Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 4 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Maghfira
"ABSTRAK
Anti-HCV menjadi marker serologi utama yang digunakan untuk uji saring hepatitis C pada donor darah di Indonesia. Selain serologi anti-HCV, untuk lebih meningkatkan kemananan darah, Unit Transfusi Darah UTD DKI Jakarta juga menerapkan pemeriksaan Nucleic Acid Test NAT . Pemeriksaan anti-HCV tidak dapat membedakan antara infeksi aktif dan infeksi yang telah sembuh. Darah akan dianggap terifeksi HCV apabila salah satu dari pemeriksaan serologi atau molekuler positif, begitupula dengan darah donor dengan hasil pemeriksaan anti-HCV grayzone dan NAT negatif. Diperlukan kepastian atas berisiko tidaknya darah tersebut dalam menularkan infeksi HCV, mengingat kebutuhan darah di sebagian besar provinsi di Indonesia masih belum memenuhi target. Sehingga dibutuhkan uji molekuler lain untuk dijadikan pembanding dengan hasil NAT. Interpretasi hasil anti-HCV dilakukan berdasarkan rasio S/CO, yang dapat dijadikan prediksi status viremia donor, sehingga perlu dilakukan analisis hubungan antara S/CO dengan hasil pengujian molekuler dan HCV Ag-Ab. Nilai prediksi viremia diharapkan dapat menjadi alternatif bagi UTD yang belum mampu menerapkan NAT. Kemudian dipilih 93 sampel dengan kriteria anti-HCV positif dan NAT positif; anti-HCV positif dan NAT negatif serta anti-HCV grayzone dan NAT negatif untuk diuji dengan nested PCR kualitatif dan HCV Ag-Ab. Berdasarkan perbandingan hasil pengujian NAT dan nested PCR diperoleh nilai sensitivitas NAT sebesar 90, 63 , dengan Spesifisitasnya 96,71 . Dari hasil analisis chi-square diperoleh hubungan yang bermakna antara nilai S/CO anti-HCV dengan hasil pengujian NAT, nested PCR kualitatif dan HCV Ag-Ab P5 dapat dijadikan prediksi adanya infeksi aktif pada donor.

ABSTRACT
Anti HCV is the main serological marker for hepatitis C screening in blood donors in Indonesia. Besides anti HCV, UTD DKI Jakarta also implementing Nucleic Acid Test NAT to improve blood transfusion safety. Anti HCV assay can not distinguish between active infection and cured infection. Blood will be considered HCV infected if either from a positive serologic or molecular test, including blood with anti HCV grayzone and NAT negative. There is a requirement to ensure the risk status of blood with anti HCV grayzone and NAT negative, because the supply of blood in most provinces in Indonesia still insufficient. So, it takes another molecular test to compare with NAT result. Interpretation of anti HCV results was calculating by S CO ratio, which could be a predictor of viremia status. It is necessary to analyze the correlation between S CO with molecular test and HCV Ag Ab results.Viremia prediction value is expected to be an alternative for UTDs who have not been able to apply NAT. There are 93 samples collected then tested with NAT and anti HCV. Sample with concondantly positive anti HCV and NAT anti HCV positive and NAT negative and anti HCV grayzone and NAT negative. These samples then tested with nested PCR and HCV Ag Ab. Based on comparison of NAT and nested PCR, obtained NAT sensitivity value of 90, 63 , with Specificity 96.71 . The result of chi square analysis shows a significant correlation between S CO anti HCV with NAT, qualitative nested PCR and HCV Ag Ab P 5 can be used as predictors of active infection in donors. "
2017
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Gina Monita
"Diare karena rotavirus adalah masalah kesehatan masyarakat di seluruh dunia. Rotavirus grup A yang menyerang manusia adalah penyebab terbesar dari penyakit gastroenteritis akut pada anak - anak baik di negara maju maupun negara berkembang. Rotavirus saat ini menjadi subjek penelitian dan ujicoba untuk pencarian vaksin yang efektif dan aman. Penelitian dilakukan untuk menentukan prevalensi rotavirus grup A di daerah Makassar selama bulan Oktober 2005 sampai Oktober 2006. Sampel feses dengan gejala diare dikumpulkan dari pasien pediatri sebanyak 326 sampel. Sampel kemudian diuji dengan metode ELISA dan menunjukkan 26,07% positif terinfeksi rotavirus grup A. Sampel positif tersebut kemudian dianalisis lebih lanjut dengan metode RT dan nested PCR menunjukkan bahwa prevalensi terbesar dari galur rotavirus grup A di daerah Makassar adalah serotipe G4G9P[8] sebanyak 36,55 (n = 31).

Rotavirus diarrhea is a public health problem throughout the world. Group A human rotaviruses are a major cause of acute gastroenteritis in young children in both developing and developed countries. Rotaviruses are at present the subject of intense vaccine research and trials worldwide to find an effective and safety vaccine. The study was conducted to determine the prevalence of group A rotavirus in Makassar on October 2005 until October 2006. Three hundred twenty six stool samples were collected from pediatric patient with diarrhea symptoms. The samples were tested by ELISA method and resulted as 26,07% positive of group A rotavirus. The ELISA positive samples were then analyzed by RT and nested PCR method, subsequently, and result showed that the major prevalence of group A rotavirus in Makassar that is 36,55% (n = 31) were G4G9P[8] serotype."
Depok: Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 2006
S33049
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ida Effendi
"ABSTRAK
Sifilis merupakan penyakit multistadium yang ditularkan terutama melalui hubungan seksual. Saat ini penggunaan uji polymerase chain reaction (PCR) untuk Treponema pallidum telah banyak digunakan dan diharapkan mampu mengurangi masalah dalam uji diagnostik sifilis. Hasil uji PCR Treponema pallidum dipengaruhi oleh jenis spesimen, metode PCR dan gen target. Penelitian ini ditujukan untuk menilai penggunaan darah dan serum untuk uji multiplex nested PCR dengan gen target 23S rRNA Treponema pallidum. Studi potong lintang dilakukan dari bulan April 2015 - April 2016. Pengambilan sampel secara konsekutif dari pasien dengan gambaran klinis sifilis sekunder yang datang ke poliklinik Infeksi Menular Seksual (IMS) di Jakarta. Uji PCR dilakukan terhadap 122 spesimen klinis (61 darah dan 61 serum). Uji serologi rapid plasma reagin (RPR) dan Treponema pallidum Haemagglutination Assay (TPHA) dilakukan pada semua serum. Hasil positif uji PCR darah sebesar 22,95% dan serum sebesar 6,56%, sedangkan hasil positif uji serologi sebesar 68,85%. Pada hasil uji serologi positif, proporsi hasil positif uji multiplex nested PCR Treponema pallidum darah sebesar 30,95% dibandingkan serum 9,52%. Uji PCR terhadap darah mampu mendeteksi 3,25 kali lebih tinggi daripada serum. Penggunaan darah memberikan nilai kepositivan yang lebih tinggi dibandingkan serum pada uji multiplex nested PCR Treponema pallidum menggunakan gen target 23S rRNA

ABSTRACT
Syphilis is a multistage disease transmitted primarily through sexual intercourse. Nowadays, polymerase chain reaction (PCR) test for Treponema pallidum has been widely used and expected to overcome problems in diagnostic test for syphilis. The PCR Treponema pallidum are influenced by type of specimens, PCR methods and gene targets. This study is aim to assess the use of blood and serum using multiplex nested PCR Treponema pallidum targeting 23S rRNA. Cross-sectional study was conducted from April 2015 - April 2016. Sampling was carried out consecutively from patients with clinical features of secondary syphilis who came to sexual transmitted infection (STI) clinics in Jakarta. PCR test performed on 122 clinical specimen ( 61 blood and 61 serum). All serum were tested with RPR and TPHA assay. The positive results of PCR test on blood was 22,95% and serum was 6,56%, while the positive results of serology was 68,85%. On positive serological test results, the proportion of positive results of multiplex nested PCR Treponema pallidum on blood was 30,95% compared to serum 9,52%. PCR test on blood is able to detect 3,25 times higher than serum. The use of blood give a higher positivity compared to serum in multiplex nested PCR Treponema pallidum using 23S rRNA gene target."
SP-pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Evelyne Tiotantra
"Latar Belakang: Eradikasi Helicobacter pylori menggunakan antimikroba
klaritromisin, amoksisilin yang dikombinasi PPI selama 10-14 hari. Resistensi
antimikroba menjadi penyebab utama kegagalan terapi. Amoksisilin sebagai salah satu rejimen terapi lini pertama H.pylori telah dilaporkan resistensi sebesar 5,2% di Indonesia tahun 2016. Beberapa penelitian menunjukkan multiple point mutation gen pbp1 hanya ditemukan pada strain H.pylori resisten amoksisilin. Kesulitan melakukan biakan Helicobacter pylori menyebabkan uji biologi molekuler sebagai pilihan alternatif.
Tujuan : Penelitian ini ditujukan untuk mengembangkan uji deteksi resistensi H.pylori dengan gen penyandi pbp 1.
Metode : Penelitian ini merupakan studi retrospektif 2017-2019. Sampel H.pylori
positif histopatologis dari Departemen PA dikumpulkan sebanyak 54 sampel blok
parafin dari pasien RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo antara tahun 2017-2019 ,
dilakukan uji Real Time PCR. Hasil positif Real Time PCR dilanjutkan uji nested PCR untuk mencari gen pbp 1 dan dilakukan sekuensing Hasil : Dari 34 sampel positif Real Time PCR didapatkan lima positif gen pbp 1, tetapi
hanya empat gen pbp 1 yang dapat dianalisis setelah sekuensing. Hasil analisis dijumpai lima sekuen (sekuen 21, 1, 27, 32A, 32B), ditemukan juga tiga titik mutasi asam amino (Lys648Gln, Arg649Lys, Arg656Pro) yang berdasarkan penelitian sebelumnya hanya ditemukan pada strain H.pylori resisten amoksisilin. Empat sampel yang positif yaitu pada pasien tumor antrum lambung susp keganasan, ulkus gaster, gastritis kronis dan riwayat infeksi H.pylori dalam keluarga.
Kesimpulan : Uji biologi molekuler menggunakan gen pbp 1 sebagai gen penyandi
resisten amoksisilin dapat digunakan sebagai uji alternatif untuk mendeteksi resistensi amoksisilin pada penderita infeksi H.pylori. Hasil analisis mutasi asam amino pada uji penelitian ini menunjukkan terdapatnya multiple point mutation yang sesuai dengan strain H.pylori resisten amoksisilin di Korea.
......Background: To eradicate Helicobacter pylori infection, physician administered clarithromycin and amoxicillin plus proton pump inhibitor during 10-14 days.
Antimicrobial resistance is known as the major cause of treatment failure. The
prevalence of Helicobacter pylori resistant strains against Amoxicillin in Indonesia was5,2% in 2016. Several studies in amoxicillin-resistant H.pylori strains had shown multiple point mutation in the pbp1 gene. Molecular method as an alternative tool was chosen due to the difficulties in cultivate H.pylori in a synthetic media.
Aim: This research was aimed to develop H.pylori resistance detection tests using pbp 1 gene.
Methods: The study was a retrospective study, with 54 histopathology of H.pylori
positive samples obtained from patients at RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo between
2017 to 2019. Real-time PCR tests were used to screen the samples before proceeded to nested PCR and obtained the pbp1 gene for sequencing.
Results: After the initial real-time PCR, 34 H.pylori positive samples were included in the study. From 34 samples of paraffin block only five specimens with positive pbp 1 genes, but only four samples can be analyzed after sequencing. The results found five sequences (sequences 21, 1, 27, 32A dan 32B), also found three amino acid mutation points (Lys648Gln, Arg649Lys, Arg656Pro) which were found only in amoxicillinresistant H.pylori strains. The four samples were collected from patients with antrum gastric tumor suspected as malignancy, gastric ulcer, chronic gastritis, and family history of H. pylori infection.
Conclusion: Molecular approach to detect pbp 1 gene encoding for amoxicillin
resistance could be used as an alternative of antibiotic susceptibility test. The multiple point mutations found in this reseach were in accordance with the amoxicillin-resistant H.pylori strains in Korea."
Depok: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2021
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library