Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Kanker payudara masih menjadi masalah kesehatan global. Modalitas terapi yang digunakan untuk pasien kanker payudara diataranya agen kemoterapi doksorubisin (DOX). DOX digunakan untuk pengobatan kanker dengan mekanisme interkalasi DNA dan penghambatan topoisomerase II, serta penggunaannya mengalami resistensi. Bahan alam berpotensi digunakan untuk terapi kombinasi mengatasi resistensi doksorubisin. Bahan alam yang digunakan diantaranya dari jahe merah yang mengandung 6-shogaol. Senyawa 6-Shogaol sebagai agen kemoterapi yang meregulasi ekspresi gen yang berhubungan dengan proses proliferasi sel. Pada penelitian ini dilakukan analisis ekspresi gen pada basis data Gene Expression Omnibus (GEO) terkait pengobatan doksorubisin (GSE124597) dan pemberian 6-shogaol (GSE36973) dengan tujuan mengetahui perbandingan pola ekspresi gen yang dipengaruhi keduanya terhadap sel kanker payudara MCF7. Dilakukan juga anotasi fungsi gen yang diekspresikan menggunakan Gen Ontologi (GO) dan KEGG, jejaring farmakologi menggunakan basis data STITCH, serta simulasi penambatan molekuler untuk mengetahui mekanisme kerja antikanker. Sifat antikanker doksorubisin, 6-shogaol, dan ekstrak jahe merah kemudian  dikonfirmasi secara invitro meggunakan metode MTT. Hasil analisis Diffrential Expression Genes (DEG) menghasilkan 227 DEG yang sama (DEG bersama) akibat pemberian doksorubisin dan 6-shogaol. Hasil anotasi fungsi gen dengan GO menunjukkan dari 227 DEG terkait dengan proliferasi sel melalui jalur TP53.Demikian juga terkait hasil analisis jejaring farmakologi menunjukkan doksorubisin dan 6-shogaol terhubung dengan protein TP53. Hasil analisis interaksi protein-protein (PPi) menunjukkan jalur persinyalan TP53 terhubung dengan protein CDKN1A, GADD45A, DDIT3 dan CXCL12. Penambatan molekuler senyawa doksorubisin dan 6-shogaol pada protein TP53 menghasilkan energi ikatan berturut-turut -7.97 kcal/mol dan -6.05 kcal/mol. Nilai IC50 senyawa doksorubisin, 6-shogaol, dan ekstrak jahe pada sel MCF-7 berturut-turut adalah: 15.45 µg/ml, 61.24 µg/ml dan 144.99 µg/ml. Hal ini menunjukkan 6-shogaol dapat digunakan sebagai kandidat komplementer antikanker pada sel MCF-7.

---

Breast cancer is still a global health problem. Therapeutic modalities used for breast cancer patients include the chemotherapeutic agent doxorubicin (DOX). DOX is used for the treatment of cancer with DNA intercalation mechanisms and topoisomerase II inhibition, and its use has experienced resistance, so a combination therapy of natural ingredients is needed. The natural ingredients used include red ginger which contains 6-shogaol. 6-Shogaol compound as a chemotherapeutic agent that regulates gene expression related to cell proliferation processes. In this study, gene expression analysis was carried out on the Gene Expression Omnibus (GEO) database related to doxorubicin treatment (GSE124597) and 6-shogaol administration (GSE36973) with the aim of knowing a comparison of gene expression patterns affected by both of them on MCF7 breast cancer cells. Functional annotations of expressed genes were also performed using Gene Ontology (GO) and KEGG, pharmacological networks using the STITCH database, as well as molecular docking simulations to determine the mechanism of anticancer action. The anticancer properties of doxorubicin, 6-shogaol, and red ginger extract were then confirmed in vitro using the MTT method. The results of the Differential Expression Genes (DEG) analysis yielded the same 227 DEGs as a result of doxorubicin and 6-shogaol administration. The results of gene function annotations with GO showed that 227 DEGs were related to cell proliferation through the TP53 pathway. Likewise, the results of pharmacological network analysis showed that doxorubicin and 6-shogaol were linked to the TP53 protein. The results of protein-protein interaction (PPi) analysis showed that the TP53 signaling pathway was connected to the CDKN1A, GADD45A, DDIT3 and CXCL12 proteins. Molecular docking of the compounds doxorubicin and 6-shogaol to the TP53 protein produces a binding energy of -7.97 kcal/mol and -6.05 kcal/mol, respectively. The IC50 values ​​of doxorubicin, 6-shogaol, and ginger extract in MCF-7 cells were: 15.45 µg/ml, 61.24 µg/ml and 144.99 µg/ml, respectively. This shows that 6-shogaol can be used as a complementary anticancer candidate in MCF-7 cells."

"Kanker paru merupakan salah satu penyebab utama kematian akibat kanker di dunia dengan tingkat mortalitas yang tinggi akibat keterbatasan dalam deteksi dini dan resistensi terapi. Modifikasi epigenetik, seperti metilasi H3K9me2 oleh EHMT1/EHMT2, berperan dalam regulasi proliferasi dan apoptosis pada kanker paru. Oleh karena itu, penghambatan EHMT1/EHMT2 berpotensi menjadi strategi terapeutik untuk menginduksi kematian sel kanker. EHMT2 bekerja secara antagonis dengan SFRP1 dalam jalur Wnt/β-catenin. Penurunan ekspresi SFRP1 dapat menyebabkan disregulasi yang berkontribusi pada progresivitas kanker. Mekanisme yang mendasari regulasi ekspresi SFRP1 dan keterkaitannya dengan EHMT2 dalam jalur Wnt/β-catenin masih belum sepenuhnya dipahami. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi efek BIX01294 sebagai inhibitor spesifik EHMT1/EHMT2, terhadap viabilitas, ekspresi gen, dan perubahan ultrastruktur sel kanker paru A549. Perlakuan dilakukan dengan tiga konsentrasi berbeda, yaitu 20 µM, 25 µM, dan 30 µM. Viabilitas sel dianalisis menggunakan Cell Counting Kit 8 (CCK-8) assay, sementara ekspresi gen EHMT1, EHMT2, CASP8, dan SFRP1 dianalisis menggunakan quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR). Selain itu, perubahan ultrastruktur sel A549 diamati menggunakan Scanning Electron Microscopy (SEM). Hasil penelitian menunjukkan bahwa viabilitas sel menurun secara dose-dependent dengan tingkat sitotoksisitas yang tinggi. Analisis SEM mengungkap perubahan morfologi khas apoptosis, seperti pembentukan badan apoptotis dan cell bebbling pada semua seri konsentrasi. Selain itu, hasil RT-qPCR menunjukkan penurunan ekspresi EHMT1/EHMT2 pada konsentrasi BIX01294 30 µM, sedangkan peningkatan konsentrasi CASP8/SFRP1 terjadi pada konsentrasi BIX01294 20 µM. Hal tersebut mengindikasikan keterlibatan regulasi epigenetik dalam mekanisme apoptosis pada jalur kematian sel. Temuan ini mendukung potensi BIX01294 sebagai agen terapi epigenetik untuk kanker paru.

---

Lung cancer is one of the leading causes of cancer-related deaths worldwide, with a high mortality rate due to limitations in early detection and therapy resistance. Epigenetic modifications, such as H3K9me2 methylation by EHMT1/EHMT2, play a role in regulating proliferation and apoptosis in lung cancer. Therefore, inhibition of EHMT1/EHMT2 may serve as a therapeutic strategy to induce cancer cell death. EHMT2 acts antagonistically with SFRP1 in the Wnt/β-catenin pathway. A reduction in SFRP1 expression can lead to deregulation, contributing to cancer progression. The mechanisms underlying the regulation of SFRP1 expression and its association with EHMT2 in the Wnt/β-catenin pathway are still not fully understood. This study aims to evaluate the effects of BIX01294, a specific inhibitor of EHMT1/EHMT2, on viability, gene expression, and ultrastructural changes in A549 lung cancer cells. Treatments were applied at three different concentrations: 20 µM, 25 µM, and 30 µM. Cell viability was analyzed using the Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay, while the expression of EHMT1, EHMT2, CASP8, and SFRP1 was analyzed using quantitative reverse transcription PCR (RT qPCR). Additionally, changes in the A549 ultrastructure were observed using Scanning Electron Microscopy (SEM). The results showed a dose-dependent decrease in cell viability with high cytotoxicity. SEM analysis revealed characteristic morphological changes of apoptosis, such as apoptotic body formation and cell bubbling, at all treatment concentrations. Moreover, RT-qPCR results showed a decrease in EHMT1/EHMT2 expression at 30 µM BIX01294, while an increase in CASP8 and SFRP1 expression occurred at 20 µM BIX01294. This indicates the involvement of epigenetic regulation in the mechanisms of apoptosis in the cell death pathway. These findings support the potential of BIX01294 as an epigenetic therapeutic agent for lung cancer."

"Latar Belakang: Kanker payudara merupakan jenis kanker invasif yang paling banyak menyerang wanita. Kejadian dan kematian akibat kanker ini tinggi, baik secara global maupun di Indonesia. Subtipe molekuler kanker payudara, terutama kanker payudara triple-negative (TNBC), berperan penting dalam menentukan pilihan pengobatan. Namun, TNBC belum memiliki terapi target khusus dan berpotensi resisten terhadap pengobatan standar. Senyawa alami semakin banyak diteliti sebagai alternatif pengobatan kanker. Asam galat (GA), menunjukkan potensi sebagai antikanker, terutama untuk kanker payudara. Daun Mangifera foetida kaya akan GA dan berpotensi menjadi sumber pengobatan. Metode: Penelitian in-vitro ini menggunakan sel TNBC MDA-MB-231 yang diberi GA murni dan ekstrak daun M. foetida. Setelah nilai IC50 didapatkan, sekuensing RNA dilakukan untuk analisis bioinformatika. Hasil: DEG signifikan setelah pemberian kedua jenis perlakuan. Gen yang mengalami peningkatan ekspresi pada kedua perlakuan sebagian besar terkait dengan respons terhadap stres sel. Gen-gen yang ekspresinya meningkat meliputi MRI1, AKR1B15, NQO1, GSTA3, SRXN1, sedangkan gen-gen yang ekspresinya menurun meliputi ISG15 dan SERPINE1. Analisis jalur menunjukkan adanya pengayaan pada jalur yang berkaitan dengan daur ulang metionin, biosintesis estrogen, respons imun, stres oksidatif, dan kematian sel. Kesimpulan: Baik GA maupun ekstrak M. foetida memengaruhi ekspresi gen pada sel TNBC. Ekstrak M. foetida menunjukkan pengaruh yang lebih besar terhadap beberapa gen yang berkaitan dengan respons stres oksidatif seluler, kemungkinan karena adanya interaksi sinergis dengan metabolit lain dalam ekstrak tersebut

---

Introduction: Breast cancer is the most prevalent invasive cancer in women, with high incidence and mortality rates globally and in Indonesia. Molecular subtyping, particularly triple-negative breast cancer (TNBC), guides treatment, but TNBC lacks targeted therapies. Chemotherapy with agents like anthracyclines is standard, but with severe side effects and potential resistance. Natural compounds are increasingly explored as alternative anticancer agents. Gallic acid (GA), a phenolic compound, shows promising anticancer activity, especially against breast cancer. Mangifera foetida leaves are a rich source of GA, potentially offering a cost-effective treatment option. Method: This in-vitro study used TNBC MDA-MB-231 cells treated with pure GA and M. foetida leaf extract. IC50 values were determined, and cells were treated at these concentrations. RNA sequencing was performed, followed by bioinformatic analysis of differentially expressed genes (DEGs) and pathway enrichment analysis. Results: Significant DEGs were identified after both treatments. Upregulated genes in both treatments were mainly related to stress response. Upregulated DEGs included MRI1, AKR1B15, NQO1, GSTA3, SRXN1, while downregulated genes included ISG15 and SERPINE1. Pathway analysis revealed enrichment in pathways related to methionine salvage, estrogen biosynthesis, immune response, oxidative stress, and cell death. Conclusion: Both GA and M. foetida extract affected gene expression in TNBC cells, with the extract showing greater effects on several genes linked to stress response, potentially indicating synergistic interactions with other metabolites"