Asosiasi Single Nucleotide Polymorphism "X" Kromosom 15 dengan kerentanan terhadap Colorectal Cancer sporadik berdasarkan pendekatan genomik di populasi Makassar-Sulawesi Selatan = Association Single Nucleotide Polymorphism "X" Chromosome 15 with the susceptibility to sporadic Colorectal Cancer based on genomic approach in Makassar-Sulawesi Selatan population
Pendrianto;
Amarila Malik, supervisor; Maksum Radji, examiner; Arry Yanuar, examiner; Effionora Anwar, examiner; Ivet Suriapranata, examiner
(Universitas Indonesia, 2012)
|
|
Insiden dan mortalitas dari colorectal cancer CRC terus meningkat Beberapa metode skrining CRC umumnya bersifat invasif dan tidak nyaman Single Nucleotide Polymorphism SNP dapat dimanfaatkan sebagai marker untuk skrining CRC dengan tingkat invasif yang rendah Penelitian ini bertujuan untuk memvalidasi asosiasi antara SNP ldquo X rdquo dengan kerentanan terhadap CRC sporadik Desain penelitian menggunakan studi potong lintang Jumlah sampel dan daya uji pada kelompok CRC sporadik dan kontrol ditentukan dengan menggunakan Epi Info versi 3 5 1 DNA genomik diperoleh dari sampel darah kedua kelompok kemudian dilakukan PCR dan sequencing untuk melacak genotip SNP ldquo X rdquo dengan ukuran amplikon 979 pb Hasil analisis statistik menunjukkan nilai PValue genotip TT terhadap Non TT sebesar 0 025 P 0 05 dengan Odds Ratio OR 0 193 0 420 0 911 Setelah dikoreksi dengan binary logistic regression didapatkan P Value sebesar 0 047 dengan OR 0 188 0 431 0 988 P Value genotip GT terhadap Non GT 0 890 dengan OR 0 561 0 963 1 652 P Value genotip GG terhadap Non GG 0 076 dengan OR 0 949 1 628 2 793 Hasil menunjukkan adanya asosiasi antara genotip TT pada SNP ldquo X rdquo dengan menurunnya kerentanan terhadap CRC sporadik Studi lanjutan pada populasi lainnya di wilayah Indonesia perlu dilakukan untuk pemetaan pola variasi genetic di SNP ldquo X rdquo dan untuk mengetahui pengaruhnya di gen gen terdekat yang berkorelasi terhadap CRC sporadik. The incidence and mortality of colorectal cancer CRC increase rapidly Some CRC screening methods are invasive and generally uncomfortable Single Nucleotide Polymorphism SNP can be utilized as a marker for CRC screening with low level of invasiveness This study aimed to validate the association between SNP X with susceptibility to sporadic CRC This study is a crosssectional study Number of samples and power in CRC and control groups were determined using Epi Info v3 5 1 Genomic DNA were obtained from whole blood samples and followed by PCR 979 bp amplicon and direct sequencing to determine the genotype pattern Statistical analysis showed that P Value of genotype TT vs Non TT is 0 025 P 0 05 with Odds Ratio OR 0 193 0 420 0 911 P Value after adjustment using binary logistic regression was 0 047 with OR 0 188 0 431 0 988 P Value of genotype GT vs Non GT was 0 890 with OR 0 561 0 963 1 652 P Value of genotype GG vs Non GG was 0 076 with OR 0 949 1 628 2 793 There was a significant association between TT genotype at the SNP X with decreased susceptibility to sporadic CRC Further study will be needed to identify genetic variation patterns in the SNP X rdquo in other populations in Indonesia region and to investigate its effect to the nearest genes and its correlation to sporadic CRC. |
 T-Pendrianto.pdf :: Unduh
|
| No. Panggil : | T-Pdf |
| Entri utama-Nama orang : | |
| Entri tambahan-Nama orang : | |
| Subjek : | |
| Penerbitan : | Depok: Universitas Indonesia, 2012 |
| Program Studi : |
| Bahasa : | ind |
| Sumber Pengatalogan : | LibUI ind rda |
| Tipe Konten : | text |
| Tipe Media : | unmediated ; computer |
| Tipe Carrier : | volume ; online resource |
| Deskripsi Fisik : | xiv, 66 pages ; 28 cm + appendix |
| Naskah Ringkas : | |
| Lembaga Pemilik : | Universitas Indonesia |
| Lokasi : | Perpustakaan UI, Lantai 3 |
| No. Panggil | No. Barkod | Ketersediaan |
|---|---|---|
| T-Pdf | 15-21-651513624 | TERSEDIA |
| Ulasan: |
| Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20329109 |
