Studi elektrokimia dan komputasi umifenovir sebagai sensor COVID-19 = Electrochemical and computational studies of umifenovir as COVID-19 sensor
Deristisya Zahra;
Ivandini Tribidasari Anggraningrum, supervisor; Muhammad Ridwan, supervisor; Helmiyati, examiner; Dita Arifa Nurani, examiner
(Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021)
|
COVID-19 atau Coronavirus disease adalah penyakit infeksius yang mudahmenular melalui tetesan air liur atau bersin orang yang terinfeksi, sehinggawabah COVID-19 ditetapkan sebagai pandemi oleh WHO pada tanggal 11Maret 2020. Pencegahan penyebaran virus ini dapat dilakukan dengan tesdiagnostik skala besar dan sejauh ini belum dilaporkan pengembangan metodeelektrokimia sebagai sensor COVID-19. Umifenovir (Arbidol) adalah salah satujenis antiviral agent yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARSCoV-2 sehingga dapat berpotensi digunakan sebagai pendeteksi COVID-19.Penelitian ini mempelajari perilaku elektrokimia umifenovir pada screen-printedcarbon electrode (SPCE). Hasil pengukuran dengan teknik cyclic voltammetrypada rentang potensial -0,6 V hingga +0,6 V dengan scan rate 50 mV/s dalam50 mM PBS pH 7,4 menunjukkan bahwa umifenovir bersifat elektroaktif denganpuncak oksidasi dan reduksi pada +0,2 V dan -0,19 V. Puncak oksidasi danreduksi ini mengalami penurunan arus jika dilakukan penambahan spikeglikoprotein pada larutan umivenovir. Penurunan arus mencapai keadaanoptimum menggunakan umifenovir 170 μM, pH 7,4, dan waktu kontak selama10 menit. Sejalan dengan studi elektrokimia, studi komputasi juga dilakukanuntuk mengetahui interaksi molekular antara umifenovir dengan spikeglikoprotein SARS-CoV-2. Selektivitas sensor diprediksi melalui simulasipenambatan molekul umifenovir dengan SARS-CoV dan virus Influenza. Hasilpenambatan molekul (docking) menunjukkan bahwa kompleks umifenovirdengan SARS-CoV-2 terbentuk spontan dengan nilai ÎGbinding sebesar -7,7306kcal/mol. Hasil ini tidak jauh berbeda pada kompleks umifenovir dengan SARSCoVyang memiliki ÎGbinding sebesar -7,7935 kcal/mol. Hasil tersebutmemprediksi adanya kompetisi SARS-CoV-2 dengan SARS-CoV untukberinteraksi dengan umifenovir. COVID-19 or Coronavirus disease is an infectious disease that can be easilytransmitted through droplets of saliva or sneezes of an infected person, so thatthe COVID-19 outbreak was declared a pandemic by WHO on March 11, 2020.The virus spread can be prevented with large-scale diagnostic tests and so far ithas not been reported the development of electrochemical methods as a sensorfor COVID-19. Umifenovir (Arbidol) is a type of antiviral agent that can interactwith the spike glycoprotein of SARS-CoV-2, thus it has the potential to be usedas a COVID-19 detector. In this study, the electrochemical behavior ofumifenovir on a screen-printed carbon electrode (SPCE) is studied.Measurement results using the cyclic voltammetry technique in a potential rangeof -0.6 V to +0.6 V with a scan rate of 50 mV/s in 50 mM PBS pH 7.4 indicatethat umifenovir is an electroactive molecule with oxidation and reduction peaksat +0.2 V and -0.19 V. Peak current decrease, both in the oxidation and reductionpeak current, occurred when the spike glycoprotein was added in the umivenovirsolution. Current reduction reached the optimum state using umifenovir 170 μM,pH 7.4, and contact time for 10 minutes. Computational studies were alsoconducted to determine the molecular interactions between umifenovir and thespike glycoprotein of SARS-CoV-2. Sensor selectivity was predicted by dockingsimulations of umifenovir molecules with SARS-CoV and influenza viruses.The docking results showed that the umifenovir complex with SARS-CoV-2formed spontaneously with a ÎGbinding value of -7.7306 kcal/mol. These resultswere not much different with the umifenovir complex with SARS-CoV whichhad ÎGbinding of -7.7935 kcal/mol. These results predict SARS-CoV-2competition with SARS-CoV to interact with umifenovir |
S-Deristisya Zahra.pdf :: Unduh
|
No. Panggil : | S-pdf |
Entri utama-Nama orang : | |
Entri tambahan-Nama orang : | |
Entri tambahan-Nama badan : | |
Subjek : | |
Penerbitan : | Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021 |
Program Studi : |
Bahasa : | ind |
Sumber Pengatalogan : | LibUI ind rda |
Tipe Konten : | text |
Tipe Media : | computer |
Tipe Carrier : | online resource (rdacarries) |
Deskripsi Fisik : | xi, 49 pages : illustration ; appendix |
Naskah Ringkas : | |
Lembaga Pemilik : | Universitas Indonesia |
Lokasi : | Perpustakaan UI |
No. Panggil | No. Barkod | Ketersediaan |
---|---|---|
S-pdf | 14-22-17390727 | TERSEDIA |
Ulasan: |
Tidak ada ulasan pada koleksi ini: 20512856 |