Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 50 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Mualifah
Abstrak :
Ion magnesium (Mg2+) merupakan salah satu faktor utama yang berperan dalam kondensasi kromatin menjadi kromosom. Berbagai penelitian mengenai pengaruh Mg2+ terhadap struktur kromosom sel HeLa telah dilakukan, namun hingga saat ini pengaruh Mg2+ terhadap pola banding yang menunjukkan bagian heterokromatin dan eukromatin belum diketahui. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui pengaruh Mg2+ terhadap kondensasi kromosom sel HeLa menggunakan teknik G-Band-Trypsin-Leishman (GTL) banding karyotyping. Sediaan sebaran metafase kromosom diperoleh dari kultur sel HeLa, kemudian dilakukan banding menggunakan pewarna Leishman. Pengaruh Mg2+ dievaluasi dengan memberikan tiga larutan yang berbeda, yaitu larutan XBE5 yang mengandung 5 mM Mg2+ sebagai kontrol, larutan XBE (0 mM Mg2+), dan larutan 1 mM EDTA sebagai chelator kation. Data yang diperoleh dianalisis secara kualitatif dengan mengamati struktur dan pola banding kromosom, serta secara kuantitatif dengan menganalisis nilai kromosom berdasarkan jumlah band yang dihasilkan sesuai dengan Quality Assessment (QA) dari International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada 5 mM Mg2+ struktur kromosom padat dengan nilai 2 hingga 3 dan memiliki pola banding yang jelas. Sementara itu, kromosom pada 0 mM Mg2+ memiliki area kromosom yang meluas dan struktur kromosom lebih fibrous dengan pola banding yang tipis. Kromosom pada 0 mM Mg2+ memiliki nilai panjang 2 hingga 4. Struktur kromosom pada 1 mM EDTA masih terlihat dengan struktur fibrous, namun dengan batas yang sulit ditentukan dan pola banding yang dihasilkan kabur. Nilai kromosom pada 1 mM EDTA berkisar antara 3 hingga 6. Hasil pengamatan struktur, pola banding, dan nilai kromosom yang diperoleh menunjukkan kromosom pada 0 mM Mg2+ dan 1 mM EDTA lebih panjang dari kromosom kontrol (5 mM Mg2+). Kromosom pada 5 mM Mg2+ lebih padat dengan band yang dihasilkan lebih jelas jika dibandingkan dengan kromosom yang diberikan perlakuan dengan 0 mM Mg2+ dan 1 mM EDTA. Hal ini menunjukkan bahwa magnesium diperlukan untuk menjaga kondensasi struktur kromosom sel HeLa.
Magnesium ion (Mg2+) is one of the major factors responsible for chromosome condensation. Studies about the effects of Mg2+ on chromosome structure of the HeLa cell have been reported, however, the effects of Mg2+ on the banding pattern showing the heterochromatin and euchromatin areas are yet to be investigated. This research was carried out to determine the effect of Mg2+ on chromosome condensation of the HeLa cells structure using karyotyping by G-Band-Trypsin-Leishman (GTL) banding technique. Chromosome were obtained from the cultured HeLa cell. The chromosomes banding was evaluated using Leishman dye. The effect of Mg2+ was evaluated by giving three different solutions, namely XBE5 solution containing 5 mM Mg2+ as a control, XBE solution (0 mM Mg2+), and 1 mM EDTA solution as cation chelator. The obtained data was analyzed qualitatively by observing the structure and banding pattern of the chromosomes, as well as quantitatively by analyzing the value of chromosomes based on the number of bands produced according to the Quality Assessment (QA) from International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). The results showed that at 5 mM Mg2+, chromosome structure was more solid with a value of 2 to 3 and had a clear banding pattern. Meanwhile, the chromosomes treated with buffer containing 0 mM Mg2+ showed an expanded chromosome area and a more fibrous structure with a pale banding pattern, the chromosome at 0 mM Mg2+ showed a value of 2 to 4. Futhermore, the structure of chromosomes treated with EDTA was still visible with fibrous structure, but with boundaries that were difficult to determined and the blurred banding pattern. The value of the chromosome in 1 mM EDTA ranges from 3 to 6. Based on the observations of the structure, banding pattern, and the value obtained, the chromosomes at 0 mM Mg2+ and 1 mM EDTA were longer than those treated with 5 mM Mg2+. Chromosomes at 5 mM Mg2+ were more condensed with the clear bands compared to those treated with 0 mM Mg2+ and 1 mM EDTA. These results further emphasize that Mg2+ is required for chromosome condensation and maintenance of chromosome structure of the HeLa cell.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2019
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Siska Apriliana Kusumawati
Abstrak :
Penelitian untuk mengetahui pengaruh waktu pengambilan pucuk daun terhadap fase mitosis Hibiscus rosa-sinensis L. variasi double red telah dilakukan sejak Januari 2018 hingga Mei 2018. Pembuatan preparat kromosom dilakukan menggunakan metode squashing yang terdiri dari tahap pengambilan bahan, pretreatment, fiksasi, hidrolisis, dan squashing/pemencetan. Pengambilan pucuk daun dilakukan pada lima waktu yang berbeda, yaitu pukul 08.00 WIB, 09.00 WIB, 10.00 WIB, 11.00 WIB, dan 12.00 WIB. Waktu pengambilan pucuk yang menunjukkan persentase profase akhir tertinggi dan interfase yang rendah dijadikan parameter waktu terbaik pengambilan pucuk daun H. rosa-sinensis L. variasi double red untuk studi kromosom. Morfologi dan jumlah kromosom diamati di bawah mikroskop Leica DM500 dengan perbesaran 10 x 40 dan 10 x 100, dan dihitung menggunakan aplikasi ImageJ. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pengambilan sampel pukul 10.00 WIB merupakan waktu terbaik untuk observasi kromosom. Pengaruh waktu pengambilan pucuk daun terhadap fase mitosis dapat dilihat melalui fase interfase dan profase akhir. Hasil uji Kruskal-Wallis menunjukkan adanya pengaruh waktu pengambilan pucuk daun terhadap fase interfase dan profase akhir sel pucuk daun H. rosa-sinensis L. variasi double red P < 0,05 . Berdasarkan hasil Uji Mann Whitney pada kedua fase tersebut, pengambilan pucuk daun pukul 10.00 WIB tidak berbeda nyata dengan pukul 11.00 WIB. Morfologi kromosom H. rosa-sinensis L. variasi double red yang diperoleh berukuran kecil, dengan jumlah kromosom yang banyak 2n=ca. 26--46 dan bersifat miksoploidi. Hasil penelitian ini dapat dijadikan dasar untuk penelitian terkait kromosom selanjutnya.
The study to determine the effect of leaf rsquo s shoots sampling time on mitotic phases of Hibiscus rosa sinensis L. double red flower has been carried out from January 2018 until May 2018. Preparation of chromosome slides was done using a squashing method. The method consist of sampling stage, pretreatment, fixation, hydrolysis, and squashing punching. The sampling has been done at five different times, at 08.00 a.m, 09.00 a.m, 10.00 a.m, 11.00 a.m, and 12.00 a.m. The sampling time showing the highest late prophase percentage and lowest interphase were determined as the most optimum time for H. rosa sinensis L. double red flower leaf rsquo s shoots sampling for chromosome studies. Morphology and number of chromosomes were observed under the Leica DM500 microscope with magnification 10 x 40 and 10 x 100, and calculated using the ImageJ application. The results showed that 10.00 a.m. was the most optimum time for chromosome observation. The effect of leaf rsquo s shoots sampling time on the mitotic phases can be seen through the percentage of interphase and late prophase. The result of Kruskal Wallis test showed that leaf rsquo s shoots sampling time had a significantly effect on interphase and late prophase of cell phase Hibiscus rosa sinensis double red flower leaf rsquo s shoots P 0,05 . Based on Mann Whitney test of both phases, leaf rsquo s shoots sampling time at 10.00 a.m did not significantly affect with 11.00 a.m. The chromosome of H. rosa sinensis L. double red flower obtained in this study has small size with large numbers of chromosomes 2n ca.26 46 and were mixoploid. The results of this study would be beneficial for further chromosome analysis.
2018
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Nur Annisa Iriani
Abstrak :
ABSTRAK
Penelitian dilakukan untuk mengetahui pengaruh waktu pengambilan pucuk daun terhadap fase pembelahan sel dan mengetahui waktu optimum pengambilan pucuk daun untuk mengamati fase pembelahan sel Hibiscus rosa-sinensis L. variasi single pink besar. Waktu pengambilan pucuk yang dilakukan yaitu pada pukul 08:00--16:00 WIB, dengan jarak waktu dua jam yaitu pada pukul 08:00, 10:00, 12:00, 14:00, 16:00 WIB. Metode squash dengan pewarna Aceto-orcein digunakan untuk pembuatan sediaan kromosom. Tahapan perlakuan meliputi perendaman pucuk daun di dalam air dingin selama 3 jam, fiksasi dalam larutan Carnoy selama 24 jam, dan hidrolisis dalam larutan HCl 5N selama 30 menit. Data perhitungan jumlah setiap fase sel interfase, profase awal, profase akhir, metafase, anafase, dan telofase dianalisis dengan menggunakan uji Kruskall-Wallis. Jumlah profase akhir yang tinggi, serta jumlah interfase, metafase, anafase, dan telofase yang rendah digunakan untuk waktu optimum pengambilan pucuk untuk studi kromosom. Hasil uji Kruskall-Wallis menunjukkan bahwa waktu pengambilan pucuk berpengaruh terhadap fase sel interfase, profase awal, dan profase akhir pucuk daun Hibiscus rosa-sinensis. Pukul 10:00 merupakan waktu optimum pengambilan pucuk untuk studi kromosom. Morfologi kromosom Hibiscus rosa-sinensis L. variasi single pink besar yang diperoleh berukuran kecil, dengan jumlah kromosom banyak 2n=ca. 69--111 dan bersifat mixoploid.
ABSTRACT
The research conducted to determine the effect on collecting the leaf shoots time of the phase of cell division and to find out the optimal time of collecting the leaf shoots time to observe the phase of cell division of Hibiscus rosa sinensis. Period time of collection the leaf shoots is from 08 00 AM to 16 00 PM, with two hours gap each at 08 00, 10 00, 12 00, 14 00, 16 00 pm. The squash method with Aceto orcein dye used for making preparation of chromosomes. Treatment steps include soaking the leaf shoots in cold water for 3 hours, fixation in Carnoy solution for 24 hours, and hydrolysis in 5N HCl solution for 30 minutes. The total calculated data on the number of each cell phase interphase, early prophase, late prophase, metaphase, anaphase, and telophase were analyzed by Kruskall Wallis test. The high number of resulted prophase, as well as low number of interphase, metaphase, anaphase, and low telophase are used to determine the optimum time of collecting the leaf shoots for chromosome studies. The result of Kruskall Wallis test showed that shoots sampling time had a significantly effect on interphase, early prophase, and late prophase of cell phase Hibiscus rosa sinensis leaf shoots. The optimum time of collection the leaf shoots for chromosome study is at 10 00 The results showed that leafs shoots sampling at 10 00 is the optimum time of shooting for chromosome studies. The chromosome morphology of Hibiscus rosa sinensis L. large single pink flower resulted small size, with numorous chromosomes number 2n ca. 69 111 and mixoploid.
2018
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Hardini Puspitaningrum
Abstrak :
Penelitian kromosom meiosis dan berbagai tahapan pembelahan sel dari beberapa stages perkembangan bunga Hibiscus schizopetalus telah dilakukan sejak bulan Maret hingga Mei 2018. Penelitian ini mengamati kromosom meiosis dan melihat berbagai tahapan pembelahan sel yang ditemukan pada stage 1 sampai 6 yang dikaitkan dengan proses mikrosporogenesis dan karakteristik kromosom haploid atau diploid yang ditemukan pada tiap stages tersebut. Sampel kuncup bunga yang digunakan dalam penelitian diisolasi dari stage 1 sampai 6 dan dikumpulkan pada pukul 09.00 WIB. Sampel kuncup bunga yang berada pada stage 1 sampai 3 diisolasi dari bagian calyx dan epicalyx-nya, sedangkan sampel kuncup bunga yang berada pada stage 4 sampai 6 diisolasi bagian anther-nya untuk digunakan dalam penelitian. Preparat kromosom dibuat dengan menggunakan metode squash aceto-orcein. Hasil pengamatan kromosom menunjukkan bahwa kecenderungan pembelahan meiosis 1 ditemukan pada stage 1 sampai 3, sedangkan pembelahan meiosis 2 cenderung ditemukan pada stage 4 sampai 6. Struktur mikrospora diketahui ditemukan pada stage 4, 5, dan 6, sedangkan struktur polen ditemukan pada stage 6. Peluang ditemukannya kromosom yang bersifat haploid semakin tinggi seiring dengan peningkatan stages perkembangan bunga. Diperlukan studi lebih lanjut terkait kromosom dan pembelahan sel pada stages perkembangan bunga dari tanaman lain. ......The research on meiotic chromosome and various cell division phases from several stages of Hibiscus schizopetalus flower development had been conducted from March to May 2018. This research observed meiotic chromosome and discovered the various cell division phases that took place in stages 1 to 6 of the flower developmental stages. The association of the results with the process of microsporogenesis and the chromosomal characteristics haploid or diploid which were found at those stages were further assessed. Flower buds that were used in the study were isolated from stages 1 to 6 and were collected at 9 A.M. Flower buds from stages 1 to 3 were isolated from the calyx and epicalyx, while flower buds from stages 4 to 6 were isolated on the anther part. Chromosome preparation was carried out using the method of aceto orcein squash. The result of chromosomal observation found that the tendency of meiosis 1 was found in stages 1 to 3, whereas meiosis 2 tended to be found in stages 4 to 6. The microspore structure was found in stage 4, 5, and 6, while the structure of pollen was found in stage 6. Haploid chromosomes were found to increase along with the increase of the stages of flower development. Further studies are needed to learn more about chromosome and cell division in the flower developmental stages of other plants.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Fendi Sofyan Arifudin
Abstrak :
Struktur kromosom berperan penting dalam pembagian materi genetik pada siklus sel. Hingga saat ini, penelitian mengenai faktor utama yang berperan dalam kondensasi kromosom terus dilakukan, salah satunya ion magnesium. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengetahui pengaruh perbedaan konsentrasi ion magnesium (Mg2+) terhadap struktur permukaan dan bagian dalam kromosom sel HeLa menggunakan mikroskop fluoresens dan high resolution microscopy meliputi Scanning Electron Microscope (SEM), Helium Ion Microscope (HIM), Transmission Electron Microscope (TEM), dan Focused Ion Beam/Scanning Electron Microscope (FIB/SEM) dengan teknik preparasi ionic liquid. Sel HeLa dikultur kemudian diisolasi kromosomnya menggunakan metode Polyamine (PA). Kromosom sel HeLa kemudian diberikan tiga perlakuan berbeda meliputi larutan XBE5 dengan 5 mM Mg2+ sebagai kontrol, perlakuan larutan XBE tanpa Mg2+, dan perlakuan 1 mM EDTA sebagai chelator kation. Kromosom sel HeLa selanjutnya difiksasi dengan 2,5% glutaraldehyde dan post-fiksasi menggunakan OsO4. Kromosom kemudian diwarnai dengan DAPI (4,6-diamidino-2-phenylindole) untuk pengamatan dengan mikroskop fluoresens dan Platinum Blue untuk pengamatan dengan high resolution microscopy. Kromosom yang telah diwarnai dan diberi 0,5% ionic liquid BMI-BF4 kemudian diamati sesuai prosedur masing-masing high resolution microscopy. Hasil pengamatan kualitatif menunjukkan kromosom sel HeLa kontrol memiliki struktur yang lebih padat, tidak pipih, dengan kromatid yang tidak berlubang dibandingkan dengan kromosom yang diberi perlakuan XBE dan EDTA. Hasil pengukuran kuantitatif menunjukkan panjang rata-rata kromosom kontrol 2,95 μm ± 0,99868 dengan ketebalan kromatid 500 nm. Kromosom sel HeLa yang diberikan perlakuan XBE tanpa Mg2+ memiliki panjang rata-rata 4,2 μm ± 1,1964 dengan ketebalan kromatid 310 nm. Panjang rata-rata kromosom sel HeLa yang diberikan perlakuan 1 mM EDTA adalah 8,65 μm ± 3,85762 dengan ketebalan kromatid 200 nm. Hasil pengamatan dan pengukuran menunjukkan kromosom kontrol XBE5 dengan 5 mM Mg2+ memiliki struktur permukaan dan bagian dalam yang lebih padat dibandingkan dengan kromosom yang diberi perlakuan larutan XBE dan 1 mM EDTA. Hasil tersebut menunjukkan pentingnya ion magnesium dalam kondensasi kromosom.
Chromosome structure is crucial for the equal distribution of genetic materials into the daughter cells during the cell cycle. To date, the major factors for chromosome condensation have been being evaluated, including Magnesium ions. This research aimed to evaluate the effects of Magnesium ions (Mg2+) concentrations on HeLa chromosome surface and inner structure observed by high-resolution microscopies including Scanning Electron Microscope (SEM), Helium Ion Microscope (HIM), Transmission Electron Microscope (TEM), and Focused Ion Beam/Scanning Electron Microscope (FIB/SEM) using ionic liquid method. HeLa cells were cultured and the chromosomes were isolated using Polyamine (PA) method. The chromosomes were treated with different buffers, XBE5 (contained 5 mM Mg2+) as control, XBE (contained 0 mM Mg2+) and 1 mM EDTA as a cations chelator. HeLa chromosomes were then fixed with 2.5% glutaraldehyde and post-fixed with OsO4. Chromosomes were stained with DAPI (4,6-diamidino-2-phenylindole) and Platinum Blue for fluorescence and high-resolution microscopy observation, respectively. Finally, the chromosomes were subjected to ionic liquid treatment using 0.5% BMI-BF4 prior to high-resolution microscopy observation. The qualitative results showed that the control HeLa chromosomes had a more compact structure without any fibres as compared to those treated with XBE and 1 mM EDTA. The quantitative results showed that the average chromosome length of the control was 2,95 μm ± 0,99868 with the chromatid thickness of 500 nm, while the XBE- and EDTA-treated chromosomes showed the average length of 4,2 μm ± 1,1964 and 8,65 μm ± 3,85762, respectively, with the chromatid thickness of 310 nm and 200 nm. The results of this study revealed that the chromosome treated with XBE5 (control) has a more compact surface and inner structure as compared to those treated with XBE and EDTA. The results of this study further revealed the importance of Mg2+ on chromosome condensation.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2019
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Rizka Arifah Iskandar
Abstrak :

Gen mismatch repair (MMR) merupakan gen yang berperan dalam mekanisme DNA repair. Gen MMR dapat memperbaiki kesalahan pasangan basa, perubahan nukleotida dan kesalahan dalam unit pengulangan pasangan basa (microsatellites) selama proses replikasi DNA. Mutasi pada MMR yang umum terjadi pada gen MLH1 dan MSH2 memiliki asosiasi dengan terjadinya Lynch Syndrome pada pasien kanker kolon. Lynch Syndrome (LS) atau Hereditary Non-Polyposis Colorectal Carcinoma (HNPCC) merupakan sindrom kanker kolon herediter yang paling umum diwariskan. LS dapat ditandai dengan mutasi gen MLH1 dan MSH2 berupa delesi dan duplikasi large genomic. Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) merupakan teknik kuantifikasi berbasis PCR yang dapat digunakan untuk mendeteksi perubahan copy number variant pada large genomic. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi mutasi gen MLH1 dan MSH2 pada kanker kolon dengan teknik Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA). Sebanyak 25 sampel darah pasien yang terdiagnosis kanker kolon yang dikumpulkan secara retrospektif di Rumah Sakit Kanker Dharmais dikoleksi dari tahun 2018-2019. Mutasi gen MLH1 dan MSH diidentifikasi pada sampel darah pasien yang terdiagnosis kanker kolon dengan teknik MLPA menggunakan Probemix P003-D1 MLH1/MSH2 (MRC-Holland). Penelitian ini berhasil melakukan optimalisasi penggunaan teknik MLPA dengan terpenuhinya kualitas fragmen kontrol MLPA, kualitas fragment analysis, dan comparative analysis pada perangkat lunak Coffalayser.Net. Hasil screening pada 25 sampel menunjukkan tidak ditemukan adanya pola mutasi gen MLH1 dan MSH2 pada sampel yang mengindikasikan tidak terjadinya Lynch Syndrome dan kanker kolon yang terjadi bersifat sporadis.


Mismatch repair genes (MMR) plays a role in the mechanism of DNA repair. The MMR genes correct base pair errors, nucleotide changes, and errors in base pair repeating units (microsatellites) during DNA replication. Mutations in MMR are common in MLH1 and MSH2 genes that have an association with the occurrence of Lynch Syndrome in colon cancer. Lynch Syndrome or Hereditary Non-Polyposis Colorectal Carcinoma (HNPCC) is the most common inherited hereditary colon cancer syndrome. LS is characterized by MLH1 and MSH2 gene mutations in the form of large genomic deletions and duplication. Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) is a PCRbased quantification technique that can detect changes in copy number variants in large genomics. The aim of the study was to identify MLH1 and MSH2 gene mutations in colon cancer with Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) technique. Twenty-five blood samples of patients diagnosed with colon cancer were collected in Dharmais Cancer Hospital collected in 2018-2019, retrospectively. Mutations in MLH1 and MSH2 genes were identified in blood samples of patients diagnosed with colon cancer by the MLPA technique using Probemix P003-D1 MLH1/MSH2 (MRC-Holland). This study succeeded in optimizing the use of MLPA technique by fulfilling the fragments quality control of MLPA, the quality of fragment analysis, and comparative analysis in Coffalayser.Net software. The results of 25 samples screening showed no pattern of MLH1 and MSH2 gene mutations in the sample. This data indicated that there was no Lynch Syndrome and the colon cancer was sporadic.

Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Vycka Fikriyani Fairuz
Abstrak :
Kondensasi kromosom pada tahap metafase memiliki peranan penting dalam keberlangsungan siklus sel. Sejauh ini masih terus dilakukan penelitian mengenai faktor yang mempengaruhi kondensasi kromosom. Kation divalen, terutama kalsium (Ca2+) diketahui memiliki peranan penting dalam kondensasi kromosom manusia. Akan tetapi, peranan Ca2+ terhadap kromosom tumbuhan belum diketahui. Gandum merupakan salah satu organisme model dalam sitogenetika. Oleh karena itu, diperlukan penelitian mengenai efek Ca2+ kalsium terhadap kondensasi kromsosom gandum (Triticum spp.). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengaruh pemberian 1 mM BAPTA (1, 2-bis(2-aminophenoxy) ethane-N, N, N′, N′-tetraacetic acid), 1 mM EDTA (Ethylenediaminetetraacetic acid), sebagai pelekat Ca2+, terhadap struktur kromosom gandum menggunakan mikroskop cahaya dan Scanning Electron Microscope (SEM). Kecambah gandum dipotong bagian ujung akar dan diinkubasi di dalam larutan PFA (Paraformaldehyde) 2%. Sampel diinkubasi dengan enzim selulase 2,5 % dan pectoliase 2,5%. Setelah itu sampel diberi perlakuan masing-masing dengan 1 mM BAPTA, 1 mM EDTA, dan kontrol dengan PBS. Kromosom kemudian diwarnai dengan aceto orcein sedangkan yang diamati SEM dipreparasi melalui tahap fiksasi, post-fiksasi, staining, dehidrasi, dan dikeringkan dengan HMDS (hexamethyldisilazane) sebelum diamati menggunakan SEM. Hasil yang diperoleh pada pengamatan kuantitatif menunjukkan panjang rata-rata untuk kromosom kontrol 12,5±3,4 µm sedangkan pada perlakuan 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA panjang rata-rata yang diperoleh adalah 17,7±6,6 µm dan 41,9±16,3 µm. Struktur kromosom kontrol secara kualitatif lebih padat dan lebih terkondensasi. Akan tetapi kromosom yang diberi perlakuan 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA menunjukkan hasil yang lebih panjang, tersebar, dan terjadi dekondensasi kromosom sehingga serat-serat kromatin lebih terlihat jelas. Hal tersebut menunjukkan Ca2+ memiliki peranan penting dalam kondensasi kromosom gandum. ......Chromosome condensation at metaphase has an important role in the continuation of the cell cycle. Researches on the investigation of the major factors affecting chromosome condensation has been conducted so far. Divalent cations, especially Ca2+ has been reported to have an important role in human chromosome condensation. Nevertheless, its effect on the plant chromosome has yet to be evaluated. Wheat (Triticum spp.) is one of the model organisms in cytogenetics.Therefore, study to evaluate the effect of Ca2+ on wheat chromsosomes is required. The purpose of this study was to determine the effect of 1 mM BAPTA and 1 mM EDTA as the Ca2+ chelating agent on the wheat chromosomes using light microscope and SEM (Scanning Electron Microscope). The root tips of wheat sprouts was cut off and incubated in a 2% PFA (Paraformaldehyde)  solution. The sample was incubated with 2.5% cellulase and 2.5% pectoliase enzyme. After that, the samples were treated with 1 mM BAPTA, 1 mM EDTA, and PBS as control. Chromosome were then stained with aceto orcein, while sample for SEM were subjected to SEM preparation including fixation, post-fixtaion, staining, dehydration, and HMDS (hexamethyldisilazane)  drying. The results showed that the average length of the control chromosome was 12.5±3.4 µm, while those treated with 1 mM BAPTA and 1 mM EDTA showed the average length of 17.7 ± 6.6 µm and 41. 9 ± 16.3 µm, respectively. The qualitative observation of the control chromosomes showed the more compact and condensed structure. However, chromosomes treated with 1 mM BAPTA and 1 mM EDTA showed a longer, dispered, and decondensed chromosome showing the chromatin fibers. This result indicated that Ca2+ play an important role in wheat chromosome condensation.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Azzahra Ayu Gigantia
Abstrak :
Kasus kanker yang terjadi terutama kanker serviks menempati urutan kedua dengan pengidap terbesar di dunia. Peningkatan kasus tersebut diikuti dengan perkembangan berbagai pengobatan baik secara kimia maupun alami. Salah satunya adalah dengan memanfaatkan senyawa yang terdapat pada ekstrak tanaman akar wangi (Chrysopogon zizanioides (L.) Roberty) sebagai alternatif pengobatan antikanker. Penelitian ini dilakukan untuk melihat pengaruh variasi konsentrasi ekstrak akar wangi. Konsentrasi yang digunakan terdiri dari 5, 10, 15, dan 20 μg/mL. Variasi konsentrasi tersebut diuji terhadap viabilitas sel HeLa menggunakan metode trypan blue dan ultrastruktur sel HeLa menggunakan SEM. Hasil uji statistik menunjukkan bahwa tidak terdapat perbedaan signifikan nilai viabilitas antara sampel kontrol dan perlakuan. Namun, ekstrak akar wangi konsentrasi 20 μg/mL terlihat lebih mampu menurunkan viabilitas sel HeLa dibandingkan dengan variasi konsentrasi lainnya. Salah satu pengaruh ekstrak terhadap viabilitas dapat diamati ultrastrukturnya dan diukur diameter selnya. Pengamatan ultastruktur menunjukkan bahwa konsentrasi 20 μg/mL menghasilkan lebih banyak blebbing dan memiliki diameter sel lebih besar dibandingkan konsentrasi lainnya. Berdasarkan hasil yang diperoleh dapat disimpulkan bahwa ekstrak akar wangi memiliki pengaruh terhadap viabilitas dan ultrastruktur sel HeLa. ...... Cancer cases that occur, especially cervical cancer, ranks second with the largest sufferers in the world. The increase in cases was followed by the development of various treatments, both chemical and natural. One way is to utilize the compounds contained in vetiver plant extracts (Chrysopogon zizanioides (L.) Roberty) as an alternative to cancer treament. This research was conducted to see the effect of variations in the concentration of vetiver extract.. The concentration used consist of 5, 10, 15, and 20 μg/mL. These concentration variations were tested on HeLa cell viability using the trypan blue method and HeLa cell ultrastructure using SEM. The statistical test results showed that there was no significant difference in the viability values between the control and treatment samples. However, vetiver extract concentration of 20 μg/mL was more able to reduce HeLa cell viability compared to other concentration variations. One of the effects of extract on viability can be observed for its ultrastructure and measured cell diameter. Ultrastructural observations showed that the concentration of 20 μg/mL produced more blebbing and had a larger cell diameter than the other concentrations. Based on the results obtained, it can be concluded that vetiver extract has an influence on the viability and ultrastructure of HeLa cells.
Depok: Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Zahratul Aliifah Saumi
Abstrak :
Kanker serviks merupakan kanker dengan jumlah kasus tertinggi kedua di Indonesia. Banyaknya jumlah kasus kanker di Indonesia serta kasus kematian akibat kanker menyebabkan diperlukannya pengembangan obat-obatan untuk menyembuhkan kanker. Pengobatan yang ada dinilai cukup efektif tetapi memiliki beberapa efek samping yang berbahaya, sehingga diperlukan juga pengembangan obat antikanker dari bahan-bahan alami seperti ekstrak tumbuhan. Minyak esensial akar wangi memiliki potensi antikanker, akan tetapi pengaruh konsentrasi minyak esensial akar wangi perlu diteliti. Tujuan dari penelitian adalah untuk mengetahui pengaruh variasi konsentrasi minyak esensial akar wangi terhadap sel HeLa. Sel HeLa diberikan empat perlakuan dengan variasi konsentrasi (5 µg/mL, 10 µg/mL, 15 µg/mL, dan 20 µg/mL) minyak esensial akar wangi dan dilakukan pengulangan sebanyak lima kali. Viabilitas sel diuji menggunakan WST-1 dan Scepter cell counter. Nilai viabilitas pada metode WST-1 dihitung berdasarkan nilai absorbansi, sedangkan nilai viabilitas pada metode Scepter cell counter dihitung berdasarkan ukuran diameter sel. Semakin tinggi nilai absorbansi, maka semakin tinggi juga nilai viabilitasnya. Untuk ukuran diameter, sel HeLa yang viable memiliki rentang diameter 12—14 µm. Hasil penelitian menunjukkan tiap variasi konsentrasi minyak esensial akar wangi memiliki efek yang tidak signifikan terhadap viabilitas sel HeLa. Namun, minyak esensial akar wangi 15 µg/mL dan 20 µg/mL memiliki kecenderungan paling besar dalam menurunkan viabilitas sel HeLa berdasarkan hasil uji viabilitas dengan WST-1 dan Scepter cell counter. Kesimpulan dari penelitian adalah minyak esensial akar wangi tidak memberikan pengaruh yang signifikan terhadap viabilitas sel HeLa, akan tetapi terdapat konsentrasi tertentu yang memiliki kecenderungan dalam menurunkan viabilitas sel HeLa, yaitu konsentrasi 15 µg/mL dan 20 µg/mL. ...... Cervical cancer is the cancer with the second highest number of cases in Indonesia. The large number of cancer cases in Indonesia as well as cases of death due to cancer make it necessary to develop drugs to cure cancer. Existing treatments are considered quite effective but have several dangerous side effects, so it is also necessary to develop anticancer drugs from natural ingredients such as plant extracts. Vetiver essential oil has anticancer potential, but the effect of vetiver essential oil concentration needs to be studied. The aim of the research was to determine the effect of varying concentrations of vetiver essential oil on HeLa cells. HeLa cells were given four treatments with varying concentrations (5 µg/mL, 10 µg/mL, 15 µg/mL, and 20 µg/mL) of vetiver essential oil and repeated five times. Cell viability was tested using WST-1 and Scepter cell counter. The viability value in the WST-1 method is calculated based on the absorbance value, while the viability value in the Scepter cell counter method is calculated based on the size of the cell diameter. The higher the absorbance value, the higher the viability value. In terms of diameter, viable HeLa cells have a diameter range of 12—14 µm. The results showed that each variation in vetiver essential oil concentration had an insignificant effect on HeLa cell viability. However, 15 µg/mL and 20 µg/mL vetiver essential oil had the greatest tendency to reduce HeLa cell viability based on the results of viability tests with WST-1 and Scepter cell counter. The conclusion of the research is that vetiver essential oil does not have a significant effect on HeLa cell viability, but there are certain concentrations that have a tendency to reduce HeLa cell viability, namely concentrations of 15 µg/mL and 20 µg/mL.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Erina Aurellia Athallah
Abstrak :
Kanker serviks merupakan salah satu jenis kanker yang paling banyak diderita wanita di Indonesia. Pengobatan kanker serviks seperti operasi, kemoterapi, dan radioterapi masih terus diupayakan, namun tingkat kesembuhan penderita kanker serviks masih rendah, yaitu dengan 1-year survival rate hanya sekitar 10-20%. Salah satu tanaman terapeutik di Indonesia yang memiliki aktivitas antikanker adalah bajakah tampala (Spatholobus littoralis Hassk). Nanopartikel bajakah tampala dilaporkan memiliki sitotoksisitas sedang terhadap sel HeLa. Namun, belum diketahui konsentrasi optimal ekstrak bajakah tampala terhadap sel HeLa berdasarkan viabilitas dan ultrastruktur sel. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui pengaruh variasi konsentrasi ekstrak bajakah tampala (100, 150, 200 dan 250 µg/mL) terhadap viabilitas sel HeLa menggunakan trypan blue dan ultrastruktur sel HeLa dengan scanning electron microscope (SEM). Hasil analisis statistik dengan tingkat kepercayaan 0,05 menunjukkan terdapat perbedaan signifikan nilai persentase viabilitas sel antara kontrol dan perlakuan konsentrasi ekstrak bajakah tampala. Hasil pengamatan ultrastruktur dengan scanning electron microscope menunjukkan terdapat perbedaan ultrastruktur sel HeLa antara sampel kontrol dengan perlakuan. Hasil tersebut menunjukkan bahwa konsentrasi ekstrak bajakah tampala 100 μg/mL, 150 μg/mL, 200 μg/mL dan 250 μg/mL memiliki pengaruh terhadap viabilitas dan ultrastruktur sel HeLa. Konsentrasi 200 μg/mL cenderung lebih mampu menekan viabilitas sel dan menunjukkan karakteristik apoptosis secara ultrastruktur. ...... Cervical cancer is one of the cancer that most women suffer from in Indonesia. Treatment for cervical cancer such as surgery, chemotherapy and radiotherapy is still being attempted, but the cure rate for cervical cancer sufferers is still low, with a 1-year survival rate of only around 10-20%. One of the therapeutic plants in Indonesia that has anticancer activity is bajakah tampala (Spatholobus littoralis Hassk.). Bajakah tampala nanoparticles were reported to have moderate cytotoxicity against HeLa cells. However, the optimal concentration of bajakah tampala extract for HeLa cells is not yet known based on cell viability and ultrastructure. The aim of this research was to determine the effect of varying concentrations of bajakah tampala extract (100, 150, 200 and 250 µg/mL) on HeLa cell viability using trypan blue and HeLa cell ultrastructure using a scanning electron microscope (SEM). The results of statistical analysis with a confidence level of 0.05 show that there is a significant difference in the percentage value of cell viability between the control and the bajakah tampala extract concentration treatment. The results of ultrastructural observations using a scanning electron microscope showed that there were differences in the ultrastructure of HeLa cells between control and treated samples. These results indicate that the concentrations of bajakah tampala extract of 100 μg/mL, 150 μg/mL, 200 μg/mL and 250 μg/mL have an influence on the viability and ultrastructure of HeLa cells. A concentration of 200 μg/mL tends to be more capable of suppressing cell viability and shows ultrastructural characteristics of apoptosis.
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5   >>