:: Artikel Jurnal :: Kembali

Artikel Jurnal :: Kembali

Genetic diversity of indonesian bacterial leaf blight isolate (xanthomonas oryzae pv. oryzae) core collection based on the vntr and avrxa7 molecular markers / Siti Yuriyah, Dwinita Wikan Utami

Siti Yuriyah; Dwinita Wikan Utami (The Indonesian Center for Agricultural Biotechnology and Genetic Resource Research and Development, Bogor, 2015)

 Abstrak

Bacterial leaf blight (BLB) is one of the major diseases in rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae. This study
aimed to identify and analyze the genetic diversity of 18 BLB isolates that consist of 7 races and 11 haplotypes from
various locations in Indonesia. The genetic diversity analysis was conducted on the basis of the VNTR (Variable
Number of Tandem Repeat) markers and the avrxa7 gene marker. The banding pattern of the amplification product was
made into binary data as input for the construction of a dendogram. Based on the dendogram, three X. oryzae pv. oryzae
genotype groups with different virulence levels were formed. The VII (IXO80_021) race of X. oryzae pv. oryzae
genotype group I and the VIII-A (IXO 80_024) race of genotype group II were avirulent, whereas the races and
haplotypes of genotype group III were virulent.
Keragaman Genetik Core Collection Isolat Bacterial Leaf Blight (Xanthomonas oryzae pv. oryzae) Indonesia
berdasarkan Marka Molekular VNTR dan avrXa7. Bacterial leaf blight (BLB) adalah salah satu penyakit utama padi
yang disebabkan oleh bakteri pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi
dan menganalisis keragaman genetik 18 isolat isolates yang terdiri dari 7 ras dan 11 haplotipe yang berasal dari
beberapa lokasi koleksi di Indonesia. Analisis keragaman genetik dilakukan menggunakan marka VNTR (Variable
Number of Tandem Repeat) dan marka gen avrxa7. Pola pita DNA hasil amplifikasi digunakan sebagai data input biner
untuk membuat dendogram keragaman. Berdasarkan dendogram tersebut, terdapat tiga kelompok genotipe X. oryzae
pv. oryzae dengan tingkat virulensi yang berbeda. Ras VII (IXO80_021) yang termasuk dalam kelompok I dan Ras
VIII-A (IXO 80_024) yang termasuk dalam kelompok II merupakan ras BLB yang tidak virulen. Sedangkan kelompok
III merupakan kelompok ras dan haplotipe yang bersifat virulen.

 Kata Kunci

 Metadata

No. Panggil : PDF
Entri utama-Nama orang :
Entri tambahan-Nama orang :
Subjek :
Penerbitan : [Place of publication not identified]: The Indonesian Center for Agricultural Biotechnology and Genetic Resource Research and Development, Bogor, 2015
Sumber Pengatalogan : LibUI eng rda
ISSN : 23560851
Majalah/Jurnal : Makara Journal of Science
Volume : Vol 19, No 3 September 2015 123-130
Tipe Konten : text
Tipe Media : computer
Tipe Carrier : online resource
Akses Elektronik : http://journal.ui.ac.id/index.php/science/article/view/4893
Institusi Pemilik : Universitas Indonesia
Lokasi :
  • Ketersediaan
  • Ulasan
No. Panggil No. Barkod Ketersediaan
PDF TERSEDIA
Ulasan:
Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20447965
 See also