Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"This updated edition features concise background information on chromosome methods and applications, essential information on heteromorphism frequencies in normal and clinical populations as well as new listing and discussions of euchromatic, subtelomeric and FISH variants. The addition of two new sections make this an even more valuable reference than before. A section on common and rare fragile sites includes a short historical discussion, definitions and an extensive table of officially recognized sites that includes the HUGO name, chromosomal location, methods of induction, genes and references to the most recent molecular characterization. A new section on array CGH discusses the clinical challenge of interpreting copy number variations (CNVs) revealed by this newest technology, gives examples of various levels of interpretation and lists the several most common websites used in this interpretation."

"Insiden dan mortalitas dari colorectal cancer CRC terus meningkat Beberapa metode skrining CRC umumnya bersifat invasif dan tidak nyaman Single Nucleotide Polymorphism SNP dapat dimanfaatkan sebagai marker untuk skrining CRC dengan tingkat invasif yang rendah Penelitian ini bertujuan untuk memvalidasi asosiasi antara SNP ldquo X rdquo dengan kerentanan terhadap CRC sporadik Desain penelitian menggunakan studi potong lintang Jumlah sampel dan daya uji pada kelompok CRC sporadik dan kontrol ditentukan dengan menggunakan Epi Info versi 3 5 1 DNA genomik diperoleh dari sampel darah kedua kelompok kemudian dilakukan PCR dan sequencing untuk melacak genotip SNP ldquo X rdquo dengan ukuran amplikon 979 pb Hasil analisis statistik menunjukkan nilai PValue genotip TT terhadap Non TT sebesar 0 025 P 0 05 dengan Odds Ratio OR 0 193 0 420 0 911 Setelah dikoreksi dengan binary logistic regression didapatkan P Value sebesar 0 047 dengan OR 0 188 0 431 0 988 P Value genotip GT terhadap Non GT 0 890 dengan OR 0 561 0 963 1 652 P Value genotip GG terhadap Non GG 0 076 dengan OR 0 949 1 628 2 793 Hasil menunjukkan adanya asosiasi antara genotip TT pada SNP ldquo X rdquo dengan menurunnya kerentanan terhadap CRC sporadik Studi lanjutan pada populasi lainnya di wilayah Indonesia perlu dilakukan untuk pemetaan pola variasi genetic di SNP ldquo X rdquo dan untuk mengetahui pengaruhnya di gen gen terdekat yang berkorelasi terhadap CRC sporadik.

---

The incidence and mortality of colorectal cancer CRC increase rapidly Some CRC screening methods are invasive and generally uncomfortable Single Nucleotide Polymorphism SNP can be utilized as a marker for CRC screening with low level of invasiveness This study aimed to validate the association between SNP X with susceptibility to sporadic CRC This study is a crosssectional study Number of samples and power in CRC and control groups were determined using Epi Info v3 5 1 Genomic DNA were obtained from whole blood samples and followed by PCR 979 bp amplicon and direct sequencing to determine the genotype pattern Statistical analysis showed that P Value of genotype TT vs Non TT is 0 025 P 0 05 with Odds Ratio OR 0 193 0 420 0 911 P Value after adjustment using binary logistic regression was 0 047 with OR 0 188 0 431 0 988 P Value of genotype GT vs Non GT was 0 890 with OR 0 561 0 963 1 652 P Value of genotype GG vs Non GG was 0 076 with OR 0 949 1 628 2 793 There was a significant association between TT genotype at the SNP X with decreased susceptibility to sporadic CRC Further study will be needed to identify genetic variation patterns in the SNP X rdquo in other populations in Indonesia region and to investigate its effect to the nearest genes and its correlation to sporadic CRC."

"Insiden dan mortalitas dari colorectal cancer (CRC) terus meningkat. Beberapa metode skrining CRC umumnya bersifat invasif dan tidak nyaman. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) dapat dimanfaatkan sebagai marker untuk skrining CRC dengan tingkat invasif yang rendah. Penelitian ini bertujuan untuk memvalidasi asosiasi antara SNP ?X? dengan kerentanan terhadap CRC sporadik. Desain penelitian menggunakan studi potong lintang. Jumlah sampel dan daya uji pada kelompok CRC sporadik dan kontrol ditentukan dengan menggunakan Epi Info versi 3.5.1. DNA genomik diperoleh dari sampel darah kedua kelompok, kemudian dilakukan PCR dan sequencing untuk melacak genotip SNP "X" dengan ukuran amplikon 979 pb.Hasil analisis statistik menunjukkan nilai PValue genotip TT terhadap Non TT sebesar 0,025 (P<0,05), dengan Odds Ratio (OR) 0,193<0,420<0,911. Setelah dikoreksi dengan binary logistic regression, didapatkan P-Value sebesar 0,047 dengan OR 0,188<0,431<0,988). P-Value genotip GT terhadap Non GT 0,890 dengan OR 0,561<0,963<1,652. P-Value genotip GG terhadap Non GG 0,076 dengan OR 0,949<1,628<2,793. Hasil menunjukkan adanya asosiasi antara genotip TT pada SNP ?X? dengan menurunnya kerentanan terhadap CRC sporadik. Studi lanjutan pada populasi lainnya di wilayah Indonesia perlu dilakukan untuk pemetaan pola variasi genetik di SNP ?X?, dan untuk mengetahui pengaruhnya di gen-gen terdekat yang berkorelasi terhadap CRC sporadik.

---

The incidence and mortality of colorectal cancer (CRC) increase rapidly. Some CRC screening methods are invasive and generally uncomfortable. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) can be utilized as a marker for CRC screening with low level of invasiveness. This study aimed to validate the association between SNP "X" with susceptibility to sporadic CRC. This study is a crosssectional study. Number of samples and power in CRC and control groups were determined using Epi Info v3.5.1. Genomic DNA were obtained from whole blood samples, and followed by PCR (979 bp amplicon) and direct sequencing to determine the genotype pattern.Statistical analysis showed that P-Value of genotype TT vs Non TT is 0.025 (P<0.05), with Odds Ratio (OR) 0.193<0.420<0.911. P-Value after adjustment using binary logistic regression was 0.047 with OR 0.188<0.431<0.988. P-Value of genotype GT vs Non GT was 0.890 with OR 0.561<0.963<1.652. P-Value of genotype GG vs Non GG was 0.076 with OR 0.949<1.628<2.793. There was a significant association between TT genotype at the SNP "X" with decreased susceptibility to sporadic CRC. Further study will be needed to identify genetic variation patterns in the SNP "X" in other populations in Indonesia region, and to investigate its effect to the nearest genes and its correlation to sporadic CRC."

"ABSTRAKSel limfosit darah perifer dan sel fibroblast kulit manusia, yang telah dibenihkan dapat dipakai untuk penelitian mutagenita in vitro. Begitu pula SCE dapat digunakan sebagai titik akhir biologik untuk mengukur mutagenitas beberapa agens. Pambenihan sel limfosit darah perifer mudah dan sederhana. Oleh karena itu sel limfosit merupakan bahan pilihan terbaik untuk menganalisa kromosom dalam pemeriksaan rutin diagnostik sitogenetik. Pada keadaan-keadaan tertentu, misalnya pada pemeriksaan ?point mutation" pembenihan sel fibroblast sangat diperlukan. Penelitian-penelitian yang dikemukakan dalam tesis ini diawali dengan usaha untuk mengembangkan suatu metoda baru yang lebih baik, untuk mendeteksi micronucleus didalam sel darah limfosit perifer, sehingga dapat digunakan untuk mengukur efek-efek mutagen. Karena micronucleus itu berasal dari fragmen kromosom yang tidak mengandung sentromir, sehingga ditinggalkan di dalam sitoplasma ?daughter cell" pada mitosis, maka adalah penting pada metodayang diperbaiki itu, untuk mempertahankan keutuhan sitoplasma sel limfosit. Pencampuran sel darah limfosit perifer dengan suatu larutan hipotonik lemah, merupakan suatu langkah penting untuk mempertahankan agar sitoplasma itu tetap utuh. Secara eksperimental dapat ditemukan bahwa larutan hipotonik lemah tersebut ialah suatu campuran garam faali (0,9 8 natriu klorida) dan 5,6 gr/1 kalium klorida dengan perbandingan 10 dan 1. Campuran ini ternyata mempunyai tekanan osmotik sebesar 285 milliosmol. Bila metoda ini digunakan, maka membedakan suatustruktur yang mirip micronucleus (umpama fragmen dari sel yang sedang mengalami kemunduran dan akan mati) dan micronucleusnya sendiri tidaklah sukar lagi. Ternyata metoda yang telah diperbaiki ini dapat pula diterapkan pada sel fibroblast manusia, untuk mempertahankan agar sitoplasma itu utuh, sehingga micronuoleus yang terletak didalamnya dapat dideteksi. (lihat karangan IV dan gambar 16). Sel fibroblast itu berubah menjadi hulat, dengan sitoplasma yang utuh. Bila didalamnya terdapat micronucleus, akan tampak jelas. Frekuensi micronucleus spontan pada penderita "chromosomal breakage disease" (Fanconi'S anemia, karangan IV; Blackfan Diamond, karangan II; Down?s syndrome, karangan VI) dengan mudah dapat ditentukan. Ternyata freknensi spontan pada penderita penyakit tersebut lebih tinggi daripada pada orang normal. Karena micronucleus ltu didalam sitoplasma dapat tinggal lama, maka sel yang mengandunqnya dapat diperiksa dari pembenihan, pada saat mana saja setelah proses tersebut dimulai. (Yang optimum adalah 72 jam setelah dibenihkan). Dari panelitian dapat disimpulkan bahwa frekuensi micronucleus spontan dapat digunakan untuk mandeteksi adanya suatu "chromosome breakage syndrome". Kesederbanaan atau mudahnya tehnik yang diperbaiki ini sehagai metoda untuk pemeriksaan atau pengukuran efek-efek mutagen dapat dilihat dari makalah II dan VI untuk MMC dan sinar X, makalah III untuk Aflatoxin B1, serta karangan IV untuk acataldehida dan akhirnya karangan V untuk EMS dan MMC. Peningkatan efek-efek mutagen Aflatoxin B1 olah ?S9 mix" dapat diukur dengan frekuensi MN yang meningkat, hal mana dapat dipelajari di makalah III. Analisa kelainan atruktur kromosom danfrékuensi MN (yang timbul karena dirangsang) pada yenderita Down's syndrome dan pada orang normal disajikan dalam tulisan VI. Didalam eksperimen ini ditunjukkan pula kepekaan sel limfosit darah penderita Down's syndrome pada sinar X. yang mennnjukkan adanya hubungan dengan umur, serta refleksinya dapat terlihat pada frekuensi disentrik dan M yang meninggi. Data yang diperoleh, memperkhat pula kesimpulan-kesimpulan Hedrile yang menyatakan bahwa meningkatnya frekuensi MN lebih merupakan refleksi kelainan jenis "exchanges" daripada frekuensi " chromosome breaks ". Suatu kesan yang kuat tentang kemungkinan adanya suatu respons in vitro yang berbeda dan bersangkut-paut dengan sex, disajikan dalam karangan VI. Tldak adanya perbedaan respons semacam itu untuk MMC, juga disajikan dalam karangan tersebut. Pada penelitian ini meningkatnya frekuensi M yang berbeda antara pria dan wanita akibat exposure pada EMS, merupakan hukti adanya perbedaan yang herkaitan dengan sex. Kesimpulan ini diperkuat dengan analisa dari frekuensi SCE yang meninggi pada wanita, akibat pemaparan sel limfosit A nya pada BMS. Frekuensi MN akibat pemaparan pada EMS, nenunjukkan perbedaan yang menyolok antara pria dan wanita, tetapi tidaklah demikian halnya dengan response terhadap MMC. Karena data SCE tidak dapat dihasilkan untuk donor VI, suatn kesimpulan yang tegas belumlah dapat dibuat. Tetapi penemuan lain, menimbulkan dugaan yang kuat tentang adanya suatu respons yangherbeda terhadap EMS bagi pria dan wanita, tetapi tidak untuk MMC. Hasil-hasil yang didapat dari semua eksperimen menunjukkan bahwa metoda yang diperbaiki untuk mendeteksi MN dalam sel limfosit manusia dan sel fibroblast itu mudah, cepat dan dapaf disesuaikan dengan tujuan suatu penelitian. Karenanya faedah dari etoda ini dihari kamudian nampaknya besar. Jadi apa yang diramalkan dalam hipotesa itu ternyata benar.

---

ABSTRACTPeripheral blood lymphocytes and cultured skin fibroblasts can be used as materials for in vitro mutagenicity studies, using chromosomal aberrations, micronuclei, as well as SCEs as biological endpoints for assessing mutagenicity of diverse agents. However, for routine diagnostic cytogenetic work, in clinics culture of peripheral blood lymphocytes is really the material of choice, in view of the ease and simplicity with which they can be cultured and processed for chromosomal analysis. In some situations, such as point mutation studies, culture of fibroblasts is essential. The studies in this thesis were initiated to develop an improved method for the detection of MN in peripheral human lymphocytes, which can be used for assaying effects of mutagens. As a micronucleus is left behind in the cytoplasm of a daughter cell following cell division, it should be important in an improved method to preserve the cytoplasm of the lymphocytes intact. Mild hypotonic treatment was found to be the important step in preserving cytoplasm. This mild hypotonic solution consists of a mixture of physiological saline (0.9% sodium chloride) and 5,6 gr/l potassium chloride with a proportion of 10 to 1, of which the osmotic pressure was found to be 285 milliosmol.To distinguish an intracytoplasmic localized micronucleus and other structures resembling M is very easy by this method. This improved method seems also to be applicable for human fibroblasts, with regard to preserving the cytoplasm intact for detecting a micronucleus (see paper IV and figure 16), The fibroblasts are transformed to a spherical shaped cell with an intact cytoplasm and a micronucleus inside when present. The frequencies of spontaneous M in normal individuals, and in patients with chromosomal breakage disease (Fanconi's anemia, paper IV; Blackfan Diamond, paper II; and Down's syndrome paper VII), can be easily determined. The frequencies are higher in chromosomal breakage syndrome when compared to normal. Since MN persists for a long time, a larger number of cells carrying them can be scored in the culture at any time following initiation. From these studies we can conclude that the frequencies of spontaneous MN can be used easily for detection of a chromosome breakage syndrome. The ease with which the improved method can be used as a method of assay for effects of mutagens are also demonstrated in papers II, VI, VII for MMC and X-ray irradiation, paper III for Aflatoxin Bl, paper IV for acetaldehyde, paper VI for EMS and MMC.The enhancement of effect of Aflatoxin B1 by S9 mix, assessed by the frequencies of induced MN, is.also shown in paper III. An analysis of the induced chromosomal aberrations and micronuclei in Down's syndrome patients and in normal individuals is presented in paper VII. In this experiment is shown the age related sensitivity the patients to X-ray, which is reflected in the yield of both dicentrics and micronuclei: Our data also support Heddle's conclusion that the increase of frequencies of micronuclei is more a reflection of the exchange type of aberrations, than the frequencies of chromosome breaks.A strong.suggestion about the possible existence of a sex related difference of in vitro responses between male and female to aus is presented in paper VI. The absence of such difference for MMC is also shown in that paper. In this study, the differential increase of frequencies of induced M , following exposure to EMS between male and female, provides some evidence to conclude a sex related difference of responses. This conclusion is supported by the analysis of the frequencies of induced SCEs (for each treatment as well as controls) The frequencies of induced HN, show a considerable difference between male and female donors, which is not the case following exposure to MMC. As SCE data are not available for donor VI, a firm conclusion cannot be reached as yet. But the other findings, strongly suggest the existence of a sex related response to EMS, but not for MMC.The results obtained from all experiments indicate that the improved method for the detection of MN in human lymphocytes and fibroblasts, is easy, fast amdadaptable to the aim of an investigation. Therefore the utility of this method in the future investigations appears to be high, It is clear, that what is stated in the hypothesis is true."

"Kromosom merupakan untai DNA yang mengalami penebalan akibat kondensasi. Kondensasi struktur kromosom sangat mempengaruhi segregasi kromosom saat fase mitotik. Penelitian sebelumnya telah melaporkan bahwa kondensasi kromosom sel HeLa dipengaruhi oleh ion kalsium (Ca2+), namun pengaruh Ca2+ pada kromosom manusia normal belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh terhadap struktur kromosom limfosit manusia dengan pemberian 1 mM 1, 2-bis(2-aminophenoxy)ethane-N-N,N’,N’-tetraacetic acid (BAPTA, chelator Ca2+), 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA, chelator kation), dan PBS (kontrol) yang diamati menggunakan mikroskop cahaya. Sampel darah dikultur selama 72 jam, kemudian kromosom limfosit diisolasi dan diberi perlakuan 1 mM BAPTA, 1 mM EDTA, dan PBS. Kromosom diwarnai dengan Giemsa dan diamati dengan mikroskop cahaya. Hasil yang diperoleh menunjukkan struktur kromosom kontrol lebih pendek, padat, serta memiliki intensitas pewarna yang pekat dibandingkan dengan kromosom yang diberi perlakuan 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA yang memiliki struktur yang lebih panjang, lebih berongga, serta intensitas pewarna yang kurang pekat. Hasil analisis kuantitatif menunjukkan panjang, lebar, dan luas rata-rata kromosom kontrol sebesar 1,73±0,73 μm, 0,55±0,43 μm, dan 3,5±2,17 μm2, sedangkan panjang, lebar, dan luas rata-rata kromosom yang diberi 1 mM BAPTA sebesar 2,91±1,3 μm, 1,43±0,43 μm, dan 4,17±2,75 μm2. Rata-rata panjang dan lebar kromosom yang diberi 1 mM EDTA sebesar 2,26±0,52 μm dan 0,93±0,29 μm. Hasil tersebut memperlihatkan bahwa Ca2+ berperan penting dalam kondensasi struktur kromosom limfosit.

---

The Chromosome is a DNA strand that undergoes thickening due to condensation. Condensation of chromosomal structure affects the segregation of chromosomes during the mitotic phase. Previous studies have reported that chromosomal condensation of HeLa cells is affected by calcium ions (Ca2+). Nevertheless, the effect of Ca2+ on human normal cells has yet to be investigated. This study aims to determine the effect of Ca2+ on the chromosomal structure of human lymphocyte by the treatments of 1 mM 2-bis(2-aminophenoxy)ethane-N-N,N’,N’-tetraacetic acid (BAPTA, a Ca2+ chelator), 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA, a cation chelator), and PBS (control), using a light microscope. The blood sample was cultured for 72 hours, followed by lymphocyte chromosomes isolation. After that, the samples were treated with PBS (control), 1 mM BAPTA, and 1 mM EDTA. Chromosomes were then stained with Giemsa and observed using a light microscope. The qualitative analysis showed that control chromosomes have shorter, and more condensed structures with a high dye intensity compared with those treated with 1 mM BAPTA and 1 mM EDTA which showed a longer and fibrous structure with low dye intensity. The quantitative analysis showed that the average length, width, and area of the control chromosome was 1.73±0.73 μm, 0.55±0.2 μm, and 3.5±2.17 μm2, respectively. while those treated with 1 mM BAPTA were 2.91±1.3 μm, 1.43±0.43 μm, and 4.17±2.75 μm2. Then, the average length and width of 1 mM EDTA chromosome was 2.26±0.52 μm and 0.93±0.29 μm. These results showed that Ca2+ plays an important role in the lymphocyte chromosome structure."

"[ABSTRAKPenelitian ini bertujuan untuk menganalisis distribusi pola polimorfisme gen LEPG-2548A pada pasien dengan dan tanpa osteoporosis. Seratus sampel terdiri daripasien dengan osteoporosis (50 sampel) dan pasien tanpa osteoporosis (50sampel). Polimorfisme gen LEP G-2548A dianalisis menggunakan metode PCRRFLP.Perhitungan distribusi genotip dan alel pada kedua kelompokmenggunakan uji Fisher. Frekuensi alel A dan genotip AA gen LEP G-2548Apada pasien osteoporosis berisiko meningkat dibandingkan pada pasien tanpaosteoporosis. Genotip LEP G-2548A pada pasien dengan dan tanpa osteoporosismemiliki hubungan tidak berbeda bermakna (p = 0,191). Distribusi polapolimorfisme gen LEP G-2548A berisiko meningkat pada pasien denganosteoporosisABSTRACTThe aim of this study was to analyzed pattern distribution polymorphism LEP G-2548A in patient with and without osteoporosis.One hundred samples consist ofpatient with and without osteoporosis.Genetic polymorhism LEP G-2548A wereanalyzed by PCR-RFLP methods.The calculation of the distribution of genotypesand alleles in both groups using Fisher test.The frequency of A allele and AAgenotype LEP G-2548A gene presented increased risk in patient withosteoporosis.Statistical analysis of LEP G-2548A gene using fisher test betweenpatient with and without osteoporosis showed no significant differences(p=0,191).Distribution of leptin gene G-2548A polymorphism pattern presentedincreased risk in patient with osteoporosis;The aim of this study was to analyzed pattern distribution polymorphism LEP G-2548A in patient with and without osteoporosis.One hundred samples consist ofpatient with and without osteoporosis.Genetic polymorhism LEP G-2548A wereanalyzed by PCR-RFLP methods.The calculation of the distribution of genotypesand alleles in both groups using Fisher test.The frequency of A allele and AAgenotype LEP G-2548A gene presented increased risk in patient withosteoporosis.Statistical analysis of LEP G-2548A gene using fisher test betweenpatient with and without osteoporosis showed no significant differences(p=0,191).Distribution of leptin gene G-2548A polymorphism pattern presentedincreased risk in patient with osteoporosis, The aim of this study was to analyzed pattern distribution polymorphism LEP G-2548A in patient with and without osteoporosis.One hundred samples consist ofpatient with and without osteoporosis.Genetic polymorhism LEP G-2548A wereanalyzed by PCR-RFLP methods.The calculation of the distribution of genotypesand alleles in both groups using Fisher test.The frequency of A allele and AAgenotype LEP G-2548A gene presented increased risk in patient withosteoporosis.Statistical analysis of LEP G-2548A gene using fisher test betweenpatient with and without osteoporosis showed no significant differences(p=0,191).Distribution of leptin gene G-2548A polymorphism pattern presentedincreased risk in patient with osteoporosis]"

"Ion kalsium (Ca2+) merupakan kation yang berperan dalam kondensasi kromosom. Berbagai penelitian mengenai pengaruh Ca2+ terhadap struktur kromosom telah dilaporkan. Akan tetapi, penelitian-penelitian tersebut masih terbatas pada galur sel kanker atau sel hewan mamalia dengan pendekatan analisis ultrastruktur. Pengaruh Ca2+ terhadap struktur dan pola banding kromosom pada sel manusia non-kanker belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh Ca2+ terhadap struktur dan pola banding kromosom dari sel darah manusia melalui teknik GTL-banding. Sel darah manusia dikultur, kemudian dilakukan pemanenan kromosom dan banding menggunakan pewarna Leishman. Pengaruh Ca2+ dievaluasi dengan menginkubasikan kromosom pada dua larutan berbeda, yaitu larutan 1 mM BAPTA sebagai chelator spesifik Ca2+ dan 1 mM EDTA sebagai chelator kation, dan dibandingkan dengan kontrol. Data yang diperoleh dianalisis secara kualitatif dengan mengamati struktur dan pola banding kromosom, serta secara kuantitatif dengan menentukan nilai kromosom berdasarkan kriteria Quality Assessment (QA) dari International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). Hasil yang diperoleh menunjukkan kromosom kelompok perlakuan 1 mM BAPTA memiliki struktur tidak padat, membentuk struktur fibrous, dan berukuran lebih lebar dibandingkan kromosom kontrol dengan pola banding tidak jelas dan kabur. Kromosom kelompok perlakuan 1 mM EDTA membentuk struktur tidak padat dan berukuran lebih panjang dibandingkan kelompok kontrol. Rata-rata nilai kromosom pada kelompok kontrol, BAPTA, dan EDTA berturut-turut adalah 4,467 ± 0,78; 4,30 ± 0,75; dan 4,467 ± 0,86. Perbedaan struktur kromosom, pola banding, dan rata-rata nilai kromosom pada kromosom 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA menunjukkan bahwa kation Ca2+ merupakan faktor penting dalam kondensasi struktur kromosom.

---

Calcium ion (Ca2+) is a cation that has a major role in chromosome condensation. Studies about Ca2+ effect in chromosome structure have been reported. However, the studies are limited for cancer cell lines using the ultrastructure analysis approach. The effect of Ca2+ on chromosome structure and banding pattern of the human non-cancer cell line is still unknown. This study aims to determine the effect of Ca2+ on human blood cell chromosome structure and banding pattern using the GTL-banding technique. The blood cell was cultured and then the chromosome was harvested and banded with Leishman dye. The Ca2+ effect was evaluated by using 1 mM BAPTA as Ca2+ specific chelator and 1 mM EDTA as common cation chelator and then compared with the control. The data were then analysis both qualitatively by observing chromosome structure and banding pattern, as well as quantitatively by determining chromosome value based on Quality Assessment (QA) from International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). The result showed that the BAPTA-treated chromosome structure was fuzzy, fibrous, and wider than the control group with a less clear banding pattern than the control. In addition, EDTA-treated chromosome structure was less condensed and longer than those of the control. The mean chromosome value of control, BAPTA-, and EDTA-treated chromosome are 4.467 ± 0.78; 4.30 ± 0.75; and 4.467 ± 0.86. Distinct characteristic of chromosome structure, banding pattern, and mean of chromosome value from BAPTA- and EDTA-treated chromosome further indicates that Ca2+ plays an important role in chromosome condensation."

"Ion Magnesium (Mg2+) merupakan salah satu kation divalen yang berperan dalam kondensasi kromosom. Penelitian mengenai pengaruh Mg2+ terhadap kondensasi kromosom dengan menggunakan kromosom yang berasal dari berbagai sel, terutama sel kanker, telah dilakukan. Namun, hingga saat ini, belum ada penelitian yang menggunakan kromosom yang berasal dari sel normal (non-kanker). Salah satu sel yang dapat digunakan adalah limfosit dari sel darah. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi pengaruh Mg2+ terhadap struktur kromosom limfosit dengan menggunakan teknik GTL-banding dan karyotyping. Kromosom pada tahap metafase diperoleh dengan mengultur sel darah dan dilanjutkan dengan banding menggunakan Leishman stain. Pengaruh Mg2+ diteliti dengan memberikan larutan XBE5 yang mengandung 5 mM Mg2+ sebagai kontrol, XBE yang mengandung 0 mM Mg2+, dan 1 mM EDTA sebagai chelator kation. Kromosom pada masing-masing perlakuan diberikan penilaian berdasarkan Quality Assesment yang disusun oleh Association for Clinical Cytogenetics berdasarkan International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa kromosom kontrol yang mengandung 5 mM Mg2+ memiliki struktur padat dengan pola banding yang jelas dan intensitas band tebal, sedangkan kromosom pada kelompok perlakuan XBE (0 mM Mg2+) dan 1 mM EDTA memiliki struktur tidak padat dan fibrous dengan pola banding kurang jelas dan intensitas band yang tipis. Nilai rata-rata±SD kromosom kelompok XBE (4,389±0,607) dan EDTA (4,611±0,607) lebih tinggi dibandingkan kontrol XBE5 (4,222±0,427). Hal ini menunjukkan bahwa Mg2+ memiliki pengaruh terhadap struktur kromosom limfosit manusia.

---

Magnesium ion (Mg2+ ) is one of the divalent cations that have an important role in chromosome condensation. Researches about the role of Mg2+ have been conducted on the chromosome from various type of cells, especially human cancer cell line. However, there has not been any research conducted using human normal cells such as blood cells lymphocyte chromosome. This study aims to evaluate the effects of Mg2+ on chromosome structure from lymphocyte using GTL-banding and karyotyping. Metaphase chromosomes were obtained by culturing blood cells, followed by banding using Leishman stain. Magnesium ion role was assessed by using XBE5 solution that contains 5 mM Mg2+ as control, XBE solution that contains 0 mM Mg2+, and 1 mM EDTA solution as a cation chelator. The chromosome value from each treatment was evaluated using Quality Assessment from Association for Clinical Cytogenetics according to the International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). The result shows that the control chromosome (XBE5) had a compact structure with a clear banding pattern and bold band intensity, while those treated with XBE and EDTA had a less compact and fibrous structure with an unclear banding pattern and thin band intensity. In addition, the average chromosome score±SD of the XBE (4.389±0.607) and EDTA-treated (4.611±0.607) chromosomes were higher than those of control (4.222±0.427). These data indicated that Mg2+ affects the structure of the human lymphocyte chromosome."

"This handbook emphasizes why solid-state issues are important, which approaches should be taken to avoid problems and exploit the opportunities offered by solid state properties in the pharmaceutical and agricultural industries."