Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Tanaman karet merupakan salah satu komoditas utama ekspor Indonesia. Namun, dalam beberapa tahun terakhir, produksi karet di Indonesia mengalami penurunan. Hal tersebut disebabkan karena adanya penyakit gugur daun yang disebabkan oleh jamur Pestalotiopsis sp.. Berkembangnya teknologi artificial intelligence dengan pendekatan deep learning mampu melakukan pendeteksian pada penyakit ini dengan menggunakan data citra. Convolutional Neural Network (CNN) merupakan algoritma deep learning yang diterapkan pada data berbentuk visual atau citra. Pada penelitian ini, peneliti menggunakan metode Convolutional Neural Network (CNN) dengan arsitektur Residual Network 50 (ResNet-50). Pada penelitian ini juga digunakan Transfer Learning yang merupakan sebuah model yang dapat diajarkan dan disempurnakan untuk suatu kegiatan dan kemudian bisa diterapkan pada kegiatan lain. Dataset yang digunakan pada penelitian ini adalah data daun karet yang berjumlah 1629 data yang dibagi dalam 5 kelas yaitu level 0 atau sehat merupakan daun yang sehat, level 1 merupakan daun yang telah terbentuk bercak coklat yang merupakan gejala dari penyakit namun belum memiliki tanda-tanda perubahan warna, level 2 merupakan daun yang telah terbentuk banyak bercak cokelat disertai dengan adanya perubahan warna pada daun, level 3 merupakan daun yang mengalami kerusakan jaringan, perubahan warna menjadi cokelat atau kuning namun masih memiliki sedikit bagian daun yang berwarna hijau, level 4 merupakan daun yang mengalami kerusakan jaringan cukup parah, dipenuhi bercak cokelat dan telah berwarna cokelat menyeluruh. Dari hasil simulasi yang dilakukan, diperoleh hasil terbaik dengan rata-rata accuracy 96,01%, recall 95,888%, dan precision 96,184% dengan running time rata-rata running time 69,759 detik. ......Rubber plants are one of Indonesia's main export commodities. However, in recent years, rubber production in Indonesia has experienced a decline. This is due to the presence of the leaf fall disease caused by the Pestalotiopsis sp. fungus. The advancement of artificial intelligence technology using deep learning approaches enables the detection of this disease using image data. The Convolutional Neural Network (CNN) is a deep learning algorithm applied to visual or image data. In this study, researchers utilized the Convolutional Neural Network (CNN) method with the Residual Network 50 (ResNet50) architecture. Transfer Learning was also employed in this research, which involves training and refining a model for one task and then applying it to another task. The dataset used in this study consists of 1629 rubber leaf samples divided into 5 classes: level 0, representing the healthy leaves; level 1, indicating leaves with brown spots, a symptom of the disease, but without major visible color changes; level 2, comprising of leaves with numerous brown spots accompanied by slight color changes; level 3, representing leaves with tissue damage, a color change from green to brown or yellow, but still retaining some green parts; and level 4, depicting leaves with severe tissue damage, extensively covered in brown spots and having turned completely brown. The simulation results showed the best outcome with an average accuracy of 96.01%, recall of 95.888%, and precision of 96.184%, with an average running time of 69.759 seconds.

Abstrak :
Penyakit Gugur Daun Pestalotiopsis (PGDP) adalah penyakit yang menyerang perkebunan karet Indonesia sejak akhir 2017. PGDP disebabkan oleh infeksi kelompok fungi Pestalotiopsis. PGDP mampu menyebabkan gugur daun hingga mencakup 75-90% kanopi dan penurunan produksi lateks hingga 45%. PGDP mampu menyerang semua jenis klon Hevea brasiliensis. Klon-klon tersebut antara lain adalah klon dengan resitensi moderat seperti IRR 112 dan klon rentan seperti PB 260. Analisis morfologi gejala penyakit belum pernah dilakukan sejak PGDP pertama kali terdeteksi dan diidentifikasi. Analisis morfologi gejala penyakit dilakukan guna mengetahui respons daun terhadap infeksi fungi Pestalotiopsis dan mengetahu pola persebaran miselia fungi Pestalotiopsis pada permukaan daun Hevea brasiliensis. Sebanyak 3 helai anak daun dari 3 individu Hevea brasiliensis klon IRR 112 dan PB 260 dipotong dan diinokulasi isolat fungi Pestalotiopsis secara ex planta. Inokulasi dilakukan di 3 titik pada permukaan anak daun daun dan diamati hingga 7 hari setelah inokulasi (hsi). Sediaan morfologi yang mewakili perkembangan gejala pada 3, 5, dan 7 hari setelah inokulasi juga dibuat dan diamati di bawah mikroskop cahaya. Respons yang ditunjukkan anak daun Hevea brasiliensis klon IRR 112 dan PB 260 adalah nekrosis dan klorosis. Selain itu terdapat 2 tipe lesi, yakni lesi tipe I yang diduga berasal dari kontaminasi fungi Colletotrichum sp. dan lesi tipe II yang merupakan ciri khas lesi hasil infeksi fungi Pestalotiopsis. Kedua lesi muncul berdampingan dalam kompleks lesi Pestalotiopsis-Colletotrichum. Hasil pengamatan mikromorfologi menunjukkan bawha kompleks miselia Pestalotiopsis-Colletotrichum cenderung tersebar pada dan/atau di sekitar pertulangan daun. ......Pestalotiopsis Leaf Fall Disease (PLFD) is a disease affecting Indonesia’s rubber plantation since 2017. PLFD is caused by Pestalotiopsis fungi. PLFD is capable in defoliating up to 75-90% of tree canopy and decreasing latex production up to 45%. PLFD is capable in affecting every clone of Hevea brasiliensis. Some clones of which affected by the disease are moderately resistant clone such as  IRR 112 and susceptible clone such as PB 260. Disease morphology is yet to be analyzed since the first reported case and identification. Disease morphology analysis is conducted to determine various responses of Pestalotiopsis infected leaf and reveal Pestalotiopsis  mycellial distribution pattern on the surface of Hevea brasiliensis leaf. Three leaflets from 3 individuals of Hevea brasiliensis IRR 112 and PB 260 clones were cut and inoculated with Pestalotiopsis isolate following ex planta procedure. Inoculation was performed at 3 points on the leaflets surface and was observed until 7 days post inoculation (dpi). Samples for micromorphological observation were also made, each one representing disease development on 3, 5, and 7 dpi and were observed under the microscope. The responses shown by the leaflets of Hevea brasiliensis IRR 112 and PB 260 clones were necrosis and chlorosis. Accordingly, 2 types of lession were observed: type I of which suspected as Colletotrichum sp. contamination and type II of which similar to distinctive lession of  Pestalotiospis fungi. Both types occured simultaneously in the Pestalotiopsis-Colletotrichum lession complex. Micromorphological observation has shown that Pestalotiopsis-Colletotrichum mycellial complex was distributed at the vicinity of leaf veins.

Abstrak :
Penyakit gugur daun Pestalotiosis sp. (PGDP) merupakan salah satu penyebab penurunan produksi lateks di Indonesia karena mampu menggugurkan 90% kanopi Hevea brasiliensis. Gejala pada PGDP yaitu timbul bercak cokelat pada permukaan daun. Upaya penanganan PGDP dapat dilakukan pengembangan klon tanaman karet unggul yang diawali dengan analisis ekspresi gen ketahanan. Salah satu gen ketahanan yang berperan pada sistem pertahanan pertama adalah gen Hevea brasiliensis Poliphenol Oxidase (HbPPO) yang dapat mengaktivasi sistem Reactive Oxygen Species (ROS). Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui perbandingan profil ekspresi HbPPO pada tanaman karet sehat, mengalami luka, dan terinfeksi Pestalotiopsis sp. serta perbandingan profil ekspresi HbPPO pada tanaman karet klon moderat IRR 112 dan rentan GT 1 di hari ketiga dan keenam. Hipotesis dari penelitian ini yaitu terdapat perbedaan ekspresi gen HbPPO pada setiap perlakuan serta pada kedua klon. Proses untuk mengetahui ekspresi HbPPO dimulai dengan dilakukan ekstraksi RNA dari daun H. brasiliensis kemudian hasil ekstraksi disintesis menjadi cDNA. Hasil sintesis cDNA digunakan sebagai template quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Berdasarkan hasil qPCR diperoleh nilai Ct yang selanjutnya diolah menggunakan rumus Livak. Hasil penelitian belum dapat menunjukkan tingkat ekspresi gen HbPPO pada klon IRR 112 dan klon GT 1 pada semua perlakuan karena data ekstraksi RNA pada penelitian belum diverifikasi dengan melakukan elektroforesis dan belum terdapat kurva standar sebagai acuan penggunaan rumus Livak. Hasil penelitian ini berupa dugaan adanya perbedaan ekspresi gen HbPPO pada tanaman Hevea brasiliensis sehat, dengan perlakuan pelukaan, dan perlakuan pelukaan+infeksi Pestalotiopsis serta antara klon GT 1 dan IRR 112. Oleh karena itu, perlu dilakukan penelitian lebih lanjut untuk memperoleh data korelasi ekspresi gen HbPPO dan infeksi Pestalotiopsis yang akurat. ......Leaf fall disease caused by Pestalotiosis sp. has been identified as a factor contributing to the decline in latex production in Indonesia, as it can lead to the deciduous of approximately 90% of Hevea brasiliensis canopy. The symptoms of its disease manifest as brown spots on the leaf surface. In response to this issue, an approach to against this disease involves the development of superior rubber plant clones, initiated with an analysis of resistance gene expression. Among the resistance genes involved in the primary defense system is the Hevea brasiliensis Polyphenol Oxidase (HbPPO) gene, which activates the Reactive Oxygen Species (ROS) system. This study aimed to compare the expression profiles of the HbPPO gene in healthy, wounded, and infected rubber plants with Pestalotiopsis sp., as well as compare the HbPPO expression profiles between the IRR 112 moderate clone and the GT 1 susceptible clone on the third and sixth days. The hypothesis of this study posits that there are variations in HbPPO gene expression across the different treatments and between the two clones. To evaluate the HbPPO expression levels, the process began with RNA extraction from H. brasiliensis leaves, followed by the synthesis of the extracted RNA into cDNA. The cDNA obtained was then used as a template for quantitative polymerase chain reaction (qPCR). The Ct values obtained from qPCR were subsequently processed using the Livak formula to assess the relative gene expression levels. The results have been unable to demonstrate HbPPO expression due to unverified RNA data through electrophoresis and the absence of a standard curve. The study imply disparities in HbPPO gene expression among healthy Hevea brasiliensis plants, wound treatment, and wounded+Pestalotiopsis infection treatment, also variations between GT 1 and IRR 112 clones. Therefore, further research is imperative to acquire precise data regarding the correlation between HbPPO gene expression and Pestalotiopsis infection.

Abstrak :
Five kinds of endophytic fungi i.e pastalotiopsis sp. isola GNC fusarium sp, GNC -A fusarium sp..GNC-B.Pastalotiopsis sp, GUC and fusarium sp......