Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Infeksi dengue masih merupakan masalah kesehatan di dunia termasuk Indonesia. Deteksi dini berperan penting sebagai dasar penatalaksanaan awal infeksi dengue. Antigen NS1 pada virus dengue telah terbukti sebagai marka untuk diagnosis dini. Penelitian ini menganalisis lebih lanjut mengenai sensitivitas dan spesifisitas kit SD Bioline Dengue Duo terhadap keberadaan protein Non- Structural (NS1) pada pasien yang terinfeksi virus dengue serotipe 2 (DENV-2). Kinetik NS1 dan keberadaan imunoglobulin M (IgM) pada serum pasien pun dievaluasi dari hari pertama demam sampai hari ketujuh. Penelitian ini merupakan penelitian berbasis komunitas di Jakarta yang dimulai sejak Januari 2010 sampai Mei 2013. Kami menggunakan sampel serum dari pasien dengan gejala klinis infeksi dengue. Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasi virus dan/atau kenaikan titer imunoglobulin G (IgG) antidengue digunakan sebagai baku emas. Sensitivitas, spesifisitas, nilai prediksi negatif dan positif ditampilkan dalam tabel 2x2 dan area dibawah kurva dari Receiver Operating Curve. Dari 105 pasien, 23 diantaranya positif terinfeksi DENV-2, sementara 34 orang teruji negatif infeksi virus dengue (DENV). Sensitivitas dan spesifisitas SD Bioline Dengue Duo terhadap DENV-2 bernilai 78.3% dan 100% (CI 95%, 73.5% sampai 94.2%). Hasil kinetik NS1 menunjukkan pola penurunan, yang dimulai pada hari kelima. Namun, keberadaan IgM mengalami pola kenaikan secara bertahap Dapat disimpulkan bahwa kit ini memiliki sensitivitas dan spesifisitas tinggi terhadap DENV-2 sehingga dapat digunakan sebagai alat diagnostik infeksi dengue di Jakarta, Indonesia.

---

Dengue infection is still become the major health problem in the world, including Indonesia. Early detection plays important role in developing early basic management. NS1 antigen in dengue virus is proven to be an early marker for early diagnosis and this research to analyzed the sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo based on the presence of Non-Structural protein 1 (NS1) on dengue serotype-2 virus (DENV-2) infected patients. Kinetics of NS1 and the presence of immunoglobulin M (IgM) antibody were also evaluated from the 1 st day to 7th day. This research was a community-based study in Jakarta started from January 2010 until May 2013. We used serum samples from patients with clinical manifestation of dengue infection. Furthermore, Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation and/or augmentation of immunoglobulin G (IgG) antidengue titer were used as a gold standard. Sensitivity, specificity, negative and positive predictive value of diagnostic kit will be presented in 2x2 tables and area under the curve of the Receiver Operating Curve. From the total of 105 patients, 23 patients were confirmed positive for DENV-2 infection, while 34 patients were confirmed negative DENV infection. Sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo towards DENV-2 accounted for 78.3% and 100% (CI 95%, 73.5% to 94.2%), respectively. Kinetic of NS1 depicted downward trend starting on the 5th day. Nevertheless, IgM presence showed gradual increase trend. This indicates that this kit has high sensitivity and specificity for DENV-2, therefore it can be used as a diagnostic kit for dengue infection in Jakarta, Indonesia."

"Infeksi dengue yang ditularkan melalui gigitan nyamuk Aedes aegypti kepada manusia kerap terjadi di area tropis dan subtropis. Oleh karena manifestasi klinis yang tidak spesifik, berbagai Rapid Diagnostic Tests (RDTs) termasuk SD Bioline Dengue Duo Antigen NS1 dan Antibodi IgM/IgG dibuat untuk memberikan diagnosis dini infeksi dengue yang lebih akurat. Meskipun beberapa studi telah dilakukan untuk menguji sensitifitas dan spesifitas kit tersebut di berbagai negara tetapi informasi mengenai validitasnya dalam mendeteksi keberadaan protein NS1 dari DENV-3 belum dilaksanakan di Indonesia. Pada penelitian ini 105 serum dari pasien yang diduga menderita infeksi dengue diambil dan diuji menggunakan SD Bioline Dengue Duo. Standar baku emas yang digunakan pada penelitian ini adalah RT-PCR dan/atau isolasi virus di sel C6/36 dan atau kenaikan titer antibodi.Hasil penelitian ini menunjukkan rasio deteksi NS1 berbanding terbalik dengan keberadaan antibodi IgM. Sensitivitas, spesifisitas, PPV, dan NPV menunjukkan 81.25%, 100%, 100%, dan 91.89% pada masing-masingnya di awal demam pasien yang terinfeksi DENV-3. Oleh karena itu, SD Bioline Dengue Duo sangat direkomendasikan untuk diagnosis infeksi DENV-3 karena cepat, mudah digunakan, sangat sensitive, spesifik, dan memiliki PPV dan NPV yang tinggi.

---

Dengue infection is transmitted through the bite of Aedes aegypti mosquitoes to human particularly occurs in tropic and subtropic area. Having unspecific spectrum of clinical manifestations, various rapid diagnostic tests (RDTs) including SD Bioline Dengue Duo NS1 antigen and IgM/IgG antibody were made to give early diagnosis of acute dengue infection.

Although several studies have been conducted to examine the sensitivity and spesificity of the kits in various countries, its validity to detect the presence of DENV-3 NS1 antigen has not been held in Indonesia. In total, 105 sera from patients suspected of suffering dengue infection were collected and subjected to SD Bioline Dengue Duo and RT-PCR test as the gold standard.

The result of this study showed NS1 detection rate was inversely proportional to the presence of IgM antibodies. The sensitivity, specificity, PPV, and NPV showed 81.25%, 100%, 100%, and 91.89% respectively at the beginning of fever in DENV-3 infected patients. Thus SD Bioline Dengue Duo is highly recommended for diagnosis of DENV-3 infction as it is rapid, easily applicable, sensitive, highly specific and has great PPV and NPV."

"Deteksi cepat protein non-structural 1 (NS1) telah banyak digunakan untuk diagnosis infeksi dengue. Beberapa kit diagnostik yang mampu mendeteksi antigen NS1 sudah tersedia di Indonesia, salah satunya adalah SD Bioline Dengue Duo®. Penelitian ini merupakan studi cross-sectional, berbasis komunitas, yang mengevaluasi sensitivitas dan spesifisitas SD Bioline Dengue Duo® pada infeksi dengue primer dan sekunder di Jakarta, Indonesia dari tahun 2010 sampai 2011. Kinetika NS1 serta antibodi antidengue juga diamati. Sampel serum diambil dari 105 pasien dengan demam kurang dari 48 jam. Infeksi dengue dikonfirmasi menggunakan tiga tes standar emas, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasi virus di cell line C6/36 dan/atau Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Sensitivitas SD Bioline Dengue Duo® lebih tinggi pada infeksi primer (93,1% [95% CI, 92,7 sampai 100]) dibandingkan infeksi sekunder (86,1% [95% CI, 82,7 sampai 100]). Spesifisitas kit di kedua kelompok penelitian adalah 100%. Selain itu, penelitian kami menunjukkan bahwa pada infeksi sekunder, tes NS1 yang dilakukan sedini mungkin setelah onset demam berbuah pada sensitivitas kit yang lebih baik dibandingkan dengan studi-studi sebelumnya. Kemampuan kit untuk mendeteksi NS1 menurun seiring dengan perjalanan penyakit dan mencapai titik nadir pada hari ke 7 di kelompok infeksi primer maupun sekunder. Oleh karena sensitivitas yang baik dan spesifisitas yang sempurna, SD Bioline Dengue Duo® adalah alat yang dapat dipercaya untuk keperluan skrining infeksi dengue pada awal demam.

---

Some diagnostic kits capable of detecting dengue virus (DENV) NS1 are already available in Indonesia, one of which is SD Bioline Dengue Duo®. This research is a cross-sectional that evaluates the sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo® for primary and secondary DENV infection in Jakarta, Indonesia between 2010 and 2011. The kinetics of NS1 as well as anti-DENV antibodies detected by the kit was also observed. A panel of sera samples from 105 patients experiencing fever within the last 48 hours was tested. DENV infection was confirmed using three gold standard tests, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation in C6/36 cell line and/or Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA).

The sensitivity of SD Bioline Dengue Duo® was higher in primary infection (93.1% [95% CI, 92.7 to 100]) than in secondary infection (86.1% [95% CI, 82.7 to 100]). The kit's specificity in both study groups was 100%. Moreover, our study showed that in secondary infection, NS1 test performed as early as 1 or 2 days after fever onset resulted in a better sensitivity of the kit compared to past studies. NS1 detection rate reduced over the course of the illness and was lowest on day 7 in both primary and secondary infection. Given its high sensitivity and excellent specificity, SD Bioline Dengue Duo® is a reliable tool for early screening for DENV infection."

"Angka kejadian infeksi dengue tinggi di Indonesia, dan Jakarta untuk lebih spesifiknya. Virus dengue terdiri dari 4 serotipe, yang serotipe 1 (DENV-1), 2 (DENV-2), 3 (DENV-3), dan 4 (DENV-4). Sampai saat ini, penanganan infeksi dengue masih mengandalkan diagnosis dini. Meskipun reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) masih sebagai baku emas, metode ini cenderung mahal dan sulit untuk dilakukan. Inilah alasan untuk pengembangan berbagai tes cepat, termasuk diantaranya SD Bioline Dengue Duo. Dengan demikian, evaluasi SD BIOLINE Dengue Duo akan bermanfaat dalam dunia klinis. Peneliti menggunakan sampel serum yang diambil dari masyarakat, menguji sampel tersebut menggunakan SD BIOLINE Dengue Duo, dan membandingkannya dengan baku emas [reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) dan isolasi virus pada lini sel C6/36)]. Ditemukan bahwa sensitivitas, spesifisitas, NPV, dan PPV SD BIOLINE Dengue Duo untuk mendeteksi demam berdarah serotype campur dan tidak diketahui adalah 100%. Dalam infeksi DENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo menunjukkan sensitivitas 60% dan spesifisitas 100%.

---

Dengue infection incidence remained high in Indonesia, and Jakarta to be more specific. Dengue virus consists of 4 serotypes, which are dengue serotype 1 (DENV-1), 2 (DENV-2), 3 (DENV-3), and 4 (DENV-4). Until now, management of dengue infection still relies on early diagnosis. Although Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) remains as a gold standard diagnostic method, this method is costly and difficult to set up. These issues are the reasons for the development of various rapid tests, including SD Bioline Dengue Duo. Evaluation of SD BIOLINE Dengue Duo would therefore be beneficial in the clinical setting. Researchers used serum sample taken from the community, tested the samples using SD BIOLINE Dengue Duo, and compare it with the gold standard [Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and virus isolation in cell line C6/36)]. It was found that the sensitivity, specificity, NPV, and PPV of SD BIOLINE Dengue Duo for detection of dengue of mixed and unknown serotype were 100%. In infection of DENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo showed a sensitivity of 60% and specificity of 100%."

"ABSTRAKInfeksi DENV masih menjadi masalah kesehatan masyarakat Indonesia, karena angka kesakitan semakin meningkat, masih menimbulkan kematian dan sering terulangnya kejadian luar biasa (KLB). Salah satu permasalahan terbesar pada manajemen pasien yang terinfeksi adalah untuk memperoleh hasil diagnosis yang cepat dan spesifik dari infeksi DENV pada fase akut. Deteksi NS1 virus dengue merupakan solusi untuk deteksi dini infeksi dengue. Pada penelitian ini dilakukan produksi antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP untuk mendeteksi antigen NS1 DENV. Untuk mendapatkan antibodi anti-NS1 DENV 2, protein NS1 sebanyak 500µg disuntikkan ke kelinci. Booster dilakukan sebanyak tiga kali dengan menyuntikkan NS1 500µg. Antibodi anti-NS1 yang dihasilkan oleh kelinci kemudian dilabel menggunakan horseradish peroxidase (HRP) dan dilakukan optimasi slot blot immunoassay. Setelah antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP dikonfirmasi dengan direct ELISA, dilakukan uji reaksi silang. Pada penelitian ini digunakan 15 plasma pasien positif dengue yang terdiri dari serotipe 1, 2, 3 dan 4, 3 plasma negatif dengue, 1 plasma orang sehat dan 1 kontrol positif yaitu protein NS1 DENV 2. Hasil menunjukkan, antibodi anti-NS1 DENV serotipe 2 dapat mengenali NS1 yang berasal dari serotipe 1,2,3, dan 4. Hal ini disebabkan karena protein NS1 merupakan glikoprotein yang sangat terkonservasi diantara keempat serotipe dengue. Adanya kemiripan epitop NS1 DENV 2 dengan serotipe lainnya membuat antibodi anti-NS1 DENV 2 dapat mengenali protein NS1 dari serotipe dengue yang lain. Sedangkan hasil negatif ditunjukkan pada plasma pasien orang sehat. Untuk sampel 3 plasma negatif dengue, hasil slot blot menunjukkan 2 negatif dan 1 indeterminate. Disimpulkan bahwa antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP dapat digunakan untuk dalam uji slot blot untuk mendeteksi keempat serotipe virus dengue.

---

ABSTRACTDENV infection remains a public health problem in Indonesia, as the number of illnesses is still increasing, causing death and frequent recurrence of outbreaks. One of the biggest problems in managing infected patients is how to get a rapid and specific diagnosis of DENV in the acute phase. Detection of dengue virus is a solution for early detection of dengue infection. In this study, production of labelled anti-NS1 DENV 2 antibody to be used for dengue antigen detection. To get anti-NS1 DENV 2 antibody, protein NS1 500 μg was injected into rabbit. Booster is done three times by injecting NS1 500 μg. Anti-NS1 antibodies produced by rabbits then were labeled by horseradish peroxidase (HRP). After confirmation of labelled anti-NS1 DENV antibody and optimation of in-house slot blot immunoassay, cross reactivity between DENV serotype was performed. In this study, 15 dengue positive patients serotypes 1, 2, 3 and 4, three dengue negative plasma, 1 healthy person plasma and 1 positive control on NS1 DENV 2 were used. The results showed that anti-NS1 DENV serotype 2 antibody could recognize NS1 from serotypes 1,2,3, and 4. This may be because the NS1 protein is a highly conserved glycoprotein among four dengue serotypes. The similarity of NS1 DENV 2 epitopes with other serotypes makes NS1 DENV 2 antibody can recognize NS1 protein from other dengue serotypes. While negative results are shown on the plasma of healthy patients. For a sample of 3 negative plasma dengue, the result of the blot slot showed 2 negatives and 1 indeterminate. An HRP-labelled anti-NS1 DENV 2 antibody could be used in slotblot immunassay to detect NS1 of four serotype of dengue infection."

"Demam berdarah dianggap sebagai masalah kesehatan utama bukan hanya di Indonesia, tetapi juga banyak negara lain. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kinetik Non Structural-1 (NS1) dan persen positif antigen NS1 yang dideteksi dengan menggunakan diagnostik dini Strip Ag Bio-rad NS1 pada hari demam ke 1 sampai 3. Uji diagnostik ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Universitas Indonesia melalui pemeriksaan laboratorium pada 102 sampel dari pasien yang diduga demam berdarah. Standar baku untuk uji ini adalah Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), isolasi virus di cell line C6/36, serta kenaikan titer antibodi. Program SPSS 17.0 digunakan untuk analisis data. Dari total pasien yang terlibat dalam penelitian ini, 68 (68.3%) pasien terinfeksi demam berdarah. Investigasi lebih lanjut dalam mendeteksi keberadaan antigen NS-1 berdasarkan hari demam dilakukan pada penelitian ini. Berdasarkan hasil yang diperoleh, keberadaan NS-1 pada pasien terinfeksi demam berdarah pada hari demam ke 1, 2 dan 3 adalah 100%, 96,36%, dan 94.55% berturut - turut. Kesimpulan penelitian ini adalah bahwa Strip Ag Bio-Rad NS1 dapat digunakan sebagai deteksi dini demam berdarah di Indonesia.

---

Dengue is considered as a major health problem in not only Indonesia, but many other countries. The aim of this study was to know the kinetic of Non-Structural-1 (NS1) and positive percentage of NS1 detected by a diagnostic kit Bio-Rad NS1 Ag Strip Test during first until third day of fever. This diagnostic test was conducted in Microbiology Laboratorium of Universitas Indonesia by performing laboratory examination to 102 serum samples of dengue suspected patients. Gold standard of this study was Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), virus isolation in C6/36 cell line, and increase of antibody titer. SPSS 17.0 program was used to analyze the data. Based on total patients involved, 68 (68.3%) patients were infected with dengue. Further investigation on detecting presence of NS-1 antigen according to days of fever was done in this study. From the result, presence of NS-1in dengue-infected patients during day 1, 2, and 3 of fever were 100%, 96.36%, and 94.55% respectively. Conclusion of this study was that Bio-Rad NS1 Ag Strip can be used as early detection of dengue fever in Indonesia."

"ABSTRAK Pengembangan diagnosis DBD dengan pendekatan deteksi antigen saat iniadalah deteksi IgM/IgG antibodi dan circulating dengue virus non-structuralprotein 1 yang bersirkulasi dalam serum atau plasma penderita. Nonstructaralprotein I (NS1) merupakan glikoprotein yang diperlukan dalam proses replikasivirus. Pada infeksi akut NSI disekresikan dari sel yang terinfeksi dan akanbersirkulasi dalam darah penderita DBD baik pada infeksi primer maupuninfeksi sekunder. NSI dapat dideteksi pada penderita terinfeksi virus dengueserotipe 1, 2, 3 maupun 4. NSI disekresi pada hari 1 sampai hari 9 saat onsetdemarn, sehingga dengan deteksi NSI diharapkan diagnosis DBD dapatditegakkan lebih dini, atau secepatnya pada hari 1 onset demam. Saat ini sudahtersedia secara komersial Diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+AbCombo). Penelitian ini bertuiuan untuk mendapatkan alternatif diagnosis infeksivirus dengue dengan melakukan uii validasi produk tersebut terhadap IgM, IgGdan NS1 pada tersangka penderita DBD di Rumah sakit Imanuel BandarLampung. Uji validasi meliputi sensitivitas, spesifisitas, nilai duga positif, nilaiduga negatif, rasio kecenderungan positif, rasio kecenderungan negatif danakurasi. Hasil uji dibandingkan dengan RT-'PCR sebagai baku emas (goldstandard). Hasilnya menunjukkan Dengue NSI Ag menunjukkan sensitivitas(sebesar 100%), spesifisitas sebesar 92%, nilai duga positif (NDP) sebesar 58%,nilai duga negatif (NDN) sebesar 100% dan akurasi sebesar 92,5%, nilai ROCsebesar 95.8% menunjukkan bahwa NS-1 dapat mendiagnosis Dengue dengan baiksekali.Disimpulkan bahwa Diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo )layak dan memadai sebagai perangkat diagnosis DBD.

---

ABSTRACT New approach of dengue diagnosis is detecting of circulating denguenonstructural protein 1 (NS1) IgM/IgG antibodies, antigen in patient sera orplasma. NSI is a glycoprotein essential use for virus replication process. It issecreted from infected cells and detectable in blood from the lst day aftertheonset of fever up to day 9. This protein could be detected in dengue virusinfection either serotype 1,2,3 and 4 by NS1 detection and IgM/IgG. Promptdiagnosis could be made as soon as on day 1 onset of fever. The NS I antigen assayhas been developed for commercial use Diagnostik Kit SD Dengue Duo (DengueNS1 Ag+Ab Combo). To find out an alternative dengue diagnostic tool DengueNS1. Ag was validated for early diagnosis of febrile stage in patients withsuspect dengue infection as a gold standard of the test was rely on RT-PCR.The diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo) showssensitivity 100%, spesificity 92%, positive predictive value (PPV) 58%, negatifpredictive value (NPV) 100% and accuracy 94,5% respectively, ROC 95.8%the agreement between both tests were good. It was concluded that DiagnostikKit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo) and NSI Ag good and could beused for early diagnosis of dengue virus infection."

"Latar Belakang: Infeksi Dengue virus (DENV) masih menjadi masalah besar di Indonesia. Manifestasi infeksi DENV yang berat umumnya ditemukan pada infeksi sekunder. Modalitas diagnosis yang cepat dan akurat dibutuhkan dalam tata laksana infeksi DENV. Salah satu pemeriksaan yang dapat dilakukan pada tingkat komunitas adalah pemeriksaan serologi menggunakan rapid immunochromatographic test. Dalam penelitian ini, dilakukan perbandingan antara Bioline SD Dengue Duo yang diperiksa serial selama 7 hari dengan uji hemagglutination inhibition (HI) dalam hal penentuan jenis infeksi dengue. Tujuan: Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui kesesuaian antara Bioline SD Dengue Duo dengan HI. Selain itu, penelitian ini juga bertujuan mengetahui apakah pada pemeriksaan Bioline SD Dengue Duo secara serial terdapat konsistensi hasil dari hari ke hari. Metode: Penelitian ini dilakukan untuk melengkapi penelitian sebelumnya berjudul "International Study on Biomarkers and Gene Expression Patterns in Patients with Dengue Virus Infection (The Indonesian Study Center, Jakarta)" oleh dr.Leonard Nainggolan, SpPD-KPTI. Serum pasien yang didiagnosis infeksi dengue dengan hasil NS1 positif ditentukan jenis infeksi menurut HI. Hasil NS1, IgM, IgG, serotipe virus, dan gambaran klinis pasien didapatkan sebagai data sekunder dari penelitian sebelumnya. Pada analisis, perbandingan antara Bioline SD Dengue Duo dengan HI, variabel hasil dari kedua pemeriksaan tersebut diklasifikasikan menjadi "Sekunder" dan "Nonsekunder". Hasil: Terdapat 25 sampel yang memenuhi kriteria inklusi. Infeksi primer dan sekunder menurut Bioline SD Dengue Duo adalah 44% dan 56%. Menurut HI, terdapat 8% infeksi primer dan 92% infeksi sekunder. Kesesuaian Bioline SD Dengue Duo dengan HI tertinggi (68%) dalam 7 hari pemeriksaan dicapai pada hari demam ketujuh. Ketidaksesuaian hasil antara Bioline SD Dengue Duo dengan HI adalah 36%. Hampir seluruh sampel (98%) mengalami perubahan interpretasi hasil bila Bioline SD Dengue Duo diinterpretasikan secara harian. Perubahan interpretasi hasil tersebut terutama ditemukan pada demam hari kelima. Kesimpulan: Hasil Bioline SD Dengue Duo cukup sesuai dengan HI bila dilakukan pemeriksaan pada hari demam ketujuh dan dapat menggantikan HI untuk menentukan jenis infeksi dengue karena hasilnya lebih cepat. Namun penggunaannya perlu mempertimbangkan klinis pasien karena adanya fenomena perubahan interpretasi hasil. Penentuan jenis infeksi terbaik dilakukan pada hari demam ketujuh, namun paling dini dapat dilakukan pada hari demam ketiga.

---

Background: Dengue virus (DENV) infection is still a burden in Indonesia. Severe DENV manifestations commonly occur in secondary infections. A rapid and accurate diagnostic tool is needed in patient management. DENV serology assay using rapid immunochromatographic test is one of DENV diagnostic modalities that is applicable in community setting. In this research, serial rapid immunochromatographic test Bioline SD Dengue Duo was compared with hemagglutination inhibition (HI) in determining type of DENV infection.

Objective: This research was conducted to observe agreement between Bioline SD Dengue Duo and HI in determining type of DENV infection. Beside that, this research was also performed to observe the consistency of serial Bioline SD Dengue Duo when interpreted daily.

Methods: This study was done to complete the previous study entitled "International Study on Biomarkers and Gene Expression Patterns in Patients with Dengue Virus Infection (The Indonesian Study Center, Jakarta)" by dr.Leonard Nainggolan, SpPD-KPTI. All paired stored sera from dengue patient with positive NS1 result were subjected to HI assay, according to Igarashi. Serial NS1, IgM, IgG, clinical features, and virus serotype result from previous study were taken as secondary data and would be compared with HI assay. For RDT vs HI analysis, RDT and HI results were classifed as "Secondary" and "Nonsecondary".

Results: A total of 25 samples fulfilled the inclusion criteria. The proportion of primary and secondary infection according to Bioline SD Dengue Duo was 44% and 56%, respectively. In the other side, 92% classified as secondary infection by mean of HI assay; the rest was primary infection. The highest agreement rate between serial Bioline SD Dengue Duo and HI was 68%, which achieved in 7th day of fever. Almost all samples experienced changing of result interpretation when Bioline SD Dengue Duo was interpreted daily. This was mainly observed in 5th day of fever.

Conclusion: The result of Bioline SD Dengue Duo was in accordance with HI if it was examined in 7th day of fever and can replace HI for determining type of infection because of the rapid result. But its use should consider patient’s clinical condition due to the changing of result interpretation phenomenon. Type of infection is best determined on 7th day of fever, but it can also be done as early as on 3th day of fever."

"Demam Berdarah Dengue (DBD adalah salah satu masalah kesehatan di dunia. Penggunaan Non Structural-1 (NS-1) antigen dari virus dengue untuk deteksi awal telah terbukti sebagai salah satu solusi dari penentu infeksi dengue. Salah satu alat diagnosik yang tersedia di Indonesia adalah Bio-Rad NS1 Ag strip. Penelitian ini berjalan selama18 bulan di mulai dari tanggal November 2010 sampai dengan Mei 2012. Seratus dua pasien dengan demam kurang dari 2 hari terlibat dalam studi ini. Peneliti menggunakan Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), Virus isolation di sel C6/36, atau IgG and IgM titer ELISA sebagai standard emas dalam mendeteksi infeksi dengue. Dalam riset ini, kami menggunakan Bio-Rad NS1 antigen untuk mendeteksi keberadaan antigen NS1 dalam serum darah pasien yang terduga terkena demam berdarah. SPSS 16.0 digunakan untuk menganalisa data. Hasil yang diperoleh adalah dari 102 pasien yang terduga terkena demam berdarah, terdapat 68(68.3%) positf terkena demam berdarah dan 34(31.7%) negatif. Serotype virus juga dipeoleh mellaui RT PCR. Dari 68 pasien yang positif demam berdarah, ada 17 terkena DENV-1, 21 terinfeksi DENV-2, 16 terinfeksiDENV-3, 4 terinfeksi DENV-4, 8 terinfeksi campuran, dan 2 tidak diketahui serotypenya. Nilai sensitivitas dan specifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip dalam mendeteksi infeksi demam berdarah dengan nilai 86.2% dan 96.3%. Dalam mendeteksi infeksi DENV-1, sensitivitas and spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag strip adalah 94.12dan 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Sedangkan untuk mendeteksi DENV-3, alat ini mempunyai sensitivitas 75% dan spesifisitas 94.44% (95% CI, 69.3% to 93.5%). Bedasarkan hasil ini, Bio-Rad NS1 Ag Strip dapat dipergunakan sebagai alat untuk menegakan diagnosis dari infeksi demam berdarah DENV-1 dan DENV-3 pada awal demam.

---

Dengue infection has been one of the health issues in worldwide. The utilization of Non Structural-1 (NS1) antigen in order to detect early dengue infection has been proven to be one of the solutions. Diagnostic kit named Bio-Rad NS1Ag Strip is one of the kit that uses antigen which is available in Indonesia. The purpose of this study is to evaluate the sensitivity, specificity, PPV, and NPV value of the kit. This study was held in 18 months duration from November 2010 until Mei 2012. One hundred and two subjects with fever less than 48 hours were included in the study. RT-PCR or virus isolation C6/36 or ELISA antibody titer were used as the gold standard of this research. Bio-Rad NS1 Ag Strip was used to determine the presence of NS1 antigen in the patient. Data analysis and statistics uses SPSS 16.0.In the result, there were 68 (68.3%) positive and 34 (31.7%) negative. RT PCR also determined the virus’s stereotypes. There were 17 of DENV-1, 21 of DENV-2, 16 of DENV-3, 4 of DENV-4, 8 of mixed infection and 2 unknown serotypes. Bio-Rad NS1 Ag has 86.2% of sensitivity and 96.35 of specificity to detect all stereotypes. In for detecting DENV-1, the kit has 94.12% sensitivity and 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Meanwhile, in detecting DENV-3, the kit has 75%sensitivity and 94.44% specificity (95% CI, 69.3% to 93.5%). According to these findings, Bio-Rad NS1 Ag strip is suitable as a diagnostic kit to make early diagnosis of dengue fever DENV-1 and DENV-3."

"ABSTRAKPenelitian terkait karakteristik genetik sekuens virus dengue (DENV) diperlukan dalam menilai kekerabatan antara strain DENV yang tersebar di seluruh dunia. Tujuan dalam penelitian ini adalah membandingkan karakteristik genotype dan sekuens data DENV serotipe 2 (DENV-2) nukleotida envelope dibandingkan dengan sekuens data DENV-2 nukleotida Non-Struktural 1 (NS1). Data didapatkan dari Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia untuk strain data yang berasal dari Indonesia dan GenBank untuk strain data yang berasal dari seluruh dunia sebagai data pembanding dengan jumlah sebanyak 42 data, yang kemudian dianalisis menggunakan Genetyx 5.1. Hasil penelitian didapatkan bahwa sekuens data NS1 strain DENV-2 yang berasal dari Indonesia termasuk ke dalam kelompok genotype Cosmopolitan, serupa dengan hasil analisis data dengan sekuens data envelope strain DENV-2. Sementara pada analisis epitope LX1 yang merupakan epitope khas dari NS1, terdapat berbagai peubahan komponen asam amino pada epitope tersebut dibandingkan dengan sekuens data strain Indonesia yang tergabung ke dalam kelompok genotype Cosmopolitan. Kesimpulan dari penelitian ini adalah bahwa filogenetik dengan menggunakan NS1 sebagai bahan analisis dapat digunakan untuk menentukan genotipe. Sehingga gen NS1 pada DENV-2 strain Indonesia masih dapat dipertimbangkan sebagai salah satu dasar metode pengembangan vaksin.

---

ABSTRACTStudies about genetic characteristic between dengue virus serotype 2 (DENV-2) sequence data is needed to determine its relationship between DENV strain over the world. The main purpose of this study is to compare between characteristic of sequence data DENV-2 envelope nucleotide and sequence data DENV-2 Non- Structural 1 (NS1) nucleotide, and analyze between amino acid homology in this study and related previous studies. 42 data used for this study are obtained from Laboratory of Microbiology Faculty of Medicine University of Indonesia for data from Indonesia and form GenBank for data from other countries as a comparison, which is analyzed with software Genetyx 5.1. NS1 sequence data from DENV-2 strain from Indonesia is classified in Cosmpolitan genotype group, which are similar than data analysis from envelope sequence data from same data. Meanwhile in analysis of LX1 epitope, which is considered as typical epitope from NS1, there are any differences in amino acid component at it compared than strain Indonesia data sequences which are included in Cosmopolitan genotype group. As a conclusion, phylogenetic analysis of NS1 nucleotide is useful for determining the genotypes, which means NS1 DENV-2 gene strain Indonesia can be useful as the basis for vaccine development"