Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
ABSTRAK
Cryptococcus sp. adalah jamur yang sering menginfeksi penderita imuno-kompromis, termasuk AIDS. Jamur tersebut tersebar luas dan memiliki keragaman hayati (bio-diversity). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman karakteristik molekular, faktor virulensi dan hubungan kepekaan isolat Cryptococcus dengan obat antijamur. Metode: Penelitian ini menggunakan desain eksploratif-analitik dan dilakukan di Departemen Parasitologi FKUI dan CBS, Utrecht, Belanda pada tahun 2011-2014. Sebanyak148 isolat tunggal Cryptococcus yang berasal dari 108 cairan otak pasien dan 291 isolat multipel Cryptococcus dari 48 sampel klinik (cairan otak, darah, cairan perikard) dilakukan penentuan spesies dan serotype. Sampel tunggal diidentifikasi menggunakan PCR dan sampel multiple dengan MALDI-TOF MS. Identifikasi genotipe pada sampel tunggal menggunakan RFLP-URA5 dan sampel multipel dengan AFLP. Uji kepekaan amfoterisin B, flusitosin, flukonazol, vorikonazol dan ketokonazol dilakukan dengan metode difusi cakram. Hasil: Sampel tunggal: Seluruh isolat tunggal adalah C. neoformans. Hasil identifikasi serotipe/varietas menunjukkan serotipe A 136 (91,9%) dan serotipe AD 12 (8,1%). Matingtype α (85,8%) lebih banyak dibanding matingtype a (14,2%). Dari identifikasi genotipe diperoleh AFLP1/VN I (86,5%), genotipe AFLP3/VN III (8,1%), dan AFLP1A/VN II (5,4%). Pada umumnya genotipe masih sensitif terhadap antijamur, kecuali terhadap flusitosin (100% resisten). Terhadap amfoterisin B terdapat isolat yang susceptible dose dependent (SDD), yaitu AFLP1/VN I (10,2%) dan AFLP1A/VN II (25%), sedangkan terhadap flukonazol diperoleh isolat SDD dan resisten. Sampel multipel: Seluruh isolat multipel adalah C. neoformans; 269 isolat serotipe A, 6 isolat serotipe D, 16 serotipe AD dan 1 isolat serotipe AB. Sebanyak 18 (60%) pasien disebabkan oleh strain yang sama, 10 pasien (33,3%) disebabkan dua strain dan dua pasien (6,7%) disebabkan oleh tiga strain. Uji kepekaan menunjukkan 100% isolat sensitif terhadap amfoterisin B dan ketokonazol, 16 (21%) isolat resisten terhadap vorikonazol, 19 (24%) isolat resisten terhadap flukonazol dan 100% isolat resisten terhadap flusitosin. Kesimpulan: Terdapat keragaman karakteristik molekular dan faktor virulensi Cryptococcus. Seluruh isolat sensitif ketokonazol, namun resisten terhadap flusitosin. Terhadap amfoterisin B ada isolat yang SDD dan terhadap flukonazol ada yang resisten.

---

ABSTRACT
Cryptococcus sp. is a fungus that commonly infect immunocompromised patients, including AIDS. The fungus is cosmoplite and known has biodiversities. This study aim is to determine the characteristics of molecular diversity, virulence factors and its relation to Anti fungal Pattern. Methods: This study use exploratory-analytical design and performed at the Department of Parasitology, Faculty of Medicine and CBS, Utrecht, the Netherlands in 2011-2014. Out of 148 single Cryptococcus isolates originated from 108 patients and 291 cerebrospinal fluid Cryptococcus multiple isolates of 48 clinical samples (cerebrospinal fluid, blood, pericardial fluid) is the determination of the species and serotype. Single isolates were identified using PCR and multiple isolates were identified by MALDI-TOF MS. Identification of genotype on a single isolates using RFLP-URA5 and multiple isolates by AFLP. Susceptibility testing amphotericin B, flucytosine, fluconazole, voriconazole and ketoconazole performed by disc diffusion method. Results: Single sample: The entire single isolates are C. neoformans. Identification of serotype/variety shows serotype A 136 (91.9%) and the serotype AD 12 (8.1%). Matingtype α (85.8%) more than matingtype a (14.2%). Identification of genotypes obtained AFLP1/VN I (86.5%), genotype AFLP3/VN III (8.1%), and AFLP1A/VN II (5.4%). In general, all isolates are still sensitive to the anti-fungal, except against flucytosine (100% resistant). Some isolates show susceptible dose-dependent (SDD) to amphotericin B, they are AFLP1/VN I (10.2%) and AFLP1A/VN II (25%). Some isolates also obtained SDD and resistant to fluconazole. Multiple samples: The whole samples are C. neoformans; 269 isolates of serotype A, 6 isolates of serotype D, 16 serotype AD and 1 isolate serotype AB. 18 (60%) patients caused by the same strain, 10 patients (33.3%) due to two strains and two patients (6.7%) is caused by three strains. Susceptibility testing showed 100% of isolates are sensitive to amphotericin B and ketoconazole, 16 (21%) isolates were resistant to voriconazole, 19 (24%) isolates were resistant to fluconazole and 100% of isolates were resistant to flucytosine. Conclusion: There is a diversity of molecular characteristics and virulence factors of Cryptococcus. All isolates are susceptible to ketoconazole, but resistant to flucytosine. Some isolates SDD to amphotericin B and resistant to fluconazole.

Abstrak :
ABSTRAK
Latar belakang: Infeksi HIV masih banyak ditemukan di Indonesia saat ini. Terapi antiretroviral telah merubah morbiditas dan mortalitas pasien terinfeksi HIV, dan juga merubah manifestasi oral HIV/AIDS, termasuk kandidiasis orofaring KOF . Dalam penelitian ini dieksplorasi peran faktor genetik dan respons imun pasien terinfeksi HIV dengan dan tanpa KOF, sebelum dan sesudah terapi ARV.Metode: Subyek penelitian sebesar 82 pasien terinfeksi HIV, ARV-na ve dengan jumlah sel T CD4

---

ABSTRACT
Background HIV infection remains common in Indonesia nowadays. Antiretroviral therapy ART has altered morbidity and mortality of HIV infected people, and also altered oral manifestation of HIV AIDS, including oropharyngeal candidiasis OPC . Here we explore the role of host genetic factors and immune responses in HIV infected patients beginning ART.Methods This study included 82 ARV na ve HIV infected patients with

Abstrak :
Pendahuluan: Interaksi Cryptococcus neoformans dengan makrofag mempengaruhi kejadian kriptokokosis meningeal, infeksi oportunistik fatal pada populasi AIDS, dimana pada keadaan imunokompromi, kemampuan fagositosis makrofag terganggu. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis aktifitas fagositik makrofag penderita HIV, profil sitokin yang terbentuk serta pengaruh pemberian obat anti retroviral. Metode: Desain penelitian eksploratif-analitik terhadap interaksi makrofag-C. neoformans. Makrofag pasien HIV dan orang sehat (selanjutnya disebut Kasus dan Kontrol). Penelitian mencakup pengukuran kadar nitrit petanda aktivasi makrofag, uji indeks internalisasi jamur (IIJ), laju fagositosis (LF), dan daya bunuh (DB) makrofag terhadap jamur yang diamati pada menit ke 30, 120 dan 240. Selain itu juga diteliti profil sitokin yang terbentuk (IL-5, IL-10, IL-6, TNF-?, IFN-?) dan uji serologis terhadap plasma menggunakan Cryptococcus antigen lateral flow assay (CrAg-LFA). Hasil: Terkumpul 38 Kasus dan 42 Kontrol dengan hasil uji LFA seluruh subyek, Kasus maupun Kontrol, negatif. Kadar nitrit yang terbentuk lebih tinggi pada kelompok Kontrol. IIJ makrofag Kasus lebih tinggi pada T30 dan T120. LF makrofag kontrol lebih tinggi pada T30 dan T120. DB makrofag Kontrol jauh lebih tinggi dibanding makrofag Kasus pada seluruh pengamatan. Pola sitokin yang terbentuk oleh makrofag kasus mengarah ke sitokin anti inflamasi (IL-5 dan IL-10 tinggi), sedangkan pola sitokin yng terbentuk oleh makrofag Kontrol mengarah ke sitokin pro inflamasi (IL-6 dan IFN-? tinggi) kecuali untuk TNF-? yang lebih tinggi pada supernatan makrofag Kasus. Pembahasan: Aktifitas fagositik makrofag Kasus terganggu, ditandai dengan daya bunuh yang jauh lebih rendah. Selain itu, tingginya kadar sitokin pro inflamasi pada populasi kontrol menunjukkan pembersihan jamur yang lebih efektif sedangkan sitokin anti-inflamasi yang lebih tinggi pada subjek terinfeksi HIV memungkinkan terjadinya parasitisme intraseluler makrofag oleh C. neoformans. Kesimpulan: terdapat perbedaan daya bunuh dan pola sitokin pro dan anti inflamasi pada subjek terinfeksi HIV dibanding kontrol. ......Introduction: interaction of Cryptococcus neoformans-macrophage affecting the incidence of cryptococcal meningitis, a fatal opportunistic infection in AIDS population. In immunocompromised condition, macrophage phagocytic activity was impaired. This study aimed to analyze phagocytic activity of macrophage derived from HIV infected individuals against C. neoformans, the cytokine profile and the role of antiretroviral therapy in that interaction. Method: using explorative-analytical design on the interaction between macrophageyeast seen as: internalization index, phagocytic rate, killing ability, production of cytokine and NO. We also tested the plasma against Cryptococcus antigen lateral flow assay (CrAg-LFA). Result: out of 38 HIV(+) subjects and 42 healthy subject all were negatif for LFA. Nitrite formed were higher in the Control group. Internalization index were higher in the Cases group, Phagocytosis rate were higher in the Control group: Killing ability were far superior in the Control group. Cytokine profile of the Cases group were anti inflammatory (higher IL-5 and IL-10) while in the Control group, were more pro inflammatory (higher IL-6 and IFN-?) with the exception of TNF-? which was higher in the Cases group. Discussion: the higher level of pro-inflammatory cytokine among control group represent a more effective clearance of fungal by macrophages while higher level of anti-inflamatory cytokine among HIV+vderived macrophage indicates profound intracellular parasitism of macrophage by C. neoformans. Conclusion: there is difference of killing ability, NO production and antiinflammatory cytokine production among macrophage derived from healthy subjects that showed us a more effective fungal clearance and activation of macrophage.

Abstrak :
Latar belakang. Kandidiasis orofaring adalah infeksi oportunistik ketiga terbanyak pada pasien HIV/AIDS di Indonesia. Penggunaan flukonazol yang luas sebagai pengobatan standar untuk kandidiasis orofarings, mengakibatkan terjadinya masalah resistensi. Untuk memahami mekanisme terjadinya resistensi C. albicans terhadap flukonazol diperlukan pemahaman mutasi genetik ERG11 dan overekspresi gen ERG11, CDR1, CDR2, dan MDR1, sebagai dasar pengembangan strategi kebijakan pengobatan. Tujuan. Untuk mendapatkan peran mutasi gen ERG11 dan overekspresi gen ERG11, CDR1, CDR2, MDR1 dalam mekanisme resistensi C. albicans isolat pasien terinfeksi HIV di Jakarta terhadap flukonazol. Metode Penelitian. Penelitian ini merupakan studi potong lintang dengan cara deskriptif analitik untuk mendapatkan mekanisme pola genetik resistensi C. albicans isolat pasien terinfeksi HIV di Jakarta terhadap flukonazol. Penelitian dilakukan bulan Mei 2009 sampai dengan Maret 2013 di FKUI dan RSCM. Analisis mutasi gen ERG11 dilakukan dengan metode sekuensing. Analisis overekspresi gen CDR1, CDR2, MDR1, ERG11 dengan metode real time RT-PCR. Hasil Penelitian. Didapatkan 17 isolat C. albicans yang resisten terhadap antijamur azol, dari 92 spesies C. albicans yang berhasil diisolasi dari 108 subjek sumber isolat pasien terinfeksi HIV di RSCM. Resistensi C. albicans (n = 92) terhadap flukonazol ditemukan sebanyak 13 %. Ditemukan 30 mutasi nukleotida gen ERG11 yang menyebabkan perubahan asam amino pada enam posisi yaitu D116E, S153E, I261V, E266D, V437I, V488I yang berada pada area hot spot yang dilaporkan oleh Marichal dkk., yaitu asam amino pada posisi 105-165, 266–287, dan 405–488. Pola substitusi asam amino kombinasi 1). D116E, D153E, E266D; 2). D116E, I261V, E266D, V437I; 3). E266D, V437I; 4). E266D, V488I berhubungan dengan resistensi C. albicans terhadap flukonazol. Substitusi asam amino I261V gen ERG11 yang ditemukan pada penelitian ini, masih mungkin berhubungan dengan resistensi flukonazol karena berada pada rantai b heliks yang diduga sebagai tempat terikatnya flukonazol. Selain itu, perubahan asam amino isoleusin (I) yang berukuran besar menjadi valin (V) yang berukuran kecil, diduga akan menghalangi masuknya flukonazol. Mekanisme overeskpresi lebih diperankan oleh overekspresi CDR2 pada isolat C. albicans multiresisten terhadap flukonazol dan overekspresi gen ERG11 pada isolat C. albicans resisten terhadap flukonazol tunggal. Kombinasi mutasi dan overekspresi ditemukan saling memengaruhi pada resistensi C. albicans terhadap flukonazol Simpulan. Kombinasi substitusi asam amino yang ditemukan, berhubungan dengan resistensi C. albicans terhadap flukonazol. Struktur tiga dimensi substitusi asam amino I261V gen ERG11 yang ditemukan pada penelitian ini dan belum pernah dilaporkan, masih mungkin berhubungan dengan resistensi flukonazol. Overeskpresi gen CDR2 dan ERG11 berperan pada isolat C. albicans yang resisten terhadap flukonazol. Kombinasi mutasi gen ERG11 dan overekspresi CDR2 dan ERG11 berperan pada isolat C. albicans resisten terhadap flukonazol. ......Background: Oropharyngeal candidiasis is the third opportunistic infection in HIV / AIDS patients in Indonesia. Extensive use of fluconazole as a standard treatment for candidiasis orofarings results in the emerging of resistance problem. Understanding the genetic mutations ERG11 and ERG11, CDR1, CDR2, and MDR1 gene overexpression are required to identify the mechanism of the resistance of C. albicans to fluconazole, as it can contribute to determining treatment policy. Objective. To analyze the role of mutations in ERG11 gene and ERG11, CDR1, CDR2, MDR1 gene overexpression as a genetic mechanisms of C. albicans resistance to fluconazole isolated from HIV patients in Jakarta. Method. This study is a cross-sectional study with descriptive analytical method to determine the genetic mechanisms of C. albicans resistance to fluconazole isolated from HIV patients in Jakarta. The study was conducted from May 2009 until March 2013. ERG11 gene mutation analysis was performed by sequencing methods, while over expression of ERG11, CDR1, CDR2, and MDR1 genes were analyzed by real-time RT-PCR method. Results. In this study, 17 isolates out of 92 species of C. albicans isolated from 180 HIV patients in RSCM were found to be resistant to azole antifungal. Candida albicans (n ??= 92) resistant to fluconazole was found in 13 % isolates. Thirty (30) nucleotide mutations of ERG11 genes were observed that caused amino acid changes in six positions at D116E, S153E, I261V, E266D, V437I, V488I, which is located in the hot spot area reported by Marichal et al. at positions 105-165 , 266-287, and 405-488. Combinations of amino acid substitution pattern 1). D116E, D153E, E266D; 2). D116E, I261V, E266D, V437I; 3). E266D, V437I; 4). E266D, V488I are associated with resistance of C. albicans to fluconazole. Amino acid substitution at I261V due to ERG11 gene mutation identified in this study is probably associated with fluconazole resistance, since it is located at the ? helical chain as a binding site of fluconazole. Moreover, the subtitution of the large size isoleucine (I) amino acid to small size valine (V) hinders the entry of fluconazole. Resistant C. albicans isolates of HIV-infected patients in Jakarta was alleged mainly to be caused by CDR2 gene over expression, detected in all isolates of C. albicans multiresistant to fluconazole, and to ERG11 gene over expression that played a role in isolates of C. albicans resistant to single fluconazole. The combination of amino acid substitutions due to mutations in ERG11 gene and over expression of CDR2 and ERG11 can occur in C. albicans isolates resistant to fluconazole. Conclusion. Combinations of amino acid substitution pattern in this study are associated with C. albicans resistance to fluconazole. Three-dimensional structure of the amino acid substitution I261V ERG11 genes was identified in this study, and is probably associated with fluconazole resistance. CDR2 and ERG11 genes over expression play a role in C. albicans resistant to fluconazole. The combination of mutations in ERG11 gene and over expression of CDR2 and ERG11 play a role in C. albicans isolates resistant to fluconazole.