Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Siklus evolusi bentuk lahan di daerah Manado dan sekitarnya terjadi karena : pelapukan, erosi, transportasi, sedimentasi, dan faktor manusia. Semua proses ini terjadi sejak daratan muncul dan kejadiannya dipercepat oleh kegiatan manusia. Berdasarkan kecuraman, jenis tanah/batuan, vegetasi/penutup lahan, dan bentuk erosi, kerentanan erosi di daerah penelitian dapat dikelompokkan menjadi : erosi sangat tinggi, erosi tinggi, erosi sedang, erosi lemah, dan tidak ada erosi. Erosi sangat tinggi terjadi pada bentuk lahat kerucut gunung api a dan b, lereng gunung api a dan b, lereng pegunungan vulkanik tertoreh dan pegunungan vulkanik memanjang tertoreh. Erosi tinggi terjadi pada bentuk lahan padang solfatara, fumarola, lereng kaki gunung berapi b, lereng pegunungan vulkanik memanjang tertoreh, lereng gunung api c, bukit sisa dan aliran lava. Erosi sedang terjadi pada bentuk lahan lereng kaki gunung api a dan kipas alluvial. Erosi lemah terjadi pada bentuk lahan lereng kaki gunung api c, dataran antar gunung, dan dataran banjir. Tidak ada erosi terjadi pada bentuk aluvium.

Abstrak :
Diversitas Molekuler Berbasis ISSR pada Durio tanjungpurensis Asal Kalimantan Barat, Indonesia. Durian Tengkurak (Durio tanjungpurensis Navia) adalah salah satu spesies langka yang eksotis dari suku Malvaceae. Durian tersebut bernilai penting untuk konservasi plasma nutfah dan berpotensi sebagai sumber daya genetik untuk pengembangan durian di masa depan. Tujuan penelitian adalah mengetahui keragaman molekuler D. tanjungpurensis asal Kalimantan Barat berdasarkan penanda Inter Simple Sequence Repeat (ISSR). Sepuluh primer ISSR digunakan untuk mengetahui keragaman genetik 60 individu Durian Tengkurak dari enam populasi endemik alami D. tanjungpurensis. Parameter keragaman genetik didasarkan pada data biner pita DNA produk PCR, yaitu ada atau tidak- ada pita. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata jumlah alel, rata-rata jumlah efektif alel, diversitas genetik, indeks informasi Shannon, jumlah polimorfik lokus, dan persentase polimorfik lokus berturut-turut adalah 1,53, 1,29, 0,17, 0,26, 77,83 dan 52,59. Analisis ragam molekuler (AMOVA) menunjukkan keragaman genetik yang lebih tinggi di dalam populasi (65%) dibandingkan antar populasi (35%). Analisis gugus menggunakan metode UPGMA berdasarkan matriks keserupaan Dice dan analisis koordinat utama digunakan untuk mengelompokkan semua individu populasi ke dalam tiga kelompok, yaitu grup 1 (Hutan Rejunak dan Tembaga), grup 2 (Bukit Merindang), dan grup 3 (Hutan Rawak, Bukit Sagu 1 dan Bukit Sagu 2). Analisis lebih lanjut terhadap struktur populasi menggunakan program STRUCTURE menyatukan grup 2 dan 3 ke dalam satu grup utama. Penelitian ini berhasil mengungkap keragaman genetik Durian Tengkurak menggunakan penanda ISSR.

---

The Durian Tengkurak (Durio tanjungpurensis Navia) is one of the endangered exotic species in the Malvaceae family. The species is important for conservation of the germplasm and is considered a potential genetic resource for the development of durian in the future. The objective of this research project was to assess the molecular diversity of D. tanjungpurensis in West Kalimantan, based on Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. We applied ten ISSR primers to reveal the genetic diversity of 60 individuals from six natural endemic D. tanjungpurensis populations. The genetic diversity parameters were estimated based on binary data about PCR products (present or absent bands). The results showed that the mean number of observed alleles, the mean number of effective alleles, the genetic diversity, the Shannon?s Information Index score, the number of polymorphic loci, and the percentage of polymorphic loci were 1.53, 1.29, 0.17, 0.26, 77.83, and 52.59, respectively. An analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the genetic diversity within a population (65%) was higher than that found between the populations (35%). UPGMA clustering and principal coordinate analysis, based on the DICE similarity matrix, were used to classify the populations into three groups: 1) Hutan Rejunak and Tembaga, 2) Bukit Merindang, and 3) Hutan Rawak, Bukit Sagu 1, and Bukit Sagu 2. Further analysis of the population structure using STRUCTURE software was used to classify all the individuals into two major categories, thus uniting Groups 2 and 3 as one major category. In conclusion, a high level of genetic diversity in the Durian Tengkurak was revealed utilizing the ISSR markers employed in the study.

Abstrak :
Jatropha is one of the many biodiesel plants developed in tropical countries. Efforts to increase its productivity can be done using various methods of breeding. One of the breeding methods is the introduction of genes into the Jatropha plant. The aim of this study is to assess the success of genetic transformation using the Inhibitor of Meristem Activity (IMA) gene in Jatropha curcas. The research procedures included inoculation of explants with Agrobacterium tumefaciens, callus induction, screening test of selection media, regeneration, and gene expression analysis using Polymerase Chain Reaction (PCR). IMA is one of the genes that controls flowering genes and ovule development. It was first isolated from tomato plants and has been successfully overexpressed in these plants using the Cauliflower Mosaic Virus (CaMV) 35S promoter. In this experiment, plant transformation was performed on J. curcas as the target. Explant callus formation in both the control and treated samples was good, but shoot formation decreased dramatically in the treated explants. PCR analysis indicated that IMA genes can be inserted into J. curcas with the size of the IMA gene is 500 bp.

---

Transformasi Gen Inhibitor of Meristem Activity ke Tanaman Jatropha curcas L. Jarak Pagar merupakan salah satu tanaman penghasil biodiesel yang banyak dikembangkan di beberapa negara tropis. Usaha peningkatan produktivitasnya terus ditingkatkan dengan berbagai metode pemuliaan. Salah satu metode pemuliaan tersebut adalah dengan menyisipkan gen-gen yang unggul ke tanaman Jarak Pagar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat keberhasilan transformasi genetik yang menggunakan gen IMA (Inhibitory Meristem Activity) ke dalam tanaman Jatropha curcas L. Tahapan penelitian meliputi inokulasi eksplan dengan Agrobacterium tumefaciens, induksi kalus, seleksi, regenerasi, dan analisis ekspresi gen IMA dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Gen IMA merupakan salah satu gen yang dapat mengontrol pembungaan dan perkembangan ovul. Gen ini diisolasi pertama kali dari tanaman tomat dan peningkatan ekspresi telah berhasil dilakukan pada tanaman tomat itu sendiri menggunakan promoter 35S Cauliflower Mosaic Virus (CaMV). Pada percobaan ini dilakukan transformasi gen ke dalam tanaman target J. curcas. Pembentukan kalus pada menunjukkan hasil yang baik eksplan kontrol dan eksplan yang mengalami perlakuan, tetapi pada eksplan perlakuan hasil sangat menurun pada tahap pembentukan tunas. Analisis dengan PCR mengindikasikan bahwa gen IMA dapat disisipkan ke J. curcas dengan ukuran gen IMA sebesar 500 bp.

Abstrak :
ABSTRACT
Actin is a major component of the plant cytoskeleton, so all cells contain this protein. Actin is expressed constitutively and is involved in basic housekeeping functions required for cell maintenance. Because of this, it has been frequently used as an internal control to normalize changes in gene expressions analysis. Actually, the information of nucleotide sequence of actin gene of Jatropha curcas L. population IP-2P from Indonesia is not available yet. The objective of this research was to isolate, clone and characterize cDNA of actin genes of J. curcas IP-2P. Three partial actin gene sequences had been successfully isolated by PCR using total cDNA as template, and actin primer designed from conserved region of Arabidopsis thaliana. Nucleotide sequence analysis showed that the length of JcACT fragment is 610, 534, and 701 bp encoding 203, 177, and 234 amino acids respectively. Local alignment analysis based on mRNA sequences shows that JcACT fragment shares 98% similarity with actin mRNA of Hevea brasiliensis and 99% with actin mRNA of Ricinus communis. Based on deduced amino acid sequence, JcACT is 100% identical to acting from Prunus salicina, Gossypium hirsutum, and Betula luminifera. Even though these clones of cDNA are not completed yet, they can be used as reference in J. curcas L. gene expression analysis.