Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 144829 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Widya Setyaningtyas
Pengaruh mutasi Southeast Asian Ovalocytosis (SAO) dan thalassemia α (alfa) terhadap penderita defisiensi enzim G6PD (Glucose-6-Phosphate-Dehydrogenase) = Southeast Asian Ovalocytosis (SAO) and α (alfa) thalassemia mutation effect on people with G6PD (Glucose-6-Phosphate-Dehydrogenase) enzyme deficiency
"Southeast Asian Ovalocytosis (SAO), thalassemia α, serta defisiensi enzim G6PD (Glukosa-6-Fosfat Dehidrogenase) merupakan kelainan sel darah merah yang terjadi akibat adanya mutasi. Kelainan sel darah merah tersebut banyak ditemukan pada daerah endemik malaria. Hal tersebut diduga terkait dengan adanya mekanisme proteksi terhadap parasit malaria. Penelitian bertujuan untuk mengetahui frekuensi penderita SAO, thalassemia α, G6PDd/SAO dan G6PDd/thalassemia α.
Metode deteksi yang dilakukan yaitu dengan pengamatan morfologi eritrosit, perhitungan sel darah total (CBC), serta biologi molekuler menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR). Berdasarkan hasil PCR, didapatkan frekuensi penderita SAO sebesar 11,4%, thalassemia α sebesar 15,2%, G6PDd/SAO sebesar 0,8%, serta penderita G6PDd/thalassemia α sebesar 0,32%. Manifestasi klinis dapat dilihat dari nilai perhitungan sel darah total (CBC) penderita G6PDd/SAO dan G6PDd/thalassemia α yang cenderung rendah.
Southeast Asian Ovalocytosis (SAO), α thalassemia, and G6PD (Glucose-6-Phosphate- Dehydrogenase) enzyme deficiency are red blood cell disorders that occur due to mutations in the DNA. These red blood cell disorders are commonly found in malaria endemic areas. That lead to the asumption that may provide protection against malaria parasite. The research done in order to determine the frequency of SAO, α thalassemia, G6PDd/SAO, and also G6PDd/ α thalassemia.
Detection method used by erythrocytes morphological observation and also from haematological profile. In addition, for more accurate result used moleculer method detection by Polymerase Chain Reaction (PCR). Based on PCR, result showed frequency for SAO 11,4%, α thalassemia 15,2%, G6PDd/SAO 0,8% , and for G6PDd/ α thalassemia 0,32%. Haematological profile from suffered showed tend to be lower."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2015
S60820
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Lisa Amelia
Identifikasi Polimorfisme Insersi/Delesi Gen Angiotensin-Converting Enzyme (ACE) Pasien Hipertensi Menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) = Identification of Insertion/Deletion Polymorphism on Angiotensin-Converting Enzyme (ACE) Gene in Hypertensive Patients Using Polymerase Chain Reaction (PCR)
"Polimorfisme gen penyandi Angiotensin-Converting Enzyme (ACE) diketahui berasosiasi dengan penyakit hipertensi yang merupakan salah satu masalah global penyebab utama kematian di seluruh dunia, termasuk Indonesia. Salah satu cara mengidentifikasi polimorfisme gen adalah dengan Polymerase Chain Reaction (PCR). Pada penelitian ini bertujuan melakukan perancangan protokol identifikasi polimorfisme dengan PCR dari berbagai literatur, kemudian melakukan identifikasi polimorfisme I/D pada sejumlah sampel relawan, dan menganalisis hasil identifikasi polimorfisme gen ACE terhadap alel insersi (I) maupun delesi (D). Prosedur yang dilakukan pada penelitian ini yaitu melakukan ekstraksi DNA, mengamplifikasi fragmen gen ACE menggunakan PCR, dan memvisualisasi hasil PCR berupa fragmen amplikon menggunakan elektroforesis gel agarosa. Hasil menunjukkan bahwa protokol untuk identifikasi polimorfisme dengan PCR sudah terancang dengan baik. Selain itu, hasil identifikasi polimorfisme gen ACE dari sejumlah sampel menunjukkan bahwa kedua alel I dan D terkonfirmasi alel polimorfisme. Hasil analisis statistik dari jumlah sampel yang diterapkan dalam penelitian ini menunjukkan bahwa tidak ada perbedaan signifikan antara genotipe dengan hipertensi dan non-hipertensi, serta pada alel dengan hipertensi dan non-hipertensi.
Polymorphism of the gene encoding Angiotensin-Converting Enzyme (ACE) is known to be associated with hypertension, which is one of the main global problems causing death worldwide, including Indonesia. One way to identify gene polymorphisms is using Polymerase Chain Reaction (PCR). This study aims to design a protocol for identifying I/D polymorphism with PCR from various literatures, then identify I/D polymorphisms in a number of volunteer samples, and analyze the results of the identification of ACE gene polymorphisms for both the insertion (I) and deletion (D) alleles. The procedures carried out in this study were DNA extraction, amplification of the ACE gene fragment using PCR, and visualizing the PCR results in the form of amplicon fragments using agarose gel electrophoresis. The results showed that the protocol for identifying polymorphisms by PCR was well designed. In addition, the identification of ACE gene polymorphisms from several samples showed that both I and D alleles were confirmed as polymorphism alleles. The statistical analysis results from the number of samples applied in this study showed no significant difference between the genotypes with hypertension and non-hypertension, as well as in the alleles with hypertension and non-hypertension."
Depok: Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 2022
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Rahmawati Kusumastuti Roosadiono
Penggunaan plasmid kompetitor dan plasmid target untuk membandingkan dua metode polymerase chain reaction kuantitatif
"Kuantitasi DNA mitokondria antarjaringan memerlukan suatu metode
yang memiliki tingkat akurasi yang tinggi. Polymerase chain reaction (PCR)
adalah suatu metode enzimatis yang dilakukan untuk memperbanyak
fragmen DNA yang diinginkan. PCR dapat dimanfaatkan untuk kuantitasi
DNA dan disebut teknik PCR kuantitatif. Ada dua macam metode dalam
teknik PCR kuantitatif yang sering digunakan, yaitu metode regresi linier dan
metode koampi ifikasi kompetitif.
Pada penelitian mi telah direkayasa plasmid yang mengandung
fragmen DNA mitokondria termutasi yang berasal dari penderita Leber's
hereditary optic neuropathy (LHON) dan plasmid yang mengandung fragmen
DNA mitokondnia normal. Plasmid-plasmid tersebut masing-masing disebut
plasmid kompetitor dan plasmid target, serta dapat dipergunakan sebagai
DNA kompetitor dan DNA target pada teknik PCR kuantitatif metode
koamplifikasi kompetitif, sedangkan metode regresi tinier hanya
membutuhkan plasmid target. Dengan plasmid tersebut telah diuji tingkat
akurasi antara metode regresi tinier dengan metode koamplifikasi kompetitif.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode koamplifikasi kompetitif memiliki tingkat akurasi yang lebih tinggi dibandingkan dengan metode regresi tinier."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 1997
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Felix
Pengembangan dan pengujian dari purwarupa modul thermal cycler dalam alat PCR portabel = Development and testing of thermal cycler module prototype in portable PCR device
"Tujuan utama dari studi ini adalah untuk mengembangkan sebuah bentuk Thermal cycler yang efektif dan ramah pengguna untuk melaksanakan polymerase chain reaction (PCR) untuk DNA. Karya tulis ini meneliti kemampuan untuk memanufaktur Thermal cycler dengan metode konvensional dan komponen yang umum tersedia untuk mencapai hasil kinerja yang efektif dengan biaya produk yang rendah dibandingkan model yang tersedia secara komersial. Umumnya, thermal cycler menggunakan blok pemanas perak yang berfungsi sebagai wadah pemanas untuk mencapai perbuahan temperatur yang cepat dan keseragaman suhu, tapi Lab-on-a-chip (LoC) dari Polydimethylsiloxane (PDMS) digunakan dibandingkan perak untuk mencapai sifat biocompatibility dengan beragam sampel. Komputer mini Raspberry-Pi digunakan sebagai pengendali untuk mencapai kinerja kendali yang diperlukan sembari menyediakan ruang untuk pengembangan lebih lanjut. Karakterisasi dari proses pemanasan dan PCR dilakukan untuk memagami fenomena perpindahan panas dan kecepatan siklus suhu dalam lingkungan PDMS. Karya tulis ini juga menyertakan analisa dari kecepatan siklus berkaitan dengan parameter kendali dari Thermal cycler yang sudah diproduksi. Pada akhirnya, karakterisasi dan hasil analisa akan menunjukkan kemampuan performa yang telah dicapai thermal cycler.
The ultimate goal of this study is to develop an effective and user-friendly form of Thermal cycler to perform DNA Polymerase Chain Reaction (PCR). This paper research the ability to manufacture a Thermal cycler using conventional methods and readily available components to achieve an effective performance result with low production cost compared with commercially available counterparts. Commonly, Thermal cycler use silver heating block to act as a heating vessel for samples to achieve fast temperatur changes and uniformity in temperatur, but Polydimethysiloxane (PDMS) lab-on-a-chip (LoC) is utilized in contrast to silver as heating vessel in this study to achieve biocompatibility with various samples. Raspberry-Pi pocket computer was utilized as a controller to achieve the necessary control with room for future capabilities addition and improvement. Characterization of the heating and PCR processes was done to understand the heat transfer phenomenon and thermal cycling speed in PDMS environment. This paper also includes analysis of the cycle speed in correspond to the control parameters of the manufactured Thermal cycler. Ultimately, the characterization and analysis results will show the achieved performance capabilities of the Thermal cycler."
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2019
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Elvina Eka Putri Harefa
Efek Paparan Lipopolisakarida pada Sel Punca Pulpa Gigi (hDPSCs) terhadap Ekspresi IL-10 (Analisis in-vitro) = The Effect of Lipopolysaccharide Exposure on IL-10 Expression in Dental Pulp Stem Cells (hDPSCs): An In Vitro Analysis
"Latar Belakang: Banyak penelitian yang berfokus pada peran hDPSCs dalam perkembangan dan pengobatan pulpitis dengan membangun model pulpitis in vitro untuk mensimulasikan lingkungan inflamasi hDPSCs. LPS banyak digunakan dalam model penelitian untuk meniru infeksi pada pulpa. IL-10 memiliki potensi untuk mengubah jalur inflamasi menjadi antiinflamasi dan mendukung proliferasi sel yang berkontribusi pada regenerasi jaringan. Tujuan: Mengamati efek paparan LPS pada hDPSCs terhadap Ekspresi IL-10. Metode: Penelitian eksperimental laboratorik in vitro dengan pengamatan ekspresi IL-10 menggunakan uji ELISA dengan waktu pengamatan 6, 24, dan 48 jam. Konsentrasi LPS yang digunakan adalah 0,5 μg /mL. Hasil: Ekspresi IL-10 tertinggi terdapat pada kelompok normal 6 jam (13,838 μg /mL) dan terendah pada kelompok normal 24 jam (12,673 μg /mL). Pada hDPSC terpapar LPS, ekspresi IL-10 tertinggi pada kelompok 6 jam dan terendah (13,569 μg /mL) pada kelompok 24 jam (12,697 μg /mL). Tidak terdapat perbedaan signifikan ekspresi IL-10 antara hDPSCs yang terpapar LPS dibandingkan normal pada waktu observasi 6, 24, dan 48 jam (p >0,05). Kesimpulan: Hasil penelitian ini menunjukkan tidak terdapat efek paparan LPS pada hDPSCs terhadap ekspresi IL-10 yang signifikan.
Background: Numerous studies have explored the role of human dental pulp stem cells (hDPSCs) in the development and treatment of pulpitis by establishing in vitro pulpitis models to simulate the inflammatory environment of hDPSCs. Lipopolysaccharide (LPS) is widely used in research models to mimic pulp infections. IL-10 has the potential to shift inflammatory pathways toward anti-inflammatory responses and support cell proliferation, contributing to tissue regeneration. Objective: To observe the effect of LPS exposure on IL-10 expression in hDPSCs. Methods: This study was an in vitro laboratory experiment investigating IL-10 expression using ELISA assays at observation times of 6, 24, and 48 hours. The LPS concentration applied was 0.5 μg/mL. Results: The highest IL-10 expression was found in the normal 6-hour group (13,838 μg/mL) and the lowest in the normal 24-hour group (12,673 μg/mL). In hDPSCs exposed to LPS, the highest IL-10 expression was in the 6-hour group (13,569 μg/mL) and the lowest in the 24-hour group (12,697 μg/mL). There was no significant differences in IL-10 expression were observed between LPS-exposed hDPSCs and normal group across the observation times (p > 0,05). Conclusion: These findings indicate that LPS exposure does not significantly affect IL-10 expression in hDPSCs."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Elvina Eka Putri Harefa
Efek Paparan Lipopolisakarida pada Sel Punca Pulpa Gigi (hDPSCs) terhadap Ekspresi IL-10 (Analisis in-vitro) = The Effect of Lipopolysaccharide Exposure on IL-10 Expression in Dental Pulp Stem Cells (hDPSCs): An In Vitro Analysis
"Latar Belakang: Banyak penelitian yang berfokus pada peran hDPSCs dalam perkembangan dan pengobatan pulpitis dengan membangun model pulpitis in vitro untuk mensimulasikan lingkungan inflamasi hDPSCs. LPS banyak digunakan dalam model penelitian untuk meniru infeksi pada pulpa. IL-10 memiliki potensi untuk mengubah jalur inflamasi menjadi antiinflamasi dan mendukung proliferasi sel yang berkontribusi pada regenerasi jaringan. Tujuan: Mengamati efek paparan LPS pada hDPSCs terhadap Ekspresi IL-10. Metode: Penelitian eksperimental laboratorik in vitro dengan pengamatan ekspresi IL-10 menggunakan uji ELISA dengan waktu pengamatan 6, 24, dan 48 jam. Konsentrasi LPS yang digunakan adalah 0,5 μg /mL. Hasil: Ekspresi IL-10 tertinggi terdapat pada kelompok normal 6 jam (13,838 μg /mL) dan terendah pada kelompok normal 24 jam (12,673 μg /mL). Pada hDPSC terpapar LPS, ekspresi IL-10 tertinggi pada kelompok 6 jam dan terendah (13,569 μg /mL) pada kelompok 24 jam (12,697 μg /mL). Tidak terdapat perbedaan signifikan ekspresi IL-10 antara hDPSCs yang terpapar LPS dibandingkan normal pada waktu observasi 6, 24, dan 48 jam (p >0,05). Kesimpulan: Hasil penelitian ini menunjukkan tidak terdapat efek paparan LPS pada hDPSCs terhadap ekspresi IL-10 yang signifikan.
Background: Numerous studies have explored the role of human dental pulp stem cells (hDPSCs) in the development and treatment of pulpitis by establishing in vitro pulpitis models to simulate the inflammatory environment of hDPSCs. Lipopolysaccharide (LPS) is widely used in research models to mimic pulp infections. IL-10 has the potential to shift inflammatory pathways toward anti-inflammatory responses and support cell proliferation, contributing to tissue regeneration. Objective: To observe the effect of LPS exposure on IL-10 expression in hDPSCs. Methods: This study was an in vitro laboratory experiment investigating IL-10 expression using ELISA assays at observation times of 6, 24, and 48 hours. The LPS concentration applied was 0.5 μg/mL. Results: The highest IL-10 expression was found in the normal 6-hour group (13,838 μg/mL) and the lowest in the normal 24-hour group (12,673 μg/mL). In hDPSCs exposed to LPS, the highest IL-10 expression was in the 6-hour group (13,569 μg/mL) and the lowest in the 24-hour group (12,697 μg/mL). There was no significant differences in IL-10 expression were observed between LPS-exposed hDPSCs and normal group across the observation times (p > 0,05). Conclusion: These findings indicate that LPS exposure does not significantly affect IL-10 expression in hDPSCs."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Hanun Qurrota A`yun
Deteksi Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) menggunakan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) Gen nuc dan mecA = Detection of Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus by Polymerase Chain Reaction (PCR) Amplification of nuc and mecA Genes
"Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) merupakan strain Staphylococcus aureus yang resistan antibiotik β-laktam. Penelitian deteksi MRSA dilakukan menggunakan metode PCR dengan amplifikasi gen nuc dan mecA. Sampel diambil dari usapan nasofaring 161 orang dewasa ≥50 tahun. Uji sensitivitas antibiotik juga dilakukan untuk mengetahui resistansi pada isolat MRSA. Fragmen DNA untuk gen nuc dan mecA terdeteksi dengan ukuran 255 bp dan 527 bp. Sebanyak 12 sampel (7,5%) dideteksi sebagai MRSA dan diketahui resistan terhadap antibiotik oxacillin dan cefoxitin dari golongan β-laktam. Variasi resistansi pada isolat MRSA terlihat pada antibiotik erythromycin, tetracycline, gentamicin, chloramphenicol dan trimethophim/sulfametoxazole. Hasil penelitian mengindikasikan kolonisasi MRSA dapat dideteksi dengan amplifikasi gen nuc dan mecA.
Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a strain of Staphylococcus aureus that is resistant to β lactame antibiotics. Detection of MRSA was conducted by amplification of nuc and mecA genes using PCR method. Samples were taken from nasopharyngeal swab from 161 adult ≥ 50 years old. Susceptibility test was also done by disc diffusion to determine resistance characteristic in MRSA isolates. DNA fragment for nuc and mecA genes was detected in 255 bp and 527 bp. About 12 MRSA isolates (7,5%) showed resistance toward oxacillin and cefoxitin which belong to β lactame antibiotics. There were variety of resistance in MRSA isolates to other antibiotics, such as erythromycin, tetracycline, gentamicin, chloramphenicol, and trimethophim/sulfametoxazole. The results indicate that amplification of nuc and mecA genes by PCR can be used for MRSA detection from nasopharyngeal swab."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2014
S56009
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Eka Octaviani Budiningtyas
Uji diagnostik metode Real-Time Multiplex Polymerase Chain Reaction Strip terhadap Real-Time Polymerase Chain Reaction Tunggal untuk deteksi Multi-Patogen pada uveitis : analisis Humor Akuos = Diagnostic study of Real-Time Multiplex Polymerase Chain Reaction Strip assay in comparison with Single Real-Time Polymerase Chain Reaction for Multi-Pathogen detection in uveitis : Aqueous Humor analysis
"Latar Belakang: Uveitis infeksi di Indonesia berkisar antara 30-60% dari total kasus uveitis. Identifikasi patogen etiologi infeksi sangat penting agar dapat diberikan terapi antimikroba yang sesuai dengan segera sehingga komplikasi kebutaan dapat diminimalisir. Dewasa ini, perkembangan teknologi biologi molekuler menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) untuk deteksi uveitis infeksi sedang berkembang pesat.
Tujuan: Melakukan uji validasi diagnostik pada metode PCR Multiplex dibandingkan dengan metode PCR Tunggal.
Metodologi: Uji diagnostik untuk menentukan sensitivitas dan spesifisitas dari alat Real-Time PCR Multiplex terhadap PCR Tunggal dari spesimen cairan intraokular humor akuos yang diambil dari parasentesis bilik mata depan. Dilakukan pemeriksaan PCR terhadap patogen Mycobacterium tuberculosis (M.tuberculosis), Toxoplasma gondii (T.gondii), Herpes Simplex Virus (HSV), Varicella Zoster Virus (VZV), Cytomegalovirus, dan Treponema pallidum.
Hasil: Dilakukan analisis uji diagnostik pada 46 subjek penelitian. Didapatkan hasil sensitivitas sebesar 57.14% dan spesifisitas sebesar 100%. Positivity rate terbanyak didapatkan untuk patogen VZV (n=4), dan tidak didapatkan hasil positif terhadap deteksi patogen M.tuberculosis. Patogen T.pallidum berhasil dideteksi sebanyak 4.34% (n=2) oleh PCR Multiplex.
Kesimpulan: Metode PCR Multiplex pada penelitian ini memiliki sensitivitas yang rendah dengan spesifisitas yang tinggi. Hasil positif pada PCR Multiplex dapat bermanfaat untuk mendiagnosis pasien dengan uveitis infeksi.
Background: In Indonesia, infectious uveitis represents 30-60% of the country’s total uveitis cases. The identification of etiological pathogens is imperative to immediately select and administer the appropriate antimicrobial therapy in infectious uveitis, thereby complications of blindness can be minimized. Currently, the development of molecular biology technology using the Polymerase Chain Reaction (PCR) method for detection of infectious uveitis pathogens is growing rapidly.
Objective: To compare the diagnostic validation test results of the Multiplex PCR method and Single PCR method.
Method: Diagnostic test to determine the sensitivity and specificity of the Multiplex Real-Time PCR device against the Single PCR of aqueous humor intraocular fluid specimens taken from anterior chamber paracentesis. PCR examinations were carried out to identify the pathogens of Mycobacterium tuberculosis (M.tuberculosis), Toxoplasma gondii (T.gondii), Herpes Simplex Virus (HSV), Varicella Zoster Virus (VZV), Cytomegalovirus, dan Treponema pallidum.
Result: A diagnostic test analysis was performed on 46 study subjects. The results obtained 57.14% sensitivity and 100% specificity. Highest positivity rate was obtained for VZV pathogens, while positive results were not obtained for M.tuberculosis. There were 4.34% of subjects (n = 2) of T. pallidum were detected by PCR Multiplex. 
Conclusion: The PCR Multiplex method in this study has low sensitivity with high specificity. A positive result on Multiplex PCR can be useful for diagnosing patients with infectious uveitis."
Depok: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia , 2020
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Muhamad Rifky Aditya
Proyek CAMPER (chip analisis mini untuk polymerase chain reaction): desain dan realisasi = Project CAMPER (mini analysis chip for polymerase chain reaction): design and realization
"ABSTRAK
CAMPER merupakan perangkat chip mini sebagai lokasi proses Polymerase Chain Reaction dalam proses penguatan DNA (DNA amplification). Penguatan DNA tersebtu dibutuhkan dalam identifikasi dan diagnosis rantai DNA tertentu. Dengan proses ini, DNA dapat dihasilkan dalam jumlah yang besar dengan waktu yang relatif singkat dibandingkan dengan proses yang dihasilkan pada laboratorium konvensional. Penerapan PCR banyak dilakukan di bidang biokimia dan biologi molekular karena relatif murah dan hanya memerlukan jumlah sampel yang kecil. Dalam proses PCR memerlukan jalur putaran agar panas dapat merambat pada fluida yang mengalir secara berulang. Sumber panas pada CAMPER menggunakan pengaturan 3 suhu berbeda yaitu 90 °C, 75 °C, dan 55 °C. Penelitian ini membahas mengenai perancangan, fabrikasi, dan pengukuran geometri dari CAMPER. CAMPER terbuat dari bahan PDMS yang dipilih karena bahan ini idak beracun dan baik digunakan dalam dunia medis. CAMPER direaliasikan dengan teknik molding yang mana Molding PDMS dilakukan pada cetakan yang telah dibentuk menggunakan metode milling. Dimensi yang telah dirancang untuk ketiga desain saluran mikro sebesar 250 x 250 μm (lebar x tinggi). CAMPER terdiri dari 3 desain saluran mikrofluida berbeda yaitu pada jumlah jalur putaran. Desain untuk produk pertama, yaitu saluran mikro dengan 3 putaran. Desain kedua yaitu desain saluran mikro dengan 5 jalur putaran. Desain ketiga yaitu saluran mikro dengan 30 jalur putaran. Desain ini dirancang dengan acuan pada jumlah putaran optimal yaitu 30 ? 40 putaran. Pengukuran geometri hasil fabrikasi dilakukan pada seluruh komponen. Pengukuran meliputi pengukuran lebar dan tinggi dari saluran mikro, pengukuran kekasaran pada PDMS dan cetakan, serta pengukuran sudut kontak pada PDMS. Simulasi dilakukan untuk mendapatkan aliran fluida dan persebaran panas dari sistem yang telah direalisasikan. Hasil menunjukkan bahwa pada simulasi aliran fluida terdapat keseragaman aliran dalam keseluruhan jalur mikro, dan pada simulasi persebaran panas dapat menybarkan panas sesuai suhu yang diatur
ABSTRACT
CAMPER is mini devices based of Polymerase Chain Reaction that serves as an apparatus that can replicate DNA in enzymatic without use some help of organisms. With this technique, DNA can be produced in large quantities by the time is short compared to the process that?s produced on a conventional laboratory. The application of PCR are mostly done in the field of biochemical and molecular biology because relatively inexpensive and only need the number of a small sample. n the process pcr need the round to heat travels in fluid that flows in a recurrent manner. The source of heat in camper use 3 different temperature such as 90 °C, 75 °C, and 55 °C. CAMPER consisting of 3 different design of microfluidic channel that is on the number of the cycle. In the process, PCR need the cycle to travels the heat to fluid flows in a recurrent manner. Research also discussed design, fabrication, and measurement of the geometry. A molding PDMS fabricated in a mold was formed from milling process. The dimensions for the three design micro channels amounting to 250 x 250 μm (width x high). The first CAMPER design, namely micro channels with 3 cycle. The second design is micro channels with 5 cycle. Third Design namely micro channels with 30 the cycle. This design designed with reference on the number of optimal cycle which is 30 ? 40 cycle. The measurement of geometry that the results of fabrication performed on all components. The measurement of covering the measurement of width and height than micro channel, the measurement of roughness on pdms and mold, and measurement of wettability at PDMS surface. Results obtained from simulation fluid flow showed that the speed of the flow of uniforms on all cross section micro channel. The results obtained from simulation heat distribution the temperature desired to reach function polymerase chain reaction can be achieved to the surface of micro channel"
2016
S62673
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Metty Ariani
Pengembangan Metode Deteksi DNA Babi (Sus scrofa) Menggunakan Ekstraksi DNA Otomatis Dan Analisis Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) = The Development of Pig (Sus scrofa) DNA Detection Using Automated DNA Extraction and Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) Analysis
"Penelitian ini mengembangkan metode deteksi spesies babi (Sus scrofa) pada sampel daging campuran menggunakan automasi ekstraksi DNA magLEAD gC. DNA dianalisis menggunakan PCR dan TaqMan probe RT-PCR dengan primer spesifik untuk gen Cytochrome c oxidase I (COI), Cytochrome b (Cytb), dan NADH5 dehydrogenase 5 (ND5). Hasil menunjukkan bahwa ekstraksi DNA otomatis menghasilkan konsentrasi DNA 129,4–388,5 ng/μL pada daging mentah dan 66,4–89,5 ng/μL pada bakso dengan rasio kemurnian A260/A280 dan 260/A230 > 1,8. Primer COI, Cytb dan ND5 dapat mendeteksi DNA babi. PCR dan RT-PCR in vitro menunjukkan ketiga primer hanya mendeteksi DNA babi. Efisiensi amplifikasi RT-PCR primer COI, Cytb, dan ND5 adalah 144,14% (R2=0,982), 88,05% (R2=0,998), dan 81,25% (R2=0,997) dengan batas deteksi 0,0001 ng/μL, 0,001 ng/μL, dan 0,001 ng/μL. Primer/probe Cytb dan ND5 mendeteksi bakso dengan campuran daging babi hingga 0,1% (w/w).
This study developed a method to detect pig species (Sus scrofa) in mixed meat samples using automated DNA extraction with the magLEAD gC. DNA was analyzed using PCR and TaqMan probe RT-PCR with specific primers for the genes Cytochrome c oxidase I (COI), Cytochrome b (Cytb), and NADH5 dehydrogenase 5 (ND5). Results showed that automated DNA extraction produced DNA concentrations of 129.4–388.5 ng/μL in raw meat and 66.4–89.5 ng/μL in processed meatballs with purity ratios A260/A280 dan 260/A230 > 1.8. The COI, Cytb and ND5 primers could be used to detect pig DNA. In vitro PCR and RT-PCR showed that all three primers only detected pig DNA. The RT-PCR amplification efficiency for COI, Cytb, and ND5 primers were 144,14% (R2=0,982), 88,05% (R2=0,998), dan 81,25% (R2=0,997) with detection limits of 0.0001 ng/μL, 0.001 ng/μL, and 0.001 ng/μL. The Cytb and ND5 primers/probes detected meatballs with pig meat content as low as 0.1% (w/w)."
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10   >>