Adenilat siklase 10 merupakan suatu enzim yang berlokasi di sitosol yang berperan dalamkatalisis konversi ATP menjadi cyclic adenosine monophosphate (cAMP). Sebagai suatusecond messenger, cAMP berperan dalam pengaturan berbagai fungsi sel terutamaproliferasi dan apoptosis, termasuk pada sel kanker dalam kondisi patofisiologis. Enzimini diketahui memperparah kondisi kanker dengan meningkatkan proliferasi danmenghambat apoptosis. Hal ini menjadikan inhibisi adenilat siklase 10 menjadi salah satutarget yang dapat dimanfaatkan untuk menjadi agen terapi antikanker. Studi penelitianmenunjukkan bahwa senyawa flavonoid diketahui memiliki aktivitas pada penekananproliferasi dan induksi apoptosis. Oleh karena itu, dilakukan analisis in silico untukmendapatkan senyawa kandidat inhibitor adenilat siklase 10 dengan afinitas terbaik.Penambatan molekuler dilakukan menggunakan AutoDock 4, selanjutnya dilakukanvisualisasi interaksi hasil penambatan menggunakan LigPlot dan PyMOL. Parameteroptimisasi yang diperoleh untuk penambatan molekuler adenilat siklase 10 adalahmenggunakan grid box 40x40x40 unit dengan energi evaluasi 2.500.000 (medium).Berdasarkan hasil penambatan, flavonoid amentoflavone merupakan kelompok senyawaterbaik dengan afinitas ikatan tertinggi, yang mana tujuh dari delapan senyawanyamemiliki energi ikatan pada rentang -10,00 kkal/mol hingga -11,50 kkal/mol. Selain itu,sepuluh senyawa flavonoid yang direkomendasikan adalah yang memiliki energi ikatanpada rentang -10,00 kkal/mol hingga -11,50 kkal/mol. Dapat disimpulkan bahwasenyawa-senyawa tersebut adalah senyawa potensial yang dapat dijadikan kandidat obatinhibitor adenilat siklase 10.
Adenylyl cyclase 10 is an enzyme located in cytosol that plays a role in catalysis of ATPto cyclic adenosine monophosphate (cAMP). As a secondary messenger, cAMPphysiologically regulates various cell functions especially proliferation and apoptosis,including cancer cells in pathophysiological condition. This enzyme is known to worsenthe condition of cancer by increasing the proliferation and inhibiting the apoptosis. Hence,the inhibition of adenylyl cyclase 10 is one of the targets that can be used to become ananticancer therapy agent. Research studies show that flavonoid compounds are known tohave an activity on suppression of proliferation and induction of apoptosis. Therefore, anin silico analysis needs to be done to obtain the candidate compound of adenylyl cyclase10 inhibitor with the best affinity. Molecular docking was done by using AutoDock 4,then the interactions of docking results is visualized by using LigPlot and PyMOL.Optimization parameter obtained for molecular docking of adenylyl cyclase 10 was using40x40x40 unit grid box with 2.500.000 energy evaluation (medium). Based on thescreening results, amentoflavone is the best group of compounds with the highest affinitybond, which is seven of its eight compunds had the binding energy in the range of -10,00kcal/mol to -11,50 kcal/mol. Other than that, the most ten recommended flavonoidcompounds are those with the lowest binding energy in the range of -10,00 kcal/mol to -11,50 kcal/mol. These compounds are the potential compounds that can be used asadenylyl cyclase 10 inhibitor drug candidates. |
S-Dhiyadira Ayu Cendikia.pdf :: Unduh