Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"この研究ノートは、グラフ（ネットワーク）の基本的な概念と、グラフをソフトウェアCytoscape を用いて分析・作図する方法を簡単に記したものである。文章の前半で、筆者はグラフの概念（点、線、有向・無向グラフなど）を説明したあとで、コンマ区切りのファイルを Cytoscape に読み込む方法を述べる。このあたりは適切なオプションを指定するべき重要なポイントである。グラフの作図例も提示されている。また、グラフの属性である点の次数、点の媒介中心性などが正しく計算されていることが確認できる。文章の後半では、大阪近郊の鉄道網についてのデータを筆者が Cytoscape に読み込んだ例が紹介されている。ここでは作図のスタイルについて言及がある。それは、重みによって線の属性（実線、破線）を、また、次数によって点の属性（ラベル文字の大きさ）を設定することである。次数と媒介中心性の計算例も示されている。文章の最後で筆者は、グラフ理論の教科書で示されているグラフの代表例にふれ、応用例の可能性について述べる。"

"COVID-19 sudah didetapkan sebagai pandemi oleh WHO, dan minat untuk meneliti mengenai pengobatan COVID-19 sangatlah tinggi. Akan tetapi, tidak hanya obat-obatan, minat untuk mempelajari tentang senyawa herbal, serta mencari kandidat senyawa untuk pengobatan juga tinggi. Dalam penelitian ini dilakukan investigasi potensi dari berbagai senyawa herbal yang memiliki efek anti-COVID-19, dan tidak hanya terhadap COVID-19 tetapi juga terhadap penyakit sistem imun. Dalam studi ini, peneliti menggunakan metode jejaring farmakologi. Metode ini dapat mengeksplorasi potensi efek yang dimiliki dari senyawa herbal dan target terkait untuk mengobati penyakti COVID-19. Target kandidat protein diprediksi melalui ChemBL, lalu dilakukan penelusuran terhadap penyakit dan validasi melalui website target validation. Jaringan dibentuk menggunakan Cytoscape 3.8.0 yang hasilnya merupakan jaringan senyawa-target, dan target-penyakit. Hasil konstruksi jaringan C-T-D menunjukkan 72 senyawa, 86 target, 1164 penyakit, dan 22 kategori penyakit. Terdapat 9 target potensial dan 69 senyawa yang terkait dengan COVID-19, selain itu ditemukan juga 286 spesies tanaman yang berpotensi. Pada penyakit sistem imun seluruh senyawa memiliki kaitan, lalu didapatkan 39 target yang berkaitan juga dengan 134 jenis penyakit sistem imun serta 318 spesies tanaman yang berpotensi. Dari penelitian ini diperoleh rekomendasi spesies tanaman yaitu Citrus maxima, Acronychia laurifolia, Santalum album yang masing-masing memiliki 12, 11, dan 6 interaksi dengan target atau senyawa.......COVID-19 has been declared a pandemic by the WHO, and interest in research on the treatment of COVID-19 is very high. However not only drugs, interest in learning about herbal compounds, as well as looking for candidate compounds for treatment is also high. In this study, we investigated the potential of various herbal compounds that have anti-COVID-19 effects, and not only against COVID-19 but also against diseases of the immune system. In this study, researchers used the pharmacology network method. This method can explore the potential effects of herbal compounds and related targets to treat COVID-19 disease. The target protein candidate is predicted through ChemBL, then a search for the disease is carried out and validation through the target validation website. Networks were formed using Cytoscape 3.8.0 which resulted in compound-target, and disease-target networks. The results of the C-T-D network construction showed 72 compounds, 86 targets, 1164 diseases, and 22 disease categories. There are 9 potential targets and 69 compounds associated with COVID-19, in addition, 286 potential plant species were found. In diseases of the immune system, all compounds are related, then 39 targets were obtained which are also related to 134 types of immune system diseases and 318 potential plant species. From this study, it was found that plant species recommendations were Citrus maxima, Acronychia laurifolia, Santalum album which each had 12, 11, and 6 interactions with targets or compounds."