Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Penelitian dilakukan untuk mengetahui kemampuan antagonisme enam spesies khamir filum Basidiomycota dari tanaman saeh (Broussonetia papyrifera Vent.) asal Bandung terhadap kapang Aspergillus spp. UICC. Pengujian menggunakan metode co-culture dalam medium Potato Dextrose Broth pH 5 pada suhu 30° C selama empat hari inkubasi. Khamir Cryptococcus luteolus UICC Y-461, Cryptococcus rajasthanensis UICC Y-458, Cryptococcus zeae UICC Y-463, Rhodotorula dairenensis UICC Y-457, Rhodotorula glutinis UICC Y-454, dan Rhodotorula mucilaginosa UICC Y-466 memiliki kemampuan antagonisme terhadap kapang Aspergillus spp. UICC. Cryptococcus luteolus UICC Y-461 merupakan khamir antagonis paling potensial karena mengalami peningkatan panjang sel rata-rata dan lebar sel rata-rata tertinggi ketika ditumbuhkan bersama Aspergillus niger UICC yaitu sebesar 9,88% dan 14,17%, mengalami peningkatan panjang sel rata-rata tertinggi ketika ditumbuhkan bersama Aspergillus ochraceus UICC yaitu sebesar 18,43%, memiliki kemampuan tertinggi dalam menghambat pertumbuhan kapang Aspergillus spp. UICC yaitu sebesar 100% (menyebabkan mortalitas kapang sebesar 100%), dan mengalami peningkatan jumlah sel tertinggi ketika ditumbuhkan bersama Aspergillus terreus UICC yaitu sebesar 41,62% pada inkubasi hari ke-4. ......The antagonism activity of six species of Basidiomycota yeasts from saeh plant (Broussonetia papyrifera Vent.) from Bandung against Aspergillus spp. UICC were investigated. The antagonism test was carried out by using co-culture method in Potato Dextrose Broth of pH 5 for four days at 30° C. Result showed that Cryptococcus luteolus UICC Y-461, Cryptococcus rajasthanensis UICC Y-458, Cryptococcus zeae UICC Y-463, Rhodotorula dairenensis UICC Y-457, Rhodotorula glutinis UICC Y-454, and Rhodotorula mucilaginosa UICC Y-466 were antagonists. Cryptococcus luteolus UICC Y-461 is the most potential antagonistic yeast because of the highest increase in average cell length and average cell width when grown with Aspergillus niger UICC by 9.88% and 14.17%, the highest increase in average cell length when grown with Aspergillus ochraceus UICC by 18.43%, the highest inhibition of growth of Aspergillus spp. UICC by 100% (caused 100% mortality of moulds), and increase the number of yeast cells when grown with Aspergillus terreus UICC by 41.62% at day-4.

Abstrak :
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi 16 strain kapang dari tujuh manuskrip kuno berbahan kertas Eropa dengan analisis sekuens daerah internal transcribed spacers (ITS) pada rDNA dan melakukan deskripsi morfologi terhadap kapang-kapang tersebut. Kapang tersebut berasal dari manuskrip kuno asal Keraton Kasepuhan Cirebon dan Perpustakaan Fakultas Ilmu Pengetahuan Budaya Universitas Indonesia (FIB UI). Amplifikasi daerah ITS rDNA menggunakan forward primer ITS 1 dan reverse primer ITS 4. Deskripsi morfologi dilakukan pada medium Czapek’s Dox Agar (CDA). Panjang fragmen daerah ITS berdasarkan elektroforesis gel dari kapang genus Aspergillus adalah 500--800 pb, Penicillium 500--600 pb, dan mycelia sterilia 550--800 pb. Satu strain kapang merupakan anggota filum Ascomycota, kelas Loculoascomycetes,ordo Dothideales, famili Davidielaceae, dan memiliki homologi sekuens daerah ITS dengan spesies terdekatnya, yaitu Cladosporium cladosporioides (Fresen.). Sebanyak 13 strain merupakan anggota filum Ascomycota, kelas Plectomycetes,ordo Eurotiales, famili Trichocomaceae, dan memiliki homologi sekuens daerah ITS dengan spesies terdekatnya, yaitu Aspergillus flavus Link. (satu strain),Aspergillus oryzae Cohn. (dua strain), Aspergillus niger (dua strain), Penicillium citrinum Thom (empat strain), Penicillium griseofulvum Dreckx. (satu strain),Penicillium janthinellum Biourd (satu strain), Eurotium amstelodami L. Mangin (satu strain), dan Eurotium rubrum Jos. Konig. (satu strain). Dua strain kapang lainnya, yaitu satu strain Aspergillus sp. dan satu strain Penicillium sp. belum berhasil diidentifikasi hingga tingkat spesies. ......The aim of this research was to identify 16 strains of moulds from seven old European paper manuscripts based on sequence analysis of ITS region rDNA and to describe their morphology. The moulds were isolated from old manuscripts from Keraton Kasepuhan Cirebon and the library of Faculty of Humanities University of Indonesia. ITS 1 and ITS 4 primers were used as forward and reverse primers for PCR, respectively. The mould’s morphology was examined on Czapek’s Dox Agar (CDA). The lengths of ITS region of genus Aspergillus based on gel electrophoresis were on the range of 500--800 bp, Penicillium 500--600 bp, and mycelia sterilia 550--800 bp. One strain belongs to phylum Ascomycota, class Loculoascomycetes, order Dothideales, family Davidielaceae,and showed ITS region similarity to Cladosporium cladosporioides (Fresen.). Thirteen strains belong to phylum Ascomycota, class Plectomycetes, order Eurotiales, family Trichocomaceae, and showed ITS region similarities to Aspergillus flavus Link. (one strain), Aspergillus oryzae Cohn. (two strains),Aspergillus niger (two strains), Penicillium citrinum Thom (four strains),Penicillium griseofulvum Dreckx. (one strain), Penicillium janthinellum Biourd (one strain), Eurotium amstelodami L. Mangin (one strain), and Eurotium rubrum Jos. Konig. (one strain). One strain of Aspergillus sp. and one strain of Penicillium sp. were unable to be identified to species level.

Abstrak :
Penelitian bertujuan untuk mengisolasi, mengidentifikasi, dan menguji kemampuan kapang selulolitik dari naskah kuno kertas Eropa asal Keraton Kasepuhan, Cirebon. Sebanyak 11 isolat kapang diisolasi dari lima naskah kuno pada medium DG18. Sebanyak 11 isolat dapat tumbuh pada kertas Eropa, sedangkan 7 isolat memiliki kemampuan selulolitik karena dapat menggunakan substrat Carboxy Methyl Cellulose (CMC). Tiga isolat kapang selulolitik dari naskah kuno Tafsir Al Quran. Tiga isolat kapang selulolitik dari naskah kuno Waosan Babad Galuh. Satu isolat kapang selulolitik dari naskah kuno Sajarah Cirebon. Kapang-kapang dari naskah kuno diidentifikasi sebagai genus Aspergillus (5 isolat), genus Penicillium (4 isolat), genus Eurotium (1 isolat), dan mycelia sterilia (1 isolat). ......The aim of this research is to isolate, identify, and investigate the cellulolytic fungi from old manuscripts of European papers from Keraton Kasepuhan Cirebon. Eleven isolates were isolated from five manuscripts on DG18 medium. Eleven isolates were able to grow on European paper and seven isolates were able to use Carboxy Methyl Cellulose (CMC) as substrate. Three cellulolytic isolates were isolated from manuscript Tafsir Al Quran. Three cellulolytic isolates from manuscript Waosan Babad Galuh. One cellulolytic isolate from manuscript Sajarah Cirebon. The moulds were identified as genus Aspergillus (5 isolates), genus Penicillium (4 isolates), genus Eurotium (1 isolate), and mycelia sterilia (1 isolate).

Abstrak :
Pada penelitian sebelumnya, diperoleh 18 strain Candida spp. dari Apis cerana dan bunga-bunga yang dikunjunginya di Ciburial, Jawa Barat. Hasil identifikasi berdasarkan data sequence daerah ITS rDNA menggunakan primer reverse ITS4, menunjukkan bahwa 18 strain tersebut memiliki homologi rendah (85--98%) terhadap spesies terdekatnya Candida spp. Dengan demikian belum diperoleh identitas yang akurat dari 18 strain Candida spp. tersebut. Penelitian bertujuan untuk memperoleh identitas yang akurat dari 18 strain tersebut melalui identifikasi molekuler, analisis filogenetik, dan pengamatan karakter fenotipik (morfologi, fisiologi, dan biokimia). Identifikasi dilakukan melalui sequencing pada daerah ITS rDNA dan D1/D2 LSU rDNA. Analisis filogenetik dilakukan berdasarkan data sequence daerah ITS rDNA dan D1/D2 LSU rDNA, menggunakan metode neighbor-joining. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler, analisis filogenetik, dan pengamatan karakter fenotipik, 10 strain diidentifikasi ke dalam 5 spesies, yaitu C. parapsilosis (Candida sp. CR033, CR034, dan CR038), C. orthopsilosis (Candida sp. CR015 dan CR151), C. metapsilosis (Candida sp. CR047 dan CR053), Debaryomyces hansenii (Candida sp. CR065), dan Wickerhamomyces anomalus (Candida sp. CR070 dan CR105). Sebanyak 8 strain (Candida sp. CR004, CR007, CR013, CR014, CR018, CR023, CR027, dan CR035) belum dapat ditentukan nama penunjuk (epithet) spesiesnya. Berdasarkan sequence ITS rDNA 8 strain tersebut memiliki homologi yang rendah (97%) terhadap kerabat terdekatnya C. hawaiiana. Pohon filogenetik berdasarkan sequence ITS rDNA menunjukkan 8 strain tersebut berada pada clade yang terpisah dengan C. hawaiiana dengan dukungan nilai bootstrap yang sangat tinggi, 99%. Delapan strain Candida tersebut termasuk dalam satu spesies yang memiliki perbedaan sequence ≤1% antara satu strain Candida dengan strain Candida lainnya atau disebut conspecific. Karakter fisiologi dan biokimia menunjukkan 8 strain tersebut memiliki perbedaan dengan C. hawaiiana CBS 9146T pada kemampuannya mengasimilasi sumber karbon α- methyl -D-glucoside, dan ketidakmampuannya mengasimilasi ribosa. Hasil identifikasi penelitian menunjukkan bahwa 8 strain Candida tersebut merupakan spesies yang berbeda dengan C. hawaiiana. ...... In the previous study, 18 strains of Candida spp. were obtained from Apis cerana and their visiting flowers in Ciburial, West Java. Based on sequence data of ITS rDNA using ITS4 reverse primer, these strains showed low homology (85--98%) to their closest relatives Candida spp. Therefore, the identity of these 18 strains were not established yet. The purpose of this study was to establish the identities of the 18 strains of Candida spp. by conducting molecular identification, phylogenetic analysis, and phenotypic characterization (morphological, physiological, and biochemical characters). Identification and phylogenetic analysis was carried out by sequencing the ITS rDNA and D1/D2 of LSU rDNA. Phylogenetic tree was constructed using neighbor-joining method. Based on molecular identification, phylogenetic analysis, and phenotypic characterization, 10 strains were identified into 5 species. Those 10 strains were identified as C. parapsilosis (Candida sp. CR033, CR034, and CR038), C. orthopsilosis (Candida sp. CR015 and CR151), C. metapsilosis (Candida sp. CR047 and CR053), Debaryomyces hansenii (Candida sp. CR065), and Wickerhamomyces anomalus (Candida sp. CR070 and CR105). The identities of eight strains (Candida sp. CR004, CR007, CR013, CR014, CR018, CR023, CR027, and CR035) were not established yet. Based on sequence data of ITS rDNA they have low degree of homology (97%) to their closest related species, C. hawaiiana. Phylogenetic tree based on sequence data of ITS rDNA showed they were separated from C. hawaiiana by 99% bootstrap value. Multiple alignment of their sequences of ITS and D1/D2 showed that they have ≤1% differences, which indicate that these strains are conspecific (same species). Their morphological, physiological and biochemical characteristics showed that these strains differed from C. hawaiiana CBS 9146T by their ability to assimilate α-methyl-D-glucoside and their inability to assimilate ribose as carbon sources. Our data suggest that these strains were distinct species from C. hawaiiana.

Abstrak :
Khamir dapat hidup dan bahkan ban yak ditemukan pada beberapa kultivar buah pisang. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi khamir dari kelas Ascomycetes yang terdapat pada beberapa kultivar buah pi sang berdasarkan kunci identifikasi Lodder (1971) dan Kreger-van Rij (1984). !dentifikasi yang dilakukan meliputi produksi urease, pengamatan sel dan koloni khamir, pembentukan miselium palsu, pembentukan askospora, kemampuan fermentasi gula, dan asimi!asi C dan N. Hasii penelitian menunjukkan bahwa dari 21 buah pisang yang terdiri atas 17 kultivar, diperoleh 4 marga khamir, yaitu Hanseniaspora, K/uyveromyces, Pichia, dan Sacch.a. romyces, yarg terdiri dari 11 jenis khamir yang meliput1 25 isolat. Pada pisang costa ditemukan H'spora uvarum (Niehaus) Shehata, Mrak et Phaff: pad a pi sang mas ditemukan K. wikenii van Der Walt, Ne! et van Kerken; pada pisang raja ditemukan P. amethionina Starmer, Phaff, Miranda et Miller var. amethionina; pada pisang ambon, nangka, uli, sereh, dan tanduk ditemukan P. besseyi Kurtzman et Wickerham; pada pisang ambon lumut ditemukan P. farinosa (Lindner) Hansen; pada pisang siem dan ' rabek ditemukan P. kuyveri Bedford; pada pisang lampung, kepok, uli, mas, angleng, dan kepok bangkok ditemukan P. membranaefaciens Hansen; pada pisang gebyar dan mas ditemukan Sacch. bayanus Saccardo; pada pisang - mas ditemukan Sacch.bisporus (Naganishi) Lodder et Kreger-van Rij; pada

Abstrak :
Salah satu variasi DNA mitokondria manusia adáiidelesi 9 pasangan basa (pb) pada salah satu dari dua salman perulangan 9-pb daerah intergenik sitokrom oksidase subunit 2 dan tRNA lisin. Delesi 9-pb ml banyak dipakai sebagai penanda genetik untuk mempelajani hubungan kekerabatan antarpopulasi. Penelitian ml bertujuan untuk mengetahui nhlai persentase delesi 9-pb pada populasi suku Dayak, Tengger dan Bali. Selain itu juga ingin diketahui basa-basa yang membentuk insersi di daerah sekitar delesi 9-pb pada beberapa sampel dari ketiga suku tersebut ditambah sampel dan suku Jawa, Batak, Toraja dan Kaili. Metode yang digunakan untuk deteksi delesi 9-pb adalah metode polymerase chain reaction dan elektroforesis pada gel agarosa 5%. Untuk pengamatan insersi dilakukan pembacaan urutan basa (sequencing) berdasarkan metode dideoksi dan elektroforesis pada gel poliakrilamida 6%. Persentase delesi 9-pb ketiga suku tersebut adalah suku Dayak 35,35% dari 99 sampel, suku Tenggen 29,03% dari 93 sampel dan suku Bali 24,69% dari 81 sampel. Bentuk insersi yang ditemukan pada 13 sampel dari suku Tengger, Jawa, Kaili, Batak dan Toraja yang diteliti mempenlihatkan adanya penambahan 2 basa sitosin, 3 basa sitosin, 4 basa sitosin dan 5 basa sitosin pada salah satu dari dua salman perulangan 9 pasangan basa.