Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Empat belas isolat actinomycetes berhasil diisolasi dari tanah di sekitar kawasan geothermal Cisolok, Jawa Barat. Keseluruhan isolat actinomycetes dilakukan pengujian pertumbuhan pada berbagai suhu dan medium pertumbuhan untuk mengetahui pertumbuhan optimum. Hasil pengujian diperoleh bahwa empat belas isolate mampu tumbuh pada suhu 25, 30, 35, 40 dan 45 °C yang diinkubasi pada ISP 1 agar selama 7 hari, namun pertumbuhan optimal mencapai batas suhu tertinggi terjadi pada suhu 45 °C dibandingkan pada suhu 50 dan 55 °C. Pada suhu 50 °C diketahui 10 dari 14 isolat mampu tumbuh dan 14 isolat tidak mampu tumbuh apada suhu 55 °C. Uji pertumbuhan pada berbagai medium diperoleh bahwa empat belas isolat mampu tumbuh pada 6 jenis medium pertumbuhan (ISP 1 agar, ISP 2 agar, ISP 3 agar, Modiffied Bennet’s agar, Mm 1 agar, dan Mm2 agar) yang di inkubasi pada suhu 45 °C selama 7 dan 14 hari, namun tumbuh optimal pada medium ISP 1 agar dan ISP 3 agar. Penelitian ini juga bertujuan untuk diperoleh isolat actinomycetes termofilik yang potensial sebagai penghasil senyawa antimikroba dan amilase berdasarkan pendekatan OSMAC yaitu variasi medium dan suhu inkubasi. Penapisan aktivitas antimikroba dilakukan pada isolat yang ditumbuhkan di 6 jenis medium pertumbuhan yang diinkubasi pada suhu 45 °C selama 7 dan 14 hari menggunakan metode agar plug diffusion. Hasil penapisan aktivitas antimikroba diperoleh bahwa 8 dari 14 isolat menunjukkan hasil positif terhadap aktivitas antimikroba yaitu SL1-1-R-1, SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, SL1-1-R-10, SL2-2-R-6, SL2-2-R-13, SL3-2-R-38 A2 dan SL3-2-R-38 A3. Aktivitas antibakteri terhadap S. aureus ditemukan pada tiga isolat (SL1-1-R-1, SL2-2-R-6, dan SL3-2-R-38 A3), B. subtilis pada dua isolat (SL3-2-R-38 A2 dan SL3-2-R-38 A3), dan K. rhizophila ditemukan pada tiga isolat (SL1-1-R-1, SL2-2-R-13, dan SL3-2-R-38 A3). Aktivitas antifungi terhadap C. albicans ditemukan pada empat isolat (S SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, SL1-1-R10, dan SL2-2-R-6), A. niger pada empat isolat (SL1-1-R-1, SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, dan SL2-2- R-6,) dan A. flavus pada satu isolat (SL2-2-R-6). Penapisan aktivitas amilolitik dilakukan dengan metode starch agar plate pada medium Mm + 1 % pati terlarut yang diinkubasi pada tiga suhu berbeda yaitu 45, 50 dan 55 °C selama 3 dan 7 hari. Hasil penapisan aktivitas amilolitik diperoleh bahwa 14 isolat positif terhadap aktivitas amilolitik. Sebanyak 14 isolat mampu mendegradasi pati pada suhu 45 °C (11 isolat mulai mendegradasi pati di hari ke-3 sedangkan 14 isolat mendegradasi pati pada hari ke-7), dua belas isolat mampu mendegradasi pati pada suhu 50 °C (9 isolat mendegradasi pati mulai dari hari ke-3 hingga hari ke-7 dan tiga isolat lainnya hanya pada hari ke-7). ......Fourteen of actinomycetes isolates were successfully isolated from the soil around the Cisolok geothermal area, West Java. All actinomycetes isolates were tested for growth at various temperatures and growth mediums to determine optimum growth. The results obtained the 14 isolates were able to grow at temperatures of 25, 30, 35, 40, and 45 °C were incubated at ISP 1 agar for 7 days, but optimal growth reached the highest temperature limit at 45 °C compared to 50 and 55 °C. At 50°C, it was found that 10 out of 14 isolates were able to grow and 14 not able to growth at 55 °C. Growth tests on various media showed that fourteen isolates were able to grow on six types of growth medium (ISP 1 agar, ISP 2 agar, ISP 3 agar, Modified Bennet's agar, Mm 1 agar, and Mm2 agar) were incubated at 45 °C for 7 and 14 days, but grew optimally on ISP 1 agar and ISP 3 agar. This study also aims to obtain thermophilic actinomycetes isolates that have the potential to produce antimicrobial compounds and amylase based on the OSMAC approach (variation of medium and temperatures). The screening for antimicrobial activity was carried out on isolates grown in 6 types of growth medium which were incubated at 45 °C for 7 and 14 days using the agar plug diffusion methods. The results showed that 8 out of 14 isolates showed positive results for antimicrobial activity, namely SL1-1-R-1, SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, SL1-1-R-10, SL2 -2-R-6, SL2-2-R-13, SL3-2-R-38 A2, and SL3-2-R-38 A3. Antibacterial activity against S. aureus was found in three isolates (SL1-1-R-1, SL2-2-R-6, and SL3-2-R-38 A3), B. subtilis in two isolates (SL3-2-R -38 A2 and SL3-2-R-38 A3), and K. rhizophila were found in three isolates (SL1-1-R-1, SL2-2-R-13, and SL3-2-R-38 A3). Antifungal activity against C. albicans was found in four isolates (S SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, SL1-1-R-10, and SL2- 2-R-6), A. niger in four isolates (SL1-1-R-1, SL1-1-R-3, SL1-1-R-6, and SL2-2-R-6,) and A. flavus on one isolate (SL2-2-R-6). Screening for amylolytic activity using starch agar plate methods was carried out on Mm medium + 1% soluble starch and was incubated at three different temperatures; 45, 50, and 55 °C for 3 and 7 days. The results showed that 14 isolates were positive for amylolytic activity. A total of 14 isolates were able to degrade starch at 45 °C (11 isolates began to degrade starch on day 3 , while 14 isolates degraded starch on day 7), twelve isolates were able to degrade starch at 50 °C (9 isolates degraded starch from day 3 to day 7, and three other isolate only on day 7).

Abstrak :
Dalam rangka pencarian aktivitas antimikroba dari aktinomycetes di Papua, sebanyak seratus isolat Actinomycetes yang berasal dari tanah dan serasah dari beberapa ekosistem di Pulau Batanta dan Salawati, Papua Barat telah diuji. Sebanyak 200 ekstrak dari 100 isolat Actinomycetes telah diperoleh melalui dua tahap ekstraksi. Metabolit non polar diekstraksi menggunakan pelarut etil asetat : metanol (4:1), sedangkan metabolit polar diperoleh dari pemekatan medium menggunakan metode kering beku. Berdasarkan hasil pengujian menggunakan metode difusi agar, sebanyak 43 dari 200 ekstrak (21,5%) memiliki aktivitas antimikroba terhadap bakteri dan khamir (Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis NBRC 3134, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Micrococcus luteus NBRC 1367, Candida albicans NBRC 1594, dan Saccharomyces cerevisiae NBRC 10217). Hasil penelitian menunjukkan beberapa ekstrak Actinomycetes memiliki aktivitas anti bakteri gram negatif (1,5%), anti bakteri gram positif (17%), dan anti fungi (17%). Metabolit yang diekstraksi dengan pelarut etil asetat : metanol lebih aktif (35%) dibandingkan dengan pelarut air (17%). Sebanyak lima isolat yang memiliki aktivitas antimikroba tertinggi (BL-13-5, BL-06-5, BL-14-2, BL-22-3, dan Sl-36-1) diidentifikasi berdasarkan data sekuen gen 16S rRNA. Berdasarkan hasil pencarian homologi dengan program BLAST, diperoleh homologi spesies berturut-turut adalah Streptomyces kanamyceticus (92%), Streptomyces verne (92%), Streptomyces narbonensis (92%), Streptomyces malachitofuscus (98%), dan Streptomyces hygroscopicus (96%).

---

In the framework of exploitation of antimicrobial activity of Actinomycetes in Papua, one hundred isolates of Actinomycetes isolated from soil and leaf litter samples from various ecosystems in Batanta and Salawati Island, Raja Ampat, West Papua were screened. We obtained 200 crude extracts from 100 isolates based on two extraction phases. Nonpolar metabolites were extracted by ethyl acetate : methanol (4:1) solvent while the polar metabolites were concentrated using a freeze-drying method. Based on the agar dilution method, a total of 43 from 200(21.5%) crude extracts have antimicrobial activity against bacteria and yeasts (Escherichia coli NBRC 14237, Bacillus subtilis NBRC 3134, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Micrococcus luteus NBRC 1367, Candida albicans NBRC 1594 and Saccharomyces cerevisiae NBRC 10217). Some crude extracts showed anti-Gram negative (1.5%), anti-Gram positive (17%) and antifungal (17%) activities. Crude metabolites which were extracted using ethyl acetate : methanol were more effective on antimicrobial activity (35%) compared with water extraction (17%). Five most potential isolates (BL-13-5, BL-06-5, BL-14-2, BL-22-3, and Sl-36-1) were identified based on 16S rRNA gene sequence data. Sequence similarity search by BLAST program revealed that they show sequence similarities to Streptomyces kanamyceticus (92%), Streptomyces verne (92%), Streptomyces narbonensis (92%), Streptomyces malachitofuscus (98%), and Streptomyces hygroscopicus (96%), respectively.

Abstrak :
(+)-2,2?-Epicytoskyrin A, a bis-anthraquinone isolated from fungal endophyte Diaporthe sp. GNBP-10 associated with Uncaria gambir Roxb., was investigated for its antifungal activity. The broth microdilution method was used to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) against 22 yeast strains and three filamentous fungi. The MICs of (+)-2,2?-epicytoskyrin A ranged from 16 to 128 μg/mL, which exhibited lower activity than the antifungal nystatin. A study of the mechanism of action revealed similar effects of (+)-2,2?-epicytoskyrin A and nystatin on Candida tropicalis at their MICs (16 and 8 μg/mL, respectively) and 2 times of the MIC. Both compounds caused cytoplasmic material and ion leakages on fungal cell, which were characterized by an increase in absorbance at 260 nm and 280 nm as well as Ca2+ and K+ ion concentrations. The morphology of the fungal cells after (+)-2,2?-epicytoskyrin A treatment was observed under a scanning electron microscope. The control cells, which were not treated with either (+)-2,2?- epicytoskyrin A or nystatin, showed a smooth surface, while the cells treated with either (+)-2,2?-epicytoskyrin A or nystatin shrank and displayed a donut-like shape. More shrinkage was observed in the 2 times MIC concentration and even more in the cells exposed to nystatin. The action of (+)-2,2?-epicytoskyrin A was proposed through membrane disruption.

Aktivitas Antijamur (+)-2,2?-Episitoskirin A dan Aksi Disrupsi Membran. (+)-2,2?-Episitoskirin A, suatu senyawa bis-antrakuinon yang diisolasi dari jamur endofit Diaporthe sp. GNBP-10 yang berasosiasi dengan Uncaria gambier Roxb., telah diuji aktivitas antifungi-nya. Metode mikrodilusi cair digunakan untuk menentukan konsentrasi hambat minimum (KHM) terhadap 22 strain khamir dan tiga strain kapang. KHM dari (+)-2,2?-episitoskirin A berkisar antara 16 hingga 128 μg/mL, menunjukkan aktivitas yang lebih rendah dibandingkan antijamur nistatin. Studi terhadap mekanisme kerja dari senyawa uji menunjukkan bahwa (+)-2,2?-episitoskirin A dan nistatin memiliki efek yang serupa terhadap Candida tropicalis pada konsentrasi KHM (16 dan 8 μg/mL) dan dua kali KHM-nya. Keduanya menyebabkan terjadinya kebocoran material sitoplasmik dan ion pada sel khamir yang ditandai dengan meningkatnya absorban pada panjang gelombang 260 nm dan 280 nm, serta meningkatnya konsentrasi ion Ca2+ dan K+. Morfologi dari sel khamir setelah diberi perlakuan diamati di bawah Scanning Electron Microscope. Sel kontrol yang tidak diberi perlakuan, baik dengan (+)-2,2?-episitoskirin A maupun nistatin, menunjukkan permukaan yang halus, sementara sel yang diberi perlakuan dengan (+)-2,2?-episitoskirin A dan nistatin masing-masing mengalami pengerutan dan berbentuk seperti donat. Pengerutan sel ini bertambah pada konsentrasi 2 kali KHM dan semakin bertambah pada sel yang diberi perlakuan dengan nistatin. Dari studi yang dilakukan, mekanisme kerja dari (+)-2,2?-episitoskirin A diduga melalui perusakan pada membran sel.