Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"SARS-COV-2 merupakan jenis virus yang menyebabkan pandemi COVID-19. Pandemi COVID-19 pertama kali terdeteksi di Wuhan, Cina. Berdasarkan data World Health Organization (WHO), jumlah orang yang telah terpapar COVID-19 adalah 123.216.178 orang dan 2.714.517 orang meninggal akibat COVID-19 berdasarkan data www.who.int pada tanggal 23 Maret 2021. Pada skripsi ini, dilakukan klasifikasi untuk SARS-COV-2 dengan menggunakan sekuens protein dari SARS-COV-2. Sekuens protein SARS-COV- 2 di ekstraksi fitur dengan menggunakan package discere dari Python. Package discere akan menghasilkan 27 fitur, dimana fitur-fitur diseleksi dengan menggunakan metode LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator). Setelah dilakukan seleksi fitur, dilakukan klasifikasi dengan menggunakan dua metode, yaitu metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes dan metode Naïve Bayes. Rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas tertinggi untuk metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes berturut-turut adalah 81,85%, 74,81%, dan 89,19%, sedangkan rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas tertinggi untuk metode Naïve Bayes berturut-turut adalah 81,44%, 74,58%, dan 88,24%. Terlihat bahwa metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes mempunyai rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas yang lebih tinggi dibandingkan dengan metode Naïve Bayes.

---

SARS-COV-2 is the type of virus that causes the COVID-19 pandemic. The COVID-19 pandemic was first detected in Wuhan, China. Based on data from the World Health Organization (WHO), the number of people who have been exposed to COVID-19 is 123,216,178 people and 2,714,517 people died from COVID-19 based on data from www.who.int on March 23, 2021. In this paper, the SARS-COV-2 classification is done by using the protein sequence of SARS-COV-2. The SARS-COV-2 protein sequence will be feature extraction using the discere package from Python. The discere package will produce 27 features, where the features are selected using the LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator) method. After feature selection, classification is carried out using two methods, namely the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method and the Naïve Bayes method. The highest average accuracy, sensitivity, and specificity for the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method are 81.85%, 74.81%, and 89.19%, respectively, whereas the highest average accuracy, sensitivity, and specificity for the Naïve Bayes method are 81.44%, 74.58%, and 88.24%, respectively. It can be seen that the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method has a higher average accuracy, sensitivity, and specificity than the Naïve Bayes method."

"Coronavirus yaitu kelompok virus yang menginfeksi sistem pernapasan yang dapat menyebabkan infeksi pernapasan ringan maupun berat. Salah satu virus yang termasuk ke dalam coronavirus adalah SARS-CoV-2. Penyakit yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 disebut COVID-19. COVID-19 pertama kali terdeteksi pada tahun 2019 di Wuhan, China. Penyebaran COVID-19 sangat cepat dengan tingkat kematian yang tinggi terus terjadi di berbagai negara sehingga penyakit ini berstatus pandemi. Skripsi ini menyelesaikan masalah klasifikasi virus SARS-CoV-2 dengan menggunakan data sekuens protein coronavirus. Seleksi fitur pada data sekuens protein coronavirus menggunakan metode seleksi fitur Random Forest-Recurisive Feature Elimination (RF-RFE). Setelah dilakukan seleksi fitur, dilakukan klasifikasi menggunakan pendekatan machine learning dengan metode Support Vector Machine (SVM) dan Particle Swarm Optimization-Support Vector Machine (PSO-SVM). Hasil terbaik performa rata-rata akurasi, spesifisitas, dan sensitivitas untuk metode SVM berturut-turut adalah 93,43%, 98,06%, dan 88,84% pada data pelatihan sebesar 80%. Untuk metode PSO-SVM, hasil terbaik rata-rata akurasi dan spesifisitas adalah 98,48% dan 98,57% pada data pelatihan sebesar 80%, sedangkan hasil terbaik rata-rata sensitivitas adalah 98,96% pada data pelatihan sebesar 90%. Oleh karena itu, pada penelitian ini dapat disimpulkan bahwa metode PSO-SVM menghasilkan performa yang lebih baik dibandingkan dengan metode SVM.

---

Coronaviruses are a group of viruses that infect the respiratory system that can cause mild or severe respiratory infections. One of the viruses that belongs to the coronavirus is SARS-CoV-2. The disease caused by the SARS-CoV-2 virus is called COVID-19. COVID-19 was first detected in 2019 in Wuhan, China. The spread of COVID-19 is very fast with a high mortality rate that continues to occur in various countries so that this disease has a pandemic status. This thesis solves the problem of classifying the SARS-CoV-2 virus using coronavirus protein sequence data. Feature selection on coronavirus protein sequence data used the Random Forest-Recursive Feature Elimination (RF-RFE) feature selection method. After feature selection, classification is carried out using a machine learning approach with the Support Vector Machine (SVM) and Particle Swarm Optimization-Support Vector Machine (PSO-SVM) methods. The best results of the average performance of accuracy, specificity, and sensitivity for the SVM method are 93.43%, 98.06%, and 88.84%, respectively, for training data of 80%. For the PSO-SVM method, the best results on average accuracy and specificity are 98.48% and 98.57% on training data of 80%, while the best results on average sensitivity are 98.96% on training data of 90%. Therefore, in this study it can be concluded that the PSO-SVM method produces better performance than the SVM method."