Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 2 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Clara Riski Amanda
"Kanker kolorektal (KKR) menempati urutan ketiga sebagai kanker penyebab kematian tertinggi di dunia. Diperkirakan sekitar 63% kematian akibat KKR terjadi karena kurangnya screening dan keterlambatan diagnosis. Saat ini metode standar yang digunakan dalam diagnosis KKR adalah kolonoskopi dan biopsi jaringan. Namun metode tersebut memiliki risiko yang tinggi, besifat invasif, serta tidak efisien untuk monitoring perkembangan tumor. Gen Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) telah umum digunakan sebagai marka prognostik KKR, salah satunya melalui studi ekspresi gen pada Circulating Tumor Cells (CTCs). Namun CTC memiliki beberapa kelemahan, seperti konsentrasi yang rendah dan heterogenitas yang beragam. Di sisi lain, serum darah penderita kanker mengandung cell-free Nucleic Acid (cfNA) yang membawa informasi genetik dari jaringan tumor asal. Hal tersebut menjadikan cfNA berpotensi untuk dikembangkan sebagai salah satu metode alternatif untuk diagnosis dan monitoring KKR. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi gen EGFR dari CTC dan serum darah penderita KKR menggunakan metode quantitative PCR with Melting Curve Analysis (qPCR MCA). Penelitian dilakukan terhadap 4 pasien KKR dengan karakteristik dan stadium kanker yang bervariasi. Hasil penelitian menunjukkan gen EGFR terdeteksi pada seluruh sampel serum dan hanya terdeteksi pada 1 sampel CTC. Oleh karena itu, dapat disimpulkan bahwa deteksi biomarker EGFR pada serum memiliki efektivitas yang lebih baik dibandingkan CTC.<

Colorectal cancer (CRC) ranks as the third leading cause of cancer death in the world. It is estimated that around 63% of deaths from CRC occur due to lack of screening and delay in diagnosis. Currently, the standard methods used in the diagnosis of CRC are colonoscopy and tissue biopsy. However, this method has a high risk, invasive, and inefficient for tumor monitoring. The Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) has been commonly used as a prognostic marker for CRC through gene expression analysis of Circulating Tumor Cells (CTCs). However, CTC have some limitations such as heterogeneity and low concentrations. On the other hand, the blood serum of cancer patients contains cell-free Nucleic Acid (cfNA) which carries genetic information from the original tumor tissue. Hence, cfNA have great potential to be developed as an alternative method for CRC diagnosis and monitoring. This study aims to detect the EGFR gene from CTC and blood serum of CRC patients using the quantitative PCR with the Melting Curve Analysis (qPCR MCA). The study was conducted on 4 CRC patients with various characteristics and stages of cancer. The results showed that the EGFR gene was detected in all serum samples and only in 1 CTC sample. Therefore, the results suggest that the detection of EGFR biomarkers in serum has better effectiveness than CTC."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Purba, Jessica Agustina Elisabeth
"Kanker kolorektal adalah jenis kanker pada kolon dan rektum usus besar yang disebabkan oleh pertumbuhan abnormal. Kasus kanker kolorektal di Indonesia merupakan kasus kanker tertinggi urutan ketiga dan mengalami peningkatan setiap tahunnya. Oleh karena itu, deteksi kanker kolorektal diperlukan untuk diagnosis dan prognosis kanker kolorektal. Salah satu metode deteksi yang digunakan adalah deteksi ekspresi RNA untuk mengetahui gen yang diekspresikan secara berlebih atau sebaliknya pada jalur perkembangan kanker kolorektal yang terpengaruh. Ekspresi heparanase (HPSE) diketahui menginduksi perkembangan kanker kolorektal. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat ekspresi HPSE pada jaringan normal dan kanker kolorektal. Penelitian ini menggunakan sepuluh sampel untuk masing-masing jaringan normal dan kanker kolorektal dari pasien kanker kolorektal. Nilai ekspresi HPSE diukur dengan reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Selanjutnya, analisis statistik dilakukan menggunakan aplikasi SPSS. Hasil RT-qPCR menunjukkan bahwa ekspresi HPSE RNA pada jaringan kanker 6,912 kali lebih tinggi dibandingkan pada jaringan normal. Berdasarkan nilai perbandingan ekspresi gen relatif yang diatur dengan nilai 1. Ekspresi HPSE untuk setiap individu pasien dikelompokkan menjadi ekspresi meningkat (>1) dan menurun (<1). Berdasarkan hasil qPCR, ekspresi HPSE tidak terdeteksi pada tiga sampel pasien yang ditunjukkan dengan tidak terjadinya amplifikasi. Hasil ini diduga disebabkan oleh template RNA yang digunakan mengalami degradasi. Analisis statistik menunjukkan ekspresi HPSE pada jaringan kanker kolorektal tidak memiliki perbedaan secara signifikan dengan jaringan normal berdasarkan nilai p > 0,05.

Colorectal cancer is a type of cancer of the colon and rectum of the large intestine caused by abnormal growth. Colorectal cancer cases in Indonesia are the third highest cancer cases and are increasing every year. Therefore, detection of colorectal cancer is needed for the diagnosis and prognosis of colorectal cancer. One of the detection methods used is RNA expression detection to determine which genes are overexpressed or otherwise in the affected colorectal cancer development pathway. The expression of heparanase (HPSE) is known to induce the development of colorectal cancer. This study aims to determine the level of HPSE expression in normal tissue and colorectal cancer. This study used ten samples for each of normal and colorectal cancer tissue from colorectal cancer patients. Relative expression value HPSE measured by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Furthermore, statistical analysis was performed using the SPSS application. RT-qPCR results showed that HPSE expression in cancer tissue was 6,912 higher than in normal tissue. Based on the comparative value of relative gene expression, which was set to a value of 1. The HPSE expression for each individual patient was grouped into increased (>1) and decreased (<1) expressions. Based on the results of RT-qPCR, HPSE expression was not detected in three patient samples as indicated by the absence of amplification. This result was thought to be caused by the degradation of the template RNA. HPSE in colorectal cancer tissue did not differ significantly from normal tissue based on p > 0.05."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2022
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library