Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Indonesia mempunyai keragaman sumber daya alam yang potensial dalam penemuan obat. Kapang tanah menghasilkan metabolit yang berperan penting dalam bidang kesehatan. Dihidroorotat dehidrogenase Plasmodium falciparum PfDHODH, salah satu enzim mitokondrial yang esensial dalam biosintesis pirimidin parasit, merupakan target spesifik dalam penemuan kandidat obat antimalaria.Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengelusidasi struktur kimia metabolit aktif kapang tanah, hasil skrining aktivitas kapang tanah asal Indonesia, sebagai kandidat antimalaria dengan aktivitas penghambatan enzim PfDHODH. Isolasi senyawa aktif dari ekstrak kasar butanolik kaldu fermentasi kapang tanah dilakukan dengan fraksinasi berbasis uji aktivitas. Isolasi dan purifikasi senyawa aktif dari Talaromyces cellulolyticus BioMCC-f.T.2334 dari Flores menghasilkan senyawa murni SA dengan IC50 sebesar 1,40 mM terhadap enzim PfDHODH dan tidak menunjukkan aktivitas penghambatan terhadap enzim homolog manusia.Senyawa SA menunjukkan aktivitas penghambatan terhadap kultur sel Plasmodium falciparum 3D7 dengan IC50 sebesar 1,00 mM. Elusidasi struktur terhadap senyawa SA menunjukkan bahwa senyawa tersebut merupakan 2,3-dihidroksi-4?-metil-7-okso-2,3,4,4?,5,7-heksahidro-pirido[1,2-?]indazol-9-karboksi metil ester. Senyawa SA1 berpotensi sebagai senyawa penuntun inhibitor enzim PfDHODH.

---

Indonesia is a mega biodiversity country, provides opportunities in drug discovery. Soil fungi produce valuable metabolites with important role in health. Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase PfDHODH , an essential mitochondrial enzyme in de novo pyrimidine biosynthesis pathway of the parasite, is an attractive target in malarial therapy.The aim of this research was to isolate and elucidate the chemical structure of active metabolite from soil fungi broth as antimalarial candidate with PfDHODH inhibitory activity. Isolation of active compound from microbial broth was conducted by bio assay guided fractionation. Isolation and purification of active compound from microbial broth of Talaromyces cellulolyticus BioMCC f.T.2334 isolated from Flores obtained compound SA with IC50 1.40 mM against PfDHODH, and exhibited no inhibitory activity against human homolog.Compound SA suppressed Plasmodium falciparum 3D7 growth with IC50 1.00 mM. Structure elucidation exhibited compound SA as 2,3 dihydroxy 4 methyl 7 oxo 2,3,4,4 ,5,7 hexahydro pyrido 1,2 indazole 9 carboxy methyl ester that showed high potency as lead compound of PfDHODH inhibitor."

"DNA Polimerase merupakan enzim sintesis DNA yang dimanfaatkan dalam metode amplifikasi DNA Polymerase Chain Reaction (PCR) untuk deteksi penyakit. Proses PCR dilakukan pada suhu tinggi dan memungkinkan terjadinya denaturasi enzim, sehingga diperlukan DNA polimerase yang termostabil dari bakteri termofilik. Penggunaan PCR yang meningkat mengakibatkan akibat masa pandemi mengakibatkan harga enzim tinggi. Sampai saat ini Indonesia masih menggunakan DNA polimerase dari impor sehingga menyebabkan tingginya biaya operasi. Di sisi lain, Indonesia memiliki potensi besar dalam pemanfaatan bakteri termofilik alami sehingga memungkinkan dilakukannya produksi DNA polimerase dari bakteri termofilik lokal seperti Geobacillus thermoleovorans strain SGAir0734 (GBK Pol) yang diisolasi dari sumber air panas Batu Kuwung, Banten. Sebelumnya, GBK Pol telah berhasil diproduksi pada skala laboratorium dalam flask 1000 ml. Pada penelitian ini, GBK Pol sekuens utuh diproduksi pada dalam flask yang diisi 50 ml, 100 ml, dan 250 ml serta pada skala bench menggunakan fermentor dengan volume kerja 3000 ml. GBK Pol berhasil dipurifikasi menggunakan metode immobilized metal affinity chromatography (IMAC), kemudian diuji menggunakan SDS-PAGE dan menghasilkan protein GBK Pol pada ±50 kDa. Kondisi optimum kultur pada fermentor mencakup: induksi IPTG pada jam ke-2 setelah kultur dan inkubasi setelah induksi selama 3 jam.

---

DNA polymerase is a DNA synthesis enzyme that is utilized in DNA polymerase chain reaction (PCR) amplification method for disease detection. PCR process is carried out at high temperatures which allows denaturation of the enzyme, therefore, a thermostable DNA polymerase from thermophilic bacteria is required. The increased usage of PCR after the pandemic resulting in high enzyme prices. Until now, Indonesia still uses DNA polymerase from imports, causing high operating costs. On the other hand, Indonesia has great potential in utilizing naturally occurring thermophilic bacteria to produce DNA polymerase from local source such as the Geobacillus thermoleovorans strain SGAir0734 (GBK Pol) isolated from Batu Kuwung hot springs, Banten. Previously, GBK Pol had been successfully produced on a laboratory scale in 1000 ml flasks. In this study, a full sequence GBK Pol was produced with working volume of 50 ml, 100 ml and 250 ml in flasks and 3000 ml in a fermenter. GBK Pol was successfully purified using the immobilized metal affinity chromatography (IMAC) method, and tested using SDS-PAGE, resulting in GBK Pol protein at ±50 kDa. The optimum conditions for culture on the fermentor were as follows: induction of IPTG after 2 hours and 3 hours incubation after induction."

"Fermentasi Penicillium chrysogenum membutuhkan sumber nitrogen untuk meningkatkan biosintesis penisilin G. Umumnya sumber nitrogen yang digunakan adalah Corn Steep Liquor (CSL) yang diperoleh dari produk samping pengolahan jagung. Ketergantungan pada CSL perlu dikurangi untuk mengantisipasi penurunan produksi jagung akibat pemanasan global. Ikan rucah, ikan berkualitas rendah dan kurang bernilai ekonomis, memiliki protein relatif tinggi. Ikan yang dihidrolisis menggunakan papain merupakan sumber asam amino yang diduga dapat menjadi sumber nitrogen pengganti CSL. Tujuan penelitian ini adalah menggunakan ikan rucah petek dalam bentuk hidrolisat protein ikan (HPI) sebagai sumber nitrogen alternatif pengganti CSL dalam biosintesis penisilin G oleh P. chrysogenum. Ikan tersebut dihidrolisis pada variasi konsentrasi papain kasar dari getah pepaya, suhu, dan lama hidrolisis. Persentase derajat hidrolisis digunakan sebagai parameter reaksi hidrolisis. Kondisi optimum hidrolisis diperoleh secara statistik menggunakan pendekatan one-factor-at-a-time dan response surface methodology. HPI dengan derajat hidrolisis tertinggi dikarakterisasi komposisi asam amino, visualisasi fragmen peptida, dan digunakan sebagai pengganti CSL dalam media fermentasi P. chrysogenum untuk produksi penisilin G. Derajat hidrolisis optimum sekitar 18% diperoleh dari reaksi hidrolisis ikan menggunakan 0,75% papain kasar pada 55,1o C selama 5,74 jam. Komposisi asam amino HPI lebih tinggi dibandingkan dengan CSL. Reaksi hidrolisis telah membentuk fragmen peptida dengan berat molekul lebih rendah. Sebanyak 189 g/L HPI telah meningkatkan produksi penisilin G sekitar 1,8 kali lipat lebih tinggi dibandingkan dengan penggunaan CSL. Berdasarkan hasil yang diperoleh, HPI rucah petek dapat menjadi sumber nitrogen alternatif pengganti CSL untuk produktivitas P. chrysogenum dalam biosintesis penisilin G dan memiliki potensi sebagai sumber protein terbarukan

---

Fermentation of P. chrysogenum requires a nitrogen source to enhance the biosynthesis of penicillin G. The nitrogen source used is corn steep liquor (CSL) solution obtained from corn processing byproducts. Dependency on the CSL needs to reduce in anticipation of a decrease in corn production due to global warming. Trash fish, low-quality and less economically valuable fish, have relatively high protein. Fish hydrolyzed using papain is a source of amino acids that will be a nitrogen source to substitute CSL. This research aims to use trash fish in the form of Fish Protein Hydrolyzate (FPH) as an alternative nitrogen source to substitute CSL for penicillin G biosynthesis by P. chrysogenum. The fish was hydrolyzed at varying concentrations of crude papain from papaya latex, temperature, and hydrolysis duration. The percentage degree of hydrolysis was used as the hydrolysis reaction parameter. The optimum hydrolysis conditions were statistically obtained using the one-factor-at-a-time and response surface methodology approach. FPH with the highest degree of hydrolysis was characterized for amino acid composition, visualization of peptide fragments, and used as a substitute for CSL in P. chrysogenum fermentation medium for penicillin G production. The optimum hydrolysis degree of about 18% was obtained from fish hydrolysis reaction using 0.75% crude papain at 55.1o C for 5.74 hours. The amino acid composition of FPH was higher than that of CSL. The hydrolysis reaction has formed peptide fragments with lower molecular weight. A total of 189 g/L FPH has increased the production of penicillin G by about 1.8-fold higher than the use of CSL. Therefore, FPH can be an alternative nitrogen source to CSL for the productivity of P. chrysogenum in penicillin G biosynthesis and has the potential as a renewable protein source."