Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Sepsis, yang salah satunya ditandai dengan adanya bakteri dalam darah (bakteremia), merupakan keadaan klinis yang mengancam jiwa seseorang. Sehingga pemilihan antibiotik yang tepat sangatlah penting untuk mengurangi angka kecacatan dan kematian. Beberapa antibiotik yang dapat digunakan untuk menangani sepsis adalah kloramfenikol, kotrimoksasol, dan tetrasiklin. Oleh karena itu diperlukan pemantauan pola resistensi bakteri penyebab sepsis terhadap ketiga antibiotik tersebut. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data sekunder yang diperoleh dari hasil uji resistensi bakteri dari spesimen darah terhadap berbagai antibiotik dari tahun 2001-2006 yang dikirim ke Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Dari 791 isolat darah, didapatkan enam bakteri tersering yang diisolasi dari spesimen darah yaitu Staphylococcus epidermidis (25%), Acinetobacter anitratus (16%), Pseudomonas aeruginosa (13%), Klebsiella pneumoniae (8%), Staphylococcus aureus (6%), dan Salmonella Typhi (5%). Hasil uji resistensi keenam bakteri tersebut terhadap ketiga antibiotik di atas sangat bervariasi. Staphylococcus epidermidis sudah cukup resisten (37,4-51,9%) terhadap ketiga antibiotik di atas. Resistensi Acinetobacter anitratus dan Pseudomonas aeruginosa terhadap kloramfenikol dan kotrimoksasol masih rendah, masing-masing 10-16,2% dan 6,2-21,4%, sedangkan terhadap tetrasiklin resistensinya sudah cukup tinggi, 62,5% pada Acinetobacter anitratus dan 71% pada Pseudomonas aeruginosa. Klebsiella pneumoniae sudah cukup resisten (36,6-71,4%) terhadap ketiga antibiotik di atas. Resistensi Staphylococcus aureus masih cukup rendah (5,9-28,6%) terhadap ketiga antibiotik di atas. Resistensi Salmonella Typhi terhadap ketiga antibiotik di atas juga masih rendah (0-5,6%). Dapat disimpulkan bahwa resistensi bakteri yang diisolasi dari spesimen darah terhadap ketiga antibiotik di atas sudah cukup tinggi, kecuali pada Staphylococcus aureus dan Salmonella Typhi, serta pada Acinetobacter anitratus dan Pseudomonas aeruginosa terhadap kloramfenikol dan kotrimoksasol.

---

Sepsis which is characterized by the presence of bacteria in bloodstream (bacteremia) is a harmful clinical state that can be life-threatening. Correct choice of antibiotics is a very important issue in reducing morbidity and mortality rates among sepsis patients. Some antibiotics that can be used to treat sepsis are chloramphenicol, co-trimoxazole, and tetracycline. Hence, it is necessary to monitor sepsis-causing bacteria resistance pattern to those three antibiotics mentioned before. The data utilized was a secondary one that was obtained from the result of blood-specimen bacterial resistance test against antibiotics in Clinical Microbiology Laboratory of Faculty of Medicine, University of Indonesia from 2001 to 2006. Of 791 blood isolates, six most frequent bacteria isolated from blood specimen were Staphylococcus epidermidis (25%), Acinetobacter anitratus (16%), Pseudomonas aeruginosa (13%), Klebsiella pneumoniae (8%), Staphylococcus aureus (6%), and Salmonella Typhi (5%), of which the results varied widely. Moderate resistance rates (37.4-51.9%) against those three antibiotics were observed from Staphylococcus epidermidis. Low resistance rates against chloramphenicol and co-trimoxazole were observed from Acinetobacter anitratus and Pseudomonas aeruginosa, each showed 10-16.2% and 6.2-21.4% respectively, while their resistance against tetracycline were already high, 62.5% in Acinetobacter anitratus and 71% in Pseudomonas aeruginosa. Klebsiella pneumonia showed moderate resistance against those three antibiotics mentioned above (36,6-71,4%). Low resistance rates (5.9-28.6%) against those three antibiotics were observed from Staphyhlococcus aureus. Very low resistance rates (0-5.6%) against those three antibiotics were also observed from Salmonella Tyhpi. It can be concluded that the resistance rates among bacteria isolated from blood specimen against those three antibiotics are already high, except Staphylococcus aureus and Salmonella Typhi, and Acinetobacter anitratus and Pseudomonas aeruginosa against chloramphenicol and co-trimoxazole."

"Cryptosporidiurn sp. adalah parasit protozoa usus intraseluler yang rnenginfeksi berbagai hewan verteblata termasuk manusia dan menyehabkan penyakit kriptosporidiosis, juga merupakan agen penycbab diare yang bersifat oportunistik. Gejaia yang berulang dan angka penularan yang tinggi akan menurunkan kualitas hidup penderita sehingga diperlukan diagnosis kriptosporidiosis yang cepat secara mikroskopis pada sediaan tinja yang diwarnai.Tesis ini bcrtujuan membandingkan metode pewamaan modiiikasi tahan asam (MTA) dan auramin fenol (AF) untuk dcteksi ookista Cryploaporidiwn sp. dari sampel tirja dengan dan tanpa konsentrasi. Sensitivitas dan spesifisitas setiap metode dari tinja yang dikonsentrasi, ditentukan dengan PCR* sebagai baku emaa Penelitian ini adalah penelitian kualitatif dengan desain cross sectional menggunakan uji diagnostik. Hasil uji skrining dan tingkat agreement dihitung Dari 130 sampel tirqa yang diperiksa, 5,4%, 10%, 10%, l9,2% dan 32,3% positif Cryprosporidium sp. dengan metode MTA tanpa konsentrasi, MTA dikonsentrasi, AF tanpa konsenuasi, AF dikonsemrasi dan PCR*. I-Iasil positif ookista Cfgptosporidium sp. lebih banyak ditemukan pada sediazm tinja yang dikonsentrasi. Hasil tidak berbeda bermakna pada perbandingan basil MTA dengan dan tanpa konsentrasi(p=0,07), sedangkan hasil berbeda bcrmakna pada AF (p=0,00). Sensitivitas MTA dan AF tinja konsentrasi adalah 30,9% dan 54,8%; spesifisitas 100% dan 97,7% dibandingkan dengan PCR*. Metode pewarnaan AF memiliki nilai sensitivitas lebih tinggi, tetapi spesifisitasnya sama dengan MTA. Metode pewamaan AF dapat digunakan scbagai altematif dari pewamaan MTA untuk deteksi ookista Cfyptosporidium sp. pada sampel tinja.

---

Cryptosporzdnm sp. is intestinal protozoa parasite intracellular which infect widely vertebrata include human and cause cryptosporidiosis disease, also opportunistic agent for diarrhea. Reinfection and high transmission can decrease quality of life patient, so it needs a quick diagnostic with microscopy analysis to stain fecal smears. The objective of this study is to investigate the comparison of the modified acid fast (MAF) and auramine phenol (APh) staining method in order to detecting Cryptosporidium sp. oocysts 'nom unconcentrated and concentrated fecal sample. The sensitivity and specificity of each method from concentrated fecal sample was determined with PCR* as the gold standard.

The result of the screening test and the levels of agreement were quantified This research is qualitative interpretation with cross sectional design study which using diagnostic test. Of the |30 fecal samples that has examined, 5,4%, 10%, 10%, 19,2% and 32,3% were positive Cryptosporidium sp. by the MAF unconcentrated, MAF concentrated, APh unconoentrated, APh concentrated and PCR* method respectively. The majority of positive Cryptosporidium sp. samples were found in concentrated samples.

The results have no significant differences between MAF staining with unconcentrated and concentrated fecal sample (p=0,07), but there is a significant difference for APh staining (p=0,00). In comparison with PCR* results, the sensitivities of MAF and APh concentrated methods were 30,9% and 54,8%; the specificities were l00% and 97,7% respectively. The APh staining method apparently has more sensitivity than MAF staining method, but has the same speciticity. The APh staining method proved to be a valuable altemative to MAF staining for detection of' Cryptosporidium sp. oocysts in fecal sample."

"Cryprosporidium sp adalah parasit yang merupakan protozoa penyebab diare pada individu lmunodefisiensi seperti penderita HlV/AIDS, Diagnosis criptosporidiosis dengan menemukan ookista pada tinja menggunakan metode pulasan tahan asam dinilai kurang sensitif. Deteksi koproantigen Crypto:,poridium sp menggunakan ELISA diketahui lebih sensitif dan spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk deteksi koproantigen Cryptosporidlum sp pada pasien HIV/AJDS dengan diare kronik menggunakan ELISA dan MTA serta melihat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista. Sebanyak 95 sampel tinja dari pasien HIV/AIDS dengan diare kronik diperiksa menggunakan pulasan tahan asam yang merupakan gold standort dan deteksi koproantigen. Frekuensi kriptosporidiosis menggunakan deteksi koproantigen sebesar 36,8% dan dengan metode MTA 11,6%. Nilai sensitivitas dan spesifisitas koproantigen dibandingkan dengan pulasan tahan asam sebesar 100% dan 71A%. Tidak terdapat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista.

---

Cryptosporidium sp is a protozoan parasite, causes severe diarrhea in immunodeficient hosts like the HIV/AIDS patients. Diagnosis of cryptosporidiosis by finding the oocyst from stool by modified acid fast staining, is insensitive. Coproantigen detection offers more sensitive and specific technique to detect Cryptosporidium infection. The objective of this study is to determine cryptosporidiosis proportion among HIVIAIDS patients by Cryptosporidial antigen detection in stool compare it to modified acid fast staining and determine its correlation with oocyts count. A number of 95 stool specimens from the HIV/AIDS patients with chronic diarrhea were subjected to coproantigen ELISA test and modified acid-fast staining (gold standard). The frequency of Criptosporidial infection was 36,8% and 11,6% respectively by coproantigen detection and AF staining with 100% sensitivity and 71.4% specificity. There is no correlation between optical density and oocyst count."

"Kandidemia merupakan salah satu bentuk kandidosis sistemik. Prevalensinya meningkat dalam dasawarsa terakhir karena mcningkatnya populasi pasien imunokompromis akibat berbagai sebab seperti prosedur kedokteran modern. Penelitian ini mcncliti tentang spesies Candida penyebab kandidemia, pola kepekaan Candida terhadap flukonazol dan vorikonazol dengan metode difusi cakram serta sumber infeksi eksogcn di lingkungan perawatan Perinatologi RSUPN-CM. Dari 187 sampel darah diperiksa dan dibiak, 95 positif (prevalensi 50,8%) dan berhasil diisolasi sebanyak 109 spesies Candida. Spesies yang dominan adalah C. zropicalis. Pola kepekaan Candida spp terhadap ilukonazol lebih beragam dibanding vorikonazol. Belum ditemukan sumbcr inf¢ksi eksogen dilingkungan rumah sakit.

---

Candidemia is one of the clinical feature of systemic candidosis. Its prevalence increasing rapidly in the last decade due to increased number of immune compromised population. Thus study is aimed to determine the species of Candida that caused candidemia, its susceptibility patten against lluconazol and voriconazol using disk diffusion method and with evaluation to determine exogenous sources of infection on perinatology ward RSUPN-CM. 95 out of 187 blood samples were positive (prevalence 50,8%) with number of Candida spp. Isolated were lO9, C. Tropicalis was the predominant species. Susceptibility pattem against iluconazol is more variable comparing to voriconazol. No exogenous sources of infection found."

"ABSTRAKKriptosporidiosis adalah penyakit parasitik yang disebabkan olehCryptosporidium sp~ parasit kokstdia intraseluler pada manusia dan hewan danmerupakan agen yang menyebabkan enterokolitis. Cryptasporidium sp. dapatmenyebabkan penyakit gastrointestinal pada manusia, terutama anak-anak danpenderita imunodefisieosi. Angka kejadian infuksi umumnya lebih tinggi padaanak-anak dibandingkan orang dewasa skala klinis kriptosporidiosis sangat luasmulai dari asimtomatik sampai diare persisten. Selain menyebabkan diare, infeksiini juga dapat menyebabkan malnutrisi Selama ini metode pulasan modifikasilaban asarn mcrupeksn nilai baku emas bagi pemeriksaan Cryptosparidium sp.Namun sensitivitas tekrrik ini rendah dan sangat bergantung pada ketrampilanserta pengalaman tenaga mikroskopis dalaM melihat Cryptosparidium sp. Deteksi ookista Cryptosporidlum dengan antibodi monoklonal terhadap dinding ookistaCryptosparidium (CmAbs) merupakan metoda yang sensitif dan spesifik untukmendeteksi ookista dari apusan tinja dibandingkan metode pewarnaankonvensional Penelitian ini, menggunakan teknik imunofluoresen denganan!ibodi monoklonal yang telal1 dilabel oleh FITC untuk deteksi kriptosporidiosispada batita. Hasilnya akan dlbandingkan dengan PCR dalam hal sensitivitas danspesifisitas. Penelitian ini adalah penelitian kualitatif dengan desain crosssectional menggunakan uji diagnostik. Hasil uji skrining dan tingkat agreementdihitung. Dari 239 sampel tinja yang diperiksa, didapatkan freknensikriptosporidiosis pada anak batita sebanyak 24,3%. Kriptosporidiosis umumtetiadi pada populasi anak-anak di bawah tiga tahun. Dibandingkan danganmetode konvensional yaitu pewamaan modifikasi tahan asam dan auramin fenoJ,deteksi kriptosporidiosis dengan pemeriksaan imunofluoresen langsung lebihsensitif dllll lebih spesifik (p=O,OOO). Dibandingkan dengan PCR, pemeriksaanlmunofluoresen langsung memiliki sensitivitas 86,2% dan spesifisitas 98,9%.Sehingga dapat digunakan sebagai altemalif untuk deteksi ooldstaCryptosporidium sp. pada sampel tinja terutama untuk studi epidemiologi atauskrining Penilaian terhadap adanya faktor resiko jenis kelamin, status gizi dandiare teenyata didapatkan hasil tidak bermakna

---

AbstractCryptosporidiosis is a parasitic disease caused by CryptospOridium sp,coccidian parasite intracellular in human and animaL Cryptosporidium sp cancause gastrointestinal diseases in human, particularly in children andimmununodeficiency individuals. Generally. the incidence higher among children!han the adults. The clinical manifestations are wide, ranging from asymptomaticto persistent diarrhea and malnutrition in children. Modified acid fast stainingmethod has been a gold standard to detect Cryptosporidlum sp, however, thistechnique has low sensitivity and depends mulct on the experience and skill of thetechnician. Detection of Cryptosporidium sp oocyst using monoclonal antibodyto Cryptosporldium sp wall (CmAbs) is a more sensitive and specific method todetermine an oocyst from stooL The objective of this study is to determinecryptosporidiosis proportion between toddlers by FITC monoclonal antibodytechnique. The result will be compared to PCR on its sensitivity and specificity tocryptosporidiosis diagnosis. This research is qualitative interpretation with crosssectional design study which using diagnostic test The result of the screening testand lhe levels of agreement were quantified. Of 239 fecal samples examined,there were 24,3% positive oocyst Cryptosporidium sp, Cryptosporidiosis iscommon in children under three years old population. Comparing to conventionalmethods, MTA and Af, cryptosporidiosis detection using directimmunofluorescent test is more sensitive and specific (p=O,OOO), Comparing toPCR technique~ direct immunofluorescent test has sensitivity 86~2% andspecificity 98,9%. Statistically, direct immunofluorescent test can can be used asan alternative method to detect CJYP!osporidium sp. compared to PCR (p--o,06S),in particular for epidemiological study or population screening. Evaluation on riskfactors such as sex. malnutrition and diarrhea symptom appear that there is nosignificant differences."

"Cryptosporidium sp adalah parasit yang merupakan protozoa penyebab diare pada individu imunodefisiensi seperti penderita HIV/AIDS. Diagnosis criptosporidiosis dengan menemukan ookista pada tinja menggunakan metode pulasan tahan asam dinilai kurang sensitif. Deteksi koproantigen Cryprosporidfum sp mengunakan ELISA diketahui lebih sensitif dan spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk deteksi koproantigen Cryptosporidium sp pada pasien HIV/AIDS dengan diare kronik menggunakan ELISA dan MTA serta melihat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista. Sebanyak 95 sampel tinja dari pasien HIV/AIDS dengan diare kronik diperiksa rnenggunakan pulasan tahan asam yang merupakan gold standorr dan deteksi koproantigen. Frekuensi kriptosporidiosis menggunakan deteksi koproantigen sebesar 36,8% dan dengan metode MTA lI,6%. Nilai sensitivitas dan spesifisitas koproantigen dibandingkan dengan pulasan tahan asam sebesar 100% dan '71,4%. Tidak terdapat korlasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista.

---

Cryptosporidium sp is a protozoan parasite, causes severe diarrhea in imrnunodeticient hosts like the HIV/AIDS patients. Diagnosis of cryptosporidiosis by finding the oocyst from stool by modified acid fast staining, is insensitive. Coproantigen detection offers more sensitive and specific technique to detect Cqptosporidium infection. The objective of this study is to determine eryptosporidiosis proportion among HTV/AIDS patients by Cryptosporidial antigen detection in stool compare it to modified acid fast staining and determine its correlation with ooeyts count. A number of 95 stool specimens from the HIV/AIDS patients with chronic diarrhea were subjected to coproantigen ELISA test and modified acid-fast staining (gold standard). The frequency of Criptosporidial infection was 36,8% and 11,6% respectively by coproantigen detection and AF staining with 100% sensitivity and 71,4% specificity. There is no correlation between optical density and oocyst count."

"Methisilin Resistant Staphylococcus aureus MRSA adalah bakteri S.aureus yang resisten terhadap penisilin dan antibiotik golongan beta-laktam lainnya. Bakteri ini sering menyebabkan berbagai infeksi termasuk infeksi yang serius dengan mortalitas yang tinggi. Infeksi MRSA tidak hanya terbatas pada lingkungan rumah sakit saja, melainkan sudah menyebar ke komunitas. Metode pemeriksaan yang cepat untuk mendeteksi MRSA pada pasien diperlukan agar klinisi dapat segera menangani dengan baik. Metode biakan membutuhkan waktu hingga lebih dari 1 hari, sedangkan pemeriksaan PCR dapat memberikan hasil yang lebih cepat. Pemeriksaan PCR bertujuan untuk mencari gen mecA yang telah diketahui sebelumnya, berperan dalam mekanisme resistensi MRSA. Namun sekarang telah diketahui adanya MRSA dengan gen mecA negatif karena adanya peran gen lain yang juga dapat berperan yaitu mecC dan blaZ. Sehingga diperlukan pemeriksaan PCR yang dapat mendeteksi ketiga gen tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan uji skrining dan konfirmasi untuk deteksi MRSA. Optimasi multipleks PCR diawali dengan optimasi unipleks masing-masing gen mecA, mecC, dan blaZ. Uji coba telah dilakukan terhadap 30 isolat MRSA dan 30 isolat MSSA. Dari 30 isolat MRSA yang diuji diperoleh hasil hanya didapatkan perbedaan pada 3 isolat MRSA sedangkan pada isolat MSSA, unipleks dan multipleks PCR memperlihatkan hasil yang sama. Perbedaan yang tampak kemungkinan diakibatkan oleh bias PCR. Berdasarkan uji diagnostik diperoleh sensitivitas tertinggi tampak pada unipleks PCR mecA sensitivitas 95,83 sehingga dapat digunakan sebagai skrining, sedangkan spesifisitas tertinggi tampak pada multipleks PCR spesifisitas 100 sehingga dapat digunakan sebagai konfirmasi. Diperlukan uji lanjutan untuk konfirmasi peran blaZ pada MRSA.

---

Methicillin Resistant Staphylococcus aureus MRSA is S.aureus that resistant to penicillin and other beta lactam antibiotics. This bacteria often cause serious infection with high mortality. Methicillin Resistant Staphylococcus aureus infection is not only found in hospital, but it also spreads into community. Rapid detection of MRSA is needed to help clinicians in giving accurate treatment. The result obtained by culture method takes more than one day, while PCR result can be read in the same day. The common purpose of PCR assay is to detect mecA gene that known to be responsible for the occurance of resistant in MRSA isolates. Nowadays, there are some MRSA with negative mecA. In that case, mecC and blaZ may play an important role in resistant mechanism in MRSA. Therefore, new PCR method that can detect all of the three genes is needed.

The purpose of this study is to develop method for screening and confirming MRSA. First, we conduct uniplex PCR for each gene mecA, mecC, and blaZ, followed by multiplex PCR. Furthermore, assay was performed to detect those genes from 30 MRSA and 30 MSSA isolates. All MSSA gave the same result of uniplex and multiplex PCR. From 30 MRSA isolates, three isolates showed discrepancies between uniplex and multiplex PCR result. It may be due to PCR bias. Uniplex PCR mecA can be used as a screening test since its high sensititivity sensitivity 95,83 , whereas multiplex PCR mecA, mecC, and blaZ may be used as a confirmation test due to its high specificity 100 . Another test is needed to confirm the detection of blaZ gene in MRSA isolates."

"Latar Belakang : Kasus difteri yang disebabkan oleh C. diphtheriae masih terus terjadi sampai saat ini. Variasi level ekspresi toksin yang dipengaruhi oleh diphtheria toxin repressor dan tox promoter/operator diduga sebagai salah satu penyebabnya. Oleh karena itu, dilakukan karakterisasi genetik untuk mengetahui kemungkinan adanya mutasi pada gen repressor dan promoter/operator tersebut.Metode : Isolasi DNA dilakukan pada sepuluh isolat yang telah terkonfirmasi sebagai penghasil toksin. DNA tersebut diamplifikasi menggunakan primer spesifik untuk gen dtxR (681 bp) dan toxPO (320 bp) untuk mendapatkan fragmen target. Selanjutnya, urutan nukleotida sekuen DNA diperoleh melalui DNA sekuensing dan dianalisis menggunakan analisis bioinformatika.Hasil : Berdasarkan analisis mutasi, sekuen dtxR menunjukkan adanya mutasi DNA namun asam amino tidak berubah. Sementara itu, sekuen toxPO menunjukkan adanya insersi satu nukleotida pada 60% isolat bakteri. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa isolat Indonesia tersebar menjadi 3 clade berdasar dtxR dan 4 clade berdasar sekuen toxPO dengan 2 clade unik Indonesia.Kesimpulan : Promoter toksin yang mengalami insersi diduga berperan penting dalam mekanisme patogenisitas C. diphtheriae dalam menyebabkan penyakit. Namun, perlu dilakukan uji laboratorium untuk melihat pengaruh insersi terhadap toksigenisitas bakteri menggunakan metode kultur sel atau pengukuran level mRNA.

---

Background : Nowadays, The diphtheria cases caused by C. diphtheriae still exist. The variation of toxin expression level influenced by diphtheria toxin repressor (dtxR) and tox promoter/operator (toxPO) was considered as one of the causes for diphtheria existence. Therefore, a genetic characterization was performed to determine a mutation in both sequences.

Methode : DNA isolation was performed to ten isolates that have been confirmed as toxin producers. The DNA was amplified using a specific primer for the dtxR (681 bp) and toxPO (320 bp) genes to obtain the target fragment. Further, nucleotides sequences of DNA sequence was obtained through DNA sequencing to be analyzed using bioinformatics analysis.

Result : Based on the mutation analysis, the dtxR sequence showed the presence of DNA mutations but it did not change the amino acid. Meanwhile, the toxPO sequence showed the insertion in 60% bacterial isolates. The results of phylogenetic analysis showed that Indonesian isolates spread into 3 clade based on dtxR and 4 clade based on toxPO sequence with 2 unique Indonesian clade.

Conclusion : The insertions in the toxin promoter area are indicated taking an important role in the mechanism of C. diphtheriae pathogenicity. However, a laboratory examination is necessary to investigate the influence of the insertion towards bacterial toxigenicity by using cell culture method or mRNA level measurement."

"Latar Belakang: Eradikasi Helicobacter pylori menggunakan antimikrobaklaritromisin, amoksisilin yang dikombinasi PPI selama 10-14 hari. Resistensiantimikroba menjadi penyebab utama kegagalan terapi. Amoksisilin sebagai salah satu rejimen terapi lini pertama H.pylori telah dilaporkan resistensi sebesar 5,2% di Indonesia tahun 2016. Beberapa penelitian menunjukkan multiple point mutation gen pbp1 hanya ditemukan pada strain H.pylori resisten amoksisilin. Kesulitan melakukan biakan Helicobacter pylori menyebabkan uji biologi molekuler sebagai pilihan alternatif.Tujuan : Penelitian ini ditujukan untuk mengembangkan uji deteksi resistensi H.pylori dengan gen penyandi pbp 1.Metode : Penelitian ini merupakan studi retrospektif 2017-2019. Sampel H.pyloripositif histopatologis dari Departemen PA dikumpulkan sebanyak 54 sampel blokparafin dari pasien RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo antara tahun 2017-2019 ,dilakukan uji Real Time PCR. Hasil positif Real Time PCR dilanjutkan uji nested PCR untuk mencari gen pbp 1 dan dilakukan sekuensing Hasil : Dari 34 sampel positif Real Time PCR didapatkan lima positif gen pbp 1, tetapihanya empat gen pbp 1 yang dapat dianalisis setelah sekuensing. Hasil analisis dijumpai lima sekuen (sekuen 21, 1, 27, 32A, 32B), ditemukan juga tiga titik mutasi asam amino (Lys648Gln, Arg649Lys, Arg656Pro) yang berdasarkan penelitian sebelumnya hanya ditemukan pada strain H.pylori resisten amoksisilin. Empat sampel yang positif yaitu pada pasien tumor antrum lambung susp keganasan, ulkus gaster, gastritis kronis dan riwayat infeksi H.pylori dalam keluarga.Kesimpulan : Uji biologi molekuler menggunakan gen pbp 1 sebagai gen penyandiresisten amoksisilin dapat digunakan sebagai uji alternatif untuk mendeteksi resistensi amoksisilin pada penderita infeksi H.pylori. Hasil analisis mutasi asam amino pada uji penelitian ini menunjukkan terdapatnya multiple point mutation yang sesuai dengan strain H.pylori resisten amoksisilin di Korea.

---

Background: To eradicate Helicobacter pylori infection, physician administered clarithromycin and amoxicillin plus proton pump inhibitor during 10-14 days.

Antimicrobial resistance is known as the major cause of treatment failure. The

prevalence of Helicobacter pylori resistant strains against Amoxicillin in Indonesia was5,2% in 2016. Several studies in amoxicillin-resistant H.pylori strains had shown multiple point mutation in the pbp1 gene. Molecular method as an alternative tool was chosen due to the difficulties in cultivate H.pylori in a synthetic media.

Aim: This research was aimed to develop H.pylori resistance detection tests using pbp 1 gene.

Methods: The study was a retrospective study, with 54 histopathology of H.pylori

positive samples obtained from patients at RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo between

2017 to 2019. Real-time PCR tests were used to screen the samples before proceeded to nested PCR and obtained the pbp1 gene for sequencing.

Results: After the initial real-time PCR, 34 H.pylori positive samples were included in the study. From 34 samples of paraffin block only five specimens with positive pbp 1 genes, but only four samples can be analyzed after sequencing. The results found five sequences (sequences 21, 1, 27, 32A dan 32B), also found three amino acid mutation points (Lys648Gln, Arg649Lys, Arg656Pro) which were found only in amoxicillinresistant H.pylori strains. The four samples were collected from patients with antrum gastric tumor suspected as malignancy, gastric ulcer, chronic gastritis, and family history of H. pylori infection.

Conclusion: Molecular approach to detect pbp 1 gene encoding for amoxicillin

resistance could be used as an alternative of antibiotic susceptibility test. The multiple point mutations found in this reseach were in accordance with the amoxicillin-resistant H.pylori strains in Korea."

"

Latar Belakang : Infeksi intraabdomen (IIA) merupakan respons inflamasi peritoneum oleh mikroorganisme penyebab sepsis dan kematian kedua terbanyak di ruang intensive care unit (ICU).^1,2Complicated intra-abdominal infection worldwide observational study (CIAOW) menunjukkan angka kematian infeksi intraabdomen komplikata sebesar 10,5%. Terapi antimikroba atau antibiotik merupakan hal penting dalam penanganan IIA. Dalam mendukung keberhasilan penanganan kasus IIA dibutuhkan informasi akurat mengenai karakteristik dan pola kepekaan terhadap antibiotik yang dapat digunakan sebagai acuan penggunaan antibiotik pada kasus IIA. Tujuan: Mendapatkan karateristik mikrobiologis dan klinis pada kasus IIA dan mengetahui hubungan antara faktor klinis dan mikrobiologi dengan luaran klinis pasien.

Metode: Data diambil secara prospektif  dengan desain pontong lintang. Sampel penelitian berupa jaringan intraabdomen dan darah yang diambil saat pembedahan. Uji identifikasi dan uji kepekaan dilakukan untuk deteksi bakteri aerob dan bakteri anaerob. Hasil:. Infeksi intraabominal komplikata lebih banyak dibandingkan IIA non-komplikata (63,63%), kasus sepsis (63,63%) dan peritonitis (45,45%). Infeksi intraabominal terkait rumah sakit lebih banyak dibanding IIA komunitas yaitu 56,36%). Patogen yang paling sering ditemukan adalah Eschericia coli (34,78%), Klebsiella pneumoniae (10,86%) dan Enterococcus faecalis ((8,69%). Pola kepekaan terhadap amikasin, meropenem, ertapenem dan tigesiklin adalah 100% pada isolat E. coli, sementara piperasilin/tazobaktam lebih rendah (90,62%), seftazidim dan sefepim (68,75%). Ditemukan E. coli resisten multiobat  (62,5%), K. pneumoniae resisten multiobat (50%) dan E. faecalis resisten multi obat (50%). Terdapat hubungan antara faktor klinis sepsis dengan luaran klinis. Pemberian terapi antimikroba sebaiknya mengacu kepada rekomendasi yang dibuat berdasarkan pola kuman dan pola kepekaan setempat.

Kesimpulan: Bakteri Gram negatif masih merupakan bakteri yang paling sering ditemukan pada kasus IIA. Dengan tingginya temuan bakteri resisten multiobat makan pemberian antimikroba harus mempertimbangkan cakupan antimikroba terhadap patogen penyebab.

<

---

Background: Intraabdominal infection (IAI) is the peritoneum inflammatory process due to microorganisms, the leading cause of sepsis, and the second cause of death in the intensive care unit (ICU). Complicated intra-abdominal infection worldwide observational study (CIAOW) showed the mortality rate of complicated IAI of 10.5%. Antimicrobial therapy or antibiotics is important in managements of IAI. Accurate information is needed to improve IAI management; regarding the characteristics and patterns of sensitivity of antibiotics as a reference for antibiotics use in IAI.

Aim: This study aims to obtain microbiological and clinical pictures in IAI and the correlation between clinical and microbiological factors with the patient’s clinical outcomes.

Method: Data were collected prospectively using a cross-sectional design. The sampel in this study is intraabdomen tissue and blood that was taken during surgery. Identification and antimicrobial sensitivity testing was carried out to detect aerob and anaerob bacteria.

Result: Complicated cases is larger in number more than non-complicated IAI (63.63%), sepsis (63.63%) and peritonitis (45.45%). Hospital-related IAI much more than community IAI (56.36%). The most common pathogens are Eschericia coli 34.78%), Klebsiella pneumoniae (10.86%) and Enterococcus faecalis (8.69%). The sensitivity of amikacin, meropenem, ertapenem and tigesycline was 100% in E. coli, while piperacillin/ tazobactam was lower (90.62%), ceftazidime and cefepime (68.75%). It was found that multi-drug E. coli was (62.5%), multi-drug resistant K. pneumoniae (50%) and multi-drug resistant E. faecalis (50%). There is correlation between sepsis clinical factors with patient’s outcome. The administration of antimicrobial therapy should refer to recommendations made based on local microba and sensitivity patterns. 

Conclusion: Gram-negative bacteria are still the most common bacteria found in patient intraabdominal infections. With the high findings of multi-drug resistant bacteria, antimicrobial administration must consider the antimicrobial coverage of the causative pathogen.

 

"