae NBRC 10217). Some crude extracts showed anti-Gram negative (1.5%), anti-Gram positive (17%) and antifungal (17%) activities. Crude metabolites which were extracted using ethyl acetate : methanol were more effective on antimicrobial activity (35%) compared with water extraction (17%). Five most potential isolates (BL-13-5, BL-06-5, BL-14-2, BL-22-3, and Sl-36-1) were identified based on 16S rRNA gene sequence data. Sequence similarity search by BLAST program revealed that they show sequence similarities to Streptomyces kanamyceticus (92%), Streptomyces verne (92%), Streptomyces narbonensis (92%), Streptomyces malachitofuscus (98%), and Streptomyces hygroscopicus (96%), respectively."