Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 7 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Astrid Indrafebrina Sugianto
Abstrak :
Background: According to WHO, breast cancer has the highest incidence rate among women. Breast cancer is caused by the uncontrolled growth of abnormal cells that form in breast tissue, triggered by the presence of cancer stem cells. The invasive properties of breast stem cells are closely related to the pluripotency of these cells. The pluripotency of a cell is closely related to the genes expressed. In this study, c-Myc gene expression was observed to determine the level of pluripotency of breast cancer stem cell fraction samples separated using the Magnetic Activated Cell Sorting (MACS) technique. Method: mRNA was obtained from 11 breast cancer stem cell samples which were fractionated using MACS. The expression of c-Myc in these cell fractions was analyzed using one step real time RT-PCR with SYBR Green ( Bioneer®) and electrophoresis. Results: Based on the experimental results, high level expression of c-Myc was present in the CD24-/44- cell fraction, while low level expression of the c-Myc gene was found in the CD24-/44+ cell fraction. Conclusions: The c-Myc gene is expressed in all breast cancer stem cell fractions. Looking at the c-Myc gene expression, higher levels of pluripotency can be found in the CD24-/44- cell fraction compared to CD24-/44+.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2015
S70304
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Annisaa Paramita Setiabudi
Abstrak :
Oct-4 dan Klf4 merupakan dua gen penyandi pluripotensi yang terdapat pada manusia. Kedua gen tersebut dapat dideteksi pada mRNA sel kanker manusia dengan menggunakan rancangan primer spesifik pada metode RT-PCR. Proses RT-PCR akan mengubah mRNA menjadi cDNA yang kemudian hasilnya dilakukan purifikasi dari gel agarosa. Hasil purifikasi gel agarosa diamplifikasi dengan PCR. Selanjutnya, dilakukan proses sekuensing untuk memeriksa keakuratan sekuen gen yang nantinya akan dikloning. Hasil sekuensing dianalisis dengan BLASTN untuk pencarian homologi pada database asam nukleat. Ligasi dilakukan menggunakan vektor pET101/D-TOPO®. Rancangan primer yang spesifik dan penambahan basa CACC ATG pada primer forward merupakan syarat untuk melakukan ligasi DNA ke vektor pET101/D-TOPO®, dimana proses ligasi ini tidak menggunakan enzim ligase. Selanjutnya, produk hasil ligasi ditransformasi ke inang Escherichia coli DH5α yang selnya sudah dibuat kompeten dengan metode heat shock. Koloni yang tumbuh di media LB agar dengan ampisilin diisolasi untuk mendapatkan plasmid yang selanjutnya dianalisis dengan menggunakan teknik PCR. Vektor plasmid yang terdapat pada E.coli DH5α kompeten mengandung sisipan gen Oct-4 dan Klf4.
Oct-4 and Klf4 are two genes coding of pluripotency in human. Both of the genes can be detected in human cancer cell mRNA by using specifically designed primers in RT-PCR method. RT-PCR process changed the mRNA into cDNA. The result from this process was purified from agarose gel fragment and amplified by PCR method. Then, sequencing of the purified products were done and analyzed using BLASTN feature in NCBI site to search the homology of the sequence compared to the sequences in nucleic acid database. The vector used in ligation process was pET101/D-TOPO® vector. Specifically designed primers and adding CACC ATG base in the beginning of forward primer are the requirements of using this vector. The ligation process using this TOPO® vector does not require the presence of DNA ligase. The next process is transformation by using the heat shock method. Ligation product is transformed into competent Escherichia coli DH5α host. Colonies that grows in LB agar media with ampicillin are treated by plasmid isolation protocol in order getting the plasmids for further anlysis using PCR method. The result from PCR analysis shows that the plasmids in competent E.coli DH5α contain Oct-4 and Klf4 inserts.
Depok: Universitas Indonesia, 2014
S57155
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ennol Endrianto
Abstrak :
ABSTRAK
Produktifitas pada pembangkit listrik merupakan kinerja terpenting dalam industri Operasi dan pemeliharaan, produktifitas tersebut banyak dipengaruhi oleh ketersediaan sparepart dalam rangka perawatan mesin-mesin, sehingga minimum stok safety sparepart yang harus dihitung pada saat awal tender harus benar-benar dihitung agar tidak terjadi kegagalan operasi dikarenakan tidak adanya sparepart. Tujuan paling penting dari hampir semua sistem produksi adalah mencapai kinerja optimal dengan biaya terendah sehingga ketersediaan minimum stok tidak boleh terlalu banyak dan tidak boleh terlalu sedikit. Untuk mengatasi permasalahan ini dibutuhkan estimasi jumlah dan jenis spare part yang harus dijaga. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah klasifikasi Multi kriteria dengan sudut pandang logistik dan juga pemeliharaan. Penelitian ini menggunakan data rekomendasi dari pabrikan sebagai initial solution berjumlah 564 item per satu lokasi pembangkit dari lima lokasi yang akan dihitung dan mengelompokkan sesuai dengan kebutuhan VED (Vital, Essential, Desireable) untuk mengetahui tingkat kekritisan yang dibagi menjadi "H" High, "M" Medium, "L" Low. Setelah mengetahui spare part apa saja yang harus disediakan sesuai dengan kekritisannya, akan dicari jumlah spare part dengan menggunakan expert judgement sebagai penentu emergency spare part. Hasil dari penelitian yang telah dilakukan didapatkan kekritisan "H" sebesar 6%, "M" sebesar 94% dan "L" sebesar 0%. Jumlah item yang direkomendasikan kurang dari rekomendasi pabrikan sebesar 52% serta penurunan biaya pencadangan safety sparepart sebesar 6%.
ABSTRACT
Productivity at the power plant is the most important performance in the operation and maintenance industry, productivity is much influenced by the availability of spare parts in the framework of maintenance of engine, so the minimum stock of safety spare parts that must be calculated at the beginning of the tender in order to avoid operation failure due to absence of spare parts. The most important goal of almost all production systems is to achieve optimal performance at the lowest cost so that the minimum availability of stock must not be too much and not too little. To overcome this problem, an estimation of the number and types of spare parts that must be maintained is needed. The method used in this study is a multi-criteria classification with a logistical perspective as well as maintenance. This study uses recommendation data from the manufacturer as an initial solution totaling 564 items per one plant location from five locations to be calculated and grouping according to the needs of VED (Vital, Essential, Desireable) to determine the level of criticality which is divided into "H" High, "M "Medium," L "Low. After knowing what spare parts must be provided in accordance with their criticality, we will look for the number of spare parts using expert judgment as a determinant of emergency spare parts. The results of the research that have been carried out obtained criticality "H" by 6%, "M" by 94% and "L" by 0%. The number of items recommended is less than the manufacturer's recommendations by 52% and a reduction in the cost of spare parts safety by 6%.;

Latar Belakang: Terapi sel punca, walaupun membuka alternatif baru terhadap tatalaksana regeneratif namun masih mempunyai hambatan dalam etik dan juga penolakan sistem imun, terutama dalam penggunaan sel punca embrionik (ESCs). Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), mempunyai karakteristik yang mirip dengan ESCs namun tidak dibatasi oleh masalah etik. Gen Oct-4 mempunyai peran penting dalam mempertahankan pluripotency dan juga dalam menginduksi sel iPSCs. Kemungkinan untuk menggunakan Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) dan Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) dalam pembuatan induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) sangat menjanjikan dan sedang dieksplorasi. Tingkat pluripotency dari ADSC dan USC belum pernah dilakukan sebelumnya. Maka dari itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan tingkat pluripotency antara dua jenis sel punca mesenkimal melalui ekspresi gen Oct-4.

Metode: Ekstraksi RNA dilakukan pada Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells dan Breast Cancer Stem Cells. Ekspresi relatif dari gen Oct-4 didapatkan melalui One-Step quantitative RT-PCR. Analisis statistik dilakukan menggunakan SPSS 24.0.

Hasil: ADSC mengekspresikan lebih banyak Oct-4 mRNA, sebanyak 1.68 kali, dibandingkan USC.

Kesimpulan: Walaupun USC lebih primitif dan seharusnya juga lebih pluripoten, data menunjukkan bahwa ADSC memiliki pluripotency yang lebih tinggi dari USC. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk mengetahui gen pluripotency yang terlibat di pluripotency core network.


Background: Stem cell therapy, despite providing new alternative approaches to regenerative treatment still presents with problems of ethical barriers and immune rejection, especially in the use of embryonic stem cells (ESCs). The induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), has similar characteristics to ESCs yet is not restricted by the ethical problems. Oct-4 gene plays a crucial role in the maintenance of pluripotency and in the induction of pluripotent stem cells. The possibilities of using mesenchymal stem cells such as Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) and Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) for induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) are promising and still being explored. The pluripotency level of the ADSC and USC have not been conducted before. Therefore, this research aims to compare the pluripotency level between the two type of mesenchymal stem cells through the Oct-4 gene expression.

Method: Extraction of RNA was performed from Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells and Breast Cancer Stem Cells. The relative expression of Oct-4 gene was obtained through One-Step quantitative RT-PCR. Further statistical analysis was done using SPSS 24.0.

Results: The ADSC expressed higher levels of Oct-4 mRNA, by 1.68 times, compared to USC.

Conclusions: Although USC is more primitive and should be more pluripotent, the data suggests that ADSC has a greater pluripotency than USC. Further study is required to examine other pluripotency genes involved in the pluripotency core network.

;

Latar Belakang: Terapi sel punca, walaupun membuka alternatif baru terhadap tatalaksana regeneratif namun masih mempunyai hambatan dalam etik dan juga penolakan sistem imun, terutama dalam penggunaan sel punca embrionik (ESCs). Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), mempunyai karakteristik yang mirip dengan ESCs namun tidak dibatasi oleh masalah etik. Gen Oct-4 mempunyai peran penting dalam mempertahankan pluripotency dan juga dalam menginduksi sel iPSCs. Kemungkinan untuk menggunakan Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) dan Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) dalam pembuatan induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) sangat menjanjikan dan sedang dieksplorasi. Tingkat pluripotency dari ADSC dan USC belum pernah dilakukan sebelumnya. Maka dari itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan tingkat pluripotency antara dua jenis sel punca mesenkimal melalui ekspresi gen Oct-4.

Metode: Ekstraksi RNA dilakukan pada Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells dan Breast Cancer Stem Cells. Ekspresi relatif dari gen Oct-4 didapatkan melalui One-Step quantitative RT-PCR. Analisis statistik dilakukan menggunakan SPSS 24.0.

Hasil: ADSC mengekspresikan lebih banyak Oct-4 mRNA, sebanyak 1.68 kali, dibandingkan USC.

Kesimpulan: Walaupun USC lebih primitif dan seharusnya juga lebih pluripoten, data menunjukkan bahwa ADSC memiliki pluripotency yang lebih tinggi dari USC. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk mengetahui gen pluripotency yang terlibat di pluripotency core network.


Background: Stem cell therapy, despite providing new alternative approaches to regenerative treatment still presents with problems of ethical barriers and immune rejection, especially in the use of embryonic stem cells (ESCs). The induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), has similar characteristics to ESCs yet is not restricted by the ethical problems. Oct-4 gene plays a crucial role in the maintenance of pluripotency and in the induction of pluripotent stem cells. The possibilities of using mesenchymal stem cells such as Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) and Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) for induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) are promising and still being explored. The pluripotency level of the ADSC and USC have not been conducted before. Therefore, this research aims to compare the pluripotency level between the two type of mesenchymal stem cells through the Oct-4 gene expression.

Method: Extraction of RNA was performed from Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells and Breast Cancer Stem Cells. The relative expression of Oct-4 gene was obtained through One-Step quantitative RT-PCR. Further statistical analysis was done using SPSS 24.0.

Results: The ADSC expressed higher levels of Oct-4 mRNA, by 1.68 times, compared to USC.

Conclusions: Although USC is more primitive and should be more pluripotent, the data suggests that ADSC has a greater pluripotency than USC. Further study is required to examine other pluripotency genes involved in the pluripotency core network.

;

Latar Belakang: Terapi sel punca, walaupun membuka alternatif baru terhadap tatalaksana regeneratif namun masih mempunyai hambatan dalam etik dan juga penolakan sistem imun, terutama dalam penggunaan sel punca embrionik (ESCs). Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), mempunyai karakteristik yang mirip dengan ESCs namun tidak dibatasi oleh masalah etik. Gen Oct-4 mempunyai peran penting dalam mempertahankan pluripotency dan juga dalam menginduksi sel iPSCs. Kemungkinan untuk menggunakan Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) dan Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) dalam pembuatan induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) sangat menjanjikan dan sedang dieksplorasi. Tingkat pluripotency dari ADSC dan USC belum pernah dilakukan sebelumnya. Maka dari itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan tingkat pluripotency antara dua jenis sel punca mesenkimal melalui ekspresi gen Oct-4.

Metode: Ekstraksi RNA dilakukan pada Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells dan Breast Cancer Stem Cells. Ekspresi relatif dari gen Oct-4 didapatkan melalui One-Step quantitative RT-PCR. Analisis statistik dilakukan menggunakan SPSS 24.0.

Hasil: ADSC mengekspresikan lebih banyak Oct-4 mRNA, sebanyak 1.68 kali, dibandingkan USC.

Kesimpulan: Walaupun USC lebih primitif dan seharusnya juga lebih pluripoten, data menunjukkan bahwa ADSC memiliki pluripotency yang lebih tinggi dari USC. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk mengetahui gen pluripotency yang terlibat di pluripotency core network.


Background: Stem cell therapy, despite providing new alternative approaches to regenerative treatment still presents with problems of ethical barriers and immune rejection, especially in the use of embryonic stem cells (ESCs). The induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), has similar characteristics to ESCs yet is not restricted by the ethical problems. Oct-4 gene plays a crucial role in the maintenance of pluripotency and in the induction of pluripotent stem cells. The possibilities of using mesenchymal stem cells such as Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) and Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) for induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) are promising and still being explored. The pluripotency level of the ADSC and USC have not been conducted before. Therefore, this research aims to compare the pluripotency level between the two type of mesenchymal stem cells through the Oct-4 gene expression.

Method: Extraction of RNA was performed from Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells and Breast Cancer Stem Cells. The relative expression of Oct-4 gene was obtained through One-Step quantitative RT-PCR. Further statistical analysis was done using SPSS 24.0.

Results: The ADSC expressed higher levels of Oct-4 mRNA, by 1.68 times, compared to USC.

Conclusions: Although USC is more primitive and should be more pluripotent, the data suggests that ADSC has a greater pluripotency than USC. Further study is required to examine other pluripotency genes involved in the pluripotency core network.

;

Latar Belakang: Terapi sel punca, walaupun membuka alternatif baru terhadap tatalaksana regeneratif namun masih mempunyai hambatan dalam etik dan juga penolakan sistem imun, terutama dalam penggunaan sel punca embrionik (ESCs). Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), mempunyai karakteristik yang mirip dengan ESCs namun tidak dibatasi oleh masalah etik. Gen Oct-4 mempunyai peran penting dalam mempertahankan pluripotency dan juga dalam menginduksi sel iPSCs. Kemungkinan untuk menggunakan Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) dan Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) dalam pembuatan induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) sangat menjanjikan dan sedang dieksplorasi. Tingkat pluripotency dari ADSC dan USC belum pernah dilakukan sebelumnya. Maka dari itu, penelitian ini bertujuan untuk membandingkan tingkat pluripotency antara dua jenis sel punca mesenkimal melalui ekspresi gen Oct-4.

Metode: Ekstraksi RNA dilakukan pada Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells dan Breast Cancer Stem Cells. Ekspresi relatif dari gen Oct-4 didapatkan melalui One-Step quantitative RT-PCR. Analisis statistik dilakukan menggunakan SPSS 24.0.

Hasil: ADSC mengekspresikan lebih banyak Oct-4 mRNA, sebanyak 1.68 kali, dibandingkan USC.

Kesimpulan: Walaupun USC lebih primitif dan seharusnya juga lebih pluripoten, data menunjukkan bahwa ADSC memiliki pluripotency yang lebih tinggi dari USC. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk mengetahui gen pluripotency yang terlibat di pluripotency core network.


Background: Stem cell therapy, despite providing new alternative approaches to regenerative treatment still presents with problems of ethical barriers and immune rejection, especially in the use of embryonic stem cells (ESCs). The induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs), has similar characteristics to ESCs yet is not restricted by the ethical problems. Oct-4 gene plays a crucial role in the maintenance of pluripotency and in the induction of pluripotent stem cells. The possibilities of using mesenchymal stem cells such as Adipocyte-derived Stem Cells (ADSC) and Umbilical Cord-derived Stem Cells (USC) for induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) are promising and still being explored. The pluripotency level of the ADSC and USC have not been conducted before. Therefore, this research aims to compare the pluripotency level between the two type of mesenchymal stem cells through the Oct-4 gene expression.

Method: Extraction of RNA was performed from Adipocyte-derived Stem Cells, Umbilical Cord-derived Stem Cells and Breast Cancer Stem Cells. The relative expression of Oct-4 gene was obtained through One-Step quantitative RT-PCR. Further statistical analysis was done using SPSS 24.0.

Results: The ADSC expressed higher levels of Oct-4 mRNA, by 1.68 times, compared to USC.

Conclusions: Although USC is more primitive and should be more pluripotent, the data suggests that ADSC has a greater pluripotency than USC. Further study is required to examine other pluripotency genes involved in the pluripotency core network.

2020
T55356
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Mariska Anindhita
Abstrak :
LatarBelakang: Keberadaan sel Oct4 pada suatu struktur merupakan indikasi adanya sel dengan kapasitas pluripoten, disebut juga sel punca pluripoten yang sedang gencar diteliti karena manfaatnya. Dalam proses pengembangan sel punca pluripoten, masih ditemukan hambatan yaitu pengisolasian sumber sel dari embryo yang dianggap kontroversial. Dengan karakteristik kulit dan pandangan sebagai material yang terbuang paska sirkumsisi, kulit prepusium diduga memiliki sel punca pada lingkungan histologinya dan dirasa bisa menjadi sumber baru yang tidak kontroversial untuk sel punca pluripoten. Metode: Sampel diambil dari sirkumsisi massal yang kemudian diolah dengan proses histoteknik dan dilakukan proses staining oleh Hematoxylin-Eosin staining dan Immunohistochemistry Oct4 staining di Laboratorium Histologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Slide sampel yang diperoleh kemudian dilakukan mikrofoto menggunakan optilab dan dianalisa. Hasil: Sel Oct4 ditemukan pada kulit prepusium. Namun sel tersebut hanya ditemukan di beberapa lokasi, yaitu kelenjar sebasea, folikel rambut, pembuluh darah, dan lapisan hipodermis dari kulit. Kesimpulan: 80 dari sampel kulit prepusium yang diambil memiliki sel Oct4 dan sel hanya di temukan pada 4 lokasi spesifik kelenjar sebasea, hair follicle, pembuluh darah dan lapisan hipodermis.
Background The presence of Oct4 cell in a structure indicates the presence of pluripotent cell, which popular nowadays being on researched due to its benefit. In the development of the cell, an obstacle is found such as the isolation process of the cell rsquo s source, embryonic stem cell, is considered as controversial. With its skin characteristic and views as discarded material, preputial skin expected to possessed stem cell in its histological environment and has the potential to be new source of pluripotent stem cell that is not controversial. Method Sample was taken from mass circumcision event, which then undergo histotechnique process involved the staining with Hematoxylin Eosin Staining and Immunohistochemistry Oct4 staining in Histology Laboratory, Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Sample slide that obtain then being analyzed by microphoto of the slide under the microscope. Results Oct4 cells are found in the preputial skin. However, these cell only found limited in several locations such as sebaceous gland, hair follicle, blood vessel, and hypodermis layer of the skin. Conclusion 80 of the preputial skin sample possessed the Oct4 cells and these cells are only found in 4 specific locations sebaceous gland, hair follicle, blood vessel, and hypodermis layer.
Depok: Universitas Indonesia, 2015
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ahmad Baihaki Ramadhan
Abstrak :
Kanker telah menjadi salah satu masalah kesehatan utama di seluruh dunia dan menyebabkan banyak kematian. Kanker dapat ditemukan di banyak organ, dan kanker payudara adalah salah satu bentuk kanker yang paling banyak ditemukan. Sel punca kanker merupakan salah satu terobosan di bidang ini, dan dianggap sebagai penyebab perkembangan dan invasi kanker. Sel punca kanker memiliki sifat pluripotensi yang mirip seperti sel punca embrio. Seperti pada sel punca Embrio, pemeliharaan pluripotensi dan ekspresi gen pluripoten mereka ditemukan dalam kondisi hipoksia. Sel punca kanker payudara CD24-/ CD44 dipelajari untuk mengamati ekspresi gen pluripotensi di kondisi hipoksia. Salah satu gen pluripotensi yang diamati adalah KLF4, yang merupakan pengatur utama gen pluripoten lainnya di jaringan pluripotensi inti NANOG, SOX2, Oct4. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pluripotensi CD24-/ CD44 melalui aktivitas KLF4 selama hipoksia. Sel punca kanker payudara CD24-/ CD44 dipaparkan kondisi hipoksia 1 O2, 5 CO2 dan kemudian RNA diisolasi untuk digunakan untuk mendeteksi gen KLF4 menggunakan qRT-PCR. Analisis ekspresi gen diperoleh dari perhitungan Ct dari qRT-PCR dengan menggunakan metode Livak. Percobaan kami menunjukkan bahwa ekspresi gen KLF4 diturunkan dalam semua sampel yang terpapar hipoksia 0.5h, 4h, 6h, 24h . Kesimpulannya, ekspresi KLF4 pada sel kanker payudara CD24-/ CD44 yang digunakan dalam penelitian ini menurun mengikuti lamanya paparan hipoksia. ......Cancer has become one major health problem worldwide and cause so many death. Cancer can be found in many organ with breast cancer as one of the most commonly found form of cancer. Cancer stem cell is one breakthrough fInding that thought to be the cause of cancer progression and invasion. Cancer stem cells suggested to have same pluripotency property as in Embryonic Stem cells. As in Embryonic Stem cells, the maintenance of it rsquo s pluripotency and expression of their pluripotent gene are found in hypoxic condition. Breast cancer stem cells CD24 CD44 are studied to observe their expression of pluripotency gene under hypoxia condition. Such one of the pluripotency gene to be observed is KLF4, which role is as the master regulator of other pluripotent gene in core pluripotency network NANOG, SOX2, OCT4. Therefore, this experiment is aimed to investigate CD24 CD44 pluripotency through KLF4 activity during hypoxia. Breast cancer stem cells CD44 CD24 exposed to hypoxic condition 1 O2, 5 CO2 and then the RNA isolated to be used for KLF4 gene detection using one step qRT PCR. Gene expression analysis obtained from Ct calculation from qRT PCR using Livak Method. From the experiment we found that the KLF4 gene expression was downregulated in all the sample undergo hypoxia 0.5h, 4h, 6h, 24h . In conclusion, the KLF4 expression in breast cancer cells CD24 CD44 that was used in this study was decreasing following the length of hypoxia exposure.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Electra Amara Florence
Abstrak :
Latar Belakang: Kanker payudara triple negatif dikenal sebagai jenis kanker yang memiliki prognosis yang lebih buruk daripada jenis kanker payudara lainnya karena kurangnya terapi target dan tingkat kekambuhan dini dan metastasis yang lebih tinggi. Manganese superoxide dismutase (MnSOD), pertahanan utama melawan superoksida, telah ditemukan untuk memiliki peran ganda dalam kanker. Meskipun MnSOD mungkin memiliki peran penekan tumor pada tahap awal tumorigenesis, MnSOD akan kemudian mempunyai peran penting untuk kelangsungan hidup sel kanker saat tumor berkembang. Sel punca kanker, ditemukan dalam tingkat yang tinggi dalam kanker payudara triple negatif, adalah subpopulasi sel tumor yang memiliki kapasitas tumorigenisitas dan stress oksidatif yang tinggi. Sel punca kanker mengekspresikan faktor transkripsi seperti Oct4 dan Sox2 yang mengatur gen yang diperlukan untuk pembaruan diri dan pluripotensi sel punca kanker ini. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penekanan ekspresi MnSOD melalui gen knockout terhadap pluripotensi sel punca kanker payudara triple negatif dengan mengukur ekspresi protein Oct4 dan Sox2. Metode: Penelitian ini menggunakan satu kelompok kontrol BT-549 sel punca kanker payudara triple negatif dan dua kelompok BT549 sel punca kanker payudara triple negatif yang telah diberi perlakuan knockout gen MnSOD. Untuk setiap kelompok sampel, tiga pasase digunakan (P2, P3, P4). Protein Oct4 dan Sox2 yang diekspresikan oleh setiap pasase dari setiap kelompok dideteksi menggunakan Western blot dan area pita masing-masing protein kemudian dianalisis menggunakan program ImageJ. Hasil: Ditemukan adanya tren penurunan ekspresi protein Oct4 dan tren peningkatan ekspresi protein Sox2. Kesimpulan: Penekanan ekspresi MnSOD mungkin bisa menjadi target untuk mengubah tingkat pluripotensi sel punca kanker payudara triple negatif melalui interaksi tidak langsung dengan Oct4 dan Sox2. ......Introduction: Triple negative breast cancer is considered to have a poorer prognosis than other subtypes of breast cancer due to the lack of targeted therapies and its higher rate of early recurrence and distant metastasis. Manganese superoxide dismutase (MnSOD), the primary defense against superoxides, have been found to have a dual role in cancer. Although MnSOD may have a tumor-suppressing role in the early stages of tumorigenesis, it later becomes essential for the survival of the cancer cells as the tumor progresses. Cancer stem cells (CSCs), enriched in triple negative breast cancer, are a population of tumor cells that possess high capacity of tumorigenicity and oxidative stress. They express transcription factors such as Oct4 and Sox2 which regulate genes necessary for the self-renewal and pluripotency of these CSCs. This study aims to determine the impact of suppressing MnSOD expression through gene knockout on the pluripotency of triple negative breast cancer stem cells by measuring Oct4 and Sox2 protein expression. Methods: A control group of wild type BT-549 BCSCs and two groups of treated BT549 BCSCs were used in this study, with the treated groups having their MnSOD gene knocked out. For each group of samples, three passages were used (P2, P3, P4). The Oct4 and Sox2 proteins expressed by each passage number from each group were detected using Western blot and their respective area densities were then analyzed using the ImageJ program. Results: There was a decreasing trend in Oct4 protein expression and an increasing trend in Sox2 protein expression. Conclusion: Suppression of MnSOD expression may be a target to alter the pluripotency of triple negative BCSCs through its indirect interaction with Oct4 and Sox2.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2022
TA-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Sharon Hanmy Angel
Abstrak :
Latar Belakang: Penelitian sel induk sekarang ini telah banyak dieksplorasi untuk nilai kuratif yang menjanjikan dalam dunia medis. Minat di bidang ini dilatarbelakangi oleh kemampuan pembaharuan diri dan diferensiasi yang memberi sel induk potensi yang dapat diterapkan secara terapeutik. Sel induk embrionik sampai hari ini masih kontroversial karena masalah etika dan penghalang kekebalannya, yang mengarahkan kepada eksplorasi sumber sel induk dari sumber lainnya termasuk jaringan adiposit dan jaringan tali pusar. Sel induk berada di microenvironment yang kompleks dan berbagai penelitian telah membuktikan bahwa tingkat oksigen terbatas diperlukan untuk pemeliharaan kapasitas proliferasi dan pluripotency. Hipoksia adalah salah satu kekuatan pendorong paling berpengaruh untuk angiogenesis yang memungkinkan kelangsungan hidup sel induk melalui adaptasi metabolik dan ekspresi gen pro-survival hidup seperti Hypoxia-inducible Factors (HIFs). HIF2α mengatur ekspresi SOX2 dan NANOG dalam kondisi hipoksia, mempertahankan kapasitas proliferasi dan pluripotency sel punca. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis ekspresi relatif HIF2α pada sel induk dari jaringan tali pusar dan jaringan adiposit untuk menentukan tingkat kapasitas proliferasi. Metode: Sel punca diekstraksi dari jaringan adiposit dan jaringan tali pusar. RNA diisolasi dan VarioskanTM Flash multimode Reader digunakan untuk mengkonfirmasi kemurnian sampel. One-Step qRT-PCR digunakan untuk mengukur ekspresi relatif gen HIF2α. Produk PCR lalu diproses dengan elektroforesis gel untuk mengkonfirmasi keakuratan amplifikasi gen. Hasil: Gen HIF2α dinyatakan lebih tinggi di UCSC dibandingkan dengan ADSC. Kesimpulan: Hasilnya menunjukkan bahwa dalam kondisi normal, UCSC memiliki pluripotency yang lebih tinggi daripada ADSC. Perluasan penelitian harus dilakukan untuk mengkonfirmasi ekspresi relatif HIF2α dalam kondisi hipoksia.
Background: Current stem cell research has been explored for promising curative value in the medical world. Interest in this field is motivated by the ability of self-renewal and differentiation that gives potential stem cells that can be applied therapeutically. Embryonic stem cells to this day are controversial because of ethical issues and their immune barriers, which lead to exploration of stem cell sources from other sources including adipocyte tissue and umbilical cord tissue. Stem cells are in a complex microenvironment and various studies have proven that limited oxygen levels are needed for maintenance of proliferation and pluripotency capacity. Hypoxia is one of the most influential driving forces for angiogenesis that allows continuity stem cell life through metabolic adaptation and expression of pro-survival living genes such as Hypoxia-inducible Factors (HIFs). HIF2α regulates the expression of SOX2 and NANOG in hypoxic conditions, maintaining the proliferation capacity and pluripotency of stem cells. This study aims to analyze the relative expression of HIF2α in stem cells from umbilical cord tissue and adipocyte tissue to determine the level of proliferation capacity. Method: Stem cells are extracted from adipocyte tissue and umbilical cord tissue. RNA isolated and Vari PostingTM Flash multimode Reader is used to confirm sample purity. One-step qRT-PCR is used to measure the relative expression of the HIF2α gene. The PCR product is then processed with gel electrophoresis to confirm the accuracy of gene amplification. Results: The HIF2α gene was expressed higher at UCSC compared to ADSC. Conclusion: The results show that under normal conditions, UCSC has higher pluripotency than ADSC. Extensive research must be carried out to confirm the relative expression of HIF2α in hypoxic conditions.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2017
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library