Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Penelitian bertujuan mengetahui keragaman spesies khamir dari saluran pencernaan lebah madu Apis cerana di apiari Desa Ciburial, Bandung. Sebanyak 48 isolat khamir dari saluran pencernaan Pollen-collecting bee (PCB) (27 isolat) dan Nectarcollecting bee (NCB) (21 isolat) diidentifikasi berdasarkan data sequence daerah internal transcribed spacer (ITS) rDNA dan dikarakterisasi secara morfologi untuk melengkapi hasil identifikasi. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa 48 isolat khamir tersebut terdiri atas delapan genus dan 16 spesies. Sebanyak 12 spesies khamir ditemukan pada PCB dan sembilan spesies khamir ditemukan pada NCB. Candida cf. apicola, C. etchellsii, Debaryomyces hansenii, Rhodotorula mucilaginosa dan Zygosaccharomyces rouxii ditemukan pada PCB maupun NCB. Spesies-spesies khamir yang diperoleh secara taksonomi heterogen, yaitu termasuk ke dalam class Hemiascomycetes dari phylum Ascomycota (13 spesies) dan class Urediniomycetes dari phylum Basidiomycota (3 spesies).

---

The aim of this study was to study the diversity of yeast species isolated from the digestive tract of honey bee Apis cerana in apiary in Ciburial, Bandung. A total of 48 yeast isolates from the digestive tract of pollen-collecting bees (27 isolates) and Nectar-collecting bee (21 isolates) were identified based on sequence data of internal transcribed spacers regions of ribosomal DNA (ITS rDNA). In addition of their sequence data, yeasts were also characterized morphologically. The results showed that those yeasts comprised of eight genera and 16 species. Twelve yeast species were found from PCB and nine yeast species were found from NCB. Candida cf. apicola, C. cf. azyma, C. etchellsii, C. naeodendra, C. orthopsilosis, Cryptococcus heveanensis, Debaryomyces hansenii, Rhodotorula mucilaginosa and Zygosaccharomyces rouxii were found both in PCB and NCB. Our molecular analysis showed that A. cerana harbors taxonomically diverse yeasts. They consisted of species belong to the class Hemiascomycetes of the phylum Ascomycota (13 species) and class Urediniomycetes of the phylum Basidiomycota (3 species)."

"Penelitian bertujuan membuat pollen substitute (PS) yang disukai dan dapat meningkatkan produktivitas lebah madu A. cerana. Tiga macam pollen substitute dibuat dengan bahan dasar tepung kedelai dan susu skim. PS A mengandung bahan dasar, Candida parapsilosis CR057, dan madu; PS B mengandung bahan dasar dan sirup gula; dan PS C mengandung bahan dasar dan madu. Pemberian PS dilakukan selama 20 hari dan lebah dibiarkan mencari serbuk sari dan nektar di alam. Koloni kontrol tidak diberi PS. Hasil penelitian menunjukkan bahwa A. cerana lebih menyukai PS A dan PS C dibandingkan PS B. Pemberian semua jenis PS meningkatkan keliling (1,03--1,51% per hari) dan jumlah honeycomb. Koloni yang diberi PS A mengalami peningkatan keliling honeycomb terbesar (1,51% per hari). Secara umum, lebah pekerja yang diberi PS dan kontrol mengalami kenaikan berat badan (28,39%--52,32%). Pada kontrol terdapat kenaikan kenaikan keliling honeycomb, akan tetapi tidak terdapat penambahan jumlah honeycomb.

---

The research aimed to make pollen substitutes preferred by and increase the productivity of A. cerana. Basic ingredients of pollen substitutes (PS) were soy flour and skim milk. There were three types of pollen substitutes, i.e. PS A contained basic ingredients, Candida parapsilosis CR057, and honey; PS B contained basic ingredients and sugar syrup; and PS C contained basic ingredients and honey. The pollen substitutes were fed to colonies of A. cerana for 20 days but they were allowed to forage on flowers. No PS was given to the control colonies.

The results showed that A. cerana preferred PS A and PS C to PS B. Increases of circumference (1.03--1.51% each day) and number of honeycombs were observed in colonies fed with all types of PSs. The increases of circumference of colonies fed PS A was greater than those of other PSs and control (1.51% each day). Generally, the weight of individual worker bees increased in colonies fed with PSs and control (28.39%--52.32%). There was an increase of the circumference of honeycombs in control but there was no addition of honeycomb."

"Penelitian bertujuan untuk memperoleh isolat dan identitas aktinomisetes yang memiliki kemampuan selulolitik. Isolat-isolat aktinomisetes diperoleh dari lima sampel tanah di Sulawesi Selatan. Isolasi aktinomisetes dilakukan dengan metode Dry Heat (DH), Rehydration-Centrifugation (RC), dan Sodium Dodecyl Sulphate-Yeast Extract (SDS-YE) menggunakan medium Humic Acid-Vitamins Agar (HVA). Pengujian kemampuan aktinomisetes dalam mendegradasi selulosa dilakukan dengan penapisan menggunakan medium Carboxy Methyl Cellulose (CMC), dan pengukuran aktivitas enzim selulase dilakukan dengan metode Dinitrosalicylic Acid (DNS). Lima isolat dengan kemampuan selulolitik tinggi diidentifikasi berdasarkan data sekuen parsial gen 16S rRNA. Pada penelitian ini diperoleh sebanyak 41 isolat aktinomisetes, yang terdiri dari 21 isolat (metode DH), 11 isolat (metode RC), dan 9 isolat (metode SDS-YE). Sembilan belas dari 41 isolat menunjukkan kemampuan selulolitik. Hasil identifikasi menunjukkan kelima isolat aktinomisetes berasal dari genus Streptomyces. Kemiripan sekuen masing-masing isolat terhadap spesies terdekatnya adalah 99%. Isolat DH-BRT06-1 memiliki kemiripan sekuen terhadap Streptomyces chartreusis, DH-BRT06-3 dan DH-BRT06-6 terhadap Streptomyces parvulus, RC-BR03-2 terhadap Streptomyces sp., dan SDSYE-BT01-1 terhadap Streptomyces mutabilis.

---

The aims of this research were to obtain and identify actinomycetes with cellulolytic ability. Actinomycetes isolates were obtained from five soil samples of South Sulawesi by Dry Heat (DH), Rehydration-Centrifugation (RC), and Sodium Dodecyl Sulphate-Yeast Extract (SDS-YE) methods with Humic Acid-Vitamins Agar (HVA) as medium isolation. Carboxy Methyl Cellulose (CMC) medium was used for screening the cellulose degrading ability, and cellulase activity was measured by Dinitrosalicylic Acid (DNS) method. A total of 41 isolates were obtained from soil samples, they were consisted of 21 isolates (DH method), 11 isolates (RC method), and 9 isolates (SDS-YE method). Nineteen of 41 isolates showed cellulolytic ability. Five isolates with high celluloytic activity were identified based on 16S rRNA gene partial sequence data. Identification result showed five isolates were belong to genus Streptomyces. Homology similarities sequence from each isolate to their closest species were 99%. Isolate DH-BRT06-1 showed sequence similarities to Streptomyces chartreusis, DH-BRT06-3 and DH-BRT06-6 to Streptomyces parvulus, RC-BR03-2 to Streptomyces sp., dan SDSYE-BT01-1 to Streptomyces mutabilis."

"Penelitian bertujuan mengetahui identitas khamir dari saluran pencernaan lebah pekerja pengumpul nektar (nectar collecting bee, NCB) Apis mellifera yang mengunjungi bunga kapuk (Ceiba pentandra) di Jepara. Sebanyak 12 isolat khamir diidentifikasi berdasarkan data sequence daerah Internal Transcribed Spacers (ITS) rDNA. Primer forward ITS1 dan primer reverse ITS4 digunakan untuk amplifikasi daerah ITS rDNA. Hasil elektroforesis produk PCR menunjukkan ukuran daerah ITS rDNA isolat khamir-khamir tersebut bervariasi antara 400 pb hingga 800 pb. Berdasarkan hasil pencarian homologi sequence daerah ITS rDNA m2elalui program Basic Local Alignment Search Tool (BLAST), analisis filogenetik dengan metode Neighbor Joining, dan pengamatan karakter morfologi, 12 isolat khamir tersebut diidentifikasi ke dalam empat genus dan lima spesies. Berdasarkan taksonomi, 11 isolat khamir termasuk ke dalam anggota order Sacharomycetales, class Hemiascomycetes dari phylum Ascomycota dan satu isolat termasuk ke dalam anggota order Ustilaginales, class Ustilaginomycetes dari phylum Basidiomycota. Isolat-isolat tersebut diidentifikasi sebagai Candida parapsilosis (JZ102, JZ105, JZ116, dan JZ121), Candida rugosa (JZ117, JZ121), Debaryomyces hansenii (JZ100, JZ113, JZ118), Meyerozyma caribbica (JZ124, JZ125), dan Pseudozyma sp. (JZ104).

---

The aim of this study was to identify the yeast isolates from the digestive tracts of nectar collecting bees (NCB) of Apis mellifera. A total of 12 yeast isolates from the digestive tracts of NCB foraging on flowers of Ceiba pentandra in Jepara, Central Java, were identified based on sequence data of Internal Transcribed Spacers Regions of ribosomal DNA (ITS rDNA). The primer set of ITS1 (forward primer) and ITS4 (reverse primer) were used to amplify the ITS rDNA of the isolates. Gel electrophoresis results showed that the size of ITS region rDNA of the isolates were varied on the range of 400 bp -- 800 bp. Based on sequence homology search results by Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) program, phylogenetic analysis by Neighbor Joining method, and morphological characterization, those 12 isolates were identified into four genera and five species. Taxonomically, 11 isolates belong to order Sacharomycetales, class Hemiascomycetes from the phylum Ascomycota and 1 isolate belongs to order Ustilaginales, class Ustilaginomycetes from the phylum Basidiomycota. Those isolates were identified as Candida parapsilosis (JZ102, JZ105, JZ116, and JZ121), Candida rugosa (JZ117, JZ121), Debaryomyces hansenii (JZ100, JZ113, JZ118), Meyerozyma caribbica (JZ124, JZ125), and Pseudozyma sp. (JZ104). "

"Phylogenetic tree merupakan suatu diagram berbentuk tree yang merepresentasikan hubungan evolusi atau kekerabatan antar spesies yang hidup di bumi. Phylogenetic tree dibentuk berdasarkan struktur genetik spesies yang dinyatakan dalam sekuens DNA atau protein. Penulisan tugas akhir ini bertujuan untuk membangun sebuah aplikasi berbasis web yang digunakan untuk membangun phylogenetic tree dari sebuah matriks jarak (distance matrix) berdasarkan sekuens DNA. Metode pembentukan tree yang dipakai dalam aplikasi ini adalah metode berdasarkan jarak (distance methods) dan algoritma yang dipakai adalah neighbor-joining (NJ). Algoritma ini memerlukan input berupa matriks jarak dan menghasilkan output berupa tree. Tree yang dihasilkan dapat dipakai untuk melihat hubungan kekerabatan antar spesies yang terlibat atau spesies yang dibandingkan. Aplikasi ini dibuat dengan menggunakan bahasa pemrograman php yang bersifat open source, sehingga dapat diakses secara online.Kata kunci : phylogenetic tree, matriks jarak, neighbor-joining, sekuens DNA.viii + 70 hlm.; lamp.Bibliografi: 12 (2002-2008)"

"Pylogenetic tree merupakan tree yang merepresentasikan evolusi dari berbagai spesies hidup di bumi. Untuk membangun phylogenetic tree ini dibutuhkan suatu matriks jarak yang elemen-elemennya merupakan jarak dari tiap pasang spesies yang terlibat. Jarak ini diperoleh dengan menggunakan metode tertentu, diantaranya yaitu metode Jukes-Cantor dan metode Kimura. Penulisan skripsi ini bertujuan untuk membentuk matriks jarak dengan menggunakan metode Jukes-Cantor dan metode Kimura yang selanjutnya akan disimulasikan terhadap data koleksi DNA dari 10 spesies kelompok Khamir milik Wellyzar Sjamsuridjal, Ph.D.. Dari matriks jarak yang terbentuk, selanjutnya akan dibangun phylogenetic tree yang akan dianalisa dengan melihat pola percabangannya. Dari hasil simulasi dapat disimpulkan bahwa nilai yang dihasilkan oleh masing-masing matriks jarak dan pola percabangan yang dihasilkan oleh masing-masing phylogenetic tree tidak begitu jauh berbeda. Namun berdasarkan teori, metode Kimura lebih merepresentasikan kondisi yang sebenarnya dibandingkan dengan metode Jukes-Cantor.Kata kunci: Jukes-Cantor dan Kimura distance matrix; Jukes-Cantor danKimura method; DNA; alignment.vii + 78 hlm.; lamp.Bibliografi: 10 (1980-2008)"