Search Result  ::  Save as CSV :: Back

"Resuscitation-promoting factor D (RpfD) merupakan protein imunogenik yang berperan untuk proses resusitasi Mycobacterium tuberculosis yang dorman menjadi bakteri yang aktif. Seed vaksin yang membawa gen pengkode protein tersebut, pcDNA3.1-rpfD telah berhasil dikonstruksi serta terbukti mampu menginduksi respon imun seluler dan humoral. Pada penelitian ini, efikasi seed vaksin pcDNA3.1-rpfD terhadap pertumbuhan M. tuberculosis dianalisis melalui mycobacterial growth inhibition assay (MGIA). Delapan belas ekor mencit BALB/c diimunisasi dengan pcDNA3.1-rpfD, pcDNA3.1 atau BCG sebanyak 3x dengan interval 2 pekan. Satu pekan setelah imunisasi terakhir, splenosit dan PBMC mencit diko-kultur dengan bakteri M. tuberculosis pada 3 x 104 CFU selama 96 jam kemudian bakteri dire-kultur kembali dalam sistem kultur otomatis BACTECTM MGITTM. Time to positivity (TTP) tiap perlakuan dibandingkan sebagai indikator penghambatan pertumbuhan M. tuberculosis. Hasil penelitian menunjukkan bahwa splenosit dan PBMC mencit yang diimunisasi dengan pcDNA3.1-rpfD memberikan penundaan waktu TTP yang signifikan dibandingkan pcDNA3.1 (p=0,024 dan p=0,047) dan BCG (p=0,412 dan p=0,081). Hasil penelitian ini menunjukkan kemampuan pcDNA3.1-rpfD dalam menghambat pertumbuhan M. tuberculosis. Adapun pengukuran kadar IFNγ dengan metode ELISA tidak menunjukkan adanya perbedaan yang bermakna antar kelompok perlakuan. Selain itu, tidak terdapat korelasi antara kadar IFNγ tersebut dengan nilai TTP.

---

Resuscitation-promoting factor D (RpfD) is a protein involved in the resuscitation of dormant Mycobacterium tuberculosis into active bacteria. The seed vaccine carrying the rpfD gene, pcDNA3.1-rpfD has been successfully constructed. It was demonstrated that this vaccine induce cellular and humoral immune responses. In this study, the efficacy of pcDNA3.1-rpfD against the growth of M. tuberculosis was analyzed using mycobacterial growth inhibition assay (MGIA). Eighteen BALB/c mice were immunized with pcDNA3.1-rpfD, pcDNA3.1 or BCG 3 times at 2-week intervals. One week after the last immunization, splenocytes and PBMCs of mice were co-cultured with M. tuberculosis at 3 x 104 CFU for 96 hours then the bacteria were re-cultured in the BACTECTM MGITTM automated culture system. Time to positivity (TTP) of each treatment was compared as an indicator of M. tuberculosis growth inhibition. The results showed that splenocytes and PBMCs of mice immunized with pcDNA3.1-rpfD gave a significant delay in TTP compared to pcDNA3.1 (p=0.024 and p=0.047) and BCG (p=0.412 and p=0.081). The results of this study showed the ability of pcDNA3.1-rpfD to inhibit the growth of M. tuberculosis. No significant diffeence of IFNγ level measured with ELISA between the treatment groups. Besides, there was no correlation between the IFNγ level and the TTP value."

"Tuberkulosis (TB) adalah penyakit akibat infeksi Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). Bacille Calmette-Guérin (BCG) adalah satusatunya vaksin berlisensi untuk melawan TB, terbukti efektif pada anak-anak tetapi tidak pada orang dewasa. Tim Peneliti Vaksin Departemen Mikrobiologi FKUI telah mengembangkan kandidat vaksin TB berbasis vaksin DNA pcDNA3.1-rpfB. Kandidat vaksin ini terbukti dapat menginduksi respon imun humoral dan seluler pada mencit tetapi belum diketahui potensinya. Baku emas uji potensi vaksin TB adalah metode tantang. Fasilitas laboratorium hewan BSL3 untuk metode tantang tidak tersedia di FKUI. Oleh karena itu, dalam penelitian ini digunakan Mycobacterial Growth Inhibition Assay (MGIA). Prinsip MGIA adalah merekultur M. tuberculosis pada Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGITTM) dari hasil co-culture M. tuberculosis dengan sel mamalia yang sebelumnya telah diberi perlakuan dengan pcDNA3.1-rpfB, pcDNA3.1 (kontrol negatif), dan BCG (kontrol positif). MGITTM akan memberikan nilai Time to Positivity, yaitu waktu yang dibutuhkan hingga terdeteksi positif pertumbuhan M. tuberculosis. Selain itu, dilakukan juga pengukuran kadar IFNγ terhadap supernatan hasil co-culture. Berdasarkan hasil penelitian ini disimpulkan bahwa pcDNA3.1-rpfB dapat menghambat pertumbuhan M. tuberculosis secara in-vitro yang tidak berbeda dengan BCG. Kadar IFNγ hasil co-culture M. tuberculosis dengan sel mamalia tidak berkorelasi dengan tingkat penghambatan pertumbuhan M. tuberculosis secara in-vitro.

---

Tuberculosis (TB) is caused by Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). Bacille Calmette-Guérin (BCG) is the only licensed vaccine against TB, effective in children but not in adults. The Vaccine Research Team, Department of Microbiology FKUI has developed a DNA based TB vaccine candidate pcDNA3.1-rpfB. This candidate has been shown to induce immune responses in mice but its potency is unknown. The gold standard for potency testing of TB vaccine is a challenge method. BSL3 animal laboratory for the challenge method are not available at FKUI. Therefore, this study used Mycobacterial Growth Inhibition Assay (MGIA). The principle of MGIA is to reculture M. tuberculosis in Mycobacteria Growth Indicator Tube (MGITTM) from co-cultured M. tuberculosis with mammalian cells that have been previously treated with pcDNA3.1-rpfB, pcDNA3.1 (negative control), and BCG (positive control). MGITTM will show Time to Positivity, time taken until a positive growth of M. tuberculosis is detected. In addition, measurements of IFNγ levels by ELISA were also carried out. This study concluded that pcDNA3.1-rpfB could inhibit the growth of M. tuberculosis in-vitro which was not different from BCG. IFNγ levels from co-culturing did not correlate with the level of inhibition of the growth of M. tuberculosis in-vitro."

"

Pneumonia karena Streptococcus pneumoniae merupakan penyebab utama kematian balita yang sebenarnya dapat dicegah dengan vaksinasi. Penelitian ini bertujuan menilai efektivitas Pneumococcal Conjugate Vaccine-13 (PCV13) dengan imunisasi dasar 2 dosis dan 1 dosis penguat (jadwal 2 + 1).

Penelitian kohort prospektif dilakukan di tiga Kabupaten Nusa Tenggara Barat pada bulan November 2017–Juni 2019. Subjek adalah bayi usia dua bulan, dibagi menjadi kelompok PCV13 dan kontrol. Vaksinasi PCV13 dilakukan oleh Dinas Kesehatan Provinsi NTB pada bulan Oktober 2017. Subjek dilakukan usap nasofaring 4 kali saat berusia 2, 4, 12, dan 18 bulan, kemudian spesimen dikultur, diidentifikasi serotipe, dan diuji kepekaannya terhadap antibiotik.

Proporsi S. pneumoniae pada usia 2 bulan adalah 22,9% pada kelompok vaksin dan 19,1% pada kontrol. Evaluasi pada usia 12 bulan menunjukkan kolonisasi S. pneumoniae lebih tinggi dibandingkan usia 2 bulan pada kedua kelompok (chi square, p < 0,01). Kolonisasi S. pneumoniae serotipe vaksin PCV13 (serotipe VT) pada kelompok vaksin menurun pada usia 18 bulan diikuti kenaikan serotipe yang tidak terdapat di vaksin PCV13 (serotipe NVT). Pada kontrol serotipe VT meningkat dengan bertambahnya usia (chi square, p < 0,05). PCV13 menurunkan kolonisasi S. pneumoniae serotipe 6A/6B (serotipe dominan). Pola kepekaan terhadap antibiotik tidak berubah dengan bertambahnya usia pada kedua kelompok. Disimpulkan pemberian PCV13 dengan jadwal 2 + 1 efektif menurunkan kolonisasi S. pneumoniae serotipe VT di nasofaring.

 

Kata kunci:    kepekaan terhadap antibiotik, kolonisasi nasofaring, perubahan serotipe, pneumonia, proporsi

---

Pneumonia caused by Streptococcus pneumoniae is the leading cause of vaccine-preventable deaths in children under five years old. The study aims to assess the effectiveness of the Pneumococcal Conjugate Vaccine-13 (PCV13) administration with 2 primary doses and 1 booster (2 + 1 schedule).

This prospective cohort study was conducted in three districts of West Nusa Tenggara from November 2017–June 2019. The subjects were 2-month-old babies, divided into the group that was given PCV13 and the control group. PCV13 administered by West Nusa Tenggara Health Office in October 2017. Four nasopharyngeal swabs were collected at the age of 2, 4, 12, and 18 months old. S. pneumoniae was identified by culture and optochin test, then serotyping and antibiotic susceptibility test were performed by multiplex PCR and disk diffusion tools respectively.

The proportion of S. pneumoniae in 2 months old was 22.9% in the vaccine group and 19.1% in the control group. Evaluation in 12 months old showed higher colonization than in 2 months old (chi-square, p < 0.01). Colonization of vaccine-type serotypes in the vaccine group decreased at the age of 18 months followed by an increase in non-vaccine serotype. In the control group, vaccine-type increased with increased age (chi-square, p < 0.05). The PCV13 lowered the 6A/6B serotype (dominant serotype). Antibiotic susceptibility patterns did not change with increased age in both groups. In conclusion, the administration of PCV13 with a 2 + 1 schedule is effective to reduce the colonization of S. pneumoniae vaccine-type serotypes in the nasopharynx.

 

 

Keywords: antibiotic susceptibility, nasopharyngeal colonization, pneumonia, prevalence, serotype changes

"

"

Latar Belakang. Konstipasi fungsional disebabkan oleh banyak faktor, faktor luminal (disbiosis mikrobiota) merupakan salah satu faktor tersebut. Mikrobiota saluran pencernaan memegang peranan penting sebagai dasar aspek kesehatan maupun terjadinya penyakit. 

Metode. Desain penelitian randomised, double-blind, placebo-controlled clinical trial   untuk mengevaluasi suplementasi  susu fermentasi yang mengandung probiotik Lactobacillus plantarum IS-10506 (1.2x10¹⁰ cfu/hari) dan plasebo pada saluran pencernaan dari 73 perempuan dengan konstipasi fungsional setelah 21 hari suplementasi. Profil fekal mikrobiota dan profil fekal SCFA (asetat, propionat dan butirat), dianalisa dengan menggunakan NGS dan GC-MS. Hasil analisa tersebut akan dikorelasikan dengan score PAC-Sym sebagai parameter  gejala konstipasi fungsional.

Hasil. Data baseline menunjukkan ketidakseimbangan (disbiosis) komposisi mikrobiota, rasio Firmicutes:Bacteroidetes; rasio lebih tinggi ditemukan pada subyek konstipasi. Selain itu  dua parameter konsentrasi SCFA secara bermakna lebih rendah pada subyek konstipasi, asetat (p=0.023) dan propionat (p=0.005). Setelah 21 hari suplementasi ditemukan korelasi negatif yang kuat antara asetat dengan skor PAC-Sym, secara bermakna meningkatkan taksa Lactobacillus sp., dan Lachnospiraceae.other meningkat setelah intervensi yang juga berkorelasi  memperbaiki  gejala konstipasi fungsional  (rho 0.5). Lachnospiraceae.other menekan Roseburia sp., Ruminococacceae.g., Bilophila sp. Penekanan dari Roseburia sp. secara signifikan berkorelasi dengan peningkatan SCFA dan signifikan berkorelasi dengan perbaikan gejala konstipasi fungsional (rho 0.4)

Simpulan. Suplementasi susu fermentasi yang mengandung probiotik  Lactobacillus plantarum IS-10506 dengan dosis 1.2x10¹⁰ cfu/hari selama 21 hari, terbukti menjaga keseimbangan profil mikrobiota mengarah pada eubiosis dan meningkatkan konsentrasi SCFA (asetat, propionat dan butirat) sebagai dasar mekanisme molekuler perbaikan  gejala perempuan dengan konstipasi fungsional.

---

Background. Functional constipation is caused by various factors, and a luminal factor (dysbiosis of microbiota) is one of those factors. The gut microbiome plays a fundamental role in several aspects of host health and diseases. 

Methods. A randomized, double-blind, placebo-controlled clinical trial was conducted to evaluate the effect of fermented milk containing probiotic Lactobacillus plantarum IS-10506 (1.2x10¹⁰ cfu/day) and placebo on gut microbiota profile and activity of 73 women with functional constipation after 21 days supplementation. Profile of fecal microbiota and fecal SCFA (acetate, propionate, and butyrate) was assessed by next generation sequencing (NGS) and GC-MS, respectively, and then correlated with the PAC-Sym score as a functional constipation symptom.  

Results. Baseline data showed that there was dysbiosis of microbiota composition in terms of Firmicutes:Bacteroidetes ratio: a higher ratio was found in constipated subjects. Also, two of the SCFA concentrations were significantly lower in constipated subjects, acetate (p=0.023) and propionate (p=0.005). After 21 days supplementation there was a strong negative correlation between acetate and PAC-Sym score, significantly increased taxa Lactobacillus sp. and Lanchospiraceae.other increase after intervention as ell as significantly improved the functional constipation symptom (rho 0.5). Lachnospiraceae.other seemed to suppress Roseburia sp,  Ruminococcaceae.g_, Bilophila sp. Suppresion of Roseburia sp,  significantly correlated with increased SCFA,  and significantly correlated with improvement of constipation symptom (PAC-Sym) (rh0 0.4).

Conclusion. Supplementation of fermented milk containing Lactobacillus plantarum IS-10506 at a dose of  1.2x10¹⁰ cfu/day for 21 days improved the balance of microbiota towards eubiosis, increased SCFA (acetate, propionate and butyrate) concentration as an underlying molecular mechanisms of the functional constipation symptom improvement in women.

"

"Latar belakang: Rekomendasi Centers for Disease Control and Prevention (CDC) 2010 (revisi 2002) tidak spesifik memberi panduan dalam pencegahan sekunder sepsis awitan dini (SAD) pada neonatus cukup bulan (NCB), asimtomatik lahir dari ibu yang mengalami KPD < 18 jam.Tujuan: Didapatnya model determinan SAD pada NCB sesuai masa kehamilan (SMK), asimtomatik lahir dari ibu yang mengalami KPD lebih dari 12 jam.Metodologi: penelitian observasional potong lintang untuk mendapatkan model determinan sepsis neonatorum awitan dini (SNAD) yang dilakukan dari Februari 2013 sampai bulan Mei 2014 di RSAB Harapan Kita, RSUD Tarakan, RSIA Budi Kemuliaan. Determinan yang diteliti adalah jenis persalinan, petanda infeksi saluran kemih (ISK) pada ibu, petanda infeksi intra amnion (IIA) seperti demam intrapartum, ibu takikardia, janin takikardia, adanya perubahan warna dan bau cairan ketuban, leukosit darah ibu, dan petanda infeksi darah tali pusat (peningkatan jumlah total leukosit, neutrofil, peningkatan rasio I/T, hs-CRP dan IL-6). Diagnosis sepsis ditegakkan berdasarkan catatan medis bayi yang dipastikan berdasarkan hasil positif biakan darah tali pusat. Model determinan SNAD yang dihasilkan adalah suatu persamaan regresi logistik yang digunakan untuk menentukan probabilitas terjadinya SNAD sebagai acuan terapi antibiotik.Hasil: model determinan SAD pada NCB SMK, asimtomatik lahir dari ibu KPD > 12 jam berupa kalkulator dan sistem skor yang dibentuk dari determinan persalinan per vaginam, perubahan warna dan bau cairan ketuban, leukosit darah ibu, leukosit darah tali pusat, kadar hs-CRP darah tali pusat dan kadar IL-6 darah tali pusat. Model determinan SNAD memiliki dua varian, varian lengkap digunakan untuk fasilitas pelayanan neonatus subspesialistik dan varian alternatif digunakan untuk fasilitas pelayanan spesialistik. Titik potong ideal penentuan probabilitas terjadinya SNAD memiliki sensitivitas di antara 24,2 – 40,3 % dan spesifisitas 87,1 - 94,5 %. Nilai diskriminasi dengan nilai AUC berkisar di antara 0,743 – 0,816 dengan kalibrasi baik berdasarkan uji Hosmer-Lemeshow.Simpulan: Hasil penelitian ini adalah model determinan SAD pada NCB SMK asimtomatik lahir dari ibu yang mengalami KPD > 12 jam, berbentuk kalkulator dan sistem skor yang memiliki varian lengkap dan alternatif untuk menentukan probabilitas terjadinya SNAD sebagai dasar pemberian terapi antibiotik empiris secara rasional.

---

Background: Centers for Disease Control and Prevention (CDC) 2010 (revised 2002) recommendations does not specifically provide guidance in secondary prevention of asymptomatic early-onset sepsis (EOS) on term infant born to mother experiencing PROM < 18 hours.

Objective: to develop early-onset neonatal sepsis (EONS) determinant model as a rational basis for determining the empirical antibiotic therapy in asymptomatic, term infant born to mother with PROM > 12 hours.

Method: A cross-sectional observational study to obtain an EONS determinant model which was conducted from February 2013 to May 2014 in RSAB Harapan Kita, Tarakan Hospital, RSIA Budi Kemuliaan. The determinant factor is the type of delivery, marker of maternal urinary tract infection (UTI), intra-amniotic infection markers (intrapartum fever, maternal tachycardia, fetal tachycardia, change in the color and odor of amniotic fluid, maternal blood leukocytes), and umbilical cord blood infection marker (increased the total number of leukocytes, neutrophils, an increase in the ratio of I / T, hs-CRP and IL-6). Early-onset neonatal sepsis was diagnosed base on infant medical record on 72 hours afeter birth and confirmed by the positive results of umbilical cord blood cultures. The resulting of EONS determinants model is a logistic regression equation used to determine the probability of the occurrence of EONS as reference rational basis empirical antibiotic therapy.

Results: The EOS determinants model on asymptomatic term infant born to mothers with PROM> 12 hours is a calculator and scoring system that is formed from the determinant of vaginal delivery, change the color and odor of amniotic fluid, maternal blood leukocytes, cord blood leukocytes, the levels of hs-CRP and IL-6 umbilical cord blood level. Early-onset neonatal sepsis determinant model has two variants, the full variant used for subspecialty neonatal care facilities and alternative variant is used for specialty neonatal care facilities. Ideal cutoff point probability of occurrence SNAD has sensitivity range of 24.2 to 40.3% and specificity of 87.1 to 94.5%. The model performe is good based on Hosmer-Lemeshow test anda discrimination value AUC in in range of 0.743 to 0.816.

Conclusion: The EOS determinant model of asymptomatic term infant born to mothers with PROM > 12 hours is a calculator and scoring system that is used to determine the probability of EONS occurrence as the basis of determining the rational empirical antibiotic therapy."