Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"

Selama masa pandemi COVID-19, teknologi Automatic Speech Recognition (ASR) menjadi salah satu fitur yang sering digunakan pada komputer untuk mencatat di kelas online secara realtime. Teknologi ini akan bekerja dimana setiap suara yang muncul akan langsung dikenali dan dicatat pada halaman terminal. Dalam penelitian ini, model ASR Wav2Letter akan digunakan menggunakan CNN (Convolution Neural Network) dengan loss function CTC (Connectionist Temporal Classification) dan ASG (Auto Segmentation Criterion). Selama proses pembuatannya, berbagai hyperparameter acoustic model dan language model dari model ASR Wav2Letter terkait dengan implementasi batch normalization¸ learning-rate, window type, window size, n-gram language model, dan konten language model diuji pengaruh variasinya terhadap performa model Wav2Letter. Dari pengujian tersebut, ditemukan bahwa model ASR Wav2Letter menunjukkan performa paling baik ketika acoustic model menggunakan metode ASG dengan learning-rate 9 × 10−5 , window size 0.1, window type Blackman, serta 6-gram language model. Berdasarkan hasil akurasi WER CTC unggul 1,2% dengan 40,36% berbanding 42,11% dibandingkan ASG, namun jika dilihat lamanya epoch dan ukuran file model, loss function ASG memiliki keunggulan hampir dua kalinya CTC, dimana ASG hanya membutuhkan setengah dari jumlah epoch yang dibutuhkan oleh CTC yakni 24 epoch berbanding dengan 12 epoch dan ukuran file model ASG setengah lebih kecil dibandingkan CTC yakni 855,2 MB berbanding dengan 427,8 MB. Pada pengujian terakhir, model ASR Wav2Letter dengan loss function ASG mendapatkan hasil terbaik dengan nilai WER 29,30%. Berdasarkan hasil tersebut, model ASR Wav2Letter dengan loss function ASG menunjukkan perfoma yang lebih baik dibandingkan dengan CTC.

---

During the COVID-19 pandemic, Automatic Speech Recognition technology (ASR) became one of features that most widely used in computer to note down online class in real-time. This technology works by writing down every word in terminal from voice that is recognized by the system. ASR Wav2Letter model will use CNN (Convolutional Neural Network) with loss function CTC (Connectionist Temporal Classification) and ASG (Auto Segmentation Criterion). While developing Wav2Letter, various hyperparameter from acoustic model and language model is implemented such as batch normalization, learning rate, window type, window size, n-gram language model, and the content of language model are examined against the performance of Wav2Letter model. Based on those examination, Wav2Letter shows best performance when it uses ASG loss function learning rate 9 × 10−5 , window size 0.1, window type Blackman, and 6-gram language model. With that configuration, WER of CTC outplay ASG around 1.2% with 40.36% compare to 42,11%, but another parameter shows ASG are way more superior than CTC with less time epoch training which are 24 epoch for CTC against 12 epoch for ASG and the size of memory model shows CTC has bigger size than ASG with 855.2 MB against 427.8 MB. In the last test, ASR Wav2Letter model with ASG loss function get the best WER value around 29.3%. Based on those results, ASR Wav2Letter Model shows its best performance with ASG loss function than CTC.

"

"Kanker kolorektal (KKR) menempati urutan ketiga sebagai kanker penyebab kematian tertinggi di dunia. Diperkirakan sekitar 63% kematian akibat KKR terjadi karena kurangnya screening dan keterlambatan diagnosis. Saat ini metode standar yang digunakan dalam diagnosis KKR adalah kolonoskopi dan biopsi jaringan. Namun metode tersebut memiliki risiko yang tinggi, besifat invasif, serta tidak efisien untuk monitoring perkembangan tumor. Gen Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) telah umum digunakan sebagai marka prognostik KKR, salah satunya melalui studi ekspresi gen pada Circulating Tumor Cells (CTCs). Namun CTC memiliki beberapa kelemahan, seperti konsentrasi yang rendah dan heterogenitas yang beragam. Di sisi lain, serum darah penderita kanker mengandung cell-free Nucleic Acid (cfNA) yang membawa informasi genetik dari jaringan tumor asal. Hal tersebut menjadikan cfNA berpotensi untuk dikembangkan sebagai salah satu metode alternatif untuk diagnosis dan monitoring KKR. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi gen EGFR dari CTC dan serum darah penderita KKR menggunakan metode quantitative PCR with Melting Curve Analysis (qPCR MCA). Penelitian dilakukan terhadap 4 pasien KKR dengan karakteristik dan stadium kanker yang bervariasi. Hasil penelitian menunjukkan gen EGFR terdeteksi pada seluruh sampel serum dan hanya terdeteksi pada 1 sampel CTC. Oleh karena itu, dapat disimpulkan bahwa deteksi biomarker EGFR pada serum memiliki efektivitas yang lebih baik dibandingkan CTC.<

---

Colorectal cancer (CRC) ranks as the third leading cause of cancer death in the world. It is estimated that around 63% of deaths from CRC occur due to lack of screening and delay in diagnosis. Currently, the standard methods used in the diagnosis of CRC are colonoscopy and tissue biopsy. However, this method has a high risk, invasive, and inefficient for tumor monitoring. The Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) has been commonly used as a prognostic marker for CRC through gene expression analysis of Circulating Tumor Cells (CTCs). However, CTC have some limitations such as heterogeneity and low concentrations. On the other hand, the blood serum of cancer patients contains cell-free Nucleic Acid (cfNA) which carries genetic information from the original tumor tissue. Hence, cfNA have great potential to be developed as an alternative method for CRC diagnosis and monitoring. This study aims to detect the EGFR gene from CTC and blood serum of CRC patients using the quantitative PCR with the Melting Curve Analysis (qPCR MCA). The study was conducted on 4 CRC patients with various characteristics and stages of cancer. The results showed that the EGFR gene was detected in all serum samples and only in 1 CTC sample. Therefore, the results suggest that the detection of EGFR biomarkers in serum has better effectiveness than CTC."

"Kanker kolorektal menempati urutan kedua dengan jumlah kasus tertinggi di dunia. Kanker kolorektal dapat dideteksi dengan menggunakan kolonoskopi, namun metode tersebut bersifat invasif. Oleh karena itu, penggunaan liquid biopsy dapat digunakan sebagai metode alternatif karena tergolong semi-invasif. Metode liquid biopsy yang digunakan adalah menggunakan darah dari pembuluh perifer. Di dalam darah terdapat beragam komponen penyusun, salah satunya adalah Circulating Tumor Cells (CTC). Circulating Tumor Cells dapat dikarakterisasi dengan menggunakan penanda spesifik sitokeratin 20 (CK20) karena pendaran ekspresinya yang tinggi pada kanker kolorektal. Proses isolasi CTC dari sampel darah dapat dilakukan dengan bervariasi metode, salah satunya dengan red blood cells lysis (eritrolisis). Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi CTC dengan penanda CK20 dari sampel darah perifer serta mengetahui karakteristik dan jumlah CTC yang diperoleh dari subjek kanker kolorektal di RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo. Pada penelitian ini sampel darah diambil dari lima subjek kanker kolorektal. Untuk mengoptimalisasi hasil isolat CTC yang nantinya diperoleh maka dilakukan spike-in experiment dengan penambahan sel HT-29 ke dalam donor sehat. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa CTC ditemukan di seluruh subjek dengan rata-rata perolehan 6 CTC tunggal dan 1 CTC cluster dari 2 mL darah. Dengan demikian, immunofluorescence dapat digunakan untuk mengarakterisasi tipe morfologinya, yaitu CTC tunggal dan CTC cluster.

---

Colorectal cancer ranks second with the highest number of cases in the world. Colorectal cancer can be detected using colonoscopy, but this method is invasive. Therefore, liquid biopsy can be used as an alternative method because it is classified as semi-invasive. The liquid biopsy method used is using blood from peripheral vessels. In the blood there are various constituent components, one of which is Circulating Tumor Cells (CTCs). Circulating Tumor Cells can be characterized using the specific marker cytokeratin 20 (CK20) due to its high expression in colorectal cancer. The process of isolating CTCs from blood samples can be carried out using various methods, one of which is red blood cells lysis (erythrolysis). This study aims to isolate CTCs with the CK20 marker from peripheral blood samples and determine the characteristics and number of CTCs obtained from colorectal cancer subjects at RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo. In this study, blood samples were taken from five colorectal cancer subjects. To optimize the CTCs isolate results that will be obtained, a spike-in experiment was carried out by adding HT-29 cells to healthy donors. The results of this study showed that CTCs were found in all subjects with an average of 6 single CTCs and 1 cluster CTCs from 2 mL of blood. Thus, immunofluorescence can be used to characterize the morphological types, namely single CTCs and cluster CTCs."

"Latar belakang: CTC sebagai bagian dari liquid biopsy berperan dalam melakukan monitoring pasien kanker payudara yang menjalani terapi. Adanya CTC menjadi pertanda resistensi terapi dan memengaruhi prognosis pasien. Penelitian ini bertujuan melihat adakah perubahan nilai CTC pada pasien kanker payudara stadium lokal lanjut atau lanjut yang mendapatkan kemoterapi serta melihat perubahan nilai CTC tersebut apakah dipengaruhi oleh usia, status menopause, subtipe, metastasis, dan grade.Metode: Didapatkan 30 sampel pasien kanker payudara stadium lokal lanjut atau lanjut yang akan mendapatkan kemoterapi berbasis Anthracycline dan Taxan. Pre kemoterapi pasien diambil darah perifer dan dilakukan pemeriksaan CTC menggunakan flowcytometry dengan antibodi EpCAM. Pasien lalu menjalani siklus kemoterapi hingga lengkap. Setelah itu pasien kembali diambil darah perifer dan diperiksa nilai CTC post kemoterapi.Hasil: Dari ke 30 sampel, didapatkan mean usia 47,93+7.30. Sebanyak 56,7 (n=17) belum menopause, 43,3% status tumor T3 dan T4, status kelenjar getah bening terbanyak adalah N0 dan N1 (43,3%). Hanya 2 pasien yang ditemukan ada metastasis. 56,7% pasien dengan grade 3, dan subtipe terbanyak adalah luminal B ( 63,4%, n=19). Terdapat 22 pasien (73,3%) dengan ER positif, 14 pasien (46,7%) dengan PR positif. Terdapat 11 pasien (36,7%) dengan Her2 positif dan 21 pasien (70%) dengan Ki67 high proliferation. Hasil CTC pre kemoterapi didapatkan nilai median 1460,50 sedangkan CTC post kemoterapi didapatkan nilai median 415,50 dilakukan uji Wilcoxon dan perbedaan bermakna dengan nilai p=0,002. Analisis multivariat regresi linier dihubungkan antara penurunan nilai CTC terhadap usia, status menopause, subtipe, metastasis, dan grading didapatkan status menopause berhubungan bermakna terhadap perubahan nilai CTC (p<0,05).Kesimpulan: CTC pada pasien kanker payudara stadium lokal lanjut dan lanjut setelah kemoterapi lebih rendah bermakna dibandingkan sebelum kemoterapi. Status menopause memiliki hubungan bermakna terhadap penurunan jumlah CTC setelah kemoterapi pada kanker payudara stadium lokal lanjut dan lanjut

---

.

Background: As part of liquid biopsy, CTCs play a role in monitoring breast cancer patients undergoing therapy. The existence of CTCs is a sign of therapy resistance and affects patient prognosis. This study aims to examine whether there are changes in CTC values in patients with locally advanced or advanced breast cancer, who receive chemotherapy and are influenced by age, menopause status, subtype, metastasis, and grade.

Method: Of the 30 samples of locally advanced or advanced breast cancer patients receiving Anthracycline and Taxan-based chemotherapy were obtained. Pre-chemotherapy, peripheral blood, was drawn and CTCs were examined using flow cytometry with EpCAM antibody. Patients then undergo a complete chemotherapy cycle. After that, the patients were again taken peripheral blood and examined for post-chemotherapy CTC values.

Result: The study was conducted at Cipto Mangunkusumo Hospital, started from December 2022 to December 2023. Of the 30 samples with the mean age was 47,93+7,30. A total of 56,7 (n=17) were not menopause, 43,3% of tumor status with the T3 and T4, and the most common lymph node status with the N0 and N1 (43,3%). Only two patients were found to have metastasis. Then, 56,7% of patients had grade 3, and the most common subtype was luminal B (63,4%, n=19). There were 22 patients (73,3%) with ER positive, 14 patients (46,7%) with PR positive, 11 patients (36,7%) with Her2 positive, and 21 patients (70%) with Ki67 high proliferation. Pre-chemotherapy CTC results obtained a median value of 1460.50, Meanwhile, post-chemotherapy CTC obtained a median value of 415,50. Wilcoxon test was performed and the difference was significant with a value of p = 0,002. Multivariate linear regression analysis was correlated between the decrease in CTC values with age, menopause status, subtype, metastasis, and grading. The menopausal status has a significant association with decrease CTC values (p<0,05).

Conclusion: CTC in locally advanced and advanced breast cancer patients after chemotherapy was significantly lower than before chemotherapy. menopause status has a significant association with decreased CTC values after chemotherapy in locally advanced and advanced breast cancer."

"Circulating tumor cell (CTC) adalah sel tumor yang terlepas dan bersirkulasi di pembuluh darah. Kultur CTC dapat bermanfaat untuk menentukan pengobatan yang efektif dan presisi terhadap penyakit kanker. Akan tetapi, hingga saat ini, kultur CTC masih terbatas dilakukan. Kobalt klorida dilaporkan dapat meningkatkan pertumbuhan sel tumor dalam kultur in-vitro. Namun, kobalt klorida belum pernah digunakan dalam mengultur CTC kanker kolorektal. Oleh karena itu, optimasi konsentrasi CoCl2 dalam mengultur CTC kanker kolorektal penting untuk dilakukan. Parameter yang dapat digunakan dalam optimasi tersebut adalah viabilitas dan jumlah agregasi CTC. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan beberapa konsentrasi CoCl2 (100 dan 150 μM) terhadap viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal. Dalam penelitian ini, isolat hasil eritrolisis dikultur dalam medium dengan berbagai konsentrasi CoCl2 (0, 100, dan 150 μM). Kultur kemudian dikonfirmasi dengan immunofluorescence staining menggunakan CK20, PLS3, dan DAPI untuk mengonfirmasi keberadaan CTC kanker kolorektal. Berdasarkan hasil yang diperoleh, ketiga kultur terkonfirmasi mengandung CTC kanker kolorektal. Viabilitas dan jumlah agregasi sel kultur dari yang paling tinggi ke paling rendah teramati pada perlakuan 0, 100, dan 150 μM CoCl2. Berdasarkan penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa penambahan konsentrasi CoCl2 tidak dapat meningkatkan viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal.

---

Circulating tumor cells (CTCs) are tumor cells that have detached from the primary tumor and circulate in the bloodstream. Culturing CTCs can be beneficial in determining the effective and precise treatments for cancer. However, until now, CTCs culture is still very rare to be successfully done. Cobalt chloride has been reported to enhance tumor cell growth in in-vitro culture, but it has not yet been used to culture colorectal CTCs. Therefore, optimizing the concentration of CoCl2 in culturing colorectal CTCs is essential. Parameters that can be used in this optimization include the cell viability and the aggregates number of CTC. This study aims to investigate the effect of adding different concentrations of CoCl2 (100 and 150 μM) on the aggregates number and cell viability of colorectal CTCs. In this study, isolates obtained from erythrolysis were cultured in a medium with various concentrations of CoCl2 (0, 100, and 150 μM). The cultures were then confirmed with immunofluorescence staining using CK20, PLS3, and DAPI to confirm the presence of colorectal cancer CTCs. Based on the results, all three cultures were confirmed to contain colorectal cancer CTCs. The viability and number of cell aggregates in the culture were observed to be highest at 0 μM, followed by 100 μM, and lowest at 150 μM CoCl2. Based on this study, it can be concluded that the addition of CoCl2 concentrations does not increase the viability and number of aggregates of colorectal cancer CTCs."

"Circulating tumor cell (CTC) adalah sel tumor yang terlepas dan bersirkulasi di pembuluh darah. Kultur CTC dapat bermanfaat untuk menentukan pengobatan yang efektif dan presisi terhadap penyakit kanker. Akan tetapi, hingga saat ini, kultur CTC masih terbatas dilakukan. Kobalt klorida dilaporkan dapat meningkatkan pertumbuhan sel tumor dalam kultur in-vitro. Namun, kobalt klorida belum pernah digunakan dalam mengultur CTC kanker kolorektal. Oleh karena itu, optimasi konsentrasi CoCl2 dalam mengultur CTC kanker kolorektal penting untuk dilakukan. Parameter yang dapat digunakan dalam optimasi tersebut adalah viabilitas dan jumlah agregasi CTC. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambahan beberapa konsentrasi CoCl2 (100 dan 150 μM) terhadap viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal. Dalam penelitian ini, isolat hasil eritrolisis dikultur dalam medium dengan berbagai konsentrasi CoCl2 (0, 100, dan 150 μM). Kultur kemudian dikonfirmasi dengan immunofluorescence staining menggunakan CK20, PLS3, dan DAPI untuk mengonfirmasi keberadaan CTC kanker kolorektal. Berdasarkan hasil yang diperoleh, ketiga kultur terkonfirmasi mengandung CTC kanker kolorektal. Viabilitas dan jumlah agregasi sel kultur dari yang paling tinggi ke paling rendah teramati pada perlakuan 0, 100, dan 150 μM CoCl2. Berdasarkan penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa penambahan konsentrasi CoCl2 tidak dapat meningkatkan viabilitas dan jumlah agregasi CTC kanker kolorektal.

---

Circulating tumor cells (CTCs) are tumor cells that have detached from the primary tumor and circulate in the bloodstream. Culturing CTCs can be beneficial in determining the effective and precise treatments for cancer. However, until now, CTCs culture is still very rare to be successfully done. Cobalt chloride has been reported to enhance tumor cell growth in in-vitro culture, but it has not yet been used to culture colorectal CTCs. Therefore, optimizing the concentration of CoCl2 in culturing colorectal CTCs is essential. Parameters that can be used in this optimization include the cell viability and the aggregates number of CTC. This study aims to investigate the effect of adding different concentrations of CoCl2 (100 and 150 μM) on the aggregates number and cell viability of colorectal CTCs. In this study, isolates obtained from erythrolysis were cultured in a medium with various concentrations of CoCl2 (0, 100, and 150 μM). The cultures were then confirmed with immunofluorescence staining using CK20, PLS3, and DAPI to confirm the presence of colorectal cancer CTCs. Based on the results, all three cultures were confirmed to contain colorectal cancer CTCs. The viability and number of cell aggregates in the culture were observed to be highest at 0 μM, followed by 100 μM, and lowest at 150 μM CoCl2. Based on this study, it can be concluded that the addition of CoCl2 concentrations does not increase the viability and number of aggregates of colorectal cancer CTCs."

"Kanker kolorektal (KKR) adalah kanker yang menyerang bagian kolon dan rektum pada usus besar. Kasus KKR menempati posisis keempat di Indonesia. Pada umumnya, KKR didiagnosis menggunakan pemeriksaan standar dengan kolonoskopi, namun metode ini bersifat invasif dan menimbulkan rasa tidak nyaman bagi penderita KKR. Oleh karena itu, diperlukan alternatif yang minim invasif dan mudah dilakukan dengan cara mendeteksi keberadaan Circulating Tumor Cells (CTC) dalam darah. Kelimpahan CTC dalam darah sangat rendah, diperkirakan 1—10 CTC per 10 mL darah, sehingga perlu dilakukan isolasi CTC untuk memperkaya jumlah CTC. Metode yang dapat digunakan untuk mengisolasi CTC, yaitu metode sentrifugasi gradien densitas termodifikasi SepMateTM-15. Dalam mendeteksi CTC diperlukan marker yang memiliki spesifisitas dan sensitivitas baik, serta berasal dari jaringan tumor primer penderita KKR, seperti CK20. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi CTC dengan menggunakan metode gradien densitas termodifikasi SepMateTM-15 dan karakterisasi CTC dengan penanda CK20 dari darah perifer KKR menggunakan Imunofluorosensi. Hasil isolasi CTC menunjukkan seluruh subjek KKR berhasil diisolasi dengan positivitas ≥1 CTC/ mL darah. Single CTC terdeteksi pada subjek 1,2, dan 4. Cluster CTC terdeteksi pada subjek 2,3, dan 5. Diameter rata-rata CTC yang diperoleh 10,82¼m. Sel CTC berhasil dikarakterisasi single CTC dan cluster CTC dengan penanda CK20 dalam analisis Imunofluorosensi.

---

Colorectal cancer (CRC) is a cancer that affects the colon and rectum in the large intestine. In Indonesia, CRC cases are ranked fourth. Generally, CRC is diagnosed using standard examinations colonoscopy, this procedure is invasive and uncomfortable for CRC patients. Therefore, an alternative that is minimally invasive and easy to perform is needed to detect the presence of Circulating Tumor Cells (CTCs).  The abundance of CTCs in blood is very low, estimated at 1—10 CTC/10 mL. Therefore, CTC isolation is required to increase the quantity of CTCs. A method to isolate CTCs is the SepMateTM-15 modified density gradient centrifugation method. To detect CTCs, markers with good specificity and sensitivity are needed originating from primary tumor tissues in CRC patients, such as CK20. This study aims to isolate CTCs using the SepMateTM-15 modified density gradient method and characterize CTCs with CK20 marker from peripheral blood using immunofluorescence. All CRC subjects were successfully isolated with positivity of  ≥1 CTC/mL. Single CTC in subjects 1, 2, and 4. CTC clusters were identified in subjects 2, 3, and 5. The average diameter of CTCs is 10.82 μm. Cell CTCs were successfully characterized between single CTCs and CTC clusters using a CK20 marker by immunofluorescence analysis."

"ABSTRAK Karsinoma sel skuamosa kepala leher (KSSKL) menempati peringkat ke-6  kanker tersering di seluruh dunia.  Perkembangan  dalam  hal  terapi yang menggunakan  beragam modalitas untuk mengontrol  lokal dan  regional masih belum dapat meningkatkan angka survival lima tahun yang hanya sekitar 50% selama tiga dekade terakhir.  Metastasis jauh  menjadi penyebab utama  morbiditas dan  mortalitas pada KSSKL.  Sebagian besar pasien dengan metastasis jauh tidak terdeteksi secara klinis dan  radiologi.  Hingga saat ini sistem staging dan radiologi konvensional tidak mampu mendeteksi metastasis sejak dini . Mikrometastasis  merupakan proses awal dari suatu makrometastasis, sehingga sel tumor yang bersirkulasi dianggap sebagai silent predictor. Deteksi  CTC dianggap sebagai metode yang inovatif, sensitif, dan spesifik untuk dapat memprediksi kemungkinan terjadinya metastasis pada pasien-pasien  KSSKL. Penelitian ini menggunakan 90 sampel darah pasien penderita KSSKL stadium I-IV yang berobat di poli Bedah Onkologi dan THT RSUPNCM  pada periode Januari hingga Desember 2018.  Sampel darah  sebanyak 8 ml dikirim ke Laboratorium Patologi Klinik FKUI/RSUPNCM untuk dianalisa jumlah CTC -nya dengan  menggunakan flow cytometry, penanda epitel EpCAM dan CK19 serta penanda lekosit CD45. Analisa statistik dilakukan untuk mengetahui ada tidaknya asosiasi antara status klinikohistopatologi pasien KSSKL dengan deteksi CTC. Flow cytometry mampu  mendeteksi CTC positif sebanyak 28 dari 90 sampel darah (31.1%). Dari analisa bivariat dan multivariat, tidak didapatkan adanya asosiasi yang bermakna antara status klinikohistopatologi pasien KSSKL dengan deteksi CTC (p>0.05).    Pasien dengan stadium lanjut  memiliki kecenderungan 4.192 kali untuk mendapatkan CTC positif dibandingkan dengan stadium awal. Begitu pula pasien  yang memiliki sublokasi  tumor di daerah  faring  dan  laring   memiliki  kecenderungan 2.634 kali  untuk mendapatkan CTC positif bila dibandingkan dengan sublokasi anatomi bibir, rongga mulut, hidung dan sinus paranasal. Flow cytometry mampu mendeteksi CTC pada KSSKL dengan presentase 31.1%  bila menggunakan dua penanda epitel. Tidak terdapat asosiasi yang bermakna antara status klinikohistopatologi pasien KSSKL dengan deteksi CTC. Diperlukan studi lanjutan untuk meningkatkan sensitivitas dan spesifisitas serta mengkonfirmasi dapat tidaknya CTC dipakai sebagai prediktor dan prognostikator di bidang KSSKL.

---

ABSTRACT

HNSCC is the sixth most common cancer worldwide. The therapy of choice for newly diagnosed patients consists of combined modality treatment for locoregional control. Despite of improvement in treatment, for all stages combined, the 5-year survival rate is approximately 50% and this rate has not changed significantly in the last 3 decades. As distant metastases develop, the chance for cure becomes low and survival decreases. Tumor metastasis is an important contributor to mortality in cancer patients. Mostly distant metastases are not seen by clinical examination and/ or conventional imaging. To date, TNM staging  system and  the existing image technology are not sufficient to detect tumor metastasis in early stages. The concept of the development of metastasis involves a tumor cell that dissociates from the primary tumor (micrometastasis) and circulates within lymphatic or vascular channels. The true utility of a circulating tumor cell (CTC) is that it acts as a silent predictor of metastatic disease. Detection of CTCs serves as an innovative, sensitive and specific marker and providing early and definitive evidence of metastatic disease. In this study, peripheral blood samples from 90 patients with SCCHN stage I-IV from Surgical Oncology and ENT OPD were taken. CTCs were quantified using flow cytometry of anti-EpCAM, CK19 and CD45. Their detection was correlated with clinicohistopathologic characteristics. CTCs were identified in 28 (31.1%) patients at any time point with a mean + standard deviation of  0.9 + 3.2 CTCs. In bivariate and  multivariate analysis, we observed no significant correlation between the presence of CTCs and clinicohistopathologic characteristics (p>0.05). However the odds for the patients with advanced stages to have positive CTCs  is 4.192 times higher than early stage. Moreover, patients with pharynx and larynx cancer have the odds 2.634 times higher than those with lips, oral cavity and paranasal sinuses cancer. The rate of CTCs detection in HNSCC by flow cytometry was 31.1%. Detection of CTCs does not correlate with any clinicohistopathological characteristics. Further studies is needed to increase the sensitivity and specificity  and  also to confirm the potential of CTC to serve as a predictor and prognosticator in patients with HNSCC."

"Circulating tumor cell (CTC) merupakan intermediet proses metastasis kanker yang dapat dimanfaatkan untuk diagnosis, prognosis, dan target pengobatan kanker. Pengembangan pemanfaatan CTC dapat dilakukan dengan penelitian yang umumnya melibatkan proses kultur. Medium bebas serum dinilai lebih baik dibanding medium berserum karena dapat menghasilkan data yang lebih konsisten, sehingga lebih cocok digunakan untuk penelitian yang mengkaji aktivitas fisiologi sel dan persinyalan molekular. Namun, medium bebas serum memerlukan suplemen agar sel dapat tumbuh optimum. Penambahan suplemen insulin-transferrin-selenium (ITS) telah diketahui memiliki peran penting dalam kultur sel keratosit, ovarium, dan keratinosit. Namun, belum diketahui peran ITS dalam medium bebas serum untuk kultur CTC. Penelitian ini mengkaji perbedaan efek FBS dan ITS dengan konsentrasi 1X dan 10X dalam medium bebas serum terhadap CTC yang diisolasi dengan metode eritrolisis. Kultur dilakukan selama 18 hari. Dinamika CTC dan leukosit diamati dengan meninjau viabilitasnya pada 6 hari pertama kutur. Selain itu, observasi morfologi dilakukan seiring dengan pengukuran morfometri sel. Pada hari ke-18, keberadaan CTC diverifikasi dengan imunofluoresens menggunakan marka cytokeratin 20 (CK20) dan plastin 3 (PLS3). Hasil penelitian menunjukkan bahwa CTC yang dikultur pada medium dengan penambahan 10X ITS memiliki diameter sel yang lebih besar dari yang dikultur pada medium dengan penambahan 1X ITS dan 10% FBS. Hal tersebut menunjukkan bahwa ITS memiliki peran penting dalam kultur CTC dalam medium bebas serum dan dalam konsentrasi 10X dapat meningkatkan pertumbuhan CTC kanker kolorektal.

---

Circulating tumor cells (CTCs) are intermediates in the cancer metastasis process and hold potential for use in cancer diagnosis, prognosis, and treatment targeting. The development of CTC applications typically involves research incorporating cell culture processes. In cell culture, serum-free media are considered superior to serum-containing media as they yield more consistent data, making them more suitable for studies examining cell physiological activity and molecular signaling. However, serum-free media require supplementation to ensure optimal cell growth. The addition of insulin-transferrin-selenium (ITS) supplements is known to play a crucial role in the culture of keratocytes, ovarian cells, and keratinocytes. However, the role of ITS in serum-free media for CTC culture remains unknown. This study investigates the differential effects of fetal bovine serum (FBS) and ITS at concentrations of 1X and 10X in serum-free media on CTCs isolated via erythrolysis. Cultures were maintained for 18 days, with CTC and leukocyte dynamics observed by assessing cell viability during the first six days of culture. Additionally, morphological observations and cell morphometric measurements were conducted. On the 18^th day, the presence of CTCs was verified using immunofluorescence with cytokeratin 20 (CK20) and plastin 3 (PLS3) markers. The results indicated that CTCs cultured in media supplemented with 10X ITS exhibited larger cell diameters compared to those cultured with 1X ITS and 10% FBS. This finding suggests that ITS plays a critical role in the successful culture of CTCs in serum-free media and that a 10X concentration of ITS can enhance the growth of colorectal cancer CTCs."

"Kanker kolorektal menempati peringkat ketiga berdasarkan angka kematian di Indonesia. Cluster of differentiation 44 (CD44) merupakan biomarker yang dapat digunakan dalam mendeteksi kanker kolorektal. Ekspresi gen CD44 dapat dideteksi pada circulating tumor cell (CTC) yang diisolasi dari darah perifer, akan tetapi CTC merupakan rare cell. Ekspresi gen CD44 pada peripheral blood mononuclear cells (PBMC) berpotensi untuk dijadikan biomarker dalam deteksi kanker kolorektal karena kelimpahannya yang banyak jika dibandingkan dengan CTC, akan tetapi penelitian tentang deteksi ekspresi gen CD44 pada PBMC masih terbatas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi ekspresi gen CD44 pada sampel CTC dan PBMC sebagai potensi biomarker kanker kolorektal menggunakan metode semi-kuantitatif RT-PCR dan direct immunofluorescence. Hasil penelitian menunjukkan tidak terdeteksinya gen CD44 baik pada sampel CTC maupun PBMC dengan menggunakan metode semi-kuantitatif RT-PCR. Gen CD44 terdeteksi pada beberapa sampel PBMC dengan menggunakan direct immunofluorescence. Gen CD44 berpotensi sebagai biomarker kanker kolorektal, namun penelitian ini perlu diteliti lebih lanjut.

---

Colorectal cancer ranks third based on mortality in Indonesia. Cluster of differentiation 44 (CD44) is a biomarker that can be used to detect colorectal cancer. CD44 gene expression can be detected in circulating tumor cells (CTC) isolated from peripheral blood, but CTC is a rare cell. The expression of the CD44 gene in Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC) has the potential to be used as a biomarker in the detection of colorectal cancer because of its high abundance when compared to CTC, but research on the detection of CD44 gene expression in PBMCs is still limited. The purpose of this study was to detect the expression of the CD44 gene in CTC and PBMC samples as a potential colorectal cancer biomarker using semi-quantitative RT-PCR and direct immunofluorescence methods. The results showed that the CD44 gene was not detected in both CTC and PBMC samples using the semi-quantitative RT-PCR method. The CD44 gene was detected in several PBMC samples using direct immunofluorescence. The CD44 gene has potential as a biomarker of colorectal cancer, but this research needs to be investigated further. "