Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Indonesia termasuk dalam negara endemik dengue dengan kasus tertinggi di Asia Tenggara. Salah satu upaya pencegahan penyakit demam berdarah dengue (DBD) yang sedang dilakukan saat ini adalah pengembangan vaksin yang efektif. Namun, studi mengenai karakter pertumbuhan dan sensitivitas terhadap suhu dari empat serotipe virus dengue (DENV) asal Indonesia belum pernah dilakukan untuk mendukung upaya tersebut. Pada penelitian ini, uji kinetika pertumbuhan dilakukan untuk mengetahui karakter pertumbuhan empat serotipe DENV (DENV-1, DENV-2, DENV-3, & DENV-4), karakter pertumbuhan tiga genotipe (genotipe I, genotipe II, & genotipe IV) dari DENV-1, dan kemampuan empat serotipe DENV bereplikasi pada dua suhu yang berbeda, yaitu 37C dan 39C. Hasil uji kinetik pertumbuhan menunjukkan adanya perbedaan profil pertumbuhan antar serotipe DENV dan antar genotipe pada DENV-1. Di sisi lain, tidak ada perbedaan profil pertumbuhan antar serotipe DENV pada suhu 37C dan 39C. ...... Indonesia belongs to dengue endemic countries with highest number of cases in Southeast Asia. One way to prevent dengue disease that has been attempted is the development of an effective dengue vaccine. However, the studies of growth characteristic and temperature sensitivity of the four dengue virus (DENV) serotypes from Indonesia have not been undertaken to support the vaccine development. In this study, growth kinetic assay was carried out to examine the growth characteristic of the four DENV serotypes (DENV-1, DENV-2, DENV-3, & DENV-4), the growth characteristic of three genotypes (genotype I, genotype II, & genotype IV) of DENV-1, and replication of the four DENV serotypes at two different temperatures, 37C and 39C. The results showed that there are differences in growth replication profiles among the four DENV serotypes and among genotypes of DENV-1. On the other hand, no differences in the growth profiles among the four DENV serotypes at 37C and 39C was observed.

Abstrak :
[ABSTRAK
Latar Belakang: Hipersensitif dentin dipengaruhi oleh akumulasi plak pada permukaan gigi dan penetrasi bakteri pada tubulus dentin. Tujuan: Menganalisis proporsi serotipe c Streptococcus mutans dan tingkat keasaman di dalam plak dan saliva penderita resesi gingiva yang hipersensitif dentin dengan penderita resesi gingiva yang non hipersensitif. Metode: Tiga puluh enam sampel plak dan saliva dibagi dalam dua kelompok yaitu kelompok hipersensitif dan non hipersensitif. Dilakukan ekstrak DNA sampel, pengukuran pH sampel dan evaluasi amplifikasi serotipe c Streptococcus mutans dengan alat Real Time PCR. Hasil: Proporsi serotipe c Streptococcus mutans di dalam plak dan saliva tidak berbeda pada penderita resesi gingiva dengan hipersensitif dentin maupun non hipersensitif, Kesimpulan: Proporsi serotipe c Streptococcus mutans plak dan saliva tidak mempengaruhi hipersensitif dentin.

---

ABSTRACT
Background: dentin hypersensitivity is affected by the accumulation of plaque on the tooth surface and penetration of bacteria in the dentinal tubules. Objective: To analyze the proportion of serotype c Streptococcus mutans and the level of acidity in plaque and saliva of patients with hypersensitive dentin and non hypersensitive. Methods: Thirty-six plaque and saliva samples were divided into two groups: the hypersensitive and non-hypersensitive. Extract the sample DNA, measure the acidity levels and evaluate serotype c Streptococcus mutans amplification with Real Time PCR. Results: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva is not significantly different in the patients with gingival recession both hypersensitive and non-hypersensitive, Conclusions: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva are equally well both in hypersensitive and non hypersensitive cases.;Background: dentin hypersensitivity is affected by the accumulation of plaque on the tooth surface and penetration of bacteria in the dentinal tubules. Objective: To analyze the proportion of serotype c Streptococcus mutans and the level of acidity in plaque and saliva of patients with hypersensitive dentin and non hypersensitive. Methods: Thirty-six plaque and saliva samples were divided into two groups: the hypersensitive and non-hypersensitive. Extract the sample DNA, measure the acidity levels and evaluate serotype c Streptococcus mutans amplification with Real Time PCR. Results: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva is not significantly different in the patients with gingival recession both hypersensitive and non-hypersensitive, Conclusions: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva are equally well both in hypersensitive and non hypersensitive cases., Background: dentin hypersensitivity is affected by the accumulation of plaque on the tooth surface and penetration of bacteria in the dentinal tubules. Objective: To analyze the proportion of serotype c Streptococcus mutans and the level of acidity in plaque and saliva of patients with hypersensitive dentin and non hypersensitive. Methods: Thirty-six plaque and saliva samples were divided into two groups: the hypersensitive and non-hypersensitive. Extract the sample DNA, measure the acidity levels and evaluate serotype c Streptococcus mutans amplification with Real Time PCR. Results: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva is not significantly different in the patients with gingival recession both hypersensitive and non-hypersensitive, Conclusions: The proportion of serotype c Streptococcus mutans in plaque and saliva are equally well both in hypersensitive and non hypersensitive cases.]

Abstrak :
Dalam mengukur tingkat keparahan karies gigi, jumlah serotipe Streptococcus mutans serta ekspresi gen glukosiltransferase gtfs dan LuxS dapat digunakan sebagai prediktor aktivitas bakteri karies dalam kategori karies rendah dan karies tinggi pada anak-anak di Indonesia. Tujuan: Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis hubungan antara jumlah serotipe Streptococcus mutans, ekspresi gen LuxS dan glucosyltransferase dengan aktivitas bakteri karies gigi yang diukur dengan menggunakan Cariostat. Metode: Penelitian observasional potong silang dilakukan pada 76 anak usia 3 - 5 tahun 37 anak perempuan dan 39 anak laki-laki di Jakarta. Sampel plak gigi diambil dari subyek untuk mengukur jumlah serotipe, dan ekspresi mRNA gen glukosiltransferase dan LuxS. Tingkat keparahan karies gigi juga diukur dengan menggunakan indeks dmft, sedangkan aktivitas bakteri karies gigi diukur dengan menggunakan metode Cariostat. Jumlah serotipe, ekspresi mRNA gen glukosiltransferase dan ekspresi LuxS diukur menggunakan metode Quantitative Polymerase Chain Reaction qPCR . Hasil: Hasil analisis regresi berganda menunjukkan bahwa jumlah tingkat ekspresi gen S. mutans serotipe f dan gtfD yang dapat secara signifikan digunakan untuk memprediksi aktivitas bakteri karies gigi atau dengan kata lain berkontribusi terhadap aktivitas bakteri karies gigi. Kesimpulan: Metode Cariostat valid untuk mengukur aktivitas bakteri karies berdasarkan mikrobiologi dan penelitian biomolekuler. Dengan menggunakan instrumen klinis yang relatif sederhana dan ekonomis, seperti Cariostat, praktisi klinis mendapatkan gambaran mikrobiologi laboratorium dan hubungan biomolekuler seperti yang telah dibuktikan melalui penelitian ini. ...... Measuring the severity of dental caries, the quantities of Streptococcus mutans serotypes as well as its genes expression of glucosyltransferases gtfs and LuxS could be used as predictor of the activity of caries in both low and high caries experience in Indonesian children. Aim This study rsquo s aim was to analyze the relationship between Streptococcus mutans serotype quantity, glucosyltransferase LuxS gene expression with dental caries bacteria activity as measured by using cariostat. Methods Cross sectional observational study was conducted in 76 children aged 3 5 years 37 girls and 39 boys in Jakarta. The dental plaques samples were taken from the subjects for measuring serotype quantity, and the mRNA expression of glucosyltransferases and LuxS genes. The dental caries severity was also measured using the dmft index, while dental caries bacterial activity was measured using Cariostat method. The quantity of serotype, expression of the glucosyltransferases and the expression of the LuxS were measured using the quantitative Polymerase Chain Reaction qPCR method. Results Result of the multiple regression analysis shows that the quantity of S. mutans serotype f and gtfD gene expression level that could significantly be used to predict the activity of dental caries bacteria or in other words contribute to dental caries bacterial activity. Conclusions Cariostat method is valid to measure activity of bacteri caries base on microbiology and biomolecular research. Using a relatively simple and economical clinical instrument, such as Cariostat, clinical practitioners get a picture of the laboratory microbiology and biomolecular relationship as has been proven through this study.

Abstrak :
Rotavirus grup A merupakan agen penting penyebab penyakit diare dengan tingkat keparahan yang cukup tinggi pada pasien bayi dan anak-anak khususnya di negara berkembang. Rotavirus diperkirakan telah menyebabkan lebih dari 800.000 kematian per tahunnya. Tingkat morbiditas dan mortalitas yang tinggi tersebut menjadi latar belakang yang mendorong untuk pengembangan vaksin yang efektif melalui karakterisasi molekular dari galur rotavirus yang bersikulasi. Oleh karena itu dibutuhkan metode yang spesifik, sensitif serta cepat untuk mendeteksi dan menentukan serotipe dari galur rotavirus grup A. Pada penelitian ini, 394 sampel feses yang diperoleh selama bulan September 2005 sampai dengan Januari 2006 dari bayi dan anak-anak dengan gejala diare di Mataram diuji dengan metode Enzyme Immunoassay (EIA) dan 82 sampel menunjukkan hasil positif (20,8%). Sampel positif tersebut kemudian dianalisis lebih lanjut dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR). Hasil uji tersebut menunjukkan bahwa prevalensi dari serotipe G4G9 dengan tipe P nonserotipe (33 dari 81 [40,7%]) merupakan galur rotavirus yang paling banyak ditemui di Mataram.

Abstrak :
Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae atau pneumokokus) dapat menyebabkan Invasive Pneumococcal Disease (IPD), seperti penumonia, meningitis, dan otitis media. Streptococcus pneumoniae memiliki lebih dari 90 serotipe yang berbeda sifat-sifat kepatogenannya. Saat ini, metode molekuler lebih banyak diterapkan dalam penentuan serotipe bakteri tersebut. Penelitian sebelumnya pada anak-anak sehat di Lombok, menemukan bahwa 73 dari 551 isolat merupakan untypeable S. pneumoniae karena tidak dapat ditentukan serotipenya berdasarkan metode PCR multipleks. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi lebih mendalam dengan mendeteksi tiga gen yang lestari (conserved genes) pada bakteri S. pneumoniae yaitu, gen psaA, lytA, dan cpsA. Sebanyak 52 isolat (71.2%) terdeteksi dengan PCR mempunyai gen psaA. Sementara itu, gen lytA terdeteksi pada 69 isolat (90.4%) dan gen cpsA terdeteksi pada 37 isolat (50.7%). Berdasarkan hasil deteksi gen psaA, lytA, dan cpsA diperoleh 6 kelompok varian untypeable S. pneumoniae. Analisa sekuens gen recA dengan metode sekuensing, menunjukkan bahwa kelompok varian I (psaA+, lytA+, cpsA+), II (psaA+, lytA+, cpsA–) dan IV (psaA–, lytA+, cpsA+) merupakan bakteri S. pneumoniae. Sementara itu, kelompok varian VI (psaA–, lytA+, cpsA–) merupakan bakteri S. pseudopneumoniae dan kelompok varian VIII (psaA–, lytA–, cpsA–) merupakan bakteri S. infantis. Hasil tersebut mengindikasikan bahwa identifikasi bakteri S. pneumoniae tidak dapat dilakukan hanya dengan satu penanda gen. Hasil penelitian ini penting untuk meningkatkan sensitifitas dari deteksi S. pneumoniae dengan teknik biologi molekuler. ......Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae or pneumococcus) can cause Invasive Pneumococcal Disease (IPD), such as pneumonia, meningitis, and otitis media. Streptococcus pneumoniae has more than 90 serotypes which differentiated based on the level of pathogenicity. Currently, molecular methods were more widely applied to determine bacterial serotype. Previous studies of healthy children in Lombok, found that 73 of 551 isolates were untypeable S. pneumoniae, because the serotypes can not be determined by multiplex PCR method. This research used a deeper identification by detecting three conserved genes in S. pneumoniae, such as psaA, lytA, and cpsA. A total of 52 isolates (71.2%) were positive for psaA gene by PCR. Meanwhile, lytA gene was detected in 69 isolates (90.4%) and cpsA gene was detected in 37 isolates (50.7%). Based on the result of psaA, lytA and cpsA gene detection, obtained 6 variants of untypeable S. pneumoniae. recA gene sequence analysis with sequencing method, showed that variant I, II and IV are S. pneumoniae. Meanwhile, variant VI is S. pseudopneumoniae and variant VIII is S. infantis. The results indicated that identification of the bacteria S. pneumoniae can not be done with just one marker gene. The results are important to increase the detection of S. pneumoniae with molecular biology techniques.

Abstrak :
[ABSTRAK
Demam berdarah dengue (DBD) merupakan penyakit yang disebabkan karena infeksi virus dengue (DENV), yang banyak ditemukan di Indonesia. Belum ada terapi yang spesifik dalam pengobatan DBD. Upaya pengembangan vaksin dengue yang efektif sangat diperlukan. Pada penelitian ini dilakukan analisa imunogenisitas kandidat vaksin DNA prM-E dengue serotipe 2 (pUMD2.kl.20) dengan menganalisis sel T CD4, sel T CD8, IFN-γ dan TNF-α. pada sel U937 dan PBMC secara in vitro, bertujuan untuk mengetahui respon imun ketika vaksin diinjeksikan ke dalam tubuh manusia. Dasar penelitian ini adalah sel U937 ditransfeksi dengan pUMD2.kl.20 menggunakan lipofectamin. Sel U937 akan berperan sebagai APCs yang akan mengekspresikan protein prM-E DENV-2 dan mempresentasikan protein tersebut melalui molekul MHC class I dan MHC class II kepada Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) manusia. Tahapan kerja yang dilakukan dalam penelitian ini terdiri dari: (a) kultur galur sel U937, (b) transfeksi sel U937 dengan pUMD2.kl.20, (c) transfeksi sel U937 dengan plasmid s(pUMVC), (d) infeksi sel U937 dengan DENV-2 strain DS.18/09, (e) pewarnaan dan pengamatan hasil pewarnaan menggunakan alat semi flowcytometri (TALI). pUMD2.kl.20 mengaktivasi sel T CD4 dan sel T CD8 untuk berploriferasi. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa konsentrasi sel T CD8 lebih tinggi dari konsentrasi sel T CD4 dan konsentrasi sel positif yang mensekresikan IFNγ lebih tinggi dari konsentrasi sel positif yang mensekresikan TNFα. Kondisi optimal dari aktivasi sel T CD4 oleh pUMD2.kl.20 adalah 24 jam setelah penambahan PBMC setelah transfeksi (8,53x10⁴sel/ml), untuk sel T CD8 adalah 24 jam setelah penambahan PBMC setelah transfeksi (49,4x10⁴ sel/ml). Kondisi optimal dari aktivasi sel+ yang mensekresikan IFNγ oleh pUMD2.kl.20 adalah 24 jam setelah penambahan PBMC 48 jam setelah transfeksi (9,86x10⁴ sel/ml), dan untuk sel+ yang mensekresikan TNFα adalah 2 jam setelah penambahan PBMC 48 jam setelah transfeksi (2,1x10⁴ sel/ml). Dari penelitian ini dapat disimpulkan bahwa pUMD2.kl.20 bersifat imunogenik.

---

ABSTRACT
Dengue hemorrhagic fever (DHF) is a disease caused by infection with dengue virus (DENV), which is found in Indonesia. There is no specific therapy in the treatment of DHF. An effort to develop an effective dengue vaccine is needed. In this research, analysis of the immunogenicity of the DNA vaccine candidate prME dengue serotype 2 (pUMD2.kl.20) by analyzing the CD4 T cells, CD8 T cells, IFN-γ and TNF-α in U937 cells and PBMC in vitro, aims to determine the immune response when the vaccine is injected into the human body. This research approach is based on transfection of U937 cells with pUMD2.kl.20 using lipofectamin. U937 cells acts as APCs which will express the protein prM-E DENV-2 and presenting these proteins through the MHC class I and MHC class II molecule to the Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) of human body. Stages of the work in this study consisted of: (a) culture cell line U937, (b) transfection of U937 cells with pUMD2.kl.20, (c) transfection of U937 cells with plasmid (pUMVC), (d) infection of U937 cells with DENV-2 strains DS.18/09, (e) staining and observation results of staining using a semi-flow cytometri (TALI). pUMD2.kl.20 activate CD4 T cells and CD8 T cells to proliferate. CD8 T cells concentration higher than the concentration of CD4 T cells and the secretion of INFγ-positive cells concentration higher than the concentration of the secretion of TNFα-positive cells. Optimal condition of CD4 T cells activation by pUMD2.kl.20 is 24 hours after the addition of PBMC after transfection (8,53x10⁴ cells/ml), for CD8 T cells was 24 hours after the addition of PBMC after transfection (49,4x10⁴ cells/ml). Optimal conditions secretion of IFNγ-positive cells were activated by pUMD2.kl.20 is 24 hours after the addition of PBMC 48 hours after transfection (9,86x10⁴ cells/ml), and for the secretion of TNFα- positive cells were activated by pUMD2.kl.20 is 2 hours after the addition of PBMC 48 hours after transfection (2,1x10⁴ cells/ml). From this study it can be concluded that the pUMD2.kl.20 immunogenic, Dengue hemorrhagic fever (DHF) is a disease caused by infection with dengue virus (DENV), which is found in Indonesia. There is no specific therapy in the treatment of DHF. An effort to develop an effective dengue vaccine is needed. In this research, analysis of the immunogenicity of the DNA vaccine candidate prME dengue serotype 2 (pUMD2.kl.20) by analyzing the CD4 T cells, CD8 T cells, IFN-γ and TNF-α in U937 cells and PBMC in vitro, aims to determine the immune response when the vaccine is injected into the human body. This research approach is based on transfection of U937 cells with pUMD2.kl.20 using lipofectamin. U937 cells acts as APCs which will express the protein prM-E DENV-2 and presenting these proteins through the MHC class I and MHC class II molecule to the Peripheral Blood Mononuclear Cell (PBMC) of human body. Stages of the work in this study consisted of: (a) culture cell line U937, (b) transfection of U937 cells with pUMD2.kl.20, (c) transfection of U937 cells with plasmid (pUMVC), (d) infection of U937 cells with DENV-2 strains DS.18/09, (e) staining and observation results of staining using a semi-flow cytometri (TALI). pUMD2.kl.20 activate CD4 T cells and CD8 T cells to proliferate. CD8 T cells concentration higher than the concentration of CD4 T cells and the secretion of INFγ-positive cells concentration higher than the concentration of the secretion of TNFα-positive cells. Optimal condition of CD4 T cells activation by pUMD2.kl.20 is 24 hours after the addition of PBMC after transfection (8,53x10⁴ cells/ml), for CD8 T cells was 24 hours after the addition of PBMC after transfection (49,4x10⁴ cells/ml). Optimal conditions secretion of IFNγ-positive cells were activated by pUMD2.kl.20 is 24 hours after the addition of PBMC 48 hours after transfection (9,86x10⁴ cells/ml), and for the secretion of TNFα- positive cells were activated by pUMD2.kl.20 is 2 hours after the addition of PBMC 48 hours after transfection (2,1x10⁴ cells/ml). From this study it can be concluded that the pUMD2.kl.20 immunogenic]

Abstrak :
Cryptococcus merupakan khamir bersimpai yang menyebabkan kriptokokosis dan pada era HIV/A1DS jumfah kasus meningkat tajam. Manifestasi klinik kriptokokosis berbeda sesuai dengan spesies dan serotipe, sehingga identifikasi menjadi sangat penting. Selain itu penerapan spesies pe;nting untuk studi epidemiologis kriptokokosis. Penelitian ini merupakan penelltian deskriptif untuk mengidentifikasi spesies dan serotipe serta virulensi jarnur. Seiai itu ingin diketahui penyebaran penyakit di Jabodetabek. Bahan yang diperiksa adalah 40 lsolat koleksi Departemen P.arasitologi FKUI dan 25 isolat dari cairan otak kulit dan darah. Metode pemeriksaan terdiri ata:s uji asimilasi (kit API 20C AUX), uji pembentukan germ tube, biakan pada medium CGB dan CDBT dan NSA. Penyebaran kasus kriptokokosis diadapatkan berdasarkan domisili pasien. Hasil uji asimilasi didapatkan Cr. neoformans (64 isolat), Cr. lat:rentii var. laurentfi (l isolat). Hasil uji pembentukan germ tube didapatkan bahwa jamur yang diteliti bukan golongan Candida. Penetapan spesies dengan medium CGB didapatkan seluruh isolat adaiah Cr. neoformans. Hasil penetapan serotipe dengan median CDBT didapatkan seluruh isoiat adalah Cr. neoformans serotipe A. Uji virulensi dengan medium NSA memperlihatkan pembentukan pigmen melanin pada semua isofat. Data demografis menunjukkan distribusi penderita kriptokokosis di Jim a wilayah DKI,.Bogor dan Bandung. ......Cryptococcus is encapsulated yeast that caused Cryptococcosis in human. In the era of HIV/AIDS there is an increased number of cryptococcosis. Its clinical manifestation varied according to the species, so species idcntif1calion is quite important. Furthermore species identification is also important in epidemiology study. This descriptive study aimed to identify species and stereotype of Cryptococcus and also its virulence. The study also aimed to know the distribution of Cryptococcosis in Jabodetabek. There wex 40 isolates from the collection of Department of Parasitology FKUl. and other 25 isolates were isolated from spinal fluid, blood and skin. The study Vas done using API 20C AUX, germ tube fonnation test, CGB for the differentiation of Cryptococcus. gattii and Cryptococcus neoformans. and, CDBT for serotyping and melanine production by plating the isolates on niger seed agar. The study on the distribution of the disease was based on patients residence. The results were, 64 isolates of Cr. neoformans and 1 Cr. laurentii. Germ tube formation test is negative. Identification of species with CGB agar showed all isolates were Cr. neoformans. Stereotype identification with CDBT were all stereotype A. All isolate were capable of forming melanin when growth on NSA. Demographic data of the patients shows a wide distribution including 5 areas of DKI, Bogor and Bandung.

Abstrak :

Pneumonia karena Streptococcus pneumoniae merupakan penyebab utama kematian balita yang sebenarnya dapat dicegah dengan vaksinasi. Penelitian ini bertujuan menilai efektivitas Pneumococcal Conjugate Vaccine-13 (PCV13) dengan imunisasi dasar 2 dosis dan 1 dosis penguat (jadwal 2 + 1).

Penelitian kohort prospektif dilakukan di tiga Kabupaten Nusa Tenggara Barat pada bulan November 2017–Juni 2019. Subjek adalah bayi usia dua bulan, dibagi menjadi kelompok PCV13 dan kontrol. Vaksinasi PCV13 dilakukan oleh Dinas Kesehatan Provinsi NTB pada bulan Oktober 2017. Subjek dilakukan usap nasofaring 4 kali saat berusia 2, 4, 12, dan 18 bulan, kemudian spesimen dikultur, diidentifikasi serotipe, dan diuji kepekaannya terhadap antibiotik.

Proporsi S. pneumoniae pada usia 2 bulan adalah 22,9% pada kelompok vaksin dan 19,1% pada kontrol. Evaluasi pada usia 12 bulan menunjukkan kolonisasi S. pneumoniae lebih tinggi dibandingkan usia 2 bulan pada kedua kelompok (chi square, p < 0,01). Kolonisasi S. pneumoniae serotipe vaksin PCV13 (serotipe VT) pada kelompok vaksin menurun pada usia 18 bulan diikuti kenaikan serotipe yang tidak terdapat di vaksin PCV13 (serotipe NVT). Pada kontrol serotipe VT meningkat dengan bertambahnya usia (chi square, p < 0,05). PCV13 menurunkan kolonisasi S. pneumoniae serotipe 6A/6B (serotipe dominan). Pola kepekaan terhadap antibiotik tidak berubah dengan bertambahnya usia pada kedua kelompok. Disimpulkan pemberian PCV13 dengan jadwal 2 + 1 efektif menurunkan kolonisasi S. pneumoniae serotipe VT di nasofaring.

 

Kata kunci:    kepekaan terhadap antibiotik, kolonisasi nasofaring, perubahan serotipe, pneumonia, proporsi

---

Pneumonia caused by Streptococcus pneumoniae is the leading cause of vaccine-preventable deaths in children under five years old. The study aims to assess the effectiveness of the Pneumococcal Conjugate Vaccine-13 (PCV13) administration with 2 primary doses and 1 booster (2 + 1 schedule).

This prospective cohort study was conducted in three districts of West Nusa Tenggara from November 2017–June 2019. The subjects were 2-month-old babies, divided into the group that was given PCV13 and the control group. PCV13 administered by West Nusa Tenggara Health Office in October 2017. Four nasopharyngeal swabs were collected at the age of 2, 4, 12, and 18 months old. S. pneumoniae was identified by culture and optochin test, then serotyping and antibiotic susceptibility test were performed by multiplex PCR and disk diffusion tools respectively.

The proportion of S. pneumoniae in 2 months old was 22.9% in the vaccine group and 19.1% in the control group. Evaluation in 12 months old showed higher colonization than in 2 months old (chi-square, p < 0.01). Colonization of vaccine-type serotypes in the vaccine group decreased at the age of 18 months followed by an increase in non-vaccine serotype. In the control group, vaccine-type increased with increased age (chi-square, p < 0.05). The PCV13 lowered the 6A/6B serotype (dominant serotype). Antibiotic susceptibility patterns did not change with increased age in both groups. In conclusion, the administration of PCV13 with a 2 + 1 schedule is effective to reduce the colonization of S. pneumoniae vaccine-type serotypes in the nasopharynx.

 

 

Keywords: antibiotic susceptibility, nasopharyngeal colonization, pneumonia, prevalence, serotype changes

Abstrak :
Virus dengue merupakan penyebab demam berdarah dengue dan bersifat endemik di Indonesia. Kejadian luar biasa (KLB) demam berdarah dengue yang dulu terjadi setiap 5 tahun berubah menjadi setiap tahun sejak 1998. Strain virulen virus dengue yang berdaya infektivitas tinggi diduga merupakan pengubah pola KLB. Virulensi diduga dikendalikan oleh gen E. Penelitian bertujuan untuk karakterisasi genetik gen E terhadap 4 sampel virus dengue serta mengetahui penggolongan filogenetik virus dengue asal Jakarta dan Bandung di antara genotipe yang telah ada. Keempat sampel adalah isolat dengue serotipe 1, 2, 3, dan 4 (DEN-1,-2,-3, dan -4) dari penderita demam berdarah dengue yang dikoleksi oleh Viral Diseases Program US NAMRU-2 pada tahun 2003-2005. Metode penelitian adalah amplifikasi segmen struktural genom menggunakan teknik RT-PCR, sequencing gen E, alignment gen E sampel terhadap strain virus yang telah diketahui (ClustalX 1.83 dan MegAlign), serta analisis filogenetik berdasarkan metode neighbor-joining (ClustalX 1.83). Hasil RT-PCR pada DEN-1 berukuran 1.605 dan 1.449 pb (pasangan basa), pada DEN-2 berukuran 1.282 dan 1.505 pb, pada DEN-3 berukuran 1.541 dan 865 pb, serta pada DEN-4 berukuran 1.664 dan 1.339 pb. Hasil sequencing gen E DEN-1,-2,-4 berukuran 1.485 pb, sedangkan gen E DEN-3 berukuran 1.479 pb. Hasil tersebut menunjukkan tidak adanya delesi maupun insersi pada gen E keempat sampel. Terhadap prototype, gen E sampel DEN-1 mengalami substitusi histidin􀃆tirosin pada asam amino ke-437, sampel DEN-2 mengalami substitusi asam aspartat􀃆asam glutamat pada asam amino ke-329, sampel DEN-3 mengalami substitusi serin􀃆fenilalanin pada asam amino ke-124, dan sampel DEN-4 tidak mengalami substitusi yang spesifik. Sampel DEN-1 dan DEN-4 termasuk genotipe II, sampel DEN-2 anggota genotipe IV, sampel DEN-3 anggota genotipe I.

Abstrak :
Pendahuluan: Demam berdarah dengue (DBD) merupakan penyakit infeksi virus dengue (DENV) dengan vektor Aedes aegypti. Pada tahun 2016, terdapat 290 ribu kasus dengue di dunia dan 68.507 kasus DBD di Indonesia pada tahun 2017. Regimen terapi DBD adalah terapi suportif yaitu terapi cairan dan simptomatik. Butil galat memiliki potensi sebagai antiviral dengue. Namun, mekanisme penghambatannya masih belum diketahui sehingga penelitian ini dilakukan untuk mengetahui efek butil galat terhadap penghambatan reseptor dan penempelan virus dengue serotipe 2 (DENV-2) in vitro dan ikatan energi butil galat dengan protein E secara in silico. Metode: Penelitian ini merupakan studi eksperimental untuk menganalisis mekanisme butil galat sebagai antiviral dengue in vitro terhadap DENV-2 menggunakan sel Vero sebagai sel uji dan in silico untuk mengetahui ikatan energi butil galat dengan protein E DENV. Focus assay dan MTT Assay digunakan untuk menilai pengambatan reseptor dan penempelan virus, serta viabilitas sel secara berturut-turut. Konsentrasi butil galat yaitu dua kali IC50. DMSO digunakan sebagai kontrol. Hasil: Persentase hambat pada reseptor dan penempelan virus adalah 28,68% dan 36,10%, viabilitas sel bernilai 108,69% serta ikatan energi bernilai -4,89 kkal/mol dengan konstanta inhibisi 0,26 mM. Kesimpulan: Butil galat memiliki efek penghambatan penempelan virus yang lebih baik daripada reseptor serta memiliki ikatan yang baik dengan protein E. ...... Introduction: Dengue hemorrhagic fever (DHF) is an infectious disease caused by dengue virus (DENV) with vector Aedes aegypti. In 2016, 290 thousand people were diagnosed with DHF. In 2017, there are 68,507 DHF cases in Indonesia. Therapy regiment of DHF are supportive treatments; fluid therapy and symptomatic therapy. Butyl gallate has potential antiviral activity against dengue serotype 2 virus (DENV-2). However, the inhibitory mechanism is still unknown. Therefore, this research aims to find out the effect of butyl gallate in receptor and virus attachment inhibition of DENV-2 in vitro and binding energy between butyl gallate and protein E DENV in silico. Method: Experimental study was done to analyze butyl gallate mechanism as dengue antiviral in vitro to DENV-2 using Vero cell as test cell and in silico to calculate binding energy between butyl gallate and DENV’s E protein. Focus assay and MTT assay were used to evaluate receptor inhibition and virus attachment as well as cell viability, respectively. Butyl gallate concentration was twice that of IC50. DMSO was used as control. Results: Inhibition percentage on receptor and virus attachment yielded 28.68% and 36.10%, Cell viability yielded 108.69%, and energy bond valued -4.89 kcal/mol with inhibition constant of 0.26 mM Conclusion: Butyl gallate had higher inhibition effect on virus attachment compared to receptor and had stronger bond with E protein.