Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Penelitian penapisan dan uji aktivitas xilanase isolat bakteri alkalotermofilik dilakukan di Laboratorium Teknologi Bioindustri (LTB), BPPT,Serpong. Penapisan dilakukan menggunakan medium Nakamura yangdimodifikasi. Produksi enzim dilakukan dengan fermentasi substrat cair padapH 9, suhu 55o C dan 150 rpm. Uji aktivitas dilakukan dengan metode Baileyyang dimodifikasi. Hasil penapisan xilanase terhadap 136 isolat bakterimenunjukkan bahwa 18 isolat menghasilkan xilanase. Tiga isolat yangmemiliki indeks xilanolitik yang tinggi adalah isolat Pawan/Tanah(2)/9/3/NMsebesar 3,095, Riau/Kayu/9/2/NM sebesar 0,955, dan Riau/Sludge/9/1/LBsebesar 0,91. Hasil uji aktivitas xilanase dari masing-masing isolat adalahPawan/Tanah(2)/9/3/NM sebesar 0,917 ± 0,093 U/ml, Riau/Kayu/9/2/NMsebesar 8,529 ± 0,093 U/ml, dan Riau/Sludge/9/1/LB sebesar 1,283 ± 0,060U/ml. Isolat yang memiliki aktivitas xilanase tertinggi ialah Riau/Kayu/9/2/NM."

"Penelitian penapisan dan uji aktivitas xilanase isolat bakteri alkalo termofilik dilakukan di Laboratorium Teknologi Bioindustri (LTB), BPPT, Serpong. Penapisan dilakukan menggunakan medium Nakamura yang dimodifikasi. Produksi enzim dilakukan dengan fermentasi substrat cair pada pH 9, suhu 55o C dan 150 rpm. Uji aktivitas dilakukan dengan metode Bailey yang dimodifikasi. Hasil penapisan xilanase terhadap 136 isolat bakteri menunjukkan bahwa 18 isolat menghasilkan xilanase. Tiga isolat yang memiliki indeks xilanolitik yang tinggi adalah isolat Pawan/Tanah(2)/9/3/NM sebesar 3,095, Riau/Kayu/9/2/NM sebesar 0,955, dan Riau/Sludge/9/1/LB sebesar 0,91. Hasil uji aktivitas xilanase dari masing-masing isolat adalah Pawan/Tanah(2)/9/3/NM sebesar 0,917 ± 0,093 U/ml, Riau/Kayu/9/2/NM sebesar 8,529 ± 0,093 U/ml, dan Riau/Sludge/9/1/LB sebesar 1,283 ± 0,060 U/ml. Isolat yang memiliki aktivitas xilanase tertinggi ialah Riau/Kayu/9/2/NM."

"Telah dilakukan penelitian isolasi dan seleksi bakteri termofilikpenghasil xilanase dari sumber air panas di desa Batukuya, KabupatenSerang, Propinsi Banten. Penelitian dilakukan di Laboratorium TeknologiBioindustri (LTB), BPP Teknologi, Serpong. Penelitian bertujuanmemperoleh isolat bakteri termofilik yang manghasilkan xilanase termostabildan mengetahui konsentrasi substrat dan pH optimum produksi xilanase dariisolat bakteri tersebut. Isolasi diawali dengan regenerasi sampel yang telahdisimpan selama 18 bulan pada suhu -85° C menggunakan medium cairLB+xilosa. Isolasi, purifikasi dan penghitungan indeks aktivitas xilanasedilakukan pada medium padat LB+xilan (oat spelt). Isolat yang diperolehdihitung indeks aktivitas xilanolitiknya (IAX) dengan cara mengukur diameterkoloni dan diameter zona bening. Produksi xilanase dilakukan selama 24jam; suhu 55° C; 150 rpm menggunakan medium cair LB + xilan denganvariasi konsentrasi substrat 0,2%; 0,35%; 0,5%; 0,65% dan 0,8% (g/ml) danvariasi pH 5, 6, 7, 8 dan 9. Enzim kasar yang diperoleh dihitung aktivitas,kadar protein dan aktivitas spesifiknya. Hasil yang diperoleh hanya satuisolat, yaitu isolat Bky/9/4a yang memiliki rerata IAX sebesar 3,09. IsolatBky/9/4a mencapai aktivitas xilanase dan aktivitas spesifik optimum padamasa inkubasi 16 jam, sedangkan kadar protein relatif tetap selama masainkubasi. Produksi xilanase dengan variasi konsentrasi substrat mencapai aktivitas optimum pada konsentrasi 0,5% (8,85 U/ml), sedangkan produksixilanase dengan variasi pH mencapai aktivitas tertinggi pada pH 6 (16,64U/ml). Hasil analisis statistik ANOVA pada α=0,05 menunjukkan bahwavariasi konsentrasi substrat dan pH yang diuji tidak berpengaruh terhadapaktivitas xilanase dan kadar protein."

"Isolat-isolat kapang serasah indigenos Indonesia hasil koleksi BalaiPengkajian Bioteknologi BPPT Serpong diduga memiliki kemampuanmenghasilkan senyawa antimikroba. Penelitian bertujuan memperoleh isolatisolatkapang dari serasah yang menghasilkan senyawa aktif antimikrobaterhadap Staphylococcus aureus (Rosenbach) ATCC25923, Bacillus subtilis(Ehrenberg) Cohn BioMCC00121, Escherichia coli (Migula) Castellani &Chalmers ATCC25922, Candida albicans (Berkhout) BioMCC00122,Saccharomyces cerevisiae (E. C. Hansen) FNCC3012, dan Aspergillus niger(Tiegh) BCSO2/C1. Penelitian dilakukan di laboratorium Mikrobiologi BalaiBiotek BPPT pada bulan Februari-Desember 2006. Penapisan awalmenggunakan agar lapis ganda diperoleh 26 isolat dari total 72 yang dapatmenghambat pertumbuhan mikroba uji. Penapisan penguat menggunakandifusi kertas cakram memperlihatkan bahwa aktivitas antimikroba terbaikdihasilkan oleh ekstrak butanol dari isolat BioMCC-258. Aktivitas antimikrobaterbaik terhadap B. subtilis dihasilkan oleh ekstrak BioMCC-258 dalamkonsentrasi 10.000 ppm (setara dengan 0,69 mg tetrasiklin) danmenghasilkan zona bening berdiameter 18,73 ± 0,38 mm. Bioautografi padaekstrak kasar isolat BioMCC-258 (Rf = 0,85) terhadap B. subtilismenunjukkan bahwa eluen KLT metanol : air (M:A) = 2:8 merupakan pelarutterbaik. Hasil pengamatan memperlihatkan bahwa isolat BioMCC-258dideskripsikan sebagai genus Penicillium."

"Isolation and Identification of Xylanase Producing Bac- teria and Characterization of Its Enzyme Properties. Nur Richana, Tun T. Irawadi, Anwar Nur, and Khaswar Syamsu. Xylanase is an extracellular enzyme produced by microorganisms. This enzyme is able to hydrolise xylane (hemicellulose) to produce xylooligosaccharide and xylose. Thermoalkaliphilic xylanase is an agent that can be used as a substitute in the pulp whitening process instead of chlor- ine. A study was done to isolate, identificate of bacteria and characterize xylanase. The isolation of xylanase producing bacteria has been done from soil and waste of starch indus- try. Colonies which produced clearing zone were presumed as xylanolytic bacteria and chosen for further screening. Identification of potential isolate in xylanase production was done using 16S ribosomal RNA sequencing. Isolate Bacillus pumilus RXA-III5 originated from lime or alkaline soil was more potential isolate in xylanase production than other 24 isolates. Precipitation of xylanase, that was done using ammonium sulphate followed by dialyzes produced xylana- se of a higher specific activity (267.1 U.mg-1) than that using acetone (131.1 U.mg-1) and ethanol (186.65 U.mg-1). Xylana- se was done at purification produced three fractions of xyla- nase. Xylanase characteristics consist of pH and tempera- ture (9 and 50oC), Km and Vmaks value 6 mg.ml-1 and 0.2 mol.minute-1, respectively. The Fe2+ was the strongest active- tor and Mg2+ was the strongest inhibitor activity. This enzyme was detected as a cellulose-free xylanase. Xylanase is a prospective agent for bio-bleaching of paper."

"Tujuan penelitian adalah mengetahui aktivitas amilolitik 17 isolat 'Actinobacteria' termofilik pada suhu tinggi, dan memperoleh informasi spesies, dan posisi filogenetik isolat potensial berdasarkan data sekuens gen 16S rRNA, analisis filogenetik, karakterisasi morfologi, fisiologi, dan biokimia. Kemampuan tumbuh 17 isolat 'Actinobacteria' termofilik pada berbagai variasi suhu diuji menggunakan medium ISP 1 agar, dan diinkubasi pada suhu 45, 50, 55, 60 ^oC selama 7 hari. Berdasarkan hasil penelitian, 17 isolat memiliki pertumbuhan yang bervariasi pada suhu 45--60 ^oC. Tujuh belas isolat tumbuh pada suhu inkubasi 45 ^oC, 16 isolat pada suhu 50 ^oC, enam isolat pada suhu 55 ^oC, dan lima isolat pada suhu 60 ^oC terdiri atas SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, SL1-2-R-4, SL2-2-R-15, dan SL3-1-R-16. Aktivitas amilolitik 17 isolat 'Actinobacteria' termofilik pada berbagai variasi suhu diuji dengan metode 'starch agar plate', menggunakan medium Minimal (Mm) agar dengan penambahan pati ('soluble starch') sebagai substrat sebanyak 1% (b/v), dan diinkubasi pada suhu 45, 50, 55, dan 60 ^oC selama 7 hari. Aktivitas amilolitik yang positif ditandai dengan terbentuknya zona bening di sekitar koloni bakteri setelah diteteskan larutan 'Lugol's iodine' sebanyak 1,5 ml. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebagian besar isolat yang diperoleh dari tanah di dekat geiser Cisolok memiliki aktivitas amilolitik yang bervariasi pada suhu 45--60 ^oC. Lima belas isolat memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 45 ^oC, 13 isolat pada suhu 50 ^oC, empat isolat pada suhu 55 ^oC, dan hanya tiga isolat pada suhu 60 ^oC. Namun demikian, dua isolat (SL2-2-R-15 dan SL3-1-R-16) tidak memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 45, 50, dan 55 ^oC setelah diinkubasi selama 7 hari. Tiga isolat potensial yang memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 60 ^oC (SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, dan SL1-2-R-4), berdasarkan data sekuens gen 16S rRNA, analisis filogenetik, dan karakterisasi fenotipik tiga isolat potensial tersebut diidentifikasi sebagai 'Actinomadura keratinilytica'.

---

The aims of this study were to screen for amylolytic activity of the 17 themorphilic 'Actinobacteria' at high temperature, and to obtain species information and phylogenetic position based on 16S rRNA gene sequence, phylogenetic analysis, morphological, physiological, and biochemical characterizations. The ability to grow at various temperature was carried out on ISP 1 agar medium, incubated at 45, 50, 55, 60 ^oC for 7 days. The results showed that the 17 isolates 'Actinobacteria' have varying growth at a temperature of 45--60 ^oC. Seventeen, 16, and six isolates grew at 45, 50, and 55 ^oC, respectively, and only five isolates grew at 60 ^oC, designated SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, SL1-2-R-4, SL2-2-R-15, and SL3-1-R-16. Amylolytic activity of the 17 themorphilic 'Actinobacteria' at various temperature was carried out using the starch agar plate method on Minimal (Mm) agar medium with the addition of 1% (w/v) soluble starch as substrate, and incubated at 45, 50, 55, and 60 ^oC for up to 7 days. Amylolytic activity was detected by flooding the plates with 1.5 ml of Lugol's iodine solution. Clear zones around the colonies indicated positive results for amylolytic activity. The results showed that most of the isolates obtained from the soil near the Cisolok geyser have varying amylolytic activity at a temperature of 45--60° C. In this study, 15, 13, four, and three out of 17 isolates were positive for amylolytic activity at 45, 50, 55, and 60 ^oC, respectively. Meanwhile, two isolates, designated SL2-2-R-15 and SL3-1-R-16, showed negative results for amylolytic activity at 45, 50, and 55 ^oC, even after 7 days of incubation. Three potential isolates which have amylolytic activity at 60 ^oC (designated SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, and SL1-2-R-4), based on 16S rRNA gene sequence, phylogenetic analysis, and phenotypic characterizations were identified as 'Actinomadura keratinilytica.'"

"Tujuan penelitian adalah mengetahui aktivitas amilolitik 17 isolat Actinobacteria termofilik pada suhu tinggi, dan memperoleh informasi spesies, dan posisi filogenetik isolat potensial berdasarkan data sekuens gen 16S rRNA, analisis filogenetik, karakterisasi morfologi, fisiologi, dan biokimia. Kemampuan tumbuh 17 isolat Actinobacteria termofilik pada berbagai variasi suhu diuji menggunakan medium ISP 1 agar, dan diinkubasi pada suhu 45, 50, 55, 60 °C selama 7 hari. Berdasarkan hasil penelitian, 17 isolat memiliki pertumbuhan yang bervariasi pada suhu 45-60 °C. Tujuh belas isolat tumbuh pada suhu inkubasi 45 °C, 16 isolat pada suhu 50 °C, enam isolat pada suhu 55 °C, dan lima isolat pada suhu 60 °C terdiri atas SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, SL1-2-R-4, SL2-2-R-15, dan SL3-1-R-16. Aktivitas amilolitik 17 isolat Actinobacteria termofilik pada berbagai variasi suhu diuji dengan metode starch agar plate, menggunakan medium Minimal (Mm) agar dengan penambahan pati (soluble starch) sebagai substrat sebanyak 1% (b/v), dan diinkubasi pada suhu 45, 50, 55, dan 60 °C selama 7 hari. Aktivitas amilolitik yang positif ditandai dengan terbentuknya zona bening di sekitar koloni bakteri setelah diteteskan larutan Lugol's iodine sebanyak 1,5 ml. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebagian besar isolat yang diperoleh dari tanah di dekat geiser Cisolok memiliki aktivitas amilolitik yang bervariasi pada suhu 45-60 °C. Lima belas isolat memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 45 °C, 13 isolat pada suhu 50 °C, empat isolat pada suhu 55 °C, dan hanya tiga isolat pada suhu 60 °C. Namun demikian, dua isolat (SL2-2-R-15 dan SL3-1-R-16) tidak memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 45, 50, dan 55 °C setelah diinkubasi selama 7 hari. Tiga isolat potensial yang memiliki aktivitas amilolitik pada suhu 60 °C (SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, dan SL1-2-R-4), berdasarkan data sekuens gen 16S rRNA, analisis filogenetik, dan karakterisasi fenotipik tiga isolat potensial tersebut diidentifikasi sebagai Actinomadura keratinilytica.

---

The aims of this study were to screen for amylolytic activity of the 17 themorphilic Actinobacteria at high temperature, and to obtain species information and phylogenetic position based on 16S rRNA gene sequence, phylogenetic analysis, morphological, physiological, and biochemical characterizations. The ability to grow at various temperature was carried out on ISP 1 agar medium, incubated at 45, 50, 55, 60 °C for 7 days. The results showed that the 17 isolates Actinobacteria have varying growth at a temperature of 45-60 °C. Seventeen, 16, and six isolates grew at 45, 50, and 55 °C, respectively, and only five isolates grew at 60 °C, designated SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, SL1-2-R-4, SL2-2-R-15, and SL3-1-R-16. Amylolytic activity of the 17 themorphilic Actinobacteria at various temperature was carried out using the starch agar plate method on Minimal (Mm) agar medium with the addition of 1% (w/v) soluble starch as substrate, and incubated at 45, 50, 55, and 60 °C for up to 7 days. Amylolytic activity was detected by flooding the plates with 1.5 ml of Lugol's iodine solution. Clear zones around the colonies indicated positive results for amylolytic activity. The results showed that most of the isolates obtained from the soil near the Cisolok geyser have varying amylolytic activity at a temperature of 45-60 °C. In this study, 15, 13, four, and three out of 17 isolates were positive for amylolytic activity at 45, 50, 55, and 60 °C, respectively. Meanwhile, two isolates, designated SL2-2-R-15 and SL3-1-R-16, showed negative results for amylolytic activity at 45, 50, and 55 °C, even after 7 days of incubation. Three potential isolates which have amylolytic activity at 60 °C (designated SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, and SL1-2-R-4), based on 16S rRNA gene sequence, phylogenetic analysis, and phenotypic characterizations were identified as Actinomadura keratinilytica."

"Tujuan dari penelitian ini adalah untuk memperoleh isolat 'Actinobacteria' termofilik dari tanah di sekitar geiser Cisolok, Jawa Barat yang memiliki aktivitas selulolitik pada suhu tinggi serta mengetahui posisi filogenetik isolat terpilih terhadap spesies-spesies terdekatnya berdasarkan gen 16S rRNA. Penapisan kemampuan degradasi selulosa 17 isolat dilakukan secara kualitatif pada 'Minimal medium' (Mm) padat yang ditambahkan substrat yaitu 'carboxymethyl cellulose' (CMC) 1% (b/v) atau  'microcrystalline cellulose' (MCC) 1% (b/v) kemudian diinkubasi selama 7 hari. Pengamatan dilakukan dengan pewarnaan 'Congo red' 0,2% (b/v) dan zona bening pada sekitar koloni mengindikasikan degradasi substrat. Hasil penapisan menunjukkan bahwa 15 isolat mendegradasi CMC 1% dan 12 isolat mendegradasi MCC 1% pada suhu 45 ^oC, 14 isolat mendegradasi CMC 1% dan MCC 1% pada suhu 50 ^oC, 4 isolat mendegradasi CMC 1% dan MCC 1% pada suhu 55 ^oC, dan 3 isolat mendegradasi CMC 1% dan MCC 1% pada suhu 60 ^oC. Tiga isolat (SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, dan SL1-2-R-4) yang mendegradasi CMC 1% dan MCC 1% hingga 60 ^oC merupakan isolat terpilih. Identifikasi dan karakterisasi telah dilakukan pada penelitian sebelumnya dan melaporkan tiga isolat terpilih memiliki kekerabatan terdekat dengan 'Actinomadura keratinilytica' WCC-2665^T(=NBRC 105837^T). Hasil pengujian menunjukkan 'type strain' NBRC 105837^T mendegradasi CMC 1% dan MCC 1% pada medium Mm padat dengan suhu 45, 50, 55, dan 60 ^oC setelah inkubasi 7 hari. 'Crude enzyme' dari tiga isolat potensial dan 'type strain' NBRC 105837^T menunjukkan aktivitas selulolitik pada medium Mm padat yang ditambahkan CMC 1% atau MCC 1% pada suhu 45, 50, 55, dan 60 ^oC. Analisis filogenetik tiga isolat terpilih berdasarkan gen 16S rRNA menggunakan metode 'Neighbor-Joining' (NJ), 'Minimum Evolution' (ME), dan 'Maximum Likelihood' (ML) menunjukkan bahwa tiga isolat terpilih berada pada satu 'clade' monofiletik dengan 'Actinomadura' 'keratinilytica' WCC-2665^T. Analisis filogenetik juga menunjukkan dua kelompok yang terpisah berdasarkan kemampuan menghasilkan selulase pada anggota famili 'Thermomonosporaceae'.

---

The aims of this study were to obtained thermophilic 'Actinobacteria' isolates from soil around Cisolok geyser, West Java with the ability to degrade cellulose at high temperatures and to analyze the phylogenetic position based on 16S rRNA gene of the selected isolates compared to closely related species. Cellulose degradation screening was performed on Minimal (Mm) medium with the addition of 1% (w/v) carboxymethyl cellulose (CMC) or 1% (w/v) microcrystalline cellulose (MCC) as substrate then incubated for 7 days. Cellulose degradations were observed by staining the plates with  0,2% (w/v) Congo red and clear zone formation around the bacterial colony would indicate the cellulose degradation. The results showed that 15 isolates were able to degrade 1% CMC and 12 isolates were able to degrade 1% MCC at 45 ^oC, 14 isolates were able to degrade 1% CMC and 1% MCC at 50 ^oC, 4 isolates were able to degrade 1% CMC and 1% MCC at 55 ^oC, and 3 isolates were able to degrade 1% CMC and 1% MCC at 60 ^oC. Three isolates (SL1-2-R-2, SL1-2-R-3, and SL1-2-R-4) were selected due to their CMC and MCC degrading ability at 60 ^oC. Molecular identification based on 16S rRNA gene and characterization in previous study showed that the three selected isolates are closely related to 'Actinomadura keratinilytica' WCC-2665^T(=NBRC 105837^T). The assay showed that type strain NBRC 105837^T was able to degrade 1% CMC and 1% MCC at 45, 50, 55, and 60 ^oC after 7 days of incubation. Cellulolytic activity show that the crude enzymes of the three selected isolates and type strain were able to degrade 1% CMC and 1% MCC at 45, 50, 55, and 60 ^oC. Phylogenetic analysis using Neighbour-Joining (NJ), Minimum Evolution (ME), and Maximum Likelihood (ML) methods showed that the  three selected isolates  were  clustered  together in monophyletic clade with 'Actinomadura keratinilytica' WCC-2265^T with 100% bootstrap value. Phylogenetic analysis also showed that cellulase  producers  and  non-cellulase  producers  in 'Thermomonosporaceae' were grouped into different clades."