:: UI - Skripsi Open :: Kembali

UI - Skripsi Open :: Kembali

Analisis Aktivitas Mutasi HIV-1 Protease dari Model Pasien RY1 dan DY1 Terhadap Inhibitor Amprenavir dengan Metode Molecular Dynamic Simulation = Activity analysis of HIV-1 Protease Mutations of Patient Model RY1 and DY1 Against Amprenavir Inhibitor with Molecular Dynamic Simulation Method

; Muhammad Aziz Majidi, examiner; Rosari Saleh, supervisor (Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2012)

 Abstrak

ABSTRAK
Protease (PR) pada HIV berperan dalam proses maturasi virus agar dapat
menginfeksi sel inang. Proses tersebut berlangsung dalam sisi aktif PR dengan
memotong poliprotein virus. Banyaknya ragam mutasi residu PR membuat
interaksi PR dengan obat yang diberikan dapat berbeda. Pasien dari Indonesia
sendiri memiliki karakteristik galur tipe AE yang berbeda dengan galur B yang
banyak ditemukan di negara-negara barat. Dua PR pasien dari Indonesia dengan
kode RY1 (10 mutasi) dan DY1 (12 mutasi) disimulasikan dengan metode
simulasi dinamika molekuler untuk meninjau interaksi antara kedua PR dengan
obat amprenavir (APV). Berdasarkan hasil energinya, interaksi RY1-APV lebih
kuat bila dibandingkan dengan DY1-APV. Hasil tersebut diperkuat dengan tinjuan
struktural dan ikatan hidrogen terhadap residu mutasi yang dimiliki kedua pasien.
Model pasien RY1 memiliki mutasi di residu ke-45 yang diketahui membantu
mempertahankan interaksi PR-APV, sedangkan model pasien DY1 memiliki
mutasi pada residu ke-10 yang diketahui mengurangi interaksinya dengan obat.
ABSTRACT
Protease (PR) on the HIV virus plays a role in the maturation process in order to
infect host cells. The process takes place in the active site PR by cutting viral
polyprotein. Many kinds of mutated residues at PR makes interaction with the
drug can vary. Patients from Indonesia itself has AE type strain that has different
characteristic with B type strain which are found in western countries. Two PR
patients from Indonesia with RY1 code (10 mutations) and DY1 code (12
mutations) is simulated by molecular dynamics simulation methods to evaluate
the interaction between two PR with amprenavir (APV). Based on the energy,
RY1-APV interaction is stronger when compared to DY1-APV. These results are
supported by structural insights and hydrogen bonding to residue mutations that
occur in both patients. RY1 patient model have mutations in 45th residue, that is
known to help maintain the interaction of PR-APV. While the DY1 patient model
have mutations in the 10th residue, that is known to reduce the interaction with
the drug.

 File Digital: 1

 Kata Kunci

 Metadata

No. Panggil : S42345
Entri tambahan-Nama orang :
Entri tambahan-Nama badan :
Subjek :
Penerbitan : [Depok;Depok, Depok]: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2012
Program Studi :
Bahasa : ind
Sumber Pengatalogan : LibUI ind rda
Tipe Konten : text
Tipe Media : unmediated ; computer
Tipe Carrier : volume ; online resource
Deskripsi Fisik : xiv, 100 pages : illustration ; 28 cm + appendix
Naskah Ringkas :
Lembaga Pemilik : Universitas Indonesia
Lokasi : Perpustakaan UI
  • Ketersediaan
  • Ulasan
No. Panggil No. Barkod Ketersediaan
S42345 14-24-61930606;14-24-61930606 TERSEDIA
Ulasan:
Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20314775
 See also