Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 8 dokumen yang sesuai dengan query
cover
M Wildan Abiyyi
Abstrak :
Kulit sensitif merupakan salah satu tipe kulit yang dapat didiagnosis secara subjektif melalui Indikator tipe kulit Baumann (BSTS). Orang dengan tipe kulit sensitif memiliki potensi yang tinggi untuk dapat mengalami gangguan kulit yang mempengaruhi kualitas hidupnya. Meskipun Mikrobioma kulit telah terbukti memiliki korelasi terhadap beberapa penyakit dan kelainan kulit, namun hubungannya dengan tipe kulit sensitif belum banyak dilaporkan. Sehingga, pada penelitian ini bertujuan untuk Melakukan analisis metagenomik pada kulit wajah dan korelasinya dengan kondisi kulit sensitif dengan metode 16S rRNA. Sampel pulasan kulit wajah diambil dari 144 responden yang terdiri dari 54 orang dengan tipe kulit sensitif dan 90 orang dengan tipe kulit normal. Dari 144 sampel yang dikumpulkan kemudian dilakukan analisis metagenomik berdasarkan hasil sekuensing amplikon 16S rRNA. Didapatkan hasil bahwa analisis diversitas alfa menggunakan indeks Chao1 dan Shanon menujukkan kelimpahan Mikrobioma lebih rendah secara signifikan (P-value = 0,04008) pada kelompok dengan tipe kulit sensitif. Analisis korelasi dengan Uji Spearman menunjukkan bahwa terdapat korelasi kelimpahan Mikrobioma kulit wajah dengan kondisi tipe kulit sensitif dimana kelimpahan Mikrobioma dengan genus Corynebacterium lebih rendah secara signifikan pada kelompok dengan tipe kulit sensitif (P-value = 0,04462) yang diiringi dengan kelimpahan genus Staphylococcus (P-value = 0,01235) dan Streptococcus (P-value = 0,02184) yang lebih tinggi secara signifikan pada kelompok ini. Pada tingkat spesies, bakteri Propionibacterium humerusii memiliki kelimpahan yang lebih tinggi secara signifikan pada kelompok dengan tipe kulit sensitif (P-value = 0,04967). Dengan demikian, kelimpahan Mikrobioma kulit memiliki korelasi dengan kondisi tipe kulit sensitif khususnya pada kasus yang ditemukan di Indonesia. Hal ini dapat dijadikan Pustaka dalam pengembangan produk perawatan kulit yang spesifik untuk kondisi kulit sensitif. Namun adanya analisis lebih lanjut yang dapat mengetahui kelimpahan dan keragaman Mikrobioma hingga ke tingkat spesies akan lebih membantu dalam perkembangan penelitian ini. ......People with sensitive skin types have a high potential to have skin disorders that affect their quality of life. Although the skin microbiotmehas been shown to have a correlation with several skin diseases and disorders, but its relationship with sensitive skin type has not been widely reported. Thus, this study aims to perform metagenomics analysis on facial skin and its correlation with sensitive skin conditions. Samples of facial skin swab were taken from 144 respondents consisting of 54 people with sensitive skin types and 90 people with normal skin types. The 144 samples collected were then subjected to metagenomics analysis based on the sequencing results of the 16S rRNA amplicon technique. The results showed that alpha diversity analysis using the Chao1 and Simpson Index showed significantly lower microbiota abundance in the group with sensitive skin types (P-value = 0,04008).. Correlation analysis with the Spearman test showed that there was a correlation between the abundance of facial skin microbiota and conditions of sensitive skin types where the abundance of microbiota with the genus Corynebacterium was significantly lower in the group with sensitive skin types (P-value = 0,04462), accompanied by the abundance of the genera Staphylococcus (P-value = 0,01235) and Streptococcus (P-value = 0,02184) which were significantly higher in this group. At the species level, Propionibacterium humerusii had a significantly higher abundance in the group with sensitive skin types (P-value = 0,04967). Thus, the abundance of skin microbiota has a correlation with the condition of sensitive skin types, especially in cases found in Indonesia. This can be used as a library in the development of specific skin care products for sensitive skin conditions. However, further analysis that can determine the abundance and diversity of microbiota down to the species level will be more helpful in the development of this research.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2023
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Tubagus Mohamad Kurniadi
Abstrak :
Latar Belakang. SARS-CoV-2 menimbulkan beban yang sangat besar pada masyarakat, sistem ekonomi dan kesehatan di seluruh dunia. Berbagai langkah diambil untuk mengendalikan penyebarannya. Langkah – langkah tergantung pada diagnosis yang tepat waktu dan akurat dari orang yang terinfeksi virus. Penyebaran COVID-19 yang cepat, deteksi virus yang cepat dan tepat memegang peranan penting untuk mengendalikan infeksi dan membantu pasien untuk mencegah perkembangan penyakit lebih lanjut. Metode real-time reverse transcriptase-PCR (rRT-PCR) sangat dianjurkan untuk deteksi SARS-CoV-2 sebagai uji kualitatif spesifik dan sederhana. Selain metode menggunakan rRT-PCR, telah terdapat metode dengan pendekatan yang berbeda untuk mendeteksi SARS-CoV-2. Salah satu metode tersebut adalah VereCoVTM yang memiliki cara kerja berdasarkan teknik PCR dan hibridisasi, namun performa dari VereCoVTM masih belum diketahui. Tujuan. Penelitian bertujuan untuk mengetahui kesesuaian dan kaitannya dengan gejala klinis menggunakan uji VereCoVTM dengan rRT-PCR dalam mendeteksi SARS-CoV-2. Metode. Penelitian ini menggunakan consecutive sampling. Sampel penelitian yaitu sampel swab nasofaring dan orofaring yang diambil kemudian dianalisis di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Analisis data menggunakan Kappa Cohen. Selanjutnya, dilakukan analisis data kesesuaian hasil pemeriksaan kedua uji pada pasien dengan gejala dan pasien tanpa gejala. Hasil. Perbedaan positivity rate antara VereCoVTM dan rRT-PCR sebesar 68% menunjukkan bahwa VereCoV™ memberikan hasil negatif palsu. Jika disandingkan terhadap data hasil rRT-PCR, maka ambang batas deteksi VereCoVTM setara dengan nilai Ct<32 atau setara dengan 118 salinan RNA. Tidak dijumpai reaksi silang dengan beberapa mikroorganise. Konsistensi antara kedua uji ditunjukan oleh koefisien Kappa (=0,609). Hal ini menggambarkan kesesuian yang moderate atau sedang. Analisis lebih lanjut menunjukkan bahwa kesesuaian kedua pemeriksaan meningkat pada pasien yang bergejala (90%), sebaliknya menurun pada pasien tanpa gejala (76,5%). VereCoVTM lebih sesuai digunakan untuk mendeteksi SARS-CoV-2 pada pasien yang bergejala. Hasil negatif pada VereCoVTM tidak dapat mengesampingkan kemungkinan infeksi COVID-19, sehingga perlu pemeriksaan lebih lanjut untuk mendukung diagnosis yang tepat. Kesimpulan. VereCoV™ lebih cocok untuk mendeteksi SARS-Cov-2 pada pasien yang bergejala. VereCoVTM tidak menunjukan adanya reaksi silang dengan beberapa mikroorganisme, yang terdapat pada saluran pernapasan. ......Background. SARS-CoV-2 places an enormous burden on society, economic systems and health around the world. Various steps were taken to control its spread. These steps depend on timely and accurate diagnosis of the person infected with the virus. The rapid spread of COVID-19, rapid and precise detection of the virus play an important role in controlling infection and helping patients to prevent further disease progression. The real-time reverse transcriptase-PCR (rRT-PCR) method is highly recommended for the detection of SARS-CoV-2 as a simple and specific qualitative test. In addition to the method using rRT-PCR, there have been methods with different approaches to detect SARS-CoV-2. One of these methods is VereCoVTM which has a working method based on PCR and hybridization techniques, but the performance of VereCoVTM is still unknown. Aim. The aim of the study was to determine the suitability and relation to clinical symptoms using the VereCoVTM test with rRT-PCR in detecting SARS-CoV-2. Method. This study used consecutive sampling. The samples of the study was swab samples of the nasopharynx and oropharynx which were taken and analyzed at the Clinical Microbiology Laboratory, Faculty of Medicine, Universitas Indonesia. Data was then analyze using Kappa Cohen. Furthermore, the data analysis of the suitability of the results of the two tests was carried out in patients with symptoms and patients without symptoms. Results. The difference in positivity rate between VereCoVTM and rRT-PCR of 68% indicates that VereCoV™ gives a false negative result. When compared to the rRT-PCR data, the VereCoVTM detection threshold is equivalent to a Ct value <32 or equivalent to 118 copies of RNA. No cross reactions were found with some microorganisms. Consistency between the two tests is indicated by the Kappa coefficient (= 0.609). This describes a moderate or moderate fit. Further analysis showed that the concordance of the two examinations increased in symptomatic patients (90%), on the contrary decreased in asymptomatic patients (76.5%). VereCoVTM is more suitable for detecting SARS-CoV-2 in symptomatic patients. A negative result on VereCoVTM cannot rule out the possibility of COVID-19 infection, so further tests are needed to support a correct diagnosis. Summary. VereCoV™ is more suitable for detecting SARS-Cov-2 in symptomatic patients. VereCoVTM did not show any cross-reactivity with some microorganisms, which are present in the respiratory tract.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2021
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Via Ekawati
Abstrak :
Latar Belakang : COVID- 19 disebabkan SARS-COV-2. WHO menerbitkan protokol pemeriksaan laboratorium untuk deteksi virus menggunakan metode real time RT-PCR dari spesimen swab nasofaring dan orofaring. Metode ini cukup invasif. Diperlukan tehnik pemeriksaan yang relatif aman dan nyaman untuk pasien. Penelitian ini bertujuan untuk melihat efetivitas swab bukal sebagai alternatif pemeriksaan SARS-COV-2. Metode : Studi uji diagnostik ini dilaksanakan sejak tahun 2020 - 2021, mengambil spesimen swab nasofaring, swab orofaring dan swab bukal dari pasien positif COVID- 19. Dilakukan optimasi, ekstraksi RNA virus dan real time RT-PCR . Hasil Penelitian : Hasil studi mengumpulkan 68 spesimen dari pasien COVID-19. Hasil uji nasofaring, orofaring dan bukal positif adalah 24 spesimen. Hasil uji nasofaring dan orofaring positif dengan uji bukal negatif adalah 23 spesimen. Berdasarkan nilai Ct < 20 dan Ct <25, hasil kesesuaian positif dan negatif adalah 100%. Nilai Ct < 30 hasil kesesuaian positif 85,3 % dan negatif adalah 100%. Nilai Ct < 40 , hasil kesesuaian positif 51,1 % dan negatif adalah 100%.  Kesimpulan : Swab bukal dapat digunakan sebagai pemeriksaan alternatif pada pemeriksaan SARS- CoV-2. ......Background: COVID-19 caused by the SARS-COV-2 virus. WHO published protocol for the detection of the virus using the real time RT-PCR from nasopharyngeal and oropharynx swab specimens. This method is invasive. Required an examination technique that is relatively safe and comfortable. This study aims to see the effectiveness of the buccal swab as an alternative to the SARS-CoV-2 examination. Methods: This diagnostic test study from 2020 to 2021, specimens of nasopharyngeal, oropharyngeal and buccal swabs from COVID-19. Specimens underwent an optimization, viral RNA extraction and real time RT-PCR. Result : This study collected 68 specimens from COVID- 19 patients. The results of positive nasopharyngeal, oropharynx and buccal tests were 24 specimens. The results of a positive nasopharynx and oropharynx test with a negative buccal test were 23 specimens. Based on the values ​​of Ct < 20 and Ct < 25 , the results of positive agreement and negative are 100%. The value of Ct < 30 and Ct < 40  results in a positive agreement are 85.3% and 51,1 %. The negative  results are 100%. Conclusion : Buccal swab can be used as an alternative test for SARS-CoV-2 examination.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2022
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Lisa Yuliantiningsih
Abstrak :
Latar Belakang: Diagnosis definitif Helicobacter pylori H.pylori hingga kini masih merupakan masalah. Biakan untuk isolasi dan identifikasi bakteri ini sulit. Uji cepat urease direkomendasikan sebagai uji diagnostik lini pertama pasien dispepsia. Tujuan: Mengembangkan komposisi medium biakan dan deteksi cepat H.pylori pada spesimen biopsi lambung pasien dispepsia. Metode: Desain penelitian merupakan studi potong lintang dan eksperimental laboratorium. Sampel diambil dengan cara consecutive sampling sebanyak 68 spesimen biopsi lambung 34 antrum, 34 korpus, masing-masing untuk biakan dan uji MIU. Sebagai pembanding digunakan histopatologi dan PCR. Mula-mula dilakukan optimasi medium biakan dan MIU konsentrasi merah fenol, pH, urea dan suhu inkubasi. Selanjutnya kondisi optimal yang diperoleh diaplikasikan pada spesimen biopsi pasien dispepsia. Hasil: Medium biakan agar darah Columbia ditambah vankomisin 5 mg / 500 mL dan darah domba 7 belum optimal, namun dapat digunakan untuk isolasi dan identifikasi. Hasil MIU modifikasi sebagai berikut: konsentrasi merah fenol 0,001 ; urea 4 ; pH medium 7; Suhu inkubasi optimal 35-370 C. Proporsi positif hasil uji MIU sebesar 35,29 12/34, biakan 32,35 11/34, PCR 32,35 11/34 dan histopatologi 20,59 7/34. Kesimpulan: Pemeriksaan MIU meningkatkan positivitas hasil pemeriksaan sebesar 14,7 bila dibandingkan dengan histopatologi. ......Background: Until now, definitive diagnostic of H.pylori is still a problem. Culture for isolation and identification of this pathogen is difficult. Rapid urease test is recommended as a first line diagnostic test. Aim: To obtain optimal composition for culture medium and Motility Indol Urease MIU test for the detection of H. pylori in dyspeptic patient biopsy specimens. Method: A cross sectional and experimental laboratory study was performed. Sixty eight gastric biopsy samples 34 antrum, 34 corpus were collected by consecutive sampling method for culture and MIU test. Histopathology and PCR were conducted for comparison. Initially, we performed the optimation of culture medium and MIU test phenol red and urea concentration, pH, and temperature. The optimal condition obtained was then applied to the specimens. Result: Columbia agar supplemented with vancomycin 5 mg 500 mL and 7 sheep blood was unable to create an optimal condition, but it can be used for isolation and identification. Modified MIU was performed by this following condition phenol red 0,001 urea 4 pH 7 incubation temperature 35 37oC. Positive proportion of MIU was 35.29 12 34, culture 32.35 11 34, PCR 32,35 11 34 and histopathology 20.59 7 34. Conclusion: MIU test was able to improve the positivity rate by 14,7 compared to histopathology.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2018
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Agus Evendi
Abstrak :
Latar Belakang: Pseudomonas aeruginosa, resisten terhadap obat, menyebabkan infeksi kesehatan. Resistensi terhadap terapi pilihan meropenem merupakan ancaman serius. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis perubahan konsentrasi hambat minimum meropenem (KHM), perubahan ekspresi gen ampC, mexA, dan oprD, serta korelasi antara KHM dengan ekspresi gen ampC, mexA, dan oprD sesudah paparan meropenem. Metode: Digunakan sepuluh isolat P. aeruginosa dari Departemen Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Sesudah bakteri terbukti peka terhadap meropenem secara fenotip, gen resistensi intrinsik dideteksi menggunakan PCR. Sesudah paparan meropenem pada hari ke 5 dan 12 dilakukan uji kepekaan dengan metode gradien konsentrasi dan deteksi RNA menggunakan real-time RT-PCR. Hasil: Semua isolat P. aeruginosa yang peka secara fenotip terhadap meropenem mempunyai gen ampC, mexA, dan oprD. Peningkatan KHM, peningkatan ekspresi gen ampC dan mexA, dan penurunan ekspresi gen oprD diamati sesudah paparan meropenem. Terdapat korelasi yang sangat kuat dan signifikan (p ≤ 0,05) antara KHM dan ekspresi gen oprD sesudah hari ke-12 paparan meropenem. Kesimpulan: Meskipun tidak terdapat perbedaan yang signifikan pada ekspresi gen KHM dan ampC, mexA, dan oprD antara hari ke-5 dan hari ke-12, namun terdapat korelasi yang sangat kuat dan signifikan antara ekspresi gen KHM dan oprD pada hari ke-12 (p≤ 0,05). Hal ini menunjukkan bahwa penurunan ekspresi gen oprD berpotensi meningkatkan resistensi meropenem pada P. aeruginosa. ......Background: Pseudomonas aeruginosa, drug-resistant, causes health infections. Resistance to the preferred therapy meropenem is a serious threat. This study aimed to analyze changes in meropenem minimum inhibitory concentration (MIC), changes in ampC, mexA, and oprD gene expression, and the correlation between MIC and ampC, mexA, and oprD gene expression after meropenem exposure. Methods: Ten isolates of P. aeruginosa from the Clinical Microbiology Department, Faculty of Medicine, Universitas Indonesia were used. After the bacteria were shown to be sensitive to meropenem phenotypically, intrinsic resistance genes were detected using PCR. After meropenem exposure on Days 5 and 12, sensitivity testing was carried out with the concentration gradient method and RNA was detected using real-time RT-PCR. Results: All P. aeruginosa isolates that were phenotypically sensitive to meropenem had the ampC, mexA, and oprD genes. An increase in MIC, an increase in ampC and mexA gene expression, and a decrease in oprD gene expression were observed after meropenem exposure. There was a very strong and significant correlation (p ≤ 0.05) between MIC and oprD gene expression after Day 12 of meropenem exposure. Conclusion: Although there were no significant differences in MIC and ampC, mexA, and oprD gene expression between Day 5 and Day 12, there was a very strong and significant correlation between MIC and oprD gene expression on Day 12 (p≤ 0.05). This indicates that decreasing oprD gene expression has the potential to increase meropenem resistance in Pseudomonas aeruginosa.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2024
D-pdf
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Lisa Yuliantiningsih
Abstrak :
Latar Belakang: Diagnosis definitif Helicobacter pylori (H.pylori) hingga kini masih merupakan masalah. Biakan untuk isolasi dan identifikasi bakteri ini sulit. Uji cepat urease direkomendasikan sebagai uji diagnostik lini pertama pasien dispepsia. Tujuan: Mengembangkan komposisi medium biakan dan deteksi cepat H.pylori pada spesimen biopsi lambung pasien dispepsia. Metode: Desain penelitian merupakan studi potong lintang dan eksperimental laboratorium. Sampel diambil dengan cara consecutive sampling sebanyak 68 spesimen biopsi lambung (34 antrum, 34 korpus), masing-masing untuk biakan dan uji MIU. Sebagai pembanding digunakan histopatologi dan PCR. Mula-mula dilakukan optimasi medium biakan dan MIU (konsentrasi merah fenol, pH, urea dan suhu inkubasi). Selanjutnya kondisi optimal yang diperoleh diaplikasikan pada spesimen biopsi pasien dispepsia. Hasil: Medium biakan agar darah Columbia ditambah vankomisin 5 mg/500 mL dan darah domba 7% belum optimal, namun dapat digunakan untuk isolasi dan identifikasi. Hasil MIU modifikasi sebagai berikut: konsentrasi merah fenol 0,001%; urea 4%; pH medium 7; Suhu inkubasi optimal 35-370 C. Proporsi positif hasil uji MIU sebesar 35,29% (12/34), biakan 32,35%(11/34), PCR 32,35%(11/34) dan histopatologi 20,59% (7/34). Kesimpulan: Pemeriksaan MIU meningkatkan positivitas hasil pemeriksaan sebesar 14,7% bila dibandingkan dengan histopatologi.
Background: Until now, definitive diagnostic of H.pylori is still a problem. Culture for isolation and identification of this pathogen is difficult. Rapid urease test is recommended as a first-line diagnostic test. Aim: to obtain optimal composition for culture medium and Motility-Indol-Urease (MIU) test for the detection of H. pylori in dyspeptic patient biopsy specimens. Method: A cross sectional and experimental laboratory study was performed. Sixty eight gastric biopsy samples (34 antrum, 34 corpus) were collected by consecutive sampling method for culture and MIU test. Histopathology and PCR were conducted for comparison. Initially, we performed the optimation of culture medium and MIU test (phenol red and urea concentration, pH, and temperature). The optimal condition obtained was then applied to the specimens. Result: Columbia agar supplemented with vancomycin 5 mg / 500 mL and 7% sheep blood was unable to create an optimal condition, but it can be used for isolation and identification. Modified MIU was performed by this following condition: phenol red 0,001%; urea 4%; pH 7; incubation temperature 35-37oC. Positive proportion of MIU was 35.29% (12/34), culture 32.35% (11/34), PCR 32,35% (11/34) and histopathology 20.59% (7/34). Conclusion: MIU test was able to improve the positivity rate by 14,7% compared to histopathology.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2018
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Selvia Ganiesa
Abstrak :
Latar Belakang. Saat ini sedang terjadi pandemi COVID-19 di seluruh dunia, pandemi ini dimulai dari Wuhan, Cina. Virus SARS-CoV-2 penyebab COVID-19 sangat menular dan penyebarannya sangat cepat, sehingga memerlukan penanganan khusus seperti isolasi atau karantina. Gejala penyakit COVID-19 menyerupai gejala infeksi saluran pernapasan akut yang disebabkan oleh patogen lain seperti SARS, influenza, rhinovirus, dll. Diagnosis penyakit COVID-19 perlu ditentukan untuk membedakan dari ISPA yang diakibatkan oleh patogen lain. Beberapa uji diagnostik telah di kembangkan untuk deteksi cepat penyebab COVID-19. Tujuan. Tujuan penelitian ini adalah membandingkan alat diagnostik kit antigen ”Genbody COVID-19 Test Ag®” dengan rRT-PCR yang menjadi refensi test, untuk mendapatkan alat diagnostik yang murah, cepat dan akurat serta memiliki kemampuan yang setara dengan rRT-PCR. Metode. Penelitian ini merupakan uji banding dengan desain penelitian potong lintang dan metode pengumpulan spesimen secara consecutive sampling pada pasien contact tracing COVID-19. Penelitian dilakukan di Fasilitas Pelayanan Kesehatan (FASYANKES) Puskesmas Kecamatan Tanah Abang, Sawah Besar, Senen dan Laboratorium Mikrobiologi Klinik (LMK) FKUI pada bulan Oktober 2020-Desember 2020. Sampel penelitian merupakan swab Nasofaring dan oropharing dari pasien contact tracing COVID-19 yang dilakukan pemeriksaan rRT-PCR menggunakan reagen LiliF COVID-19 Real Time PCR kit dan pemeriksaan antigen menggunakan “Genbody COVID-19 Test Ag®”. Analisis penelitian ini menggunakan tabel 2x2. Hasil. Dari 233 sampel sebanyak 80 (34,33%) sampel positif rRT-PCR dan 53 (22,74%) sampel yang positif pada kit antigen. Kit antigen yang digunakan pada penelitian ini mempunyai sensitivitas 66,25% (55,89-76,61), spesifisitas 100% (100-100), Nilai Duga Positif (NDP) 100% (100-100), Nilai Duga Negatif (NDN) 85% (79,78-90,22) dan akurasi 88,41%. Pada hasil rRT-PCR dengan CT < 20, kit test antigen mempunyai sensitivitas 97,14% (91,62-102,66), spesifisitas 100% (100-100) dan pada CT ≥ 21-≥ 30 sensitivitas kit antigen terus menurun. Kesimpulan. Pemeriksaan COVID-19 menggunakan kit test antigen “Genbody COVID-19 Test Ag®” mempunyai sensitivitas rendah yang tidak sesuai dengan rekomendasi WHO. Kit antigen ini mempunya sensitivitas yang tinggi pada sampel dengan hasil rRT-PCR pada CT rendah (CT <20). ......Introduction. Currently, the COVID-19 pandemic is happening over the world, this pandemic started in Wuhan, China. The SARS-CoV-2 virus that causes COVID-19 is highly contagious, spreads very quickly and requiring special handling such as isolation or quarantine. The symptoms of COVID-19 resemble an acute respiratory infection caused by other pathogens such as SARS, influenza, rhinovirus, etc. The diagnosis of COVID-19 disease needs to be determined to distinguish it from acute respiratory infection caused by other pathogens. Several diagnostic tests have been developed for rapid detection of the cause of COVID-19. Aim. The research aims to compare the antigen kit "Genbody COVID-19 Test Ag®" with rRT-PCR as a reference test to obtain an affordable, fast and accurate diagnostic tool and have equivalent capabilities as rRT-PCR. Method. The research is a comparative testing with a cross-sectional design and consecutive sampling method for collecting specimens in COVID-19 contact tracing patients. The research was conducted at the Health Service Facility (FASYANKES) Puskesmas Kecamatan Tanah Abang, Sawah Besar, Senen and Laboratorium Mikrobiologi Klinik (LMK) FKUI in October 2020-December 2020. The research samples were nasopharyngeal and oropharyngeal swabs from COVID-19 contact tracing patients who were carried out rRT-PCR test using LiliF COVID-19 Real Time PCR kit and antigen test using “Genbody COVID-19 Test Ag®”. The research analysis used a 2x2 table. Results. Of the 233 samples, 80 (34.33%) were positive for rRT-PCR and only 53 (22.74%) were positive for the antigen kit. The antigen kit used in this research had a sensitivity of 66.25% (55.89-76.61), specificity 100% (100-100), Positive Prediction Value (NDP) 100% (100-100), Negative Suggestion Value ( NDN) 85% (79.78-90.22) and accuracy 88.41%. On the results of rRT-PCR with CT < 20, the antigen test kit had a sensitivity of 97.14% (91.62-102.66), specificity 100% (100-100) and at CT 21-30 the sensitivity of the antigen kit continued to decrease. Summary. The COVID-19 examination using the “Genbody COVID-19 Test Ag®” antigen test kit has a low sensitivity which is not in accordance with WHO recommendations. This antigen kit has high sensitivity in rRT-PCR results at CT (CT < 20).
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2022
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Wasista Hanung Pujangga
Abstrak :
Latar Belakang. COVID-19 menyebar hampir ke seluruh dunia. Di Indonesia, pada 2 Maret 2020 telah dilaporkan dua kasus COVID-19 pertama yang terkonfirmasi positif. Karena banyaknya kasus COVID-19 yang terjadi di Indonesia terutama pada tenaga kesehatan, KEMENKES menerbitkan pedoman pencegahan dan pengendalian COVID- 19 sebagai acuan untuk meminimalisasi terjadinya penularan COVID-19. Tujuan. Penelitian ini bertujuan untuk merancang sistem skoring untuk memprediksi terjadinya infeksi COVID-19 pada tenaga kesehatan di Rumah Sakit Umum Pusat Nasional (RSUPN CM). Metode. Penelitian ini menggunakan metode total sampling. subyek penelitian ini adalah tenaga kesehatan yang bekerja di RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo. Pengumpulan data menggunakan kuisioner. Analisa data dengan analisis multivariat untuk melihat faktor risiko yang ada dapat dijadikan sebagai prediktor terjadinya infeksi berbahaya. Hasil. Desain penelitian ini adalah potong lintang dengan jumlah subjek sebanyak 125 orang. Tenaga kesehatan yang dinyatakan positif COVID-19 sebanyak 48,7% dari seluruh jumlah tenaga kesehatan di RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo periode bulan Maret sampai Oktober 2020 yang memenuhi kriteria inklusi. Faktor risiko yang dapat digunakan sebagai prediktor yaitu usia, tempat bekerja di RSCM, riwayat kontak erat dan status merokok. Kesimpulan. Sistem skoring dalam penelitian ini dapat digunakan sebagai prediktor tenaga kesehatan terhadap kemungkinan berisiko tinggi atau rendah terinfeksi COVID- 19. ......Background. COVID-19 has been spread almost all over the world. In Indonesia, on March 2, 2020, the first two confirmed cases of COVID-19 were reported. Due to the large number of COVID-19 cases occurring in Indonesia, especially in healthcare workers, the Ministry of Health issues guidelines for preventing and controlling COVID- 19 as a reference to minimize the occurrence of COVID-19 based on transmission. Objective. This study aims to design a scoring system to predict the occurrence of COVID-19 infection among health workers at RSUPN CM. Method. This research used total sampling method. The subjects of this study were healthcare workers who worked at RSUPN. Dr. Cipto Mangunkusumo. Data was collected using questionnaires. Then, data was analyzed until multivariate analysis to see whether the existing risk factors can be utilized as predictors of the occurrence of COVID- 19 infection. Results. This study’s design is cross-sectional with 125 people as an respondent. Health workers who tested positive for COVID-19 as many as 48.7% of the total number of health workers at RSUPN CM for the period from March to October 2020 which meets the inclusion criteria. Risk factors that contributed as predictors including age category, place of work at RSCM, history of close contact and smoking. Conclusion. The scoring system in this study can be implemented as a predictor of having created by COVID-19 in healthcare workers in RSUPN CM, whether the health worker is in a high or low risk condition of being infected with COVID-19.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2021
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library